MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 12616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_015955	AGC	2	6	554554	554559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007314
10003	NC_015955	TCG	2	6	554565	554570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007314
10004	NC_015955	CGA	2	6	554658	554663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007314
10005	NC_015955	CCG	3	9	554699	554707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007314
10006	NC_015955	AGA	2	6	554886	554891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007314
10007	NC_015955	AAG	2	6	554924	554929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007314
10008	NC_015955	TAGTCC	2	12	554938	554949	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	345007314
10009	NC_015955	GAG	2	6	554999	555004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007314
10010	NC_015955	TG	3	6	555157	555162	0 %	50 %	50 %	0 %	345007314
10011	NC_015955	AG	3	6	555192	555197	50 %	0 %	50 %	0 %	345007314
10012	NC_015955	CCA	2	6	555215	555220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007314
10013	NC_015955	TGGC	2	8	555237	555244	0 %	25 %	50 %	25 %	345007314
10014	NC_015955	TCAG	2	8	555317	555324	25 %	25 %	25 %	25 %	345007314
10015	NC_015955	CCAT	2	8	555347	555354	25 %	25 %	0 %	50 %	345007314
10016	NC_015955	CTCAT	2	10	555457	555466	20 %	40 %	0 %	40 %	345007315
10017	NC_015955	GAG	2	6	555560	555565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007315
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10019	NC_015955	CAA	2	6	555641	555646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007315
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10021	NC_015955	AACG	2	8	555765	555772	50 %	0 %	25 %	25 %	345007315
10022	NC_015955	TTC	2	6	555781	555786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007315
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10026	NC_015955	CGA	3	9	556073	556081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007315
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10030	NC_015955	GCA	2	6	556201	556206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007315
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10033	NC_015955	TCT	2	6	556281	556286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007316
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10039	NC_015955	CT	3	6	556787	556792	0 %	50 %	0 %	50 %	345007316
10040	NC_015955	CGT	2	6	556826	556831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007316
10041	NC_015955	TCGGT	2	10	557019	557028	0 %	40 %	40 %	20 %	345007316
10042	NC_015955	GCGG	2	8	557060	557067	0 %	0 %	75 %	25 %	345007316
10043	NC_015955	C	6	6	557102	557107	0 %	0 %	0 %	100 %	345007316
10044	NC_015955	AG	3	6	557198	557203	50 %	0 %	50 %	0 %	345007316
10045	NC_015955	TCGA	2	8	557220	557227	25 %	25 %	25 %	25 %	345007316
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10050	NC_015955	GTC	3	9	557354	557362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007316
10051	NC_015955	TCTT	2	8	557421	557428	0 %	75 %	0 %	25 %	345007316
10052	NC_015955	CGA	2	6	557521	557526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007316
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10055	NC_015955	GGAC	2	8	557671	557678	25 %	0 %	50 %	25 %	345007316
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10059	NC_015955	CTGA	2	8	557828	557835	25 %	25 %	25 %	25 %	345007316
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10072	NC_015955	GGCT	2	8	558390	558397	0 %	25 %	50 %	25 %	345007317
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10101	NC_015955	TGA	2	6	559671	559676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007320
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10103	NC_015955	CAG	2	6	560891	560896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007321
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10105	NC_015955	AC	3	6	560947	560952	50 %	0 %	0 %	50 %	345007321
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10120	NC_015955	AGC	2	6	561435	561440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007321
10121	NC_015955	ACTTC	2	10	561460	561469	20 %	40 %	0 %	40 %	345007321
10122	NC_015955	CGA	2	6	561475	561480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007321
10123	NC_015955	CAC	2	6	561504	561509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007321
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10125	NC_015955	GTA	2	6	561566	561571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007321
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10127	NC_015955	AGT	2	6	561619	561624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007321
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10129	NC_015955	GGTG	2	8	561712	561719	0 %	25 %	75 %	0 %	345007321
10130	NC_015955	ACC	2	6	561731	561736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007321
10131	NC_015955	TCG	2	6	561756	561761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007321
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10139	NC_015955	GCA	2	6	562385	562390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007322
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10142	NC_015955	GCG	2	6	562440	562445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007322
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10149	NC_015955	TGG	2	6	562952	562957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007322
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10152	NC_015955	CGA	2	6	563126	563131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007322
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10194	NC_015955	TCG	2	6	565718	565723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007324
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10201	NC_015955	TGGC	3	12	566749	566760	0 %	25 %	50 %	25 %	345007326
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10222	NC_015955	GAA	2	6	567840	567845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007329
10223	NC_015955	CGAACT	2	12	567866	567877	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345007329
10224	NC_015955	GAC	2	6	567879	567884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007329
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10226	NC_015955	CGT	3	9	568271	568279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007330
10227	NC_015955	TTC	2	6	568297	568302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007330
10228	NC_015955	TGA	2	6	568359	568364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007331
10229	NC_015955	CGA	2	6	568399	568404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007331
10230	NC_015955	GAG	2	6	568409	568414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007331
10231	NC_015955	CT	3	6	568446	568451	0 %	50 %	0 %	50 %	345007331
10232	NC_015955	CGGA	2	8	568494	568501	25 %	0 %	50 %	25 %	345007331
10233	NC_015955	CGG	2	6	568537	568542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007331
10234	NC_015955	TTC	2	6	568604	568609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007331
10235	NC_015955	AAG	3	9	568616	568624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007331
10236	NC_015955	CAA	2	6	568657	568662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007331
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10474	NC_015955	TCG	2	6	583383	583388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007345
10475	NC_015955	TCC	2	6	583402	583407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007345
10476	NC_015955	CGG	2	6	583414	583419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007345
10477	NC_015955	GTC	3	9	583475	583483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007345
10478	NC_015955	CG	3	6	583508	583513	0 %	0 %	50 %	50 %	345007345
10479	NC_015955	CCT	2	6	583615	583620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007345
10480	NC_015955	GAT	2	6	583640	583645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007345
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10482	NC_015955	CTG	2	6	583833	583838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007346
10483	NC_015955	TCG	2	6	583839	583844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007346
10484	NC_015955	TC	3	6	583893	583898	0 %	50 %	0 %	50 %	345007346
10485	NC_015955	GGA	2	6	583914	583919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007346
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10490	NC_015955	CGA	2	6	584082	584087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007346
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