MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 67255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015948	CGT	2	6	168470	168475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210488
4002	NC_015948	CCG	2	6	168501	168506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210488
4003	NC_015948	CGG	2	6	168514	168519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210488
4004	NC_015948	CGT	2	6	168530	168535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210488
4005	NC_015948	GTT	2	6	168763	168768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210489
4006	NC_015948	CCG	2	6	168772	168777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210489
4007	NC_015948	CCA	2	6	168786	168791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210489
4008	NC_015948	GTC	2	6	168814	168819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210489
4009	NC_015948	GTT	2	6	168820	168825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210489
4010	NC_015948	CT	3	6	168950	168955	0 %	50 %	0 %	50 %	344210490
4011	NC_015948	GCG	2	6	169102	169107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210490
4012	NC_015948	GCGG	2	8	169123	169130	0 %	0 %	75 %	25 %	344210490
4013	NC_015948	ACT	2	6	169145	169150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210491
4014	NC_015948	TCGC	2	8	169230	169237	0 %	25 %	25 %	50 %	344210491
4015	NC_015948	CGG	2	6	169241	169246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210491
4016	NC_015948	AAC	2	6	169264	169269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210491
4017	NC_015948	CAC	3	9	169314	169322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210491
4018	NC_015948	CGT	2	6	169397	169402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210491
4019	NC_015948	GCG	2	6	169427	169432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210491
4020	NC_015948	GCC	2	6	169435	169440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210491
4021	NC_015948	CGA	2	6	169442	169447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210491
4022	NC_015948	CGA	2	6	169472	169477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210491
4023	NC_015948	GGT	2	6	169499	169504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210491
4024	NC_015948	AGTC	2	8	169691	169698	25 %	25 %	25 %	25 %	344210491
4025	NC_015948	GCA	2	6	169760	169765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210491
4026	NC_015948	CGG	2	6	169844	169849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210491
4027	NC_015948	TCG	2	6	169948	169953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210491
4028	NC_015948	GC	3	6	170123	170128	0 %	0 %	50 %	50 %	344210492
4029	NC_015948	CGG	2	6	170158	170163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210492
4030	NC_015948	GACT	2	8	170275	170282	25 %	25 %	25 %	25 %	344210492
4031	NC_015948	CGT	2	6	170283	170288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210492
4032	NC_015948	AGCC	2	8	170318	170325	25 %	0 %	25 %	50 %	344210492
4033	NC_015948	GTC	2	6	170326	170331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210492
4034	NC_015948	GTA	2	6	170344	170349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210492
4035	NC_015948	CGT	3	9	170397	170405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210492
4036	NC_015948	CCG	2	6	170540	170545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210492
4037	NC_015948	CGAG	2	8	170583	170590	25 %	0 %	50 %	25 %	344210492
4038	NC_015948	ACG	2	6	170598	170603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210492
4039	NC_015948	GT	3	6	170612	170617	0 %	50 %	50 %	0 %	344210492
4040	NC_015948	CCG	2	6	170653	170658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210492
4041	NC_015948	AGT	2	6	170718	170723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210492
4042	NC_015948	CGG	2	6	170793	170798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210492
4043	NC_015948	CGC	2	6	170956	170961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210492
4044	NC_015948	TGCG	2	8	171003	171010	0 %	25 %	50 %	25 %	344210492
4045	NC_015948	AAT	2	6	171025	171030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344210492
4046	NC_015948	CGG	2	6	171120	171125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210493
4047	NC_015948	GTCC	2	8	171129	171136	0 %	25 %	25 %	50 %	344210493
4048	NC_015948	GGC	2	6	171140	171145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210493
4049	NC_015948	CGG	2	6	171168	171173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210493
4050	NC_015948	GC	3	6	171185	171190	0 %	0 %	50 %	50 %	344210493
4051	NC_015948	GCC	2	6	171200	171205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210493
4052	NC_015948	CT	3	6	171230	171235	0 %	50 %	0 %	50 %	344210493
4053	NC_015948	TCG	2	6	171245	171250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210493
4054	NC_015948	GCG	2	6	171355	171360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210493
4055	NC_015948	CCAGT	2	10	171370	171379	20 %	20 %	20 %	40 %	344210493
4056	NC_015948	GGC	2	6	171406	171411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210493
4057	NC_015948	TG	3	6	171419	171424	0 %	50 %	50 %	0 %	344210493
4058	NC_015948	GCC	2	6	171467	171472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210493
4059	NC_015948	TCGT	2	8	171583	171590	0 %	50 %	25 %	25 %	344210493
4060	NC_015948	TCC	2	6	171641	171646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210493
4061	NC_015948	CTC	2	6	171673	171678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210493
4062	NC_015948	GCC	2	6	171680	171685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210493
4063	NC_015948	GCTG	2	8	171702	171709	0 %	25 %	50 %	25 %	344210493
4064	NC_015948	CCT	2	6	171807	171812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210493
4065	NC_015948	GCT	2	6	171833	171838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210493
4066	NC_015948	CGC	2	6	171850	171855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210493
4067	NC_015948	GCC	2	6	171863	171868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210493
4068	NC_015948	TG	3	6	171929	171934	0 %	50 %	50 %	0 %	344210493
4069	NC_015948	TCG	2	6	171938	171943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210493
4070	NC_015948	TCG	2	6	171998	172003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210493
4071	NC_015948	GTC	2	6	172099	172104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210493
4072	NC_015948	CGA	3	9	172107	172115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210493
4073	NC_015948	CG	3	6	172147	172152	0 %	0 %	50 %	50 %	344210493
4074	NC_015948	GCCG	2	8	172159	172166	0 %	0 %	50 %	50 %	344210493
4075	NC_015948	CGA	2	6	172197	172202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210493
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4077	NC_015948	GCT	2	6	172269	172274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210493
4078	NC_015948	GAG	2	6	172340	172345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210493
4079	NC_015948	GGCT	2	8	172483	172490	0 %	25 %	50 %	25 %	344210494
4080	NC_015948	GTC	2	6	172611	172616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210494
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4083	NC_015948	GTC	2	6	172934	172939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210495
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4085	NC_015948	GGTC	2	8	173111	173118	0 %	25 %	50 %	25 %	344210495
4086	NC_015948	CGA	2	6	173163	173168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210495
4087	NC_015948	GTG	2	6	173211	173216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210495
4088	NC_015948	CGTC	2	8	173318	173325	0 %	25 %	25 %	50 %	344210495
4089	NC_015948	CGA	2	6	173334	173339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210495
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4091	NC_015948	ACCCCG	2	12	173402	173413	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	344210496
4092	NC_015948	TCGCG	2	10	173429	173438	0 %	20 %	40 %	40 %	344210496
4093	NC_015948	GC	3	6	173453	173458	0 %	0 %	50 %	50 %	344210496
4094	NC_015948	CGA	2	6	173574	173579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210496
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4100	NC_015948	CGA	2	6	173793	173798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210496
4101	NC_015948	TGG	2	6	173807	173812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210496
4102	NC_015948	CGC	2	6	173825	173830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210496
4103	NC_015948	CCG	2	6	173852	173857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210496
4104	NC_015948	GAC	2	6	173895	173900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210496
4105	NC_015948	TCG	2	6	174014	174019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210496
4106	NC_015948	GACC	2	8	174030	174037	25 %	0 %	25 %	50 %	344210496
4107	NC_015948	GCC	2	6	174087	174092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210496
4108	NC_015948	CGT	2	6	174280	174285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210497
4109	NC_015948	GGAG	2	8	174317	174324	25 %	0 %	75 %	0 %	344210497
4110	NC_015948	TC	3	6	174340	174345	0 %	50 %	0 %	50 %	344210497
4111	NC_015948	CT	3	6	174604	174609	0 %	50 %	0 %	50 %	344210498
4112	NC_015948	CAGA	2	8	174682	174689	50 %	0 %	25 %	25 %	344210498
4113	NC_015948	T	7	7	174706	174712	0 %	100 %	0 %	0 %	344210498
4114	NC_015948	CGGC	2	8	174732	174739	0 %	0 %	50 %	50 %	344210498
4115	NC_015948	CGG	2	6	174765	174770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210498
4116	NC_015948	TCG	2	6	174809	174814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210498
4117	NC_015948	GAA	2	6	174993	174998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210498
4118	NC_015948	GACC	2	8	175062	175069	25 %	0 %	25 %	50 %	344210498
4119	NC_015948	CAG	2	6	175072	175077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210498
4120	NC_015948	TAC	2	6	175108	175113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210498
4121	NC_015948	CTC	2	6	175153	175158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210498
4122	NC_015948	GCC	2	6	175195	175200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210498
4123	NC_015948	TCG	2	6	175211	175216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210498
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4240	NC_015948	CGA	2	6	179804	179809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210501
4241	NC_015948	GCG	2	6	179839	179844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210501
4242	NC_015948	CGAC	2	8	179881	179888	25 %	0 %	25 %	50 %	344210501
4243	NC_015948	CGT	2	6	179891	179896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210501
4244	NC_015948	CGA	2	6	179897	179902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210501
4245	NC_015948	GTC	2	6	179934	179939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210501
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4265	NC_015948	TCCGT	2	10	180846	180855	0 %	40 %	20 %	40 %	344210502
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4268	NC_015948	GTC	2	6	180965	180970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210502
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4271	NC_015948	GGAT	2	8	181042	181049	25 %	25 %	50 %	0 %	344210502
4272	NC_015948	AGC	2	6	181068	181073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210502
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4345	NC_015948	ACG	2	6	184665	184670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210507
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4347	NC_015948	CGA	2	6	184691	184696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210507
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4350	NC_015948	CGC	2	6	184799	184804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210507
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4352	NC_015948	GCGG	2	8	184889	184896	0 %	0 %	75 %	25 %	344210507
4353	NC_015948	CGA	4	12	185141	185152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210508
4354	NC_015948	GCG	2	6	185266	185271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210508
4355	NC_015948	TCC	2	6	185278	185283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210508
4356	NC_015948	CGC	2	6	185324	185329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210508
4357	NC_015948	ACT	2	6	185452	185457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210508
4358	NC_015948	GCC	2	6	185517	185522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210508
4359	NC_015948	CCT	2	6	185539	185544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210508
4360	NC_015948	CGA	2	6	185561	185566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210508
4361	NC_015948	GAA	2	6	185583	185588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210508
4362	NC_015948	TTC	2	6	185640	185645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210508
4363	NC_015948	CTG	2	6	185670	185675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210508
4364	NC_015948	GAC	2	6	185685	185690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210508
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4366	NC_015948	GGCG	2	8	185747	185754	0 %	0 %	75 %	25 %	344210508
4367	NC_015948	TTC	2	6	185835	185840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210508
4368	NC_015948	CGA	2	6	185927	185932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210508
4369	NC_015948	GC	3	6	186049	186054	0 %	0 %	50 %	50 %	344210508
4370	NC_015948	ACG	2	6	186073	186078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210508
4371	NC_015948	CGACAT	2	12	186107	186118	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	344210508
4372	NC_015948	GTC	2	6	186126	186131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210508
4373	NC_015948	GACGCC	2	12	186144	186155	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	344210508
4374	NC_015948	GCG	2	6	186217	186222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210508
4375	NC_015948	AGT	2	6	186237	186242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210508
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4378	NC_015948	CGA	2	6	186365	186370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210508
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4383	NC_015948	CGG	2	6	186638	186643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210508
4384	NC_015948	CTG	2	6	186666	186671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210508
4385	NC_015948	CTT	2	6	186680	186685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210508
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4388	NC_015948	CAT	2	6	186824	186829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210508
4389	NC_015948	GAG	2	6	186831	186836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210508
4390	NC_015948	TCA	2	6	186862	186867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210508
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4392	NC_015948	TCC	2	6	186934	186939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210508
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4399	NC_015948	ACG	2	6	187258	187263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210508
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4403	NC_015948	CGT	2	6	187466	187471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210508
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4411	NC_015948	CCGGTC	2	12	187693	187704	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344210508
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4422	NC_015948	GCTGG	2	10	188138	188147	0 %	20 %	60 %	20 %	344210509
4423	NC_015948	TCG	2	6	188167	188172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210509
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4429	NC_015948	CTG	2	6	188359	188364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210510
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4433	NC_015948	TCG	2	6	188519	188524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210510
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4435	NC_015948	GAC	2	6	188690	188695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210511
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4438	NC_015948	GGCC	2	8	188791	188798	0 %	0 %	50 %	50 %	344210511
4439	NC_015948	CGC	2	6	188836	188841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210511
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4443	NC_015948	GCTC	2	8	188971	188978	0 %	25 %	25 %	50 %	344210511
4444	NC_015948	CGA	2	6	188986	188991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210511
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4448	NC_015948	CGACG	2	10	189134	189143	20 %	0 %	40 %	40 %	344210511
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4451	NC_015948	TGGC	2	8	189210	189217	0 %	25 %	50 %	25 %	344210511
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4460	NC_015948	TGAC	2	8	189743	189750	25 %	25 %	25 %	25 %	344210512
4461	NC_015948	GTC	2	6	189787	189792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210512
4462	NC_015948	CAT	2	6	189912	189917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210512
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4464	NC_015948	GTG	2	6	189965	189970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210512
4465	NC_015948	CTG	2	6	189982	189987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210512
4466	NC_015948	TCG	2	6	189989	189994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210512
4467	NC_015948	ACG	2	6	190037	190042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210512
4468	NC_015948	CTC	2	6	190118	190123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210513
4469	NC_015948	A	6	6	190178	190183	100 %	0 %	0 %	0 %	344210513
4470	NC_015948	CGA	2	6	190196	190201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210513
4471	NC_015948	AGC	2	6	190207	190212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210513
4472	NC_015948	CGA	2	6	190247	190252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210513
4473	NC_015948	CCG	2	6	190297	190302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210513
4474	NC_015948	CCG	2	6	190348	190353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210513
4475	NC_015948	GC	3	6	190371	190376	0 %	0 %	50 %	50 %	344210513
4476	NC_015948	TCAG	2	8	190414	190421	25 %	25 %	25 %	25 %	344210513
4477	NC_015948	CGA	2	6	190454	190459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210513
4478	NC_015948	AAC	2	6	190474	190479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210513
4479	NC_015948	CCG	2	6	190489	190494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210513
4480	NC_015948	GGCGA	2	10	190519	190528	20 %	0 %	60 %	20 %	344210513
4481	NC_015948	CGG	2	6	190529	190534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210513
4482	NC_015948	CGC	2	6	190554	190559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210513
4483	NC_015948	GTA	2	6	190589	190594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210513
4484	NC_015948	GTCT	2	8	190648	190655	0 %	50 %	25 %	25 %	344210513
4485	NC_015948	TCG	2	6	190726	190731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210513
4486	NC_015948	CGC	2	6	190913	190918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210514
4487	NC_015948	GCC	2	6	190921	190926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210514
4488	NC_015948	GCC	2	6	190930	190935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210514
4489	NC_015948	CG	3	6	190996	191001	0 %	0 %	50 %	50 %	344210514
4490	NC_015948	CGA	2	6	191054	191059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210514
4491	NC_015948	CTC	2	6	191079	191084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210514
4492	NC_015948	CGA	2	6	191096	191101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210514
4493	NC_015948	CGAA	2	8	191104	191111	50 %	0 %	25 %	25 %	344210514
4494	NC_015948	CCT	2	6	191114	191119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210514
4495	NC_015948	GC	3	6	191135	191140	0 %	0 %	50 %	50 %	344210514
4496	NC_015948	CGC	2	6	191187	191192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210514
4497	NC_015948	GCG	2	6	191248	191253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210514
4498	NC_015948	CGG	2	6	191276	191281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210514
4499	NC_015948	CGG	3	9	191288	191296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210514
4500	NC_015948	GTC	2	6	191400	191405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210514

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