MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halophilic archaeon DL31 chromosome

Total Repeats: 62023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015954	ACG	2	6	158658	158663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004172
3502	NC_015954	GAC	2	6	158672	158677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004172
3503	NC_015954	CGA	2	6	158689	158694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004172
3504	NC_015954	ACGG	2	8	158830	158837	25 %	0 %	50 %	25 %	345004173
3505	NC_015954	CGG	2	6	158885	158890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004173
3506	NC_015954	TCG	2	6	158908	158913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004173
3507	NC_015954	GCC	2	6	158966	158971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345004173
3508	NC_015954	AG	3	6	158998	159003	50 %	0 %	50 %	0 %	345004173
3509	NC_015954	GGTTGG	2	12	159012	159023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345004173
3510	NC_015954	GCC	2	6	159056	159061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345004173
3511	NC_015954	GA	3	6	159084	159089	50 %	0 %	50 %	0 %	345004173
3512	NC_015954	TTGA	2	8	159100	159107	25 %	50 %	25 %	0 %	345004173
3513	NC_015954	GGC	2	6	159111	159116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004173
3514	NC_015954	GGC	2	6	159157	159162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004173
3515	NC_015954	GCG	2	6	159203	159208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004173
3516	NC_015954	GCGAC	2	10	159213	159222	20 %	0 %	40 %	40 %	345004173
3517	NC_015954	TTC	2	6	159235	159240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345004173
3518	NC_015954	CGG	2	6	159273	159278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004173
3519	NC_015954	CGT	2	6	159321	159326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004173
3520	NC_015954	TC	3	6	159336	159341	0 %	50 %	0 %	50 %	345004173
3521	NC_015954	CCT	2	6	159357	159362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345004173
3522	NC_015954	GA	3	6	159384	159389	50 %	0 %	50 %	0 %	345004173
3523	NC_015954	TCC	3	9	159539	159547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345004173
3524	NC_015954	CGG	2	6	159613	159618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004173
3525	NC_015954	CCG	2	6	159711	159716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345004173
3526	NC_015954	TGT	2	6	159783	159788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345004173
3527	NC_015954	GCGCC	2	10	159816	159825	0 %	0 %	40 %	60 %	345004173
3528	NC_015954	CGG	2	6	159831	159836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004173
3529	NC_015954	CGA	2	6	159840	159845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004173
3530	NC_015954	TCC	2	6	159923	159928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345004173
3531	NC_015954	CGT	2	6	159960	159965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004173
3532	NC_015954	CACGTC	2	12	159979	159990	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	345004173
3533	NC_015954	GCG	2	6	160009	160014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004173
3534	NC_015954	CAG	2	6	160102	160107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004173
3535	NC_015954	CGTGCG	2	12	160108	160119	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	345004173
3536	NC_015954	GCT	2	6	160208	160213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004173
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3538	NC_015954	CTC	2	6	160333	160338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345004173
3539	NC_015954	GATT	2	8	160404	160411	25 %	50 %	25 %	0 %	345004173
3540	NC_015954	CGC	2	6	160428	160433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345004173
3541	NC_015954	TTC	2	6	160447	160452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345004173
3542	NC_015954	TCG	2	6	160489	160494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004173
3543	NC_015954	TCG	2	6	160568	160573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004173
3544	NC_015954	TTGG	2	8	160574	160581	0 %	50 %	50 %	0 %	345004173
3545	NC_015954	GTTCA	2	10	160604	160613	20 %	40 %	20 %	20 %	345004174
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3547	NC_015954	CGT	3	9	160634	160642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004174
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3549	NC_015954	GAT	2	6	160767	160772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345004174
3550	NC_015954	TCGC	2	8	160845	160852	0 %	25 %	25 %	50 %	345004174
3551	NC_015954	TCG	2	6	160873	160878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004174
3552	NC_015954	TCG	2	6	160972	160977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004174
3553	NC_015954	GGC	2	6	160998	161003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004174
3554	NC_015954	GAG	2	6	161022	161027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345004174
3555	NC_015954	AGT	2	6	161493	161498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345004175
3556	NC_015954	CCT	2	6	161523	161528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345004175
3557	NC_015954	TCG	2	6	161537	161542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004175
3558	NC_015954	CGTC	2	8	161640	161647	0 %	25 %	25 %	50 %	345004175
3559	NC_015954	GCG	2	6	161669	161674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004175
3560	NC_015954	ACCGA	2	10	161678	161687	40 %	0 %	20 %	40 %	345004175
3561	NC_015954	GCAG	2	8	161736	161743	25 %	0 %	50 %	25 %	345004175
3562	NC_015954	CTC	2	6	161779	161784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345004175
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3569	NC_015954	GAG	2	6	162077	162082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345004175
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3572	NC_015954	TCG	2	6	162159	162164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004175
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3581	NC_015954	CTG	2	6	162601	162606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004175
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3593	NC_015954	CAT	2	6	162841	162846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345004175
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3612	NC_015954	CTC	2	6	163710	163715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345004176
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3621	NC_015954	GCG	2	6	164157	164162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004177
3622	NC_015954	GCA	2	6	164172	164177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004177
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3654	NC_015954	GAA	2	6	165143	165148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345004178
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3726	NC_015954	TGC	2	6	168057	168062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004181
3727	NC_015954	CGT	2	6	168074	168079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004181
3728	NC_015954	GCC	2	6	168090	168095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345004181
3729	NC_015954	CCG	2	6	168100	168105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345004181
3730	NC_015954	CGG	2	6	168129	168134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004181
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3732	NC_015954	GCT	2	6	168180	168185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004181
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3736	NC_015954	CCA	2	6	168260	168265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345004181
3737	NC_015954	CCGTT	2	10	168368	168377	0 %	40 %	20 %	40 %	345004181
3738	NC_015954	CGT	2	6	168389	168394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004181
3739	NC_015954	CCGAG	2	10	168460	168469	20 %	0 %	40 %	40 %	345004181
3740	NC_015954	CGA	2	6	168545	168550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004181
3741	NC_015954	GT	3	6	168594	168599	0 %	50 %	50 %	0 %	345004181
3742	NC_015954	CGA	2	6	168623	168628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004181
3743	NC_015954	GA	4	8	168640	168647	50 %	0 %	50 %	0 %	345004181
3744	NC_015954	AGC	2	6	168682	168687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004181
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3857	NC_015954	CGT	2	6	173520	173525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004186
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3981	NC_015954	GCG	2	6	178441	178446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345004189
3982	NC_015954	CGAG	2	8	178476	178483	25 %	0 %	50 %	25 %	345004189
3983	NC_015954	AG	3	6	178498	178503	50 %	0 %	50 %	0 %	345004189
3984	NC_015954	GAC	2	6	178510	178515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004189
3985	NC_015954	GTT	2	6	178558	178563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345004189
3986	NC_015954	CTC	2	6	178564	178569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345004189
3987	NC_015954	CAGG	2	8	178782	178789	25 %	0 %	50 %	25 %	345004190
3988	NC_015954	GAC	2	6	178790	178795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004190
3989	NC_015954	CTG	2	6	178802	178807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004190
3990	NC_015954	TCC	2	6	178824	178829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345004190
3991	NC_015954	CGC	3	9	178870	178878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345004190
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3993	NC_015954	GC	3	6	178914	178919	0 %	0 %	50 %	50 %	345004190
3994	NC_015954	GTC	2	6	178943	178948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004190
3995	NC_015954	GAC	2	6	178958	178963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345004190
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3997	NC_015954	GCC	2	6	179006	179011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	345004190
3998	NC_015954	CGT	2	6	179015	179020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004190
3999	NC_015954	CTC	2	6	179024	179029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	345004190
4000	NC_015954	GCT	2	6	179036	179041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345004190

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