MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 67255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_015948	CAC	2	6	527432	527437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210849
12003	NC_015948	GGA	2	6	527498	527503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210849
12004	NC_015948	CCT	2	6	527522	527527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210849
12005	NC_015948	CGC	2	6	527537	527542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210849
12006	NC_015948	GCG	3	9	527560	527568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210849
12007	NC_015948	GA	3	6	527582	527587	50 %	0 %	50 %	0 %	344210849
12008	NC_015948	CGAC	3	12	527616	527627	25 %	0 %	25 %	50 %	344210849
12009	NC_015948	CTG	2	6	527672	527677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210849
12010	NC_015948	CTG	2	6	527685	527690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210849
12011	NC_015948	GGT	2	6	527705	527710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210849
12012	NC_015948	CCG	2	6	527732	527737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210849
12013	NC_015948	GGC	2	6	527741	527746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210849
12014	NC_015948	TCC	2	6	527764	527769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210849
12015	NC_015948	TCG	2	6	527788	527793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210849
12016	NC_015948	TCC	2	6	527924	527929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210850
12017	NC_015948	GTC	2	6	527953	527958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210850
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12020	NC_015948	TCG	2	6	528064	528069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210850
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12025	NC_015948	TCGG	2	8	528224	528231	0 %	25 %	50 %	25 %	344210850
12026	NC_015948	CGG	2	6	528237	528242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210850
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12031	NC_015948	CGG	2	6	528463	528468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210851
12032	NC_015948	ACG	2	6	528475	528480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210851
12033	NC_015948	GTC	2	6	528486	528491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210851
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12038	NC_015948	CG	3	6	528702	528707	0 %	0 %	50 %	50 %	344210851
12039	NC_015948	CGA	2	6	528734	528739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210851
12040	NC_015948	ACGA	2	8	528798	528805	50 %	0 %	25 %	25 %	344210851
12041	NC_015948	CTG	2	6	528843	528848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210851
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12046	NC_015948	GCTC	2	8	528984	528991	0 %	25 %	25 %	50 %	344210852
12047	NC_015948	AGT	2	6	528996	529001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210852
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12049	NC_015948	CGA	2	6	529038	529043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210852
12050	NC_015948	ACG	2	6	529082	529087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210852
12051	NC_015948	TCCG	2	8	529142	529149	0 %	25 %	25 %	50 %	344210852
12052	NC_015948	CGA	2	6	529158	529163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210852
12053	NC_015948	CGT	2	6	529245	529250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210852
12054	NC_015948	AC	3	6	529267	529272	50 %	0 %	0 %	50 %	344210852
12055	NC_015948	AC	3	6	529279	529284	50 %	0 %	0 %	50 %	344210852
12056	NC_015948	GCT	2	6	529299	529304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210852
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12064	NC_015948	CGA	2	6	529727	529732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210853
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12073	NC_015948	GTC	2	6	530289	530294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210854
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12099	NC_015948	CCCG	2	8	531267	531274	0 %	0 %	25 %	75 %	344210856
12100	NC_015948	CTG	2	6	531285	531290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210856
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12113	NC_015948	CAG	2	6	531931	531936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210856
12114	NC_015948	CGAC	2	8	531956	531963	25 %	0 %	25 %	50 %	344210856
12115	NC_015948	CGAAC	2	10	532050	532059	40 %	0 %	20 %	40 %	344210856
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12235	NC_015948	AGC	2	6	536976	536981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210863
12236	NC_015948	CGA	3	9	537040	537048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210863
12237	NC_015948	GCA	2	6	537085	537090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210863
12238	NC_015948	TCC	2	6	537095	537100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210863
12239	NC_015948	GCGA	2	8	537154	537161	25 %	0 %	50 %	25 %	344210863
12240	NC_015948	GTCGCG	2	12	537173	537184	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344210863
12241	NC_015948	GTC	2	6	537220	537225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210863
12242	NC_015948	CCG	2	6	537234	537239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210863
12243	NC_015948	CCT	2	6	537277	537282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210863
12244	NC_015948	ACA	3	9	537304	537312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210864
12245	NC_015948	AC	3	6	537345	537350	50 %	0 %	0 %	50 %	344210864
12246	NC_015948	CGCC	2	8	537351	537358	0 %	0 %	25 %	75 %	344210864
12247	NC_015948	GCT	2	6	537364	537369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210864
12248	NC_015948	GTG	2	6	537374	537379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210864
12249	NC_015948	AACGA	2	10	537410	537419	60 %	0 %	20 %	20 %	344210864
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12251	NC_015948	GCT	2	6	537487	537492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210864
12252	NC_015948	TG	3	6	537498	537503	0 %	50 %	50 %	0 %	344210864
12253	NC_015948	AAC	2	6	537504	537509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210864
12254	NC_015948	TCGATG	2	12	537510	537521	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	344210864
12255	NC_015948	CGC	2	6	537526	537531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210864
12256	NC_015948	GCG	2	6	537591	537596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210864
12257	NC_015948	TTC	2	6	537612	537617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210865
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12259	NC_015948	CCT	2	6	537649	537654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210865
12260	NC_015948	CCT	2	6	537685	537690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210865
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12264	NC_015948	TCGACT	2	12	537828	537839	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	344210865
12265	NC_015948	CTG	2	6	537902	537907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210865
12266	NC_015948	GTC	2	6	537917	537922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210865
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12269	NC_015948	GCCG	2	8	538046	538053	0 %	0 %	50 %	50 %	344210865
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12271	NC_015948	GAC	2	6	538085	538090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210865
12272	NC_015948	TCG	2	6	538119	538124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210865
12273	NC_015948	CGG	2	6	538149	538154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210865
12274	NC_015948	GTC	2	6	538158	538163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210865
12275	NC_015948	GCT	2	6	538165	538170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210865
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12279	NC_015948	GTC	2	6	538277	538282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210865
12280	NC_015948	CCGG	2	8	538291	538298	0 %	0 %	50 %	50 %	344210865
12281	NC_015948	GCT	2	6	538309	538314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210865
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12305	NC_015948	GACGGT	2	12	539363	539374	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	344210866
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12312	NC_015948	GTC	2	6	539671	539676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210867
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12319	NC_015948	ACG	2	6	540696	540701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210868
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12332	NC_015948	TCATCG	2	12	541281	541292	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	344210868
12333	NC_015948	CG	3	6	541291	541296	0 %	0 %	50 %	50 %	344210868
12334	NC_015948	CCT	2	6	541300	541305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210868
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12337	NC_015948	TCG	2	6	541390	541395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210869
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12340	NC_015948	GCC	2	6	541589	541594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210869
12341	NC_015948	GGTG	2	8	541658	541665	0 %	25 %	75 %	0 %	344210869
12342	NC_015948	GTCCTC	2	12	542162	542173	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	344210870
12343	NC_015948	GTC	2	6	542174	542179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210870
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12345	NC_015948	GCC	2	6	542228	542233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210870
12346	NC_015948	TGC	2	6	542234	542239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210870
12347	NC_015948	CCG	2	6	542259	542264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210870
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12349	NC_015948	CCG	2	6	542301	542306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210870
12350	NC_015948	CTG	2	6	542312	542317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210870
12351	NC_015948	CCTGGT	2	12	542320	542331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210870
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12353	NC_015948	CTTC	2	8	542392	542399	0 %	50 %	0 %	50 %	344210870
12354	NC_015948	TCG	2	6	542469	542474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210870
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12471	NC_015948	GCG	2	6	547108	547113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210875
12472	NC_015948	CGCC	2	8	547144	547151	0 %	0 %	25 %	75 %	344210875
12473	NC_015948	GTC	2	6	547184	547189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210875
12474	NC_015948	CGG	2	6	547195	547200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210875
12475	NC_015948	CGG	2	6	547215	547220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210875
12476	NC_015948	TCC	2	6	547245	547250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210875
12477	NC_015948	CGG	2	6	547252	547257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210875
12478	NC_015948	GCG	2	6	547273	547278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210875
12479	NC_015948	AGCG	2	8	547299	547306	25 %	0 %	50 %	25 %	344210875
12480	NC_015948	CGC	3	9	547315	547323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210875
12481	NC_015948	GCCG	2	8	547382	547389	0 %	0 %	50 %	50 %	344210875
12482	NC_015948	CGT	2	6	547469	547474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210876
12483	NC_015948	GAT	2	6	547496	547501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210876
12484	NC_015948	CTG	2	6	547706	547711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210876
12485	NC_015948	GGTC	2	8	547729	547736	0 %	25 %	50 %	25 %	344210876
12486	NC_015948	CTC	2	6	547751	547756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210876
12487	NC_015948	GTC	2	6	547781	547786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210876
12488	NC_015948	GCG	2	6	547805	547810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210876
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12490	NC_015948	TCT	2	6	547828	547833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210876
12491	NC_015948	TCG	2	6	547882	547887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210876
12492	NC_015948	GGT	2	6	547889	547894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210876
12493	NC_015948	TGA	2	6	547900	547905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210876
12494	NC_015948	GAC	2	6	547922	547927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210876
12495	NC_015948	GTC	3	9	548075	548083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210876
12496	NC_015948	TCG	2	6	548085	548090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210876
12497	NC_015948	TCG	2	6	548139	548144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210876
12498	NC_015948	CGC	2	6	548206	548211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210876
12499	NC_015948	GTC	2	6	548219	548224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210876
12500	NC_015948	TCG	2	6	548481	548486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210877

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