MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 12616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_015955	TCG	2	6	669945	669950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007420
12002	NC_015955	GAC	2	6	669955	669960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007420
12003	NC_015955	GGA	2	6	669994	669999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007420
12004	NC_015955	GAGC	2	8	670070	670077	25 %	0 %	50 %	25 %	345007420
12005	NC_015955	TGA	2	6	670134	670139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007420
12006	NC_015955	GCTG	2	8	670267	670274	0 %	25 %	50 %	25 %	345007420
12007	NC_015955	GCGA	2	8	670295	670302	25 %	0 %	50 %	25 %	345007420
12008	NC_015955	GCC	2	6	670316	670321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007420
12009	NC_015955	CGG	2	6	670502	670507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007421
12010	NC_015955	TCC	2	6	670514	670519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007421
12011	NC_015955	GTG	2	6	670532	670537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007421
12012	NC_015955	GCA	2	6	670557	670562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007421
12013	NC_015955	CA	3	6	670567	670572	50 %	0 %	0 %	50 %	345007421
12014	NC_015955	GTC	2	6	670648	670653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007421
12015	NC_015955	TCG	2	6	670685	670690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007421
12016	NC_015955	GAG	2	6	670723	670728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007421
12017	NC_015955	GGC	2	6	670804	670809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007421
12018	NC_015955	CGA	2	6	670830	670835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007421
12019	NC_015955	TTC	2	6	670888	670893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007421
12020	NC_015955	CCAGC	2	10	670926	670935	20 %	0 %	20 %	60 %	345007421
12021	NC_015955	GA	3	6	671022	671027	50 %	0 %	50 %	0 %	345007421
12022	NC_015955	GACCTC	2	12	671104	671115	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345007421
12023	NC_015955	ATC	3	9	671396	671404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007422
12024	NC_015955	GT	3	6	671435	671440	0 %	50 %	50 %	0 %	345007422
12025	NC_015955	TCCT	2	8	671443	671450	0 %	50 %	0 %	50 %	345007422
12026	NC_015955	ACTC	2	8	671590	671597	25 %	25 %	0 %	50 %	345007422
12027	NC_015955	CCCA	2	8	671670	671677	25 %	0 %	0 %	75 %	345007422
12028	NC_015955	CGT	2	6	671709	671714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007422
12029	NC_015955	CGA	2	6	671767	671772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007422
12030	NC_015955	AG	3	6	671786	671791	50 %	0 %	50 %	0 %	345007422
12031	NC_015955	TCC	2	6	671825	671830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007422
12032	NC_015955	GCT	2	6	671850	671855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007422
12033	NC_015955	AGA	2	6	671896	671901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007422
12034	NC_015955	CGC	2	6	671921	671926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007422
12035	NC_015955	AGT	2	6	671943	671948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007422
12036	NC_015955	CGTC	2	8	671949	671956	0 %	25 %	25 %	50 %	345007422
12037	NC_015955	TTC	2	6	671966	671971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007422
12038	NC_015955	GAT	2	6	671981	671986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007422
12039	NC_015955	ACG	2	6	672021	672026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007422
12040	NC_015955	GA	3	6	672052	672057	50 %	0 %	50 %	0 %	345007422
12041	NC_015955	TCG	2	6	672102	672107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007423
12042	NC_015955	TCG	2	6	672195	672200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007423
12043	NC_015955	GTC	2	6	672237	672242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007423
12044	NC_015955	T	6	6	672245	672250	0 %	100 %	0 %	0 %	345007423
12045	NC_015955	TCCTGC	2	12	672282	672293	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	345007423
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12048	NC_015955	CTTC	2	8	672710	672717	0 %	50 %	0 %	50 %	345007424
12049	NC_015955	CTC	2	6	672737	672742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007424
12050	NC_015955	ATC	2	6	672792	672797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007424
12051	NC_015955	TCC	2	6	672798	672803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007424
12052	NC_015955	ACA	3	9	672848	672856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007424
12053	NC_015955	CGG	2	6	672881	672886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007424
12054	NC_015955	CGG	2	6	672960	672965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007424
12055	NC_015955	CGA	2	6	672994	672999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007424
12056	NC_015955	CA	3	6	673044	673049	50 %	0 %	0 %	50 %	345007424
12057	NC_015955	TCG	2	6	673062	673067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007424
12058	NC_015955	GCCG	2	8	673069	673076	0 %	0 %	50 %	50 %	345007424
12059	NC_015955	CGA	2	6	673096	673101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007424
12060	NC_015955	AC	3	6	673115	673120	50 %	0 %	0 %	50 %	345007424
12061	NC_015955	ACC	3	9	673245	673253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007424
12062	NC_015955	GTC	2	6	673286	673291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007424
12063	NC_015955	CGA	2	6	673324	673329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007424
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12067	NC_015955	GCT	2	6	673369	673374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007424
12068	NC_015955	GC	4	8	673379	673386	0 %	0 %	50 %	50 %	345007424
12069	NC_015955	CGA	2	6	673407	673412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007424
12070	NC_015955	CTTG	2	8	673498	673505	0 %	50 %	25 %	25 %	345007424
12071	NC_015955	AGG	2	6	673528	673533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007424
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12091	NC_015955	GGT	2	6	674962	674967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007426
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12100	NC_015955	GT	3	6	675320	675325	0 %	50 %	50 %	0 %	345007426
12101	NC_015955	CAG	2	6	675334	675339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007426
12102	NC_015955	TTCG	2	8	675346	675353	0 %	50 %	25 %	25 %	345007426
12103	NC_015955	CTC	2	6	675404	675409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007426
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12105	NC_015955	ATCG	2	8	675487	675494	25 %	25 %	25 %	25 %	345007426
12106	NC_015955	TCG	2	6	675528	675533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007426
12107	NC_015955	CGA	2	6	675544	675549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007426
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12110	NC_015955	TATT	2	8	676072	676079	25 %	75 %	0 %	0 %	345007427
12111	NC_015955	GCA	2	6	676102	676107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007427
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12115	NC_015955	TGAA	2	8	676334	676341	50 %	25 %	25 %	0 %	345007427
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12118	NC_015955	CAA	2	6	676474	676479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007427
12119	NC_015955	TCA	2	6	676495	676500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007427
12120	NC_015955	TCA	2	6	676569	676574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007427
12121	NC_015955	CGA	2	6	676699	676704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007427
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12123	NC_015955	CAT	2	6	676732	676737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007427
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12125	NC_015955	TGA	2	6	676798	676803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007427
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12128	NC_015955	GTA	2	6	677665	677670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007428
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12131	NC_015955	TGA	2	6	677771	677776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007428
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12153	NC_015955	CACGA	2	10	680055	680064	40 %	0 %	20 %	40 %	345007430
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12155	NC_015955	GAC	2	6	680097	680102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007430
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12174	NC_015955	CGG	2	6	681109	681114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007432
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12189	NC_015955	GATG	2	8	681900	681907	25 %	25 %	50 %	0 %	345007433
12190	NC_015955	GTC	2	6	681973	681978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007433
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12201	NC_015955	ACGT	2	8	682501	682508	25 %	25 %	25 %	25 %	345007433
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12212	NC_015955	TG	3	6	682874	682879	0 %	50 %	50 %	0 %	345007433
12213	NC_015955	GAG	2	6	682939	682944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007433
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12222	NC_015955	CA	3	6	683283	683288	50 %	0 %	0 %	50 %	345007433
12223	NC_015955	GAA	2	6	683316	683321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007433
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12227	NC_015955	AAGGGA	2	12	683991	684002	50 %	0 %	50 %	0 %	345007434
12228	NC_015955	CGA	2	6	684027	684032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007434
12229	NC_015955	TCG	2	6	684058	684063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007434
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12231	NC_015955	CG	3	6	684137	684142	0 %	0 %	50 %	50 %	345007434
12232	NC_015955	TC	3	6	684146	684151	0 %	50 %	0 %	50 %	345007434
12233	NC_015955	ACT	2	6	684184	684189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007434
12234	NC_015955	TGGG	2	8	684212	684219	0 %	25 %	75 %	0 %	345007434
12235	NC_015955	GCG	2	6	684257	684262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007434
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12475	NC_015955	TGA	2	6	697277	697282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007449
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12478	NC_015955	CTG	2	6	697446	697451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007449
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