MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 67255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015948	GTC	2	6	43173	43178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210349
1002	NC_015948	TCG	2	6	43235	43240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210349
1003	NC_015948	TCG	2	6	43291	43296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210349
1004	NC_015948	CGC	2	6	43302	43307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210349
1005	NC_015948	TCG	2	6	43393	43398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210349
1006	NC_015948	GC	3	6	43456	43461	0 %	0 %	50 %	50 %	344210349
1007	NC_015948	GCTG	2	8	43472	43479	0 %	25 %	50 %	25 %	344210349
1008	NC_015948	TCT	2	6	43504	43509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210349
1009	NC_015948	CCGC	2	8	43535	43542	0 %	0 %	25 %	75 %	344210349
1010	NC_015948	TCC	2	6	43567	43572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210349
1011	NC_015948	GCCG	2	8	43628	43635	0 %	0 %	50 %	50 %	344210349
1012	NC_015948	TCG	2	6	43639	43644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210349
1013	NC_015948	TCG	2	6	43652	43657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210349
1014	NC_015948	GCT	2	6	43709	43714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210349
1015	NC_015948	AACGA	2	10	43762	43771	60 %	0 %	20 %	20 %	344210349
1016	NC_015948	CAG	2	6	43776	43781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210349
1017	NC_015948	GACC	2	8	43802	43809	25 %	0 %	25 %	50 %	344210349
1018	NC_015948	TGG	2	6	43865	43870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210349
1019	NC_015948	TGC	2	6	43923	43928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210349
1020	NC_015948	TCGCG	2	10	43937	43946	0 %	20 %	40 %	40 %	344210349
1021	NC_015948	CGC	2	6	43950	43955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210349
1022	NC_015948	TCG	2	6	44011	44016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210349
1023	NC_015948	GAC	3	9	44091	44099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210349
1024	NC_015948	TCG	2	6	44152	44157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210349
1025	NC_015948	CGAC	2	8	44178	44185	25 %	0 %	25 %	50 %	344210349
1026	NC_015948	TGT	2	6	44204	44209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210349
1027	NC_015948	CGG	2	6	44231	44236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210349
1028	NC_015948	ACA	2	6	44338	44343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210349
1029	NC_015948	TCG	2	6	44344	44349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210349
1030	NC_015948	CGC	2	6	44379	44384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210349
1031	NC_015948	GC	3	6	44386	44391	0 %	0 %	50 %	50 %	344210349
1032	NC_015948	GTGC	2	8	44433	44440	0 %	25 %	50 %	25 %	344210349
1033	NC_015948	C	6	6	44470	44475	0 %	0 %	0 %	100 %	344210349
1034	NC_015948	GCTG	2	8	44480	44487	0 %	25 %	50 %	25 %	344210349
1035	NC_015948	GTC	2	6	44506	44511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210349
1036	NC_015948	GC	3	6	44648	44653	0 %	0 %	50 %	50 %	344210349
1037	NC_015948	CCGC	2	8	44674	44681	0 %	0 %	25 %	75 %	344210349
1038	NC_015948	CAC	2	6	44689	44694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210350
1039	NC_015948	CGG	2	6	44731	44736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210350
1040	NC_015948	TCG	2	6	44775	44780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210350
1041	NC_015948	GAGG	2	8	44795	44802	25 %	0 %	75 %	0 %	344210350
1042	NC_015948	GAC	2	6	44810	44815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210350
1043	NC_015948	GA	4	8	44840	44847	50 %	0 %	50 %	0 %	344210350
1044	NC_015948	CCGTCG	2	12	44878	44889	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344210350
1045	NC_015948	CGT	2	6	44893	44898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210350
1046	NC_015948	ACG	2	6	44937	44942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210350
1047	NC_015948	TCG	2	6	45072	45077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210350
1048	NC_015948	CGT	2	6	45112	45117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210350
1049	NC_015948	GCC	2	6	45221	45226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210350
1050	NC_015948	GTC	2	6	45240	45245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210350
1051	NC_015948	TCG	2	6	45256	45261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210350
1052	NC_015948	AGC	2	6	45294	45299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210350
1053	NC_015948	CGA	2	6	45382	45387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210350
1054	NC_015948	CAG	2	6	45456	45461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210350
1055	NC_015948	TGG	2	6	45473	45478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210350
1056	NC_015948	TCG	2	6	45481	45486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210350
1057	NC_015948	CAT	2	6	45559	45564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210350
1058	NC_015948	CG	4	8	45570	45577	0 %	0 %	50 %	50 %	344210350
1059	NC_015948	CGC	2	6	45593	45598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210350
1060	NC_015948	GCCC	2	8	45622	45629	0 %	0 %	25 %	75 %	344210350
1061	NC_015948	CGC	3	9	45653	45661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210350
1062	NC_015948	GCTG	2	8	45694	45701	0 %	25 %	50 %	25 %	344210350
1063	NC_015948	CTCC	2	8	45723	45730	0 %	25 %	0 %	75 %	344210350
1064	NC_015948	GAG	2	6	45794	45799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210350
1065	NC_015948	T	6	6	45814	45819	0 %	100 %	0 %	0 %	344210350
1066	NC_015948	CCG	2	6	45993	45998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210351
1067	NC_015948	GAG	2	6	46025	46030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210351
1068	NC_015948	ACT	2	6	46041	46046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210351
1069	NC_015948	CGA	2	6	46147	46152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210351
1070	NC_015948	GAG	2	6	46190	46195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210351
1071	NC_015948	CGTCCG	2	12	46246	46257	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344210351
1072	NC_015948	GGA	2	6	46273	46278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210351
1073	NC_015948	TCG	2	6	46314	46319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210351
1074	NC_015948	CAT	2	6	46330	46335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210351
1075	NC_015948	CGAC	2	8	46344	46351	25 %	0 %	25 %	50 %	344210351
1076	NC_015948	GGC	2	6	46372	46377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210351
1077	NC_015948	CCG	2	6	46422	46427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210351
1078	NC_015948	GAC	2	6	46595	46600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210351
1079	NC_015948	CAACGA	2	12	46669	46680	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	344210351
1080	NC_015948	AAG	2	6	46772	46777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210351
1081	NC_015948	TCG	2	6	46782	46787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210351
1082	NC_015948	GAGAAG	2	12	46856	46867	50 %	0 %	50 %	0 %	344210351
1083	NC_015948	GAT	2	6	46873	46878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210351
1084	NC_015948	CGGGGA	2	12	46965	46976	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	344210351
1085	NC_015948	GAT	2	6	47057	47062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210351
1086	NC_015948	CGA	2	6	47074	47079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210351
1087	NC_015948	AG	3	6	47293	47298	50 %	0 %	50 %	0 %	344210351
1088	NC_015948	AC	3	6	47303	47308	50 %	0 %	0 %	50 %	344210351
1089	NC_015948	GACCTT	2	12	47393	47404	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	344210351
1090	NC_015948	TTG	2	6	47448	47453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210351
1091	NC_015948	ACGGA	2	10	47570	47579	40 %	0 %	40 %	20 %	344210351
1092	NC_015948	ACC	2	6	47597	47602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210351
1093	NC_015948	TGT	2	6	47610	47615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210351
1094	NC_015948	CGG	2	6	47676	47681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210351
1095	NC_015948	GAGGGA	2	12	47753	47764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210351
1096	NC_015948	GCT	2	6	47815	47820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210351
1097	NC_015948	CA	3	6	47845	47850	50 %	0 %	0 %	50 %	344210351
1098	NC_015948	AAC	2	6	47879	47884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210351
1099	NC_015948	TCA	2	6	47946	47951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210351
1100	NC_015948	AC	3	6	48198	48203	50 %	0 %	0 %	50 %	344210351
1101	NC_015948	CGG	3	9	48229	48237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210351
1102	NC_015948	TCAC	2	8	48266	48273	25 %	25 %	0 %	50 %	344210351
1103	NC_015948	TCG	2	6	48279	48284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210351
1104	NC_015948	ATCGA	2	10	48308	48317	40 %	20 %	20 %	20 %	344210351
1105	NC_015948	ACG	2	6	48333	48338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210351
1106	NC_015948	AC	3	6	48371	48376	50 %	0 %	0 %	50 %	344210351
1107	NC_015948	AT	3	6	48424	48429	50 %	50 %	0 %	0 %	344210351
1108	NC_015948	CAC	2	6	48441	48446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210351
1109	NC_015948	GTC	2	6	48472	48477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210351
1110	NC_015948	GCC	2	6	48497	48502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210351
1111	NC_015948	CGA	2	6	48508	48513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210351
1112	NC_015948	CAG	2	6	48527	48532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210351
1113	NC_015948	GC	3	6	48549	48554	0 %	0 %	50 %	50 %	344210351
1114	NC_015948	CGC	2	6	48577	48582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210351
1115	NC_015948	CGA	2	6	48586	48591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210351
1116	NC_015948	CAG	2	6	48644	48649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210351
1117	NC_015948	GCT	2	6	48703	48708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210351
1118	NC_015948	CGA	2	6	48829	48834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210351
1119	NC_015948	CAT	2	6	48862	48867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210351
1120	NC_015948	CGGA	2	8	48902	48909	25 %	0 %	50 %	25 %	344210351
1121	NC_015948	GAG	3	9	48932	48940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210351
1122	NC_015948	GAG	2	6	48956	48961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210351
1123	NC_015948	CCT	2	6	48985	48990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210351
1124	NC_015948	CGA	2	6	49029	49034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210351
1125	NC_015948	GAG	2	6	49040	49045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210351
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1128	NC_015948	CGA	2	6	49192	49197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210351
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1130	NC_015948	ACT	2	6	49230	49235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210351
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1145	NC_015948	TCG	2	6	49964	49969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210353
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1240	NC_015948	CT	3	6	53936	53941	0 %	50 %	0 %	50 %	344210358
1241	NC_015948	GCT	2	6	54106	54111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210358
1242	NC_015948	AACG	2	8	54433	54440	50 %	0 %	25 %	25 %	344210359
1243	NC_015948	TCG	2	6	54509	54514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210359
1244	NC_015948	TGGAGC	2	12	54518	54529	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	344210359
1245	NC_015948	GGC	2	6	54669	54674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210359
1246	NC_015948	CCGC	2	8	54769	54776	0 %	0 %	25 %	75 %	344210359
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1248	NC_015948	TCCG	2	8	54853	54860	0 %	25 %	25 %	50 %	344210359
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1366	NC_015948	GTAGTG	2	12	59700	59711	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	344210364
1367	NC_015948	ATA	2	6	59806	59811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344210364
1368	NC_015948	TCG	2	6	59812	59817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210364
1369	NC_015948	CGT	2	6	59828	59833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210364
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1371	NC_015948	GCG	2	6	60018	60023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210365
1372	NC_015948	ACG	2	6	60030	60035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210365
1373	NC_015948	GAG	2	6	60068	60073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210365
1374	NC_015948	GTCGGT	2	12	60098	60109	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	344210365
1375	NC_015948	CGT	2	6	60130	60135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210365
1376	NC_015948	ATC	2	6	60162	60167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210365
1377	NC_015948	CGA	2	6	60206	60211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210365
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1385	NC_015948	CGA	2	6	60601	60606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210366
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1491	NC_015948	CGC	3	9	65313	65321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210369
1492	NC_015948	GCG	2	6	65351	65356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210369
1493	NC_015948	CGG	2	6	65477	65482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210369
1494	NC_015948	CGCTCG	2	12	65486	65497	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344210369
1495	NC_015948	CG	3	6	65510	65515	0 %	0 %	50 %	50 %	344210369
1496	NC_015948	GCC	2	6	65521	65526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210369
1497	NC_015948	CAG	2	6	65533	65538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210369
1498	NC_015948	TCG	2	6	65721	65726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210370
1499	NC_015948	CTG	2	6	65792	65797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210370
1500	NC_015948	CGC	2	6	65818	65823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210370

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