MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 67255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_015948	AGT	2	6	503947	503952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210827
11502	NC_015948	GTG	2	6	503967	503972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210827
11503	NC_015948	CGA	2	6	504008	504013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210827
11504	NC_015948	GTC	2	6	504163	504168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210827
11505	NC_015948	TCA	2	6	504172	504177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210827
11506	NC_015948	CCG	2	6	504238	504243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210827
11507	NC_015948	TCG	2	6	504262	504267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210827
11508	NC_015948	GCA	2	6	504302	504307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210827
11509	NC_015948	GAT	2	6	504369	504374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210827
11510	NC_015948	GAGC	2	8	504402	504409	25 %	0 %	50 %	25 %	344210827
11511	NC_015948	CGT	2	6	504477	504482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210827
11512	NC_015948	CT	3	6	504486	504491	0 %	50 %	0 %	50 %	344210827
11513	NC_015948	GAC	2	6	504508	504513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210827
11514	NC_015948	CGA	2	6	504593	504598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210827
11515	NC_015948	CGC	2	6	504611	504616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210827
11516	NC_015948	CGAA	2	8	504626	504633	50 %	0 %	25 %	25 %	344210827
11517	NC_015948	CAG	2	6	504699	504704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210827
11518	NC_015948	CGT	2	6	504713	504718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210827
11519	NC_015948	CCA	2	6	504735	504740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210828
11520	NC_015948	CGG	2	6	504745	504750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210828
11521	NC_015948	GACT	2	8	504882	504889	25 %	25 %	25 %	25 %	344210828
11522	NC_015948	TGT	2	6	504900	504905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210828
11523	NC_015948	CGCC	2	8	504917	504924	0 %	0 %	25 %	75 %	344210828
11524	NC_015948	AAT	2	6	504983	504988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344210828
11525	NC_015948	AGG	2	6	505179	505184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210828
11526	NC_015948	ACC	2	6	505236	505241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210828
11527	NC_015948	CAG	2	6	505256	505261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210828
11528	NC_015948	CAC	2	6	505298	505303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210828
11529	NC_015948	GTCA	2	8	505310	505317	25 %	25 %	25 %	25 %	344210828
11530	NC_015948	GTA	2	6	505325	505330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210828
11531	NC_015948	CGT	2	6	505349	505354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210828
11532	NC_015948	GTC	2	6	505481	505486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210828
11533	NC_015948	TCG	2	6	505584	505589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210828
11534	NC_015948	GAA	2	6	505679	505684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210828
11535	NC_015948	GAC	3	9	505685	505693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210828
11536	NC_015948	AGT	2	6	505714	505719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210828
11537	NC_015948	GTCG	2	8	505729	505736	0 %	25 %	50 %	25 %	344210828
11538	NC_015948	CGT	2	6	505741	505746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210828
11539	NC_015948	CAG	2	6	505762	505767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210828
11540	NC_015948	CAGC	2	8	505805	505812	25 %	0 %	25 %	50 %	344210828
11541	NC_015948	CGT	2	6	505909	505914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210828
11542	NC_015948	GAA	2	6	505967	505972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210828
11543	NC_015948	AGC	2	6	506046	506051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210828
11544	NC_015948	AGC	2	6	506076	506081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210828
11545	NC_015948	AGT	2	6	506109	506114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210828
11546	NC_015948	CAT	2	6	506183	506188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210828
11547	NC_015948	CGT	2	6	506190	506195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210829
11548	NC_015948	GCC	2	6	506312	506317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210829
11549	NC_015948	CAG	2	6	506326	506331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210829
11550	NC_015948	AGA	2	6	506349	506354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210829
11551	NC_015948	CGA	2	6	506361	506366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210829
11552	NC_015948	CCG	2	6	506375	506380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210829
11553	NC_015948	TGA	2	6	506403	506408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210829
11554	NC_015948	TTGGCC	2	12	506477	506488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210829
11555	NC_015948	CGG	2	6	506523	506528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210829
11556	NC_015948	GCGG	2	8	506579	506586	0 %	0 %	75 %	25 %	344210829
11557	NC_015948	TGCC	2	8	506623	506630	0 %	25 %	25 %	50 %	344210829
11558	NC_015948	TCG	2	6	506649	506654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210829
11559	NC_015948	GCT	2	6	506733	506738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210829
11560	NC_015948	CTGT	2	8	506739	506746	0 %	50 %	25 %	25 %	344210829
11561	NC_015948	TCGC	2	8	506790	506797	0 %	25 %	25 %	50 %	344210829
11562	NC_015948	AGG	2	6	506814	506819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210829
11563	NC_015948	AGT	2	6	506823	506828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210829
11564	NC_015948	ATTCCG	2	12	506873	506884	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	344210829
11565	NC_015948	TGA	3	9	506937	506945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210829
11566	NC_015948	GAC	2	6	506971	506976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210829
11567	NC_015948	GAT	2	6	507139	507144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210829
11568	NC_015948	GTC	2	6	507158	507163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210829
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11571	NC_015948	GA	3	6	507352	507357	50 %	0 %	50 %	0 %	344210830
11572	NC_015948	TCT	2	6	507369	507374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210830
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11585	NC_015948	AGC	2	6	507749	507754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210830
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11588	NC_015948	TCG	2	6	507935	507940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210830
11589	NC_015948	CCG	2	6	507989	507994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210830
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11594	NC_015948	AC	3	6	508155	508160	50 %	0 %	0 %	50 %	344210830
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11599	NC_015948	GTA	2	6	508375	508380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210830
11600	NC_015948	GTC	2	6	508381	508386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210830
11601	NC_015948	CGT	2	6	508491	508496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210830
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11605	NC_015948	GTC	2	6	508676	508681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210830
11606	NC_015948	GT	3	6	508687	508692	0 %	50 %	50 %	0 %	344210830
11607	NC_015948	GTC	2	6	508840	508845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210830
11608	NC_015948	CAG	2	6	508881	508886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210830
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11612	NC_015948	GTCG	2	8	508951	508958	0 %	25 %	50 %	25 %	344210830
11613	NC_015948	TCG	2	6	508974	508979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210830
11614	NC_015948	GGTC	2	8	509025	509032	0 %	25 %	50 %	25 %	344210830
11615	NC_015948	CTG	2	6	509048	509053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210830
11616	NC_015948	GTCACT	2	12	509101	509112	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	344210830
11617	NC_015948	TGC	2	6	509134	509139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210830
11618	NC_015948	GGC	2	6	509140	509145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210830
11619	NC_015948	GCA	2	6	509147	509152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210830
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11624	NC_015948	TCG	2	6	509601	509606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210831
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11628	NC_015948	GAT	2	6	509711	509716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210831
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11630	NC_015948	GTC	2	6	509780	509785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210831
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11648	NC_015948	CCCG	2	8	510554	510561	0 %	0 %	25 %	75 %	344210832
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11652	NC_015948	CGGT	2	8	510735	510742	0 %	25 %	50 %	25 %	344210833
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11731	NC_015948	CGA	2	6	514371	514376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210836
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11969	NC_015948	TCG	2	6	526162	526167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210848
11970	NC_015948	GTTCC	2	10	526179	526188	0 %	40 %	20 %	40 %	344210848
11971	NC_015948	CGTT	2	8	526192	526199	0 %	50 %	25 %	25 %	344210848
11972	NC_015948	CAT	2	6	526211	526216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210848
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11975	NC_015948	CGG	2	6	526295	526300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210848
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11977	NC_015948	GCCA	2	8	526316	526323	25 %	0 %	25 %	50 %	344210848
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11995	NC_015948	CGG	2	6	527155	527160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210849
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11997	NC_015948	GTC	3	9	527193	527201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210849
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11999	NC_015948	CATC	2	8	527309	527316	25 %	25 %	0 %	50 %	344210849
12000	NC_015948	CGA	2	6	527387	527392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210849

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