MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 67255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_015948	CTC	2	6	568281	568286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210893
13002	NC_015948	CTC	2	6	568308	568313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210893
13003	NC_015948	TGT	2	6	568329	568334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210893
13004	NC_015948	GAGCGC	2	12	568364	568375	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	344210893
13005	NC_015948	GC	4	8	568372	568379	0 %	0 %	50 %	50 %	344210893
13006	NC_015948	GAC	2	6	568530	568535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210894
13007	NC_015948	AG	3	6	568542	568547	50 %	0 %	50 %	0 %	344210894
13008	NC_015948	GAT	2	6	568709	568714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210894
13009	NC_015948	GCA	2	6	568775	568780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210894
13010	NC_015948	GAG	2	6	568809	568814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210894
13011	NC_015948	TCG	5	15	568819	568833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210894
13012	NC_015948	CGC	2	6	568835	568840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210894
13013	NC_015948	TCA	2	6	568864	568869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210894
13014	NC_015948	GC	3	6	568875	568880	0 %	0 %	50 %	50 %	344210894
13015	NC_015948	GGA	2	6	568886	568891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210894
13016	NC_015948	CGAG	2	8	568925	568932	25 %	0 %	50 %	25 %	344210894
13017	NC_015948	CGAC	2	8	569092	569099	25 %	0 %	25 %	50 %	344210895
13018	NC_015948	CGGC	2	8	569141	569148	0 %	0 %	50 %	50 %	344210895
13019	NC_015948	TCG	2	6	569152	569157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210895
13020	NC_015948	CAG	2	6	569161	569166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210895
13021	NC_015948	GCT	2	6	569174	569179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210895
13022	NC_015948	GC	3	6	569212	569217	0 %	0 %	50 %	50 %	344210895
13023	NC_015948	GGT	2	6	569255	569260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210895
13024	NC_015948	GC	3	6	569290	569295	0 %	0 %	50 %	50 %	344210895
13025	NC_015948	CTG	2	6	569310	569315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210895
13026	NC_015948	GCG	2	6	569316	569321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210895
13027	NC_015948	GGC	2	6	569345	569350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210895
13028	NC_015948	TCG	2	6	569371	569376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210895
13029	NC_015948	GACC	2	8	569393	569400	25 %	0 %	25 %	50 %	344210895
13030	NC_015948	CAT	2	6	569420	569425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210895
13031	NC_015948	GGT	2	6	569450	569455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210895
13032	NC_015948	CAT	2	6	569504	569509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210895
13033	NC_015948	ACG	2	6	569520	569525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210895
13034	NC_015948	CGA	2	6	569530	569535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210895
13035	NC_015948	ACG	3	9	569599	569607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210895
13036	NC_015948	CGC	2	6	569639	569644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210895
13037	NC_015948	CGG	2	6	569710	569715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210895
13038	NC_015948	AACG	2	8	569745	569752	50 %	0 %	25 %	25 %	344210895
13039	NC_015948	CAG	2	6	569790	569795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210895
13040	NC_015948	AGG	2	6	569800	569805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210895
13041	NC_015948	GCGA	2	8	569896	569903	25 %	0 %	50 %	25 %	344210895
13042	NC_015948	TCG	3	9	570017	570025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210896
13043	NC_015948	GGT	3	9	570048	570056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210896
13044	NC_015948	TAT	2	6	570109	570114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344210896
13045	NC_015948	CGACG	2	10	570116	570125	20 %	0 %	40 %	40 %	344210896
13046	NC_015948	TAC	2	6	570127	570132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210896
13047	NC_015948	GTGC	2	8	570166	570173	0 %	25 %	50 %	25 %	344210896
13048	NC_015948	TCC	2	6	570233	570238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210896
13049	NC_015948	TCG	2	6	570389	570394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210896
13050	NC_015948	TCA	2	6	570458	570463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210896
13051	NC_015948	TAC	2	6	570478	570483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210896
13052	NC_015948	TGG	2	6	570488	570493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210896
13053	NC_015948	GCG	2	6	570498	570503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210896
13054	NC_015948	CAT	2	6	570540	570545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210896
13055	NC_015948	CGA	2	6	570567	570572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210896
13056	NC_015948	CGC	2	6	570636	570641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210896
13057	NC_015948	CGG	2	6	570668	570673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210896
13058	NC_015948	GC	3	6	570704	570709	0 %	0 %	50 %	50 %	344210896
13059	NC_015948	AAT	2	6	570750	570755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344210896
13060	NC_015948	GGT	2	6	570789	570794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210896
13061	NC_015948	GCT	2	6	570813	570818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210896
13062	NC_015948	TCC	2	6	570836	570841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210896
13063	NC_015948	TCG	2	6	570842	570847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210896
13064	NC_015948	GGT	2	6	570849	570854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210896
13065	NC_015948	CGT	2	6	570855	570860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210896
13066	NC_015948	CTG	2	6	570877	570882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210896
13067	NC_015948	GCG	2	6	570899	570904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210896
13068	NC_015948	GCAC	2	8	570908	570915	25 %	0 %	25 %	50 %	344210896
13069	NC_015948	CGT	2	6	570951	570956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210896
13070	NC_015948	TTC	2	6	570976	570981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210896
13071	NC_015948	TCG	3	9	570995	571003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210896
13072	NC_015948	GCGA	2	8	571045	571052	25 %	0 %	50 %	25 %	344210896
13073	NC_015948	GGA	2	6	571277	571282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210897
13074	NC_015948	TGA	2	6	571318	571323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210897
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13076	NC_015948	TGA	2	6	571562	571567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210897
13077	NC_015948	GCG	2	6	571575	571580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210897
13078	NC_015948	ACCG	2	8	571664	571671	25 %	0 %	25 %	50 %	344210897
13079	NC_015948	GAA	2	6	571703	571708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210897
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13081	NC_015948	TCGT	2	8	571789	571796	0 %	50 %	25 %	25 %	344210897
13082	NC_015948	ACC	2	6	571810	571815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210897
13083	NC_015948	CGA	2	6	572090	572095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210897
13084	NC_015948	GTCG	2	8	572162	572169	0 %	25 %	50 %	25 %	344210897
13085	NC_015948	CGA	2	6	572183	572188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210897
13086	NC_015948	CGA	2	6	572216	572221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210897
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13090	NC_015948	CGT	2	6	572653	572658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210898
13091	NC_015948	CCG	2	6	572709	572714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210898
13092	NC_015948	CGG	2	6	572770	572775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210898
13093	NC_015948	TGGA	2	8	572778	572785	25 %	25 %	50 %	0 %	344210898
13094	NC_015948	GCC	2	6	572810	572815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210898
13095	NC_015948	GTCG	2	8	572816	572823	0 %	25 %	50 %	25 %	344210898
13096	NC_015948	CCG	2	6	572841	572846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210898
13097	NC_015948	CAG	2	6	572987	572992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210898
13098	NC_015948	GGA	2	6	573014	573019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210898
13099	NC_015948	ACCGG	2	10	573073	573082	20 %	0 %	40 %	40 %	344210898
13100	NC_015948	CGC	2	6	573105	573110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210898
13101	NC_015948	AGT	2	6	573163	573168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210898
13102	NC_015948	GAGGTC	2	12	573206	573217	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	344210898
13103	NC_015948	TGG	2	6	573243	573248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210898
13104	NC_015948	CCA	2	6	573319	573324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210898
13105	NC_015948	CGT	2	6	573337	573342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210898
13106	NC_015948	GTG	2	6	573365	573370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210898
13107	NC_015948	GGC	2	6	573412	573417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210898
13108	NC_015948	GTC	3	9	573482	573490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210898
13109	NC_015948	GGC	2	6	573512	573517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210898
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13111	NC_015948	CGA	2	6	573640	573645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210898
13112	NC_015948	GCCC	2	8	573678	573685	0 %	0 %	25 %	75 %	344210898
13113	NC_015948	CTG	2	6	573689	573694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210898
13114	NC_015948	GCC	2	6	573746	573751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210898
13115	NC_015948	GC	3	6	573772	573777	0 %	0 %	50 %	50 %	344210898
13116	NC_015948	GTCG	2	8	573835	573842	0 %	25 %	50 %	25 %	344210898
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13118	NC_015948	GAC	2	6	573962	573967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210898
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13230	NC_015948	GACT	2	8	577846	577853	25 %	25 %	25 %	25 %	344210901
13231	NC_015948	GCGA	2	8	577869	577876	25 %	0 %	50 %	25 %	344210901
13232	NC_015948	TGGA	2	8	577887	577894	25 %	25 %	50 %	0 %	344210901
13233	NC_015948	GACC	2	8	577938	577945	25 %	0 %	25 %	50 %	344210901
13234	NC_015948	G	6	6	577968	577973	0 %	0 %	100 %	0 %	344210901
13235	NC_015948	GGC	2	6	577979	577984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210901
13236	NC_015948	CGA	2	6	578072	578077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210901
13237	NC_015948	TCC	2	6	578083	578088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210901
13238	NC_015948	ATCA	2	8	578208	578215	50 %	25 %	0 %	25 %	344210901
13239	NC_015948	GCCC	2	8	578216	578223	0 %	0 %	25 %	75 %	344210901
13240	NC_015948	ACG	2	6	578281	578286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210901
13241	NC_015948	CGAG	2	8	578335	578342	25 %	0 %	50 %	25 %	344210901
13242	NC_015948	CGAC	2	8	578383	578390	25 %	0 %	25 %	50 %	344210901
13243	NC_015948	CCG	2	6	578410	578415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210901
13244	NC_015948	GTTCCC	2	12	578541	578552	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	344210902
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13246	NC_015948	CGC	2	6	578628	578633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210902
13247	NC_015948	GCG	2	6	578683	578688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210902
13248	NC_015948	TA	3	6	578708	578713	50 %	50 %	0 %	0 %	344210902
13249	NC_015948	CGA	2	6	578763	578768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210902
13250	NC_015948	ACA	2	6	578774	578779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210902
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13259	NC_015948	CGA	2	6	579051	579056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210902
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13267	NC_015948	CGG	2	6	579451	579456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210903
13268	NC_015948	ACG	2	6	579457	579462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210903
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13270	NC_015948	CGT	2	6	579497	579502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210903
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13272	NC_015948	CGA	2	6	579602	579607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210903
13273	NC_015948	CGC	2	6	579661	579666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210903
13274	NC_015948	AGG	3	9	579724	579732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210903
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13329	NC_015948	CGGC	2	8	581871	581878	0 %	0 %	50 %	50 %	344210904
13330	NC_015948	CGT	3	9	581927	581935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210904
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13338	NC_015948	ACGTC	2	10	582362	582371	20 %	20 %	20 %	40 %	344210904
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13340	NC_015948	GGCC	2	8	582410	582417	0 %	0 %	50 %	50 %	344210904
13341	NC_015948	GTC	2	6	582432	582437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210904
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13345	NC_015948	GC	3	6	582501	582506	0 %	0 %	50 %	50 %	344210904
13346	NC_015948	CCG	2	6	582524	582529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210904
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13348	NC_015948	GCC	3	9	582573	582581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210904
13349	NC_015948	CGA	2	6	582596	582601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210904
13350	NC_015948	TCC	2	6	582619	582624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210904
13351	NC_015948	CGA	2	6	582626	582631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210904
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13353	NC_015948	ACG	2	6	582679	582684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210904
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