MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 67255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015948	GAG	2	6	146902	146907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210462
3502	NC_015948	GC	3	6	146952	146957	0 %	0 %	50 %	50 %	344210462
3503	NC_015948	GAT	2	6	146959	146964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210462
3504	NC_015948	CTGC	2	8	147019	147026	0 %	25 %	25 %	50 %	344210463
3505	NC_015948	ACC	2	6	147027	147032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210463
3506	NC_015948	GGCCGC	2	12	147036	147047	0 %	0 %	50 %	50 %	344210463
3507	NC_015948	GACC	2	8	147218	147225	25 %	0 %	25 %	50 %	344210463
3508	NC_015948	CCG	2	6	147303	147308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210463
3509	NC_015948	GCC	2	6	147339	147344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210463
3510	NC_015948	GCCG	2	8	147360	147367	0 %	0 %	50 %	50 %	344210463
3511	NC_015948	CGT	2	6	147407	147412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210463
3512	NC_015948	CGT	2	6	147474	147479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210463
3513	NC_015948	ATC	2	6	147490	147495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210463
3514	NC_015948	GAT	3	9	147519	147527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210463
3515	NC_015948	GCC	2	6	147529	147534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210463
3516	NC_015948	CGT	2	6	147540	147545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210463
3517	NC_015948	GAG	2	6	147567	147572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210463
3518	NC_015948	TCG	2	6	147616	147621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210463
3519	NC_015948	GCC	2	6	147633	147638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210463
3520	NC_015948	GAC	2	6	147645	147650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210463
3521	NC_015948	GCCG	2	8	147660	147667	0 %	0 %	50 %	50 %	344210463
3522	NC_015948	GCC	2	6	147673	147678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210463
3523	NC_015948	GC	3	6	147697	147702	0 %	0 %	50 %	50 %	344210463
3524	NC_015948	GTA	2	6	147750	147755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210463
3525	NC_015948	GCG	2	6	147778	147783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210463
3526	NC_015948	CGGG	2	8	147833	147840	0 %	0 %	75 %	25 %	344210463
3527	NC_015948	CTCG	2	8	147846	147853	0 %	25 %	25 %	50 %	344210463
3528	NC_015948	GGCC	2	8	147881	147888	0 %	0 %	50 %	50 %	344210463
3529	NC_015948	GAG	2	6	147891	147896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210463
3530	NC_015948	CGA	2	6	147917	147922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210463
3531	NC_015948	CGGT	2	8	148126	148133	0 %	25 %	50 %	25 %	344210464
3532	NC_015948	GT	3	6	148144	148149	0 %	50 %	50 %	0 %	344210464
3533	NC_015948	TCGGCG	2	12	148150	148161	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344210464
3534	NC_015948	TGT	2	6	148241	148246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210464
3535	NC_015948	CGG	2	6	148277	148282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210464
3536	NC_015948	AGC	2	6	148294	148299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210464
3537	NC_015948	CGG	2	6	148371	148376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210464
3538	NC_015948	CGG	2	6	148466	148471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210464
3539	NC_015948	CGG	2	6	148511	148516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210464
3540	NC_015948	CGT	2	6	148548	148553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210464
3541	NC_015948	TCG	2	6	148564	148569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210464
3542	NC_015948	GGA	4	12	148599	148610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210464
3543	NC_015948	TCG	2	6	148636	148641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210464
3544	NC_015948	GAG	2	6	148653	148658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210464
3545	NC_015948	TCG	2	6	148684	148689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210464
3546	NC_015948	TGG	2	6	148738	148743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210464
3547	NC_015948	GTCGGC	2	12	148752	148763	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344210464
3548	NC_015948	CACG	2	8	148790	148797	25 %	0 %	25 %	50 %	344210464
3549	NC_015948	GCC	2	6	148840	148845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210464
3550	NC_015948	TGT	2	6	148859	148864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210464
3551	NC_015948	CGG	2	6	148928	148933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210464
3552	NC_015948	GCC	2	6	148953	148958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210464
3553	NC_015948	CGG	2	6	149152	149157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210465
3554	NC_015948	GACC	2	8	149187	149194	25 %	0 %	25 %	50 %	344210465
3555	NC_015948	CGA	2	6	149218	149223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210465
3556	NC_015948	CGA	2	6	149266	149271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210465
3557	NC_015948	CGG	3	9	149283	149291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210465
3558	NC_015948	GCC	2	6	149297	149302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210465
3559	NC_015948	GTC	2	6	149309	149314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210466
3560	NC_015948	TCG	2	6	149356	149361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210466
3561	NC_015948	GGC	2	6	149369	149374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210466
3562	NC_015948	AGG	2	6	149404	149409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210466
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3564	NC_015948	CTT	2	6	149444	149449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210466
3565	NC_015948	CCCA	2	8	149452	149459	25 %	0 %	0 %	75 %	344210466
3566	NC_015948	CGA	2	6	149471	149476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210466
3567	NC_015948	CGC	2	6	149600	149605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210466
3568	NC_015948	GGT	2	6	149648	149653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210466
3569	NC_015948	CCG	2	6	149662	149667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210466
3570	NC_015948	TTC	2	6	149758	149763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210466
3571	NC_015948	TCC	2	6	149788	149793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210466
3572	NC_015948	GAC	2	6	149823	149828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210466
3573	NC_015948	CTCC	2	8	149861	149868	0 %	25 %	0 %	75 %	344210466
3574	NC_015948	CGA	2	6	149876	149881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210466
3575	NC_015948	GCCCA	2	10	149887	149896	20 %	0 %	20 %	60 %	344210466
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3577	NC_015948	CCG	2	6	149947	149952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210466
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3580	NC_015948	CG	3	6	150025	150030	0 %	0 %	50 %	50 %	344210466
3581	NC_015948	CGA	2	6	150047	150052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210466
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3584	NC_015948	CGCA	2	8	150168	150175	25 %	0 %	25 %	50 %	344210466
3585	NC_015948	GA	3	6	150227	150232	50 %	0 %	50 %	0 %	344210466
3586	NC_015948	CGA	2	6	150242	150247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210466
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3588	NC_015948	CGA	2	6	150412	150417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210467
3589	NC_015948	GCT	2	6	150430	150435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210467
3590	NC_015948	CG	3	6	150448	150453	0 %	0 %	50 %	50 %	344210467
3591	NC_015948	CAT	2	6	150457	150462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210467
3592	NC_015948	CAC	2	6	150472	150477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210467
3593	NC_015948	CCGAC	2	10	150522	150531	20 %	0 %	20 %	60 %	344210467
3594	NC_015948	CCG	2	6	150538	150543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210467
3595	NC_015948	CGAC	2	8	150547	150554	25 %	0 %	25 %	50 %	344210467
3596	NC_015948	GCC	2	6	150560	150565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210467
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3601	NC_015948	CGT	2	6	150803	150808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210468
3602	NC_015948	CT	3	6	150822	150827	0 %	50 %	0 %	50 %	344210468
3603	NC_015948	GCC	2	6	150840	150845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210468
3604	NC_015948	GTC	2	6	150852	150857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210468
3605	NC_015948	TCG	2	6	150872	150877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210468
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3607	NC_015948	CGGCGT	2	12	150974	150985	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344210468
3608	NC_015948	CGCT	2	8	150993	151000	0 %	25 %	25 %	50 %	344210468
3609	NC_015948	GCTCGG	2	12	151022	151033	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344210468
3610	NC_015948	GTC	2	6	151064	151069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210468
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3616	NC_015948	GGGC	2	8	151269	151276	0 %	0 %	75 %	25 %	344210469
3617	NC_015948	TCG	2	6	151353	151358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210469
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3621	NC_015948	CTT	2	6	151491	151496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210470
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3741	NC_015948	CGA	2	6	156622	156627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210474
3742	NC_015948	GAC	2	6	156707	156712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210474
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3745	NC_015948	GAC	2	6	156836	156841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210474
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3979	NC_015948	CGT	2	6	167658	167663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210487
3980	NC_015948	TGCGCT	2	12	167664	167675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210487
3981	NC_015948	GC	3	6	167678	167683	0 %	0 %	50 %	50 %	344210487
3982	NC_015948	GAG	2	6	167722	167727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210487
3983	NC_015948	CGCA	2	8	167737	167744	25 %	0 %	25 %	50 %	344210487
3984	NC_015948	GACG	2	8	167760	167767	25 %	0 %	50 %	25 %	344210487
3985	NC_015948	CCGG	2	8	167813	167820	0 %	0 %	50 %	50 %	344210487
3986	NC_015948	AGC	2	6	167865	167870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210488
3987	NC_015948	CG	3	6	167899	167904	0 %	0 %	50 %	50 %	344210488
3988	NC_015948	GGC	2	6	167946	167951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210488
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3990	NC_015948	TCG	2	6	167998	168003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210488
3991	NC_015948	CGG	2	6	168141	168146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210488
3992	NC_015948	CGT	2	6	168171	168176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210488
3993	NC_015948	TCG	2	6	168193	168198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210488
3994	NC_015948	GTTC	2	8	168212	168219	0 %	50 %	25 %	25 %	344210488
3995	NC_015948	CGT	2	6	168224	168229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210488
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3999	NC_015948	GACG	2	8	168399	168406	25 %	0 %	50 %	25 %	344210488
4000	NC_015948	CG	3	6	168405	168410	0 %	0 %	50 %	50 %	344210488

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