MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 12616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_015955	AGG	2	6	439381	439386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007217
8002	NC_015955	AAC	2	6	439539	439544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345007218
8003	NC_015955	GGT	2	6	439595	439600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007218
8004	NC_015955	CGG	2	6	439663	439668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007218
8005	NC_015955	TGG	2	6	439691	439696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007218
8006	NC_015955	TCT	2	6	439830	439835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007219
8007	NC_015955	GTC	2	6	439873	439878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007219
8008	NC_015955	GC	3	6	439918	439923	0 %	0 %	50 %	50 %	345007219
8009	NC_015955	ACC	3	9	439977	439985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007219
8010	NC_015955	ACG	2	6	440000	440005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007219
8011	NC_015955	TCG	2	6	440013	440018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007219
8012	NC_015955	CGCT	2	8	440024	440031	0 %	25 %	25 %	50 %	345007219
8013	NC_015955	TCG	2	6	440060	440065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007219
8014	NC_015955	TCG	2	6	440072	440077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007219
8015	NC_015955	ATCG	2	8	440110	440117	25 %	25 %	25 %	25 %	345007219
8016	NC_015955	ATC	2	6	440122	440127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007219
8017	NC_015955	TGT	2	6	440150	440155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007219
8018	NC_015955	ACGA	2	8	440190	440197	50 %	0 %	25 %	25 %	345007220
8019	NC_015955	GCT	2	6	440232	440237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007220
8020	NC_015955	CGG	2	6	440243	440248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007220
8021	NC_015955	CGATGG	2	12	440292	440303	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345007220
8022	NC_015955	GTC	2	6	440477	440482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007220
8023	NC_015955	TCC	2	6	440544	440549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007220
8024	NC_015955	GTC	2	6	440581	440586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007220
8025	NC_015955	GTCG	2	8	440593	440600	0 %	25 %	50 %	25 %	345007220
8026	NC_015955	CGC	2	6	440622	440627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007220
8027	NC_015955	CGA	2	6	440652	440657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007220
8028	NC_015955	GGA	2	6	440666	440671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007220
8029	NC_015955	GTCG	2	8	440684	440691	0 %	25 %	50 %	25 %	345007220
8030	NC_015955	TGGG	2	8	440721	440728	0 %	25 %	75 %	0 %	345007220
8031	NC_015955	CCG	2	6	440732	440737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007220
8032	NC_015955	CGGG	2	8	440766	440773	0 %	0 %	75 %	25 %	345007220
8033	NC_015955	GAT	2	6	440872	440877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007220
8034	NC_015955	AGC	2	6	440914	440919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007220
8035	NC_015955	GTC	2	6	440938	440943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007220
8036	NC_015955	GAA	2	6	440989	440994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007220
8037	NC_015955	CGA	2	6	441000	441005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007220
8038	NC_015955	GGACTG	2	12	441070	441081	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	345007220
8039	NC_015955	GGA	2	6	441111	441116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007220
8040	NC_015955	GGA	2	6	441156	441161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007220
8041	NC_015955	TGC	3	9	441207	441215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007220
8042	NC_015955	GCT	2	6	441257	441262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007220
8043	NC_015955	GCC	2	6	441264	441269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007220
8044	NC_015955	CTC	2	6	441365	441370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007221
8045	NC_015955	TGG	2	6	441429	441434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007221
8046	NC_015955	TCG	2	6	441481	441486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007221
8047	NC_015955	CGGG	2	8	441535	441542	0 %	0 %	75 %	25 %	345007221
8048	NC_015955	CT	3	6	441554	441559	0 %	50 %	0 %	50 %	345007221
8049	NC_015955	GTC	2	6	441842	441847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007222
8050	NC_015955	CGA	3	9	441862	441870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007222
8051	NC_015955	GAC	2	6	441874	441879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007222
8052	NC_015955	ACG	2	6	441900	441905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007222
8053	NC_015955	GGC	2	6	441907	441912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007222
8054	NC_015955	GCT	2	6	441920	441925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007223
8055	NC_015955	GA	3	6	441995	442000	50 %	0 %	50 %	0 %	345007223
8056	NC_015955	CCG	2	6	442007	442012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007223
8057	NC_015955	CCG	2	6	442029	442034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007223
8058	NC_015955	CGT	2	6	442084	442089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007223
8059	NC_015955	CGC	3	9	442090	442098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007223
8060	NC_015955	AACGCA	2	12	442115	442126	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	345007223
8061	NC_015955	CGC	2	6	442188	442193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007223
8062	NC_015955	CCG	2	6	442221	442226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007223
8063	NC_015955	CTGC	2	8	442272	442279	0 %	25 %	25 %	50 %	345007223
8064	NC_015955	CGT	2	6	442293	442298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007223
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8070	NC_015955	CGTT	2	8	442484	442491	0 %	50 %	25 %	25 %	345007223
8071	NC_015955	ATC	2	6	442502	442507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007223
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8074	NC_015955	GAC	2	6	442609	442614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007223
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8077	NC_015955	TCG	2	6	442721	442726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007223
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8082	NC_015955	CACC	2	8	442893	442900	25 %	0 %	0 %	75 %	345007223
8083	NC_015955	CGA	2	6	442902	442907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007223
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8087	NC_015955	GCG	2	6	443055	443060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007223
8088	NC_015955	CGAGGA	2	12	443088	443099	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	345007223
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8090	NC_015955	CGCGC	2	10	443116	443125	0 %	0 %	40 %	60 %	345007223
8091	NC_015955	CAC	2	6	443139	443144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007223
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8100	NC_015955	TCG	2	6	443423	443428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007223
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8354	NC_015955	GA	3	6	456270	456275	50 %	0 %	50 %	0 %	345007234
8355	NC_015955	AGTTG	2	10	456324	456333	20 %	40 %	40 %	0 %	345007234
8356	NC_015955	CTG	2	6	456430	456435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007234
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8480	NC_015955	GTT	2	6	464625	464630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345007241
8481	NC_015955	CTA	2	6	464692	464697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007241
8482	NC_015955	G	6	6	464714	464719	0 %	0 %	100 %	0 %	345007241
8483	NC_015955	CGA	2	6	464743	464748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007241
8484	NC_015955	CGT	2	6	464767	464772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007241
8485	NC_015955	GCC	2	6	464789	464794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007241
8486	NC_015955	CGT	2	6	464809	464814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007241
8487	NC_015955	CGA	2	6	464839	464844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007241
8488	NC_015955	CCGC	2	8	464898	464905	0 %	0 %	25 %	75 %	345007241
8489	NC_015955	GT	4	8	464909	464916	0 %	50 %	50 %	0 %	345007241
8490	NC_015955	TCG	2	6	464991	464996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007241
8491	NC_015955	CTC	2	6	465014	465019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007241
8492	NC_015955	TCC	2	6	465060	465065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007241
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8494	NC_015955	CGG	2	6	465157	465162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007241
8495	NC_015955	TCGAT	2	10	465169	465178	20 %	40 %	20 %	20 %	345007241
8496	NC_015955	CTC	2	6	465179	465184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007241
8497	NC_015955	ACGT	2	8	465224	465231	25 %	25 %	25 %	25 %	345007241
8498	NC_015955	CGA	2	6	465253	465258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007241
8499	NC_015955	GAA	2	6	465272	465277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007241
8500	NC_015955	CTT	2	6	465380	465385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007241

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