MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 67255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_015948	CGA	2	6	548509	548514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210877
12502	NC_015948	CGT	2	6	548518	548523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210877
12503	NC_015948	CGGTG	2	10	548546	548555	0 %	20 %	60 %	20 %	344210877
12504	NC_015948	GTC	2	6	548558	548563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210877
12505	NC_015948	CGGA	2	8	548583	548590	25 %	0 %	50 %	25 %	344210877
12506	NC_015948	CTC	2	6	548591	548596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210877
12507	NC_015948	GTC	3	9	548600	548608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210877
12508	NC_015948	CGC	2	6	548623	548628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210877
12509	NC_015948	GTC	2	6	548633	548638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210877
12510	NC_015948	GTTC	2	8	548681	548688	0 %	50 %	25 %	25 %	344210877
12511	NC_015948	GTC	2	6	548693	548698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210877
12512	NC_015948	CCG	2	6	548705	548710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210877
12513	NC_015948	CTC	2	6	548732	548737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210877
12514	NC_015948	CGAG	2	8	548749	548756	25 %	0 %	50 %	25 %	344210877
12515	NC_015948	GGTC	2	8	548770	548777	0 %	25 %	50 %	25 %	344210877
12516	NC_015948	CTC	2	6	548789	548794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210877
12517	NC_015948	TCG	2	6	548856	548861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210877
12518	NC_015948	ACC	2	6	548874	548879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210877
12519	NC_015948	ATGTCC	2	12	548949	548960	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	344210877
12520	NC_015948	CGG	2	6	549050	549055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210877
12521	NC_015948	AGCGCC	2	12	549204	549215	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	344210878
12522	NC_015948	GAG	2	6	549265	549270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210878
12523	NC_015948	CGG	2	6	549306	549311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210878
12524	NC_015948	GAC	2	6	549394	549399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210878
12525	NC_015948	ACG	2	6	549410	549415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210878
12526	NC_015948	GAG	3	9	549424	549432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210878
12527	NC_015948	CTG	2	6	549436	549441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210878
12528	NC_015948	CTG	2	6	549448	549453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210878
12529	NC_015948	GTG	2	6	549500	549505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210878
12530	NC_015948	CGGA	2	8	549508	549515	25 %	0 %	50 %	25 %	344210878
12531	NC_015948	CCG	2	6	549516	549521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210878
12532	NC_015948	GAAGT	2	10	549544	549553	40 %	20 %	40 %	0 %	344210878
12533	NC_015948	ACG	2	6	549608	549613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210878
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12535	NC_015948	CGC	2	6	549741	549746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210879
12536	NC_015948	CCG	2	6	549784	549789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210879
12537	NC_015948	GGC	2	6	549805	549810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210879
12538	NC_015948	CG	3	6	549904	549909	0 %	0 %	50 %	50 %	344210879
12539	NC_015948	CAC	2	6	549919	549924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210879
12540	NC_015948	CGA	2	6	549945	549950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210879
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12543	NC_015948	GAC	2	6	550039	550044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210879
12544	NC_015948	GC	3	6	550048	550053	0 %	0 %	50 %	50 %	344210879
12545	NC_015948	ACG	2	6	550067	550072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210879
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12548	NC_015948	GTC	2	6	550174	550179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210879
12549	NC_015948	GAC	2	6	550195	550200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210879
12550	NC_015948	GGC	2	6	550213	550218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210879
12551	NC_015948	GTTC	2	8	550260	550267	0 %	50 %	25 %	25 %	344210879
12552	NC_015948	GCC	2	6	550277	550282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210879
12553	NC_015948	GCG	3	9	550283	550291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210879
12554	NC_015948	GGA	2	6	550300	550305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210879
12555	NC_015948	GGAC	2	8	550322	550329	25 %	0 %	50 %	25 %	344210879
12556	NC_015948	TCC	2	6	550403	550408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210879
12557	NC_015948	GACG	2	8	550467	550474	25 %	0 %	50 %	25 %	344210879
12558	NC_015948	GTC	2	6	550759	550764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210880
12559	NC_015948	GCC	2	6	550765	550770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210880
12560	NC_015948	GGCT	2	8	550804	550811	0 %	25 %	50 %	25 %	344210880
12561	NC_015948	GCT	2	6	550826	550831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210880
12562	NC_015948	CT	3	6	550838	550843	0 %	50 %	0 %	50 %	344210880
12563	NC_015948	CGC	2	6	550872	550877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210880
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12567	NC_015948	TC	3	6	550987	550992	0 %	50 %	0 %	50 %	344210880
12568	NC_015948	GTG	2	6	551008	551013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210880
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12597	NC_015948	AAGC	2	8	551925	551932	50 %	0 %	25 %	25 %	344210880
12598	NC_015948	GGAC	2	8	551982	551989	25 %	0 %	50 %	25 %	344210880
12599	NC_015948	TGC	2	6	552014	552019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210880
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12602	NC_015948	GAC	2	6	552108	552113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210880
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12606	NC_015948	CG	3	6	552256	552261	0 %	0 %	50 %	50 %	344210880
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12610	NC_015948	CGAA	2	8	552512	552519	50 %	0 %	25 %	25 %	344210880
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12843	NC_015948	CGA	2	6	561557	561562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210890
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12849	NC_015948	GGA	2	6	561726	561731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210890
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12851	NC_015948	CAA	3	9	561756	561764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210890
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12962	NC_015948	GACAA	2	10	566881	566890	60 %	0 %	20 %	20 %	344210892
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12969	NC_015948	GACCA	2	10	567034	567043	40 %	0 %	20 %	40 %	344210892
12970	NC_015948	TAC	2	6	567046	567051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210892
12971	NC_015948	CGA	3	9	567066	567074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210892
12972	NC_015948	GA	3	6	567083	567088	50 %	0 %	50 %	0 %	344210892
12973	NC_015948	CAT	2	6	567401	567406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210893
12974	NC_015948	CGAG	2	8	567416	567423	25 %	0 %	50 %	25 %	344210893
12975	NC_015948	GGT	2	6	567449	567454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210893
12976	NC_015948	TGA	2	6	567464	567469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210893
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12978	NC_015948	TCG	2	6	567505	567510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210893
12979	NC_015948	GTC	2	6	567577	567582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210893
12980	NC_015948	CGC	2	6	567626	567631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210893
12981	NC_015948	TCT	2	6	567647	567652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210893
12982	NC_015948	CGC	2	6	567659	567664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210893
12983	NC_015948	CGA	2	6	567677	567682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210893
12984	NC_015948	CTG	2	6	567684	567689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210893
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12989	NC_015948	CGA	2	6	567869	567874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210893
12990	NC_015948	CGC	2	6	567899	567904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210893
12991	NC_015948	CGC	2	6	567932	567937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210893
12992	NC_015948	GACCTC	2	12	567948	567959	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	344210893
12993	NC_015948	GC	3	6	567974	567979	0 %	0 %	50 %	50 %	344210893
12994	NC_015948	TCG	2	6	568021	568026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210893
12995	NC_015948	CCGGC	2	10	568049	568058	0 %	0 %	40 %	60 %	344210893
12996	NC_015948	TCG	2	6	568084	568089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210893
12997	NC_015948	CG	3	6	568109	568114	0 %	0 %	50 %	50 %	344210893
12998	NC_015948	GGT	2	6	568121	568126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210893
12999	NC_015948	CGT	2	6	568166	568171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210893
13000	NC_015948	CTC	2	6	568227	568232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210893

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