MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 67255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_015948	ACCG	2	8	482221	482228	25 %	0 %	25 %	50 %	344210801
11002	NC_015948	CAA	2	6	482247	482252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210801
11003	NC_015948	ACTTCG	2	12	482255	482266	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	344210801
11004	NC_015948	GGC	2	6	482289	482294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210801
11005	NC_015948	GGC	2	6	482298	482303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210801
11006	NC_015948	CTG	2	6	482326	482331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210801
11007	NC_015948	ACG	2	6	482477	482482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210801
11008	NC_015948	ACCG	2	8	482489	482496	25 %	0 %	25 %	50 %	344210801
11009	NC_015948	GGTC	2	8	482507	482514	0 %	25 %	50 %	25 %	344210801
11010	NC_015948	TCG	2	6	482552	482557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210801
11011	NC_015948	GCG	2	6	482603	482608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210801
11012	NC_015948	GAC	2	6	482614	482619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210801
11013	NC_015948	GC	3	6	482628	482633	0 %	0 %	50 %	50 %	344210801
11014	NC_015948	TGCGAG	2	12	482686	482697	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	344210801
11015	NC_015948	CGCT	2	8	482744	482751	0 %	25 %	25 %	50 %	344210801
11016	NC_015948	ACG	2	6	483032	483037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210802
11017	NC_015948	CGA	2	6	483104	483109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210802
11018	NC_015948	GTG	2	6	483121	483126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210802
11019	NC_015948	CAC	2	6	483156	483161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210802
11020	NC_015948	CGT	2	6	483171	483176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210802
11021	NC_015948	TCG	2	6	483220	483225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210802
11022	NC_015948	CG	3	6	483256	483261	0 %	0 %	50 %	50 %	344210802
11023	NC_015948	CCG	2	6	483269	483274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210802
11024	NC_015948	GCGG	2	8	483286	483293	0 %	0 %	75 %	25 %	344210802
11025	NC_015948	CGA	2	6	483362	483367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210802
11026	NC_015948	CGG	2	6	483384	483389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210802
11027	NC_015948	ACG	2	6	483424	483429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210802
11028	NC_015948	GGA	2	6	483437	483442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210802
11029	NC_015948	GTC	2	6	483454	483459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210802
11030	NC_015948	CAG	2	6	483501	483506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210802
11031	NC_015948	CGG	2	6	483512	483517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210802
11032	NC_015948	GCC	3	9	483534	483542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210802
11033	NC_015948	GCC	2	6	483549	483554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210802
11034	NC_015948	TCC	2	6	483586	483591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210802
11035	NC_015948	CGA	2	6	483596	483601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210802
11036	NC_015948	TGGGCG	2	12	483610	483621	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	344210802
11037	NC_015948	CGG	2	6	483641	483646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210802
11038	NC_015948	GCG	2	6	483667	483672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210802
11039	NC_015948	GCC	2	6	483917	483922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210803
11040	NC_015948	CGT	2	6	483925	483930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210803
11041	NC_015948	CGG	2	6	483975	483980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210803
11042	NC_015948	CAGA	2	8	483983	483990	50 %	0 %	25 %	25 %	344210803
11043	NC_015948	ACG	2	6	484070	484075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210803
11044	NC_015948	GAG	2	6	484121	484126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210803
11045	NC_015948	CCG	2	6	484267	484272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210803
11046	NC_015948	TCG	2	6	484299	484304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210803
11047	NC_015948	GGA	2	6	484309	484314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210803
11048	NC_015948	CGG	2	6	484320	484325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210803
11049	NC_015948	CAC	2	6	484360	484365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210803
11050	NC_015948	CGA	2	6	484402	484407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210803
11051	NC_015948	AAG	2	6	484421	484426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210803
11052	NC_015948	TCA	2	6	484431	484436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210803
11053	NC_015948	GCG	2	6	484464	484469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210803
11054	NC_015948	ACCT	2	8	484556	484563	25 %	25 %	0 %	50 %	344210803
11055	NC_015948	ACG	3	9	484674	484682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210803
11056	NC_015948	GGC	2	6	484693	484698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210803
11057	NC_015948	GAT	2	6	484741	484746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210803
11058	NC_015948	GTT	2	6	484774	484779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210803
11059	NC_015948	GAG	2	6	484799	484804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210803
11060	NC_015948	CAG	2	6	484844	484849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210803
11061	NC_015948	CAG	2	6	484852	484857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210803
11062	NC_015948	CG	3	6	484866	484871	0 %	0 %	50 %	50 %	344210803
11063	NC_015948	CGA	2	6	484894	484899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210803
11064	NC_015948	CGG	2	6	484908	484913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210803
11065	NC_015948	ACT	2	6	484914	484919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210803
11066	NC_015948	GAT	2	6	484926	484931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210804
11067	NC_015948	CGG	2	6	484956	484961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210804
11068	NC_015948	ACGT	2	8	484966	484973	25 %	25 %	25 %	25 %	344210804
11069	NC_015948	CCG	2	6	485012	485017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210804
11070	NC_015948	CGT	2	6	485100	485105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210804
11071	NC_015948	CGT	3	9	485130	485138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210804
11072	NC_015948	GTC	2	6	485146	485151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210804
11073	NC_015948	TTC	2	6	485156	485161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210804
11074	NC_015948	GAT	2	6	485214	485219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210804
11075	NC_015948	CTG	2	6	485251	485256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210804
11076	NC_015948	CGG	2	6	485270	485275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210804
11077	NC_015948	TCA	2	6	485351	485356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210804
11078	NC_015948	AGG	2	6	485357	485362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210804
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11080	NC_015948	GAC	2	6	485487	485492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210804
11081	NC_015948	GGTC	2	8	485529	485536	0 %	25 %	50 %	25 %	344210804
11082	NC_015948	CTC	2	6	485554	485559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210804
11083	NC_015948	CGG	2	6	485663	485668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210805
11084	NC_015948	GTC	2	6	485715	485720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210805
11085	NC_015948	CGT	2	6	485723	485728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210805
11086	NC_015948	CCGGCA	2	12	485737	485748	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	344210805
11087	NC_015948	GAC	2	6	485750	485755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210805
11088	NC_015948	GCT	2	6	485756	485761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210805
11089	NC_015948	CCGAC	2	10	485783	485792	20 %	0 %	20 %	60 %	344210805
11090	NC_015948	CGA	2	6	485816	485821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210805
11091	NC_015948	CGA	3	9	485837	485845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210805
11092	NC_015948	CCG	2	6	485858	485863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210805
11093	NC_015948	GAGCC	2	10	485886	485895	20 %	0 %	40 %	40 %	344210805
11094	NC_015948	TCG	2	6	485986	485991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210805
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11097	NC_015948	CG	3	6	486107	486112	0 %	0 %	50 %	50 %	344210805
11098	NC_015948	CGG	2	6	486130	486135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210805
11099	NC_015948	TGC	2	6	486139	486144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210805
11100	NC_015948	ACA	2	6	486175	486180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210805
11101	NC_015948	GCT	2	6	486185	486190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210805
11102	NC_015948	CGGCGT	2	12	486221	486232	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344210805
11103	NC_015948	CGT	3	9	486230	486238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210805
11104	NC_015948	CCAC	2	8	486241	486248	25 %	0 %	0 %	75 %	344210805
11105	NC_015948	CCTT	2	8	486286	486293	0 %	50 %	0 %	50 %	344210805
11106	NC_015948	ACG	2	6	486295	486300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210805
11107	NC_015948	GCCC	2	8	486319	486326	0 %	0 %	25 %	75 %	344210805
11108	NC_015948	GTT	2	6	486332	486337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210805
11109	NC_015948	TCG	2	6	486388	486393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210805
11110	NC_015948	GCC	2	6	486422	486427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210805
11111	NC_015948	CAT	2	6	486717	486722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210806
11112	NC_015948	GTC	2	6	486735	486740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210806
11113	NC_015948	TCG	2	6	486811	486816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210806
11114	NC_015948	GTC	2	6	486864	486869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210806
11115	NC_015948	CGA	2	6	486911	486916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210806
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11117	NC_015948	CGA	2	6	487032	487037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210806
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11471	NC_015948	GC	3	6	502731	502736	0 %	0 %	50 %	50 %	344210826
11472	NC_015948	CTC	2	6	502880	502885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210826
11473	NC_015948	TCC	2	6	502893	502898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210826
11474	NC_015948	GGAC	2	8	502921	502928	25 %	0 %	50 %	25 %	344210826
11475	NC_015948	TCG	2	6	502950	502955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210826
11476	NC_015948	GAC	2	6	502958	502963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210826
11477	NC_015948	CCG	2	6	503016	503021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210826
11478	NC_015948	TGG	2	6	503028	503033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210826
11479	NC_015948	GTA	2	6	503042	503047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210826
11480	NC_015948	TCG	2	6	503070	503075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210826
11481	NC_015948	GAT	2	6	503144	503149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210826
11482	NC_015948	GCG	2	6	503213	503218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210826
11483	NC_015948	CGC	3	9	503233	503241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210826
11484	NC_015948	CCGA	2	8	503312	503319	25 %	0 %	25 %	50 %	344210826
11485	NC_015948	GTC	2	6	503322	503327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210826
11486	NC_015948	CGC	2	6	503365	503370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210826
11487	NC_015948	GC	3	6	503369	503374	0 %	0 %	50 %	50 %	344210826
11488	NC_015948	GTA	2	6	503438	503443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210826
11489	NC_015948	CGA	2	6	503500	503505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210826
11490	NC_015948	ACTC	2	8	503509	503516	25 %	25 %	0 %	50 %	344210826
11491	NC_015948	CCTC	2	8	503527	503534	0 %	25 %	0 %	75 %	344210826
11492	NC_015948	GGCCG	2	10	503607	503616	0 %	0 %	60 %	40 %	344210827
11493	NC_015948	GTC	2	6	503652	503657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210827
11494	NC_015948	GTCTG	2	10	503689	503698	0 %	40 %	40 %	20 %	344210827
11495	NC_015948	GTG	2	6	503709	503714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210827
11496	NC_015948	GTC	2	6	503724	503729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210827
11497	NC_015948	GGC	2	6	503760	503765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210827
11498	NC_015948	CTG	2	6	503774	503779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210827
11499	NC_015948	TCG	2	6	503821	503826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210827
11500	NC_015948	ACG	2	6	503861	503866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210827

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