MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 12616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015955	TCCG	2	8	27059	27066	0 %	25 %	25 %	50 %	345006845
502	NC_015955	CGA	2	6	27210	27215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006845
503	NC_015955	GAAGAT	2	12	27415	27426	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	345006845
504	NC_015955	CCA	2	6	27475	27480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006845
505	NC_015955	ACCC	2	8	27491	27498	25 %	0 %	0 %	75 %	345006845
506	NC_015955	AGT	2	6	27582	27587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006845
507	NC_015955	TACCAC	2	12	27590	27601	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	345006845
508	NC_015955	GTT	2	6	27609	27614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345006845
509	NC_015955	CTA	2	6	27622	27627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006845
510	NC_015955	TGA	2	6	27639	27644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006845
511	NC_015955	GTC	2	6	27702	27707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006845
512	NC_015955	AGT	2	6	27823	27828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006845
513	NC_015955	TAG	2	6	27842	27847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006845
514	NC_015955	ACG	2	6	28477	28482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006846
515	NC_015955	GGA	2	6	28490	28495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006846
516	NC_015955	TGA	2	6	28514	28519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006846
517	NC_015955	CGC	2	6	28562	28567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006846
518	NC_015955	TC	4	8	28623	28630	0 %	50 %	0 %	50 %	345006846
519	NC_015955	CAG	2	6	28759	28764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006846
520	NC_015955	GAA	2	6	28777	28782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006846
521	NC_015955	CAGACT	2	12	28894	28905	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345006846
522	NC_015955	TGA	2	6	28944	28949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006846
523	NC_015955	GGGA	2	8	28999	29006	25 %	0 %	75 %	0 %	345006846
524	NC_015955	TC	3	6	29013	29018	0 %	50 %	0 %	50 %	345006846
525	NC_015955	AC	3	6	29124	29129	50 %	0 %	0 %	50 %	345006846
526	NC_015955	GAA	2	6	29158	29163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006846
527	NC_015955	CGGG	2	8	29232	29239	0 %	0 %	75 %	25 %	345006846
528	NC_015955	CGG	2	6	29305	29310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006846
529	NC_015955	ACT	2	6	29321	29326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006846
530	NC_015955	TGA	2	6	29463	29468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006846
531	NC_015955	CGTT	2	8	29489	29496	0 %	50 %	25 %	25 %	345006846
532	NC_015955	ACA	2	6	29525	29530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006846
533	NC_015955	AACA	2	8	30335	30342	75 %	0 %	0 %	25 %	345006847
534	NC_015955	AGA	2	6	30387	30392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006847
535	NC_015955	ACC	2	6	30407	30412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345006847
536	NC_015955	AT	3	6	30476	30481	50 %	50 %	0 %	0 %	345006847
537	NC_015955	CAA	2	6	30538	30543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006847
538	NC_015955	AGT	2	6	30558	30563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006847
539	NC_015955	TTCGA	2	10	30591	30600	20 %	40 %	20 %	20 %	345006847
540	NC_015955	CAA	2	6	30757	30762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345006847
541	NC_015955	CGAA	2	8	30763	30770	50 %	0 %	25 %	25 %	345006847
542	NC_015955	CAGA	2	8	30780	30787	50 %	0 %	25 %	25 %	345006847
543	NC_015955	CCGA	2	8	30856	30863	25 %	0 %	25 %	50 %	345006847
544	NC_015955	TTGAT	2	10	30890	30899	20 %	60 %	20 %	0 %	345006847
545	NC_015955	GTG	2	6	30905	30910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345006847
546	NC_015955	GA	3	6	30990	30995	50 %	0 %	50 %	0 %	345006847
547	NC_015955	ATC	2	6	31154	31159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006848
548	NC_015955	CTT	2	6	31218	31223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006848
549	NC_015955	ATC	2	6	31267	31272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006848
550	NC_015955	ACG	2	6	31313	31318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006848
551	NC_015955	CAT	2	6	31321	31326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006848
552	NC_015955	GGA	2	6	31399	31404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006848
553	NC_015955	GAA	2	6	31602	31607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006849
554	NC_015955	GTC	2	6	31626	31631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006849
555	NC_015955	CAT	2	6	31664	31669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006849
556	NC_015955	TAC	2	6	31703	31708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006849
557	NC_015955	AG	3	6	31745	31750	50 %	0 %	50 %	0 %	345006849
558	NC_015955	GAAA	2	8	31808	31815	75 %	0 %	25 %	0 %	345006849
559	NC_015955	GA	3	6	31822	31827	50 %	0 %	50 %	0 %	345006849
560	NC_015955	TTC	2	6	31839	31844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006849
561	NC_015955	AGG	2	6	31858	31863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006849
562	NC_015955	TAT	2	6	31927	31932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345006850
563	NC_015955	GCA	2	6	31937	31942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006850
564	NC_015955	T	6	6	31981	31986	0 %	100 %	0 %	0 %	345006850
565	NC_015955	AT	3	6	32038	32043	50 %	50 %	0 %	0 %	345006850
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567	NC_015955	A	6	6	32097	32102	100 %	0 %	0 %	0 %	345006850
568	NC_015955	GAA	2	6	32117	32122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006850
569	NC_015955	GA	3	6	32189	32194	50 %	0 %	50 %	0 %	345006850
570	NC_015955	ATT	2	6	32247	32252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345006850
571	NC_015955	GGA	2	6	32332	32337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006850
572	NC_015955	TCC	2	6	32561	32566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006850
573	NC_015955	GAT	2	6	32582	32587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006850
574	NC_015955	CTT	2	6	32596	32601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006850
575	NC_015955	ATTG	2	8	32609	32616	25 %	50 %	25 %	0 %	345006850
576	NC_015955	CTT	2	6	32663	32668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345006850
577	NC_015955	TGA	2	6	32755	32760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006850
578	NC_015955	GA	4	8	32786	32793	50 %	0 %	50 %	0 %	345006850
579	NC_015955	ACCA	2	8	32924	32931	50 %	0 %	0 %	50 %	345006850
580	NC_015955	CTA	2	6	32935	32940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006850
581	NC_015955	TC	3	6	33130	33135	0 %	50 %	0 %	50 %	345006851
582	NC_015955	AT	3	6	33156	33161	50 %	50 %	0 %	0 %	345006851
583	NC_015955	CAT	2	6	33230	33235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006851
584	NC_015955	TCA	2	6	33346	33351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006851
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587	NC_015955	GAAA	2	8	33435	33442	75 %	0 %	25 %	0 %	345006851
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591	NC_015955	TGA	2	6	33575	33580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006851
592	NC_015955	TCA	2	6	33639	33644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006851
593	NC_015955	GTT	2	6	33657	33662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345006851
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596	NC_015955	CG	3	6	33783	33788	0 %	0 %	50 %	50 %	345006851
597	NC_015955	CCT	2	6	33936	33941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345006851
598	NC_015955	AG	3	6	34040	34045	50 %	0 %	50 %	0 %	345006851
599	NC_015955	GAG	2	6	34164	34169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006851
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602	NC_015955	TC	4	8	34769	34776	0 %	50 %	0 %	50 %	345006852
603	NC_015955	CAG	2	6	34870	34875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006852
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607	NC_015955	TTCC	2	8	35017	35024	0 %	50 %	0 %	50 %	345006852
608	NC_015955	GAC	3	9	35089	35097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006852
609	NC_015955	CCG	2	6	35138	35143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006852
610	NC_015955	CTG	2	6	35158	35163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006852
611	NC_015955	GCC	2	6	35197	35202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345006852
612	NC_015955	GAT	2	6	35209	35214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345006852
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614	NC_015955	GTC	2	6	35242	35247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006852
615	NC_015955	CGA	2	6	35283	35288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006852
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618	NC_015955	CGA	2	6	35403	35408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006852
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620	NC_015955	GGA	2	6	35451	35456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345006852
621	NC_015955	CG	3	6	35481	35486	0 %	0 %	50 %	50 %	345006852
622	NC_015955	GA	3	6	35490	35495	50 %	0 %	50 %	0 %	345006852
623	NC_015955	AGA	2	6	35504	35509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345006852
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625	NC_015955	CAG	2	6	35696	35701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006852
626	NC_015955	TAC	2	6	35755	35760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006852
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629	NC_015955	TCG	2	6	36383	36388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345006853
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749	NC_015955	GGC	2	6	42082	42087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006861
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997	NC_015955	GAC	2	6	51097	51102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006866
998	NC_015955	TCA	2	6	51113	51118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345006866
999	NC_015955	CGG	2	6	51205	51210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345006866
1000	NC_015955	ACG	2	6	51244	51249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345006866

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