MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 67255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_015948	CGA	2	6	653053	653058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210978
15003	NC_015948	CGA	2	6	653065	653070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210978
15004	NC_015948	CGA	2	6	653074	653079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210978
15005	NC_015948	TCG	2	6	653094	653099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210978
15006	NC_015948	TCG	2	6	653253	653258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210978
15007	NC_015948	CGGC	2	8	653265	653272	0 %	0 %	50 %	50 %	344210978
15008	NC_015948	CTC	2	6	653291	653296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210978
15009	NC_015948	GAC	3	9	653302	653310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210978
15010	NC_015948	GCT	2	6	653317	653322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210978
15011	NC_015948	TCC	2	6	653349	653354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210978
15012	NC_015948	CGCT	2	8	653379	653386	0 %	25 %	25 %	50 %	344210978
15013	NC_015948	CGTCGA	2	12	653422	653433	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344210978
15014	NC_015948	GGC	2	6	653575	653580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210979
15015	NC_015948	GC	3	6	653579	653584	0 %	0 %	50 %	50 %	344210979
15016	NC_015948	GGC	2	6	653678	653683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210979
15017	NC_015948	GACGG	2	10	653684	653693	20 %	0 %	60 %	20 %	344210979
15018	NC_015948	CGA	2	6	653716	653721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210979
15019	NC_015948	CCGG	2	8	653759	653766	0 %	0 %	50 %	50 %	344210979
15020	NC_015948	CCT	2	6	653776	653781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210979
15021	NC_015948	CGA	3	9	653869	653877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210979
15022	NC_015948	CCG	2	6	653910	653915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210979
15023	NC_015948	AGG	2	6	653988	653993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210979
15024	NC_015948	TGG	2	6	654081	654086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210979
15025	NC_015948	TCG	2	6	654102	654107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210979
15026	NC_015948	GCAA	2	8	654118	654125	50 %	0 %	25 %	25 %	344210979
15027	NC_015948	CTG	2	6	654140	654145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210979
15028	NC_015948	TCG	2	6	654156	654161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210979
15029	NC_015948	TCG	2	6	654183	654188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210979
15030	NC_015948	GCG	2	6	654267	654272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210979
15031	NC_015948	CGA	2	6	654277	654282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210979
15032	NC_015948	GCAC	2	8	654312	654319	25 %	0 %	25 %	50 %	344210979
15033	NC_015948	GCTGTC	2	12	654325	654336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210979
15034	NC_015948	GC	3	6	654346	654351	0 %	0 %	50 %	50 %	344210979
15035	NC_015948	GGGC	2	8	654369	654376	0 %	0 %	75 %	25 %	344210979
15036	NC_015948	TCG	2	6	654528	654533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210980
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15039	NC_015948	TCG	2	6	654597	654602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210980
15040	NC_015948	CGG	2	6	654669	654674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210980
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15043	NC_015948	GTC	2	6	654728	654733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210980
15044	NC_015948	CTGG	2	8	654736	654743	0 %	25 %	50 %	25 %	344210980
15045	NC_015948	GGC	2	6	654754	654759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210980
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15048	NC_015948	CTG	2	6	654785	654790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210980
15049	NC_015948	GCC	2	6	654791	654796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210980
15050	NC_015948	ACG	2	6	654806	654811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210980
15051	NC_015948	CAA	2	6	654832	654837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210980
15052	NC_015948	GGT	2	6	654844	654849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210980
15053	NC_015948	CTG	2	6	654911	654916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210980
15054	NC_015948	CT	3	6	654923	654928	0 %	50 %	0 %	50 %	344210980
15055	NC_015948	CGC	2	6	654931	654936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210980
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15057	NC_015948	CGA	2	6	654972	654977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210980
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15059	NC_015948	CGT	2	6	655051	655056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210980
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15061	NC_015948	GTCG	2	8	655091	655098	0 %	25 %	50 %	25 %	344210980
15062	NC_015948	GGA	2	6	655141	655146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210980
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15091	NC_015948	TCC	2	6	656088	656093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210980
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15118	NC_015948	GC	3	6	657051	657056	0 %	0 %	50 %	50 %	344210981
15119	NC_015948	GGC	2	6	657089	657094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210981
15120	NC_015948	TCT	2	6	657116	657121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210981
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15230	NC_015948	TCG	3	9	661340	661348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210987
15231	NC_015948	TGC	2	6	661579	661584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210988
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15234	NC_015948	GCG	2	6	661863	661868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210988
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15236	NC_015948	TCG	2	6	661936	661941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210988
15237	NC_015948	CCG	2	6	661942	661947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210988
15238	NC_015948	GTC	2	6	661959	661964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210988
15239	NC_015948	CTG	2	6	661983	661988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210988
15240	NC_015948	GCT	2	6	662060	662065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210988
15241	NC_015948	GTC	2	6	662106	662111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210988
15242	NC_015948	TAC	2	6	662115	662120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210988
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15245	NC_015948	TCG	2	6	662227	662232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210988
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15247	NC_015948	GCC	2	6	662292	662297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210988
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15263	NC_015948	ACC	2	6	663162	663167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210989
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15273	NC_015948	CAG	2	6	663663	663668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210990
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15342	NC_015948	GT	3	6	666295	666300	0 %	50 %	50 %	0 %	344210992
15343	NC_015948	CCA	2	6	666316	666321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210992
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15347	NC_015948	GAT	2	6	666868	666873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210993
15348	NC_015948	GGCGT	2	10	666875	666884	0 %	20 %	60 %	20 %	344210993
15349	NC_015948	TTTTGC	2	12	666906	666917	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	344210993
15350	NC_015948	TCA	2	6	666933	666938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210993
15351	NC_015948	TCGC	2	8	667030	667037	0 %	25 %	25 %	50 %	344210993
15352	NC_015948	CGC	2	6	667101	667106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210994
15353	NC_015948	GTC	2	6	667130	667135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210994
15354	NC_015948	CCGG	2	8	667174	667181	0 %	0 %	50 %	50 %	344210994
15355	NC_015948	TCG	2	6	667203	667208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210994
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15432	NC_015948	GTC	2	6	670653	670658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210997
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15448	NC_015948	CTGG	2	8	671460	671467	0 %	25 %	50 %	25 %	344210998
15449	NC_015948	GTC	2	6	671702	671707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210999
15450	NC_015948	GAC	2	6	671734	671739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210999
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15452	NC_015948	CAG	2	6	671852	671857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210999
15453	NC_015948	CTCGAC	2	12	671915	671926	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	344211000
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15455	NC_015948	GCCGC	2	10	672004	672013	0 %	0 %	40 %	60 %	344211000
15456	NC_015948	CGA	2	6	672019	672024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344211000
15457	NC_015948	CGG	2	6	672033	672038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344211000
15458	NC_015948	CTG	2	6	672050	672055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344211000
15459	NC_015948	GTC	2	6	672089	672094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344211000
15460	NC_015948	CGGG	2	8	672099	672106	0 %	0 %	75 %	25 %	344211000
15461	NC_015948	CGA	2	6	672226	672231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344211000
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15464	NC_015948	CGA	2	6	672321	672326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344211000
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15467	NC_015948	TCG	2	6	672426	672431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344211000
15468	NC_015948	TTC	2	6	672461	672466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344211000
15469	NC_015948	CGGG	2	8	672484	672491	0 %	0 %	75 %	25 %	344211000
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