MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 12616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_015955	CGA	2	6	640060	640065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007388
11502	NC_015955	CCT	2	6	640078	640083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007388
11503	NC_015955	ACTC	2	8	640090	640097	25 %	25 %	0 %	50 %	345007388
11504	NC_015955	CGA	2	6	640177	640182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007388
11505	NC_015955	CG	3	6	640183	640188	0 %	0 %	50 %	50 %	345007388
11506	NC_015955	GTC	2	6	640286	640291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007388
11507	NC_015955	CTC	2	6	640409	640414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007388
11508	NC_015955	GTA	2	6	640478	640483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007388
11509	NC_015955	GTC	2	6	640493	640498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007388
11510	NC_015955	GTCCC	2	10	640514	640523	0 %	20 %	20 %	60 %	345007388
11511	NC_015955	CCAC	2	8	640599	640606	25 %	0 %	0 %	75 %	345007388
11512	NC_015955	TCG	2	6	640674	640679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007388
11513	NC_015955	GGT	3	9	640732	640740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007388
11514	NC_015955	ACG	3	9	640773	640781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007388
11515	NC_015955	CCG	2	6	640822	640827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007388
11516	NC_015955	GAT	2	6	640838	640843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007388
11517	NC_015955	GTCG	2	8	640856	640863	0 %	25 %	50 %	25 %	345007388
11518	NC_015955	GTC	2	6	640871	640876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007388
11519	NC_015955	CCG	2	6	640928	640933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007389
11520	NC_015955	GGGT	2	8	640942	640949	0 %	25 %	75 %	0 %	345007389
11521	NC_015955	GCT	2	6	640969	640974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007389
11522	NC_015955	GTC	2	6	641039	641044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007389
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11524	NC_015955	CCGA	2	8	641212	641219	25 %	0 %	25 %	50 %	345007389
11525	NC_015955	GGT	2	6	641319	641324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007389
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11530	NC_015955	TCGG	2	8	641478	641485	0 %	25 %	50 %	25 %	345007389
11531	NC_015955	TC	3	6	641503	641508	0 %	50 %	0 %	50 %	345007390
11532	NC_015955	CGGT	2	8	641534	641541	0 %	25 %	50 %	25 %	345007390
11533	NC_015955	TCCA	2	8	641548	641555	25 %	25 %	0 %	50 %	345007390
11534	NC_015955	AGG	2	6	641586	641591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007390
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11536	NC_015955	CTCG	2	8	641693	641700	0 %	25 %	25 %	50 %	345007390
11537	NC_015955	AGG	2	6	641730	641735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007390
11538	NC_015955	TGC	2	6	641792	641797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007390
11539	NC_015955	GGCCG	2	10	641849	641858	0 %	0 %	60 %	40 %	345007390
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11542	NC_015955	GCCA	2	8	642000	642007	25 %	0 %	25 %	50 %	345007390
11543	NC_015955	CGC	2	6	642008	642013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007390
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11548	NC_015955	GAC	2	6	642131	642136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007390
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11550	NC_015955	CGA	2	6	642250	642255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007390
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11552	NC_015955	CGC	2	6	642277	642282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007390
11553	NC_015955	CGA	2	6	642322	642327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007390
11554	NC_015955	GTT	2	6	642372	642377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007390
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11556	NC_015955	TCG	3	9	642887	642895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007391
11557	NC_015955	GAGT	2	8	642936	642943	25 %	25 %	50 %	0 %	345007391
11558	NC_015955	CTG	2	6	642969	642974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007391
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11565	NC_015955	CTG	2	6	643630	643635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007393
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11568	NC_015955	TCG	2	6	643748	643753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007393
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11585	NC_015955	CTC	2	6	644270	644275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007395
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11590	NC_015955	TCG	2	6	646154	646159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007396
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11592	NC_015955	GTGAA	2	10	646328	646337	40 %	20 %	40 %	0 %	345007396
11593	NC_015955	CTT	2	6	646365	646370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007396
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11598	NC_015955	GCTC	2	8	646545	646552	0 %	25 %	25 %	50 %	345007396
11599	NC_015955	TTG	2	6	646658	646663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007396
11600	NC_015955	AACG	2	8	646741	646748	50 %	0 %	25 %	25 %	345007396
11601	NC_015955	T	7	7	646806	646812	0 %	100 %	0 %	0 %	345007396
11602	NC_015955	GA	3	6	646835	646840	50 %	0 %	50 %	0 %	345007396
11603	NC_015955	CGA	2	6	646868	646873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007396
11604	NC_015955	GCAA	2	8	646929	646936	50 %	0 %	25 %	25 %	345007396
11605	NC_015955	CCT	2	6	646952	646957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007396
11606	NC_015955	CGTC	2	8	646960	646967	0 %	25 %	25 %	50 %	345007396
11607	NC_015955	GCG	2	6	646998	647003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007396
11608	NC_015955	CGC	2	6	647010	647015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007396
11609	NC_015955	ACCG	2	8	647045	647052	25 %	0 %	25 %	50 %	345007396
11610	NC_015955	TGAC	2	8	647080	647087	25 %	25 %	25 %	25 %	345007396
11611	NC_015955	TCA	3	9	647089	647097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007396
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11613	NC_015955	GCAA	2	8	647167	647174	50 %	0 %	25 %	25 %	345007396
11614	NC_015955	GTTCA	2	10	647178	647187	20 %	40 %	20 %	20 %	345007396
11615	NC_015955	TCA	2	6	647194	647199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007396
11616	NC_015955	ACA	2	6	647212	647217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007396
11617	NC_015955	ATG	2	6	647236	647241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007396
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11619	NC_015955	GTGA	2	8	648193	648200	25 %	25 %	50 %	0 %	345007397
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11724	NC_015955	GCG	2	6	654924	654929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007403
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11729	NC_015955	CGAG	2	8	655002	655009	25 %	0 %	50 %	25 %	345007403
11730	NC_015955	TCC	2	6	655013	655018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007403
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11735	NC_015955	GC	3	6	655138	655143	0 %	0 %	50 %	50 %	345007403
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