MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 12616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_015955	GCC	2	6	608744	608749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007369
11002	NC_015955	ACT	2	6	608751	608756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007369
11003	NC_015955	TAA	2	6	608789	608794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345007369
11004	NC_015955	TCG	2	6	608812	608817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007369
11005	NC_015955	ACA	2	6	608896	608901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007369
11006	NC_015955	CAA	2	6	608966	608971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007369
11007	NC_015955	TCGT	2	8	609061	609068	0 %	50 %	25 %	25 %	345007369
11008	NC_015955	ACGTCG	2	12	609088	609099	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	345007369
11009	NC_015955	TCC	2	6	609129	609134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007369
11010	NC_015955	GTCATC	2	12	609180	609191	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345007369
11011	NC_015955	CTG	2	6	609233	609238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007369
11012	NC_015955	TGGA	2	8	609243	609250	25 %	25 %	50 %	0 %	345007369
11013	NC_015955	AAC	2	6	609264	609269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007369
11014	NC_015955	TCA	2	6	609280	609285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007369
11015	NC_015955	TATT	2	8	609331	609338	25 %	75 %	0 %	0 %	345007369
11016	NC_015955	CAT	2	6	609356	609361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007369
11017	NC_015955	CAC	2	6	609404	609409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007369
11018	NC_015955	TGAG	2	8	609451	609458	25 %	25 %	50 %	0 %	345007369
11019	NC_015955	ATGC	2	8	609532	609539	25 %	25 %	25 %	25 %	345007369
11020	NC_015955	CGC	2	6	609548	609553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007369
11021	NC_015955	AGG	2	6	609568	609573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007369
11022	NC_015955	GTT	2	6	609588	609593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007369
11023	NC_015955	GA	3	6	609613	609618	50 %	0 %	50 %	0 %	345007369
11024	NC_015955	ATC	2	6	609768	609773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007370
11025	NC_015955	T	6	6	609843	609848	0 %	100 %	0 %	0 %	345007370
11026	NC_015955	TAA	2	6	609869	609874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345007370
11027	NC_015955	TCT	2	6	609979	609984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007370
11028	NC_015955	TC	3	6	610024	610029	0 %	50 %	0 %	50 %	345007370
11029	NC_015955	ACGAA	2	10	610047	610056	60 %	0 %	20 %	20 %	345007370
11030	NC_015955	ATC	2	6	610074	610079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007370
11031	NC_015955	AAT	2	6	610570	610575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345007371
11032	NC_015955	CTA	2	6	610576	610581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007371
11033	NC_015955	TC	3	6	610631	610636	0 %	50 %	0 %	50 %	345007371
11034	NC_015955	ATT	2	6	610644	610649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345007371
11035	NC_015955	ACAA	2	8	610654	610661	75 %	0 %	0 %	25 %	345007371
11036	NC_015955	GTTG	2	8	610691	610698	0 %	50 %	50 %	0 %	345007371
11037	NC_015955	TTG	2	6	610727	610732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007371
11038	NC_015955	AT	3	6	610788	610793	50 %	50 %	0 %	0 %	345007371
11039	NC_015955	AT	3	6	610828	610833	50 %	50 %	0 %	0 %	345007371
11040	NC_015955	AGC	2	6	610870	610875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007371
11041	NC_015955	ACCA	2	8	610925	610932	50 %	0 %	0 %	50 %	345007371
11042	NC_015955	CAT	2	6	610943	610948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007371
11043	NC_015955	CTG	2	6	610958	610963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007371
11044	NC_015955	AAAC	2	8	610983	610990	75 %	0 %	0 %	25 %	345007371
11045	NC_015955	GAA	2	6	611089	611094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007371
11046	NC_015955	CAA	2	6	611155	611160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007371
11047	NC_015955	ACC	2	6	611176	611181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007371
11048	NC_015955	CAA	2	6	611183	611188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007371
11049	NC_015955	AC	3	6	611191	611196	50 %	0 %	0 %	50 %	345007371
11050	NC_015955	AGA	2	6	611226	611231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007371
11051	NC_015955	AC	3	6	611343	611348	50 %	0 %	0 %	50 %	345007371
11052	NC_015955	GA	3	6	611392	611397	50 %	0 %	50 %	0 %	345007371
11053	NC_015955	TC	3	6	611414	611419	0 %	50 %	0 %	50 %	345007371
11054	NC_015955	TGAACG	2	12	611508	611519	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	345007371
11055	NC_015955	A	6	6	611551	611556	100 %	0 %	0 %	0 %	345007371
11056	NC_015955	GGT	2	6	611704	611709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007371
11057	NC_015955	GGC	2	6	611736	611741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007371
11058	NC_015955	AAG	2	6	611762	611767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007371
11059	NC_015955	CGA	2	6	611925	611930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007371
11060	NC_015955	AAACG	2	10	611961	611970	60 %	0 %	20 %	20 %	345007371
11061	NC_015955	TCC	2	6	612046	612051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007371
11062	NC_015955	CTCC	2	8	612214	612221	0 %	25 %	0 %	75 %	345007371
11063	NC_015955	CAGAAG	2	12	612233	612244	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	345007371
11064	NC_015955	AT	3	6	612253	612258	50 %	50 %	0 %	0 %	345007371
11065	NC_015955	CGA	2	6	612316	612321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007371
11066	NC_015955	GAAC	2	8	612333	612340	50 %	0 %	25 %	25 %	345007371
11067	NC_015955	TCCCA	2	10	612353	612362	20 %	20 %	0 %	60 %	345007371
11068	NC_015955	ACA	2	6	612371	612376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007371
11069	NC_015955	CAG	2	6	612465	612470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007371
11070	NC_015955	ATC	2	6	612565	612570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007371
11071	NC_015955	GAAC	2	8	612628	612635	50 %	0 %	25 %	25 %	345007371
11072	NC_015955	A	6	6	612792	612797	100 %	0 %	0 %	0 %	345007371
11073	NC_015955	AAG	2	6	612911	612916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007371
11074	NC_015955	GTC	2	6	613310	613315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007372
11075	NC_015955	TCG	2	6	613370	613375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007372
11076	NC_015955	CCA	3	9	613403	613411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007372
11077	NC_015955	CGCC	2	8	613419	613426	0 %	0 %	25 %	75 %	345007372
11078	NC_015955	CGG	2	6	613428	613433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007372
11079	NC_015955	CAC	3	9	613490	613498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007372
11080	NC_015955	CAG	2	6	613502	613507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007372
11081	NC_015955	GTTGTC	2	12	613527	613538	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	345007372
11082	NC_015955	AGT	2	6	613591	613596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007372
11083	NC_015955	GTG	2	6	613612	613617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007372
11084	NC_015955	GCG	2	6	613638	613643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007372
11085	NC_015955	GTAC	2	8	613688	613695	25 %	25 %	25 %	25 %	345007372
11086	NC_015955	GAT	2	6	613817	613822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007372
11087	NC_015955	AGC	2	6	613854	613859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007372
11088	NC_015955	GAA	2	6	613937	613942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007372
11089	NC_015955	ACT	2	6	613955	613960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007372
11090	NC_015955	TTC	2	6	614010	614015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007372
11091	NC_015955	CG	3	6	614019	614024	0 %	0 %	50 %	50 %	345007372
11092	NC_015955	GTC	2	6	614093	614098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007372
11093	NC_015955	GTA	2	6	614108	614113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007372
11094	NC_015955	CGA	2	6	614317	614322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007372
11095	NC_015955	CAG	2	6	614341	614346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007372
11096	NC_015955	AAG	2	6	614411	614416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007372
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11098	NC_015955	CCT	2	6	614730	614735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007373
11099	NC_015955	GGT	2	6	614761	614766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007373
11100	NC_015955	TTC	2	6	614771	614776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007373
11101	NC_015955	CATCAC	2	12	614916	614927	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	345007373
11102	NC_015955	ATC	2	6	614962	614967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007373
11103	NC_015955	TCT	2	6	614991	614996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007373
11104	NC_015955	TTC	2	6	615053	615058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007373
11105	NC_015955	G	6	6	615076	615081	0 %	0 %	100 %	0 %	345007373
11106	NC_015955	TGGG	2	8	615173	615180	0 %	25 %	75 %	0 %	345007373
11107	NC_015955	TGA	2	6	615200	615205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007373
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11109	NC_015955	CTG	2	6	615302	615307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007373
11110	NC_015955	TGG	2	6	615334	615339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007373
11111	NC_015955	TTG	2	6	615344	615349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007373
11112	NC_015955	TCT	2	6	615375	615380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007373
11113	NC_015955	TCC	2	6	615388	615393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007373
11114	NC_015955	GTC	2	6	615599	615604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007374
11115	NC_015955	TGA	2	6	615673	615678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007374
11116	NC_015955	C	6	6	615710	615715	0 %	0 %	0 %	100 %	345007374
11117	NC_015955	CGG	2	6	615717	615722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007374
11118	NC_015955	CAC	2	6	615779	615784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007374
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11120	NC_015955	GTC	2	6	615822	615827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007374
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11123	NC_015955	TCG	2	6	615957	615962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007374
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11126	NC_015955	CTTG	2	8	616081	616088	0 %	50 %	25 %	25 %	345007374
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11359	NC_015955	GAA	2	6	630153	630158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007383
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11474	NC_015955	ACCC	3	12	635592	635603	25 %	0 %	0 %	75 %	345007386
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11478	NC_015955	TCG	2	6	636944	636949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007387
11479	NC_015955	GCT	2	6	636958	636963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007387
11480	NC_015955	TCG	2	6	639216	639221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007388
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