MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halophilic archaeon DL31 plasmid phalar01

Total Repeats: 12616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015955	TCC	2	6	328002	328007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007101
6002	NC_015955	GTC	2	6	328041	328046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007101
6003	NC_015955	TC	3	6	328045	328050	0 %	50 %	0 %	50 %	345007101
6004	NC_015955	CGT	2	6	328072	328077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007101
6005	NC_015955	TCG	2	6	328149	328154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007101
6006	NC_015955	GTC	2	6	328163	328168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007101
6007	NC_015955	CGG	2	6	328191	328196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007101
6008	NC_015955	GAG	2	6	328226	328231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007101
6009	NC_015955	GACGCG	2	12	328233	328244	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	345007101
6010	NC_015955	GCC	2	6	328262	328267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007101
6011	NC_015955	CCG	2	6	328305	328310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007101
6012	NC_015955	TCG	2	6	328314	328319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007101
6013	NC_015955	TCC	2	6	328533	328538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007101
6014	NC_015955	TCG	2	6	328605	328610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007101
6015	NC_015955	GGC	2	6	328672	328677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007101
6016	NC_015955	CGC	2	6	328788	328793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007101
6017	NC_015955	TCG	2	6	328800	328805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007101
6018	NC_015955	CGGCG	2	10	328849	328858	0 %	0 %	60 %	40 %	345007101
6019	NC_015955	TCG	2	6	328899	328904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007101
6020	NC_015955	ACC	2	6	328922	328927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007101
6021	NC_015955	GCG	2	6	328934	328939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007101
6022	NC_015955	TCC	2	6	328947	328952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007101
6023	NC_015955	GCCCGA	2	12	329014	329025	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	345007101
6024	NC_015955	AGC	2	6	329028	329033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007101
6025	NC_015955	AGT	2	6	329199	329204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007102
6026	NC_015955	TCG	2	6	329213	329218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007102
6027	NC_015955	G	6	6	329268	329273	0 %	0 %	100 %	0 %	345007102
6028	NC_015955	CGG	2	6	329382	329387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007102
6029	NC_015955	CGC	2	6	329436	329441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007102
6030	NC_015955	CCG	2	6	329444	329449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007102
6031	NC_015955	GGA	2	6	329586	329591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007102
6032	NC_015955	GTCCT	2	10	329632	329641	0 %	40 %	20 %	40 %	345007102
6033	NC_015955	AG	3	6	329647	329652	50 %	0 %	50 %	0 %	345007102
6034	NC_015955	GAG	2	6	329695	329700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345007102
6035	NC_015955	GC	3	6	329772	329777	0 %	0 %	50 %	50 %	345007102
6036	NC_015955	CGG	2	6	330006	330011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007102
6037	NC_015955	GC	3	6	330012	330017	0 %	0 %	50 %	50 %	345007102
6038	NC_015955	CGT	2	6	330063	330068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007102
6039	NC_015955	CGA	2	6	330108	330113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007102
6040	NC_015955	CGA	2	6	330132	330137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007102
6041	NC_015955	ACC	2	6	330203	330208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345007102
6042	NC_015955	TCG	2	6	330245	330250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007102
6043	NC_015955	CGT	2	6	330291	330296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007102
6044	NC_015955	CGG	2	6	330317	330322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007102
6045	NC_015955	CCG	2	6	330337	330342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007102
6046	NC_015955	CG	3	6	330341	330346	0 %	0 %	50 %	50 %	345007102
6047	NC_015955	CGTC	2	8	330351	330358	0 %	25 %	25 %	50 %	345007102
6048	NC_015955	CGC	2	6	330396	330401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345007102
6049	NC_015955	GC	3	6	330443	330448	0 %	0 %	50 %	50 %	345007102
6050	NC_015955	CTTC	2	8	330453	330460	0 %	50 %	0 %	50 %	345007102
6051	NC_015955	GCT	2	6	330524	330529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007102
6052	NC_015955	CT	3	6	330566	330571	0 %	50 %	0 %	50 %	345007102
6053	NC_015955	GTG	2	6	330576	330581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007102
6054	NC_015955	GCCA	2	8	330623	330630	25 %	0 %	25 %	50 %	345007103
6055	NC_015955	GA	3	6	330694	330699	50 %	0 %	50 %	0 %	345007103
6056	NC_015955	TCG	2	6	330706	330711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007103
6057	NC_015955	GTG	2	6	330831	330836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345007103
6058	NC_015955	CGT	3	9	330842	330850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007103
6059	NC_015955	ACCG	2	8	331068	331075	25 %	0 %	25 %	50 %	345007103
6060	NC_015955	GTA	2	6	331086	331091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345007103
6061	NC_015955	TCG	2	6	331129	331134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007103
6062	NC_015955	TC	3	6	331231	331236	0 %	50 %	0 %	50 %	345007104
6063	NC_015955	GCT	2	6	331255	331260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007104
6064	NC_015955	CGT	2	6	331312	331317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007104
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6069	NC_015955	CGT	2	6	331432	331437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007104
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6072	NC_015955	TTC	2	6	331536	331541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007104
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6088	NC_015955	TCG	2	6	332595	332600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007105
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6092	NC_015955	CATC	2	8	332884	332891	25 %	25 %	0 %	50 %	345007105
6093	NC_015955	GACC	2	8	332917	332924	25 %	0 %	25 %	50 %	345007105
6094	NC_015955	TCT	2	6	333070	333075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007105
6095	NC_015955	TGCA	2	8	333141	333148	25 %	25 %	25 %	25 %	345007105
6096	NC_015955	GA	3	6	333177	333182	50 %	0 %	50 %	0 %	345007105
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6099	NC_015955	CGAACT	2	12	333277	333288	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	345007105
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6103	NC_015955	GGAT	2	8	333630	333637	25 %	25 %	50 %	0 %	345007106
6104	NC_015955	CTGA	2	8	333674	333681	25 %	25 %	25 %	25 %	345007106
6105	NC_015955	CGG	2	6	333716	333721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345007106
6106	NC_015955	ACGA	2	8	333822	333829	50 %	0 %	25 %	25 %	345007106
6107	NC_015955	GAC	5	15	333830	333844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007106
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6110	NC_015955	TCT	2	6	333987	333992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345007106
6111	NC_015955	CGA	2	6	334021	334026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007106
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6113	NC_015955	AGGG	2	8	334037	334044	25 %	0 %	75 %	0 %	345007106
6114	NC_015955	AGCA	2	8	334077	334084	50 %	0 %	25 %	25 %	345007106
6115	NC_015955	CGA	2	6	334397	334402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007107
6116	NC_015955	CTC	2	6	334414	334419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345007107
6117	NC_015955	GTCGA	2	10	334481	334490	20 %	20 %	40 %	20 %	345007107
6118	NC_015955	CGA	2	6	334500	334505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007107
6119	NC_015955	G	6	6	334554	334559	0 %	0 %	100 %	0 %	345007107
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6121	NC_015955	CGA	2	6	334647	334652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007107
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6482	NC_015955	CGT	2	6	355769	355774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345007128
6483	NC_015955	CTA	2	6	355811	355816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345007128
6484	NC_015955	GAA	2	6	355836	355841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007128
6485	NC_015955	AGA	2	6	355934	355939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345007128
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6487	NC_015955	ACG	2	6	355975	355980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345007128
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6491	NC_015955	GT	3	6	356097	356102	0 %	50 %	50 %	0 %	345007129
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