MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 67255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_015948	ACG	2	6	610232	610237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210933
14002	NC_015948	CGC	2	6	610244	610249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210933
14003	NC_015948	CTC	2	6	610251	610256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210933
14004	NC_015948	GTC	2	6	610272	610277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210933
14005	NC_015948	TCGG	2	8	610279	610286	0 %	25 %	50 %	25 %	344210933
14006	NC_015948	TCG	2	6	610288	610293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210933
14007	NC_015948	CGG	2	6	610364	610369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210933
14008	NC_015948	CCG	2	6	610370	610375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210933
14009	NC_015948	TCG	2	6	610417	610422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210933
14010	NC_015948	TCG	2	6	610543	610548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210933
14011	NC_015948	CGA	2	6	610556	610561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210933
14012	NC_015948	CCG	2	6	610566	610571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210933
14013	NC_015948	GCG	2	6	610584	610589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210933
14014	NC_015948	TGT	2	6	610611	610616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210933
14015	NC_015948	GC	3	6	610643	610648	0 %	0 %	50 %	50 %	344210933
14016	NC_015948	CGA	2	6	610664	610669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210933
14017	NC_015948	GAA	2	6	610775	610780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210934
14018	NC_015948	GGC	2	6	610789	610794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210934
14019	NC_015948	CAG	2	6	610865	610870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210934
14020	NC_015948	GAG	2	6	610970	610975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210934
14021	NC_015948	GAG	2	6	611015	611020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210934
14022	NC_015948	GC	3	6	611030	611035	0 %	0 %	50 %	50 %	344210934
14023	NC_015948	ACG	2	6	611037	611042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210934
14024	NC_015948	CAAT	2	8	611142	611149	50 %	25 %	0 %	25 %	344210935
14025	NC_015948	GCT	2	6	611163	611168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210935
14026	NC_015948	CGCTCG	2	12	611176	611187	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344210935
14027	NC_015948	CAG	2	6	611214	611219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210935
14028	NC_015948	CCGA	2	8	611253	611260	25 %	0 %	25 %	50 %	344210935
14029	NC_015948	CCG	2	6	611274	611279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210935
14030	NC_015948	CGA	2	6	611288	611293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210935
14031	NC_015948	GTG	2	6	611298	611303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210935
14032	NC_015948	CG	3	6	611327	611332	0 %	0 %	50 %	50 %	344210935
14033	NC_015948	CGA	2	6	611341	611346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210935
14034	NC_015948	CGG	2	6	611403	611408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210935
14035	NC_015948	CA	3	6	611415	611420	50 %	0 %	0 %	50 %	344210935
14036	NC_015948	GAC	2	6	611441	611446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210935
14037	NC_015948	TCG	2	6	611527	611532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210935
14038	NC_015948	ACG	2	6	611542	611547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210935
14039	NC_015948	CGA	2	6	611588	611593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210935
14040	NC_015948	GCG	2	6	611618	611623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210935
14041	NC_015948	GAT	2	6	611624	611629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210935
14042	NC_015948	TC	3	6	611654	611659	0 %	50 %	0 %	50 %	344210935
14043	NC_015948	CGG	2	6	611678	611683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210935
14044	NC_015948	CGT	2	6	611684	611689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210935
14045	NC_015948	TCG	2	6	611692	611697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210935
14046	NC_015948	GTCA	2	8	611778	611785	25 %	25 %	25 %	25 %	344210935
14047	NC_015948	CAG	2	6	611838	611843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210935
14048	NC_015948	CGG	2	6	611993	611998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210936
14049	NC_015948	AGG	2	6	612023	612028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210936
14050	NC_015948	AT	3	6	612038	612043	50 %	50 %	0 %	0 %	344210936
14051	NC_015948	GCC	2	6	612070	612075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210936
14052	NC_015948	CTC	2	6	612111	612116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210936
14053	NC_015948	GA	3	6	612146	612151	50 %	0 %	50 %	0 %	344210936
14054	NC_015948	CGGGG	2	10	612327	612336	0 %	0 %	80 %	20 %	344210937
14055	NC_015948	TCC	2	6	612341	612346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210937
14056	NC_015948	GCT	2	6	612411	612416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210937
14057	NC_015948	TCG	2	6	612443	612448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210937
14058	NC_015948	CGC	2	6	612458	612463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210937
14059	NC_015948	CGA	2	6	612661	612666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210938
14060	NC_015948	TGG	2	6	612685	612690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210938
14061	NC_015948	TTG	2	6	612696	612701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210938
14062	NC_015948	GAG	2	6	612744	612749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210938
14063	NC_015948	ACGA	2	8	612770	612777	50 %	0 %	25 %	25 %	344210938
14064	NC_015948	GA	3	6	612825	612830	50 %	0 %	50 %	0 %	344210938
14065	NC_015948	ATC	2	6	612831	612836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210938
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14067	NC_015948	CCG	2	6	612945	612950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210938
14068	NC_015948	CGG	2	6	612961	612966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210938
14069	NC_015948	TCG	2	6	612997	613002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210938
14070	NC_015948	CGT	2	6	613009	613014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210938
14071	NC_015948	TCG	2	6	613017	613022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210938
14072	NC_015948	GCT	2	6	613036	613041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210938
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14079	NC_015948	CGT	2	6	613330	613335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210938
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14084	NC_015948	CGT	2	6	613589	613594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210938
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14089	NC_015948	GAT	2	6	613793	613798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210938
14090	NC_015948	GAT	2	6	613802	613807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210938
14091	NC_015948	TCG	2	6	613830	613835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210938
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14100	NC_015948	ATCCG	2	10	614195	614204	20 %	20 %	20 %	40 %	344210939
14101	NC_015948	TGA	2	6	614269	614274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210939
14102	NC_015948	CGA	2	6	614276	614281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210939
14103	NC_015948	GGTCG	2	10	614283	614292	0 %	20 %	60 %	20 %	344210939
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14106	NC_015948	CAC	2	6	614359	614364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210939
14107	NC_015948	GGCA	2	8	614402	614409	25 %	0 %	50 %	25 %	344210939
14108	NC_015948	CCT	2	6	614475	614480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210939
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14110	NC_015948	CGAC	2	8	614554	614561	25 %	0 %	25 %	50 %	344210939
14111	NC_015948	CGG	2	6	614575	614580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210939
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14113	NC_015948	GGTCG	2	10	614616	614625	0 %	20 %	60 %	20 %	344210939
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14235	NC_015948	TCGG	2	8	619835	619842	0 %	25 %	50 %	25 %	344210946
14236	NC_015948	CGA	2	6	619848	619853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210946
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14353	NC_015948	CGA	2	6	625085	625090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210953
14354	NC_015948	TCG	2	6	625115	625120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210953
14355	NC_015948	GGC	2	6	625192	625197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210953
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14357	NC_015948	CGT	3	9	625280	625288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210953
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14359	NC_015948	GCT	2	6	625308	625313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210953
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14470	NC_015948	GCT	2	6	629811	629816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210956
14471	NC_015948	CGA	2	6	629826	629831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210956
14472	NC_015948	GCG	2	6	629878	629883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210956
14473	NC_015948	CGA	2	6	629922	629927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210956
14474	NC_015948	GGC	2	6	629967	629972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210956
14475	NC_015948	GCG	2	6	630012	630017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210956
14476	NC_015948	GACG	2	8	630057	630064	25 %	0 %	50 %	25 %	344210956
14477	NC_015948	CTG	2	6	630080	630085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210956
14478	NC_015948	GCT	2	6	630118	630123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210956
14479	NC_015948	GGC	2	6	630144	630149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210956
14480	NC_015948	GATGCC	2	12	630172	630183	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344210956
14481	NC_015948	CGAC	2	8	630233	630240	25 %	0 %	25 %	50 %	344210956
14482	NC_015948	CCG	2	6	630296	630301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210956
14483	NC_015948	GGC	2	6	630312	630317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210956
14484	NC_015948	CTG	3	9	630323	630331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210956
14485	NC_015948	CTGGC	2	10	630335	630344	0 %	20 %	40 %	40 %	344210956
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14490	NC_015948	GAC	2	6	630442	630447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210956
14491	NC_015948	GAC	2	6	630487	630492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210956
14492	NC_015948	CGA	2	6	630495	630500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210956
14493	NC_015948	GAC	2	6	630544	630549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210956
14494	NC_015948	CGA	2	6	630570	630575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210956
14495	NC_015948	CGG	2	6	630584	630589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210956
14496	NC_015948	CCG	2	6	630602	630607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210956
14497	NC_015948	CGA	3	9	630624	630632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210956
14498	NC_015948	GAC	2	6	630646	630651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210956
14499	NC_015948	GCT	2	6	630892	630897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210957
14500	NC_015948	GAG	2	6	630920	630925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210957

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