MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 67255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015948	CGA	2	6	106448	106453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210418
2502	NC_015948	ACCC	2	8	106461	106468	25 %	0 %	0 %	75 %	344210418
2503	NC_015948	CCG	2	6	106485	106490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210418
2504	NC_015948	GAC	2	6	106506	106511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210418
2505	NC_015948	GAC	2	6	106536	106541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210418
2506	NC_015948	CGC	2	6	106542	106547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210418
2507	NC_015948	GCCC	2	8	106549	106556	0 %	0 %	25 %	75 %	344210418
2508	NC_015948	GAC	2	6	106617	106622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210418
2509	NC_015948	GACG	2	8	106631	106638	25 %	0 %	50 %	25 %	344210418
2510	NC_015948	CGT	2	6	106644	106649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210418
2511	NC_015948	GAC	3	9	106689	106697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210418
2512	NC_015948	GAC	2	6	106716	106721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210418
2513	NC_015948	AGACG	2	10	106745	106754	40 %	0 %	40 %	20 %	344210418
2514	NC_015948	AGA	2	6	106772	106777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210418
2515	NC_015948	GAC	2	6	106788	106793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210418
2516	NC_015948	GAC	3	9	106800	106808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210418
2517	NC_015948	CGA	3	9	106817	106825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210418
2518	NC_015948	GAC	2	6	106827	106832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210418
2519	NC_015948	GAC	2	6	106851	106856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210418
2520	NC_015948	CCG	2	6	106863	106868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210418
2521	NC_015948	GCG	2	6	107028	107033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210419
2522	NC_015948	CCG	2	6	107112	107117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210419
2523	NC_015948	ACG	3	9	107187	107195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210419
2524	NC_015948	GCG	2	6	107244	107249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210419
2525	NC_015948	CGA	3	9	107251	107259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210419
2526	NC_015948	TAC	2	6	107264	107269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210419
2527	NC_015948	CGA	2	6	107314	107319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210419
2528	NC_015948	TCG	2	6	107331	107336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210419
2529	NC_015948	ATC	2	6	107375	107380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210419
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2531	NC_015948	GC	3	6	107419	107424	0 %	0 %	50 %	50 %	344210419
2532	NC_015948	GAC	2	6	107542	107547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210419
2533	NC_015948	TC	3	6	107551	107556	0 %	50 %	0 %	50 %	344210419
2534	NC_015948	CGT	3	9	107572	107580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210419
2535	NC_015948	AAAG	2	8	107614	107621	75 %	0 %	25 %	0 %	344210419
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2537	NC_015948	ACG	2	6	107697	107702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210419
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2539	NC_015948	TCA	2	6	107742	107747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210419
2540	NC_015948	ACC	2	6	107750	107755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210419
2541	NC_015948	GAG	2	6	107777	107782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210419
2542	NC_015948	CGC	2	6	107869	107874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210419
2543	NC_015948	GCC	3	9	107925	107933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210419
2544	NC_015948	CGA	2	6	108061	108066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210419
2545	NC_015948	TCGACT	2	12	108144	108155	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	344210419
2546	NC_015948	CTGA	2	8	108158	108165	25 %	25 %	25 %	25 %	344210419
2547	NC_015948	GCA	2	6	108193	108198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210419
2548	NC_015948	ACG	2	6	108627	108632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210420
2549	NC_015948	AAG	2	6	108677	108682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210420
2550	NC_015948	GACC	2	8	108696	108703	25 %	0 %	25 %	50 %	344210420
2551	NC_015948	GTCC	2	8	108748	108755	0 %	25 %	25 %	50 %	344210420
2552	NC_015948	TCG	2	6	108777	108782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210420
2553	NC_015948	CGA	2	6	108835	108840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210420
2554	NC_015948	TCG	2	6	108864	108869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210420
2555	NC_015948	CGT	2	6	108916	108921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210420
2556	NC_015948	ACC	2	6	108932	108937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210420
2557	NC_015948	CGA	2	6	109126	109131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210421
2558	NC_015948	CGT	2	6	109201	109206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210421
2559	NC_015948	CT	3	6	109230	109235	0 %	50 %	0 %	50 %	344210421
2560	NC_015948	TCGTGC	2	12	109248	109259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210421
2561	NC_015948	CACG	2	8	109568	109575	25 %	0 %	25 %	50 %	344210422
2562	NC_015948	CGG	2	6	109617	109622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210422
2563	NC_015948	TCG	2	6	109638	109643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210422
2564	NC_015948	GC	5	10	109664	109673	0 %	0 %	50 %	50 %	344210422
2565	NC_015948	ACGG	2	8	109697	109704	25 %	0 %	50 %	25 %	344210422
2566	NC_015948	CGG	2	6	109721	109726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210422
2567	NC_015948	CTG	2	6	109739	109744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210422
2568	NC_015948	TCG	2	6	109776	109781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210422
2569	NC_015948	GGC	2	6	109825	109830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210422
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2571	NC_015948	CGA	3	9	109857	109865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210422
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2579	NC_015948	CATCGG	2	12	110332	110343	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344210422
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2582	NC_015948	GAG	2	6	110396	110401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210422
2583	NC_015948	GAC	2	6	110507	110512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210422
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2591	NC_015948	ACG	2	6	110672	110677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210423
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2600	NC_015948	GGAA	2	8	111245	111252	50 %	0 %	50 %	0 %	344210424
2601	NC_015948	TCG	2	6	111287	111292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210424
2602	NC_015948	TCG	2	6	111380	111385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210424
2603	NC_015948	CGA	2	6	111411	111416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210424
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2606	NC_015948	CG	3	6	111523	111528	0 %	0 %	50 %	50 %	344210424
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2611	NC_015948	CGT	2	6	111717	111722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210425
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2613	NC_015948	AGTC	2	8	111774	111781	25 %	25 %	25 %	25 %	344210425
2614	NC_015948	CCTTCT	2	12	111795	111806	0 %	50 %	0 %	50 %	344210425
2615	NC_015948	GCC	2	6	111820	111825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210425
2616	NC_015948	GTCG	2	8	111826	111833	0 %	25 %	50 %	25 %	344210425
2617	NC_015948	CCG	2	6	111843	111848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210425
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2619	NC_015948	CCT	2	6	111939	111944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210425
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2621	NC_015948	TCG	2	6	112088	112093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210425
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2722	NC_015948	CTG	2	6	115967	115972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210430
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2725	NC_015948	GC	3	6	116077	116082	0 %	0 %	50 %	50 %	344210430
2726	NC_015948	TCA	2	6	116119	116124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210430
2727	NC_015948	ACGT	2	8	116127	116134	25 %	25 %	25 %	25 %	344210430
2728	NC_015948	GCC	2	6	116145	116150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210430
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2731	NC_015948	ATC	2	6	116274	116279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210430
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2735	NC_015948	CGG	2	6	116502	116507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210430
2736	NC_015948	ATC	2	6	116514	116519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210430
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2739	NC_015948	TGT	2	6	116688	116693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210430
2740	NC_015948	GCG	2	6	116694	116699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210430
2741	NC_015948	GTC	2	6	116721	116726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210430
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2743	NC_015948	GAC	2	6	117177	117182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210431
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2858	NC_015948	GACG	2	8	121565	121572	25 %	0 %	50 %	25 %	344210435
2859	NC_015948	GCCG	2	8	121595	121602	0 %	0 %	50 %	50 %	344210435
2860	NC_015948	CACGC	2	10	121629	121638	20 %	0 %	20 %	60 %	344210435
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2864	NC_015948	CCGA	2	8	121716	121723	25 %	0 %	25 %	50 %	344210435
2865	NC_015948	CGG	2	6	121757	121762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210435
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2887	NC_015948	TCA	2	6	122350	122355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210435
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2978	NC_015948	GC	3	6	125793	125798	0 %	0 %	50 %	50 %	344210438
2979	NC_015948	CGA	2	6	125810	125815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210438
2980	NC_015948	CGT	2	6	125846	125851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210438
2981	NC_015948	CCG	2	6	125875	125880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210438
2982	NC_015948	CG	4	8	125879	125886	0 %	0 %	50 %	50 %	344210438
2983	NC_015948	GC	3	6	125891	125896	0 %	0 %	50 %	50 %	344210438
2984	NC_015948	CCG	2	6	125900	125905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210438
2985	NC_015948	CGA	2	6	125921	125926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210438
2986	NC_015948	CGACG	2	10	125963	125972	20 %	0 %	40 %	40 %	344210438
2987	NC_015948	CGC	2	6	126008	126013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210438
2988	NC_015948	GGGC	2	8	126068	126075	0 %	0 %	75 %	25 %	344210438
2989	NC_015948	CGC	2	6	126079	126084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210438
2990	NC_015948	GCG	2	6	126163	126168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210438
2991	NC_015948	GAC	2	6	126203	126208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210438
2992	NC_015948	CGG	2	6	126235	126240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210438
2993	NC_015948	TCG	2	6	126346	126351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210438
2994	NC_015948	GACGA	2	10	126376	126385	40 %	0 %	40 %	20 %	344210438
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2996	NC_015948	CGA	2	6	126446	126451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210438
2997	NC_015948	GCC	2	6	126573	126578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210438
2998	NC_015948	TCG	2	6	126691	126696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210438
2999	NC_015948	CGA	2	6	126707	126712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210438
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