MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 67255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015948	CGT	3	9	21389	21397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210327
502	NC_015948	TAC	2	6	21426	21431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210327
503	NC_015948	CGA	2	6	21449	21454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210327
504	NC_015948	TCC	2	6	21493	21498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210327
505	NC_015948	GAC	2	6	21641	21646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210327
506	NC_015948	ATC	2	6	21675	21680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210327
507	NC_015948	CGT	2	6	21686	21691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210327
508	NC_015948	GCT	2	6	21701	21706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210327
509	NC_015948	CGG	2	6	21713	21718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210327
510	NC_015948	GCG	2	6	21724	21729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210327
511	NC_015948	GACC	2	8	21749	21756	25 %	0 %	25 %	50 %	344210327
512	NC_015948	CGC	3	9	21809	21817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210327
513	NC_015948	CGA	2	6	21848	21853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210327
514	NC_015948	GCC	2	6	21915	21920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210327
515	NC_015948	CTT	2	6	21941	21946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210327
516	NC_015948	CGG	2	6	21989	21994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210327
517	NC_015948	TGGTC	2	10	22004	22013	0 %	40 %	40 %	20 %	344210327
518	NC_015948	ACC	2	6	22051	22056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210327
519	NC_015948	CGG	2	6	22079	22084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210327
520	NC_015948	TGCG	2	8	22128	22135	0 %	25 %	50 %	25 %	344210328
521	NC_015948	CGC	2	6	22204	22209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210328
522	NC_015948	GGC	2	6	22216	22221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210328
523	NC_015948	CGA	2	6	22255	22260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210328
524	NC_015948	CTG	2	6	22262	22267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210328
525	NC_015948	ACG	2	6	22352	22357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210328
526	NC_015948	TGA	2	6	22360	22365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210328
527	NC_015948	GAA	2	6	22370	22375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210328
528	NC_015948	TGAC	2	8	22390	22397	25 %	25 %	25 %	25 %	344210328
529	NC_015948	GTC	2	6	23164	23169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210329
530	NC_015948	CGT	3	9	23205	23213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210329
531	NC_015948	CTT	2	6	23271	23276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210329
532	NC_015948	CGT	2	6	23319	23324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210329
533	NC_015948	CCG	2	6	23336	23341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210329
534	NC_015948	TGA	2	6	23352	23357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210329
535	NC_015948	TGG	2	6	23366	23371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210329
536	NC_015948	GTCG	2	8	23389	23396	0 %	25 %	50 %	25 %	344210329
537	NC_015948	GTC	2	6	23422	23427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210329
538	NC_015948	ACC	2	6	23453	23458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210329
539	NC_015948	CCG	2	6	23477	23482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210329
540	NC_015948	CCGA	2	8	23669	23676	25 %	0 %	25 %	50 %	344210330
541	NC_015948	ACC	2	6	23682	23687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210330
542	NC_015948	CGGT	2	8	23730	23737	0 %	25 %	50 %	25 %	344210330
543	NC_015948	TCG	3	9	23772	23780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210330
544	NC_015948	GCT	2	6	23801	23806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210330
545	NC_015948	CGGT	2	8	23835	23842	0 %	25 %	50 %	25 %	344210330
546	NC_015948	CGC	2	6	23854	23859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210330
547	NC_015948	CGAA	2	8	23928	23935	50 %	0 %	25 %	25 %	344210330
548	NC_015948	GTC	2	6	23945	23950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210330
549	NC_015948	GTCG	2	8	24050	24057	0 %	25 %	50 %	25 %	344210330
550	NC_015948	GGCG	2	8	24067	24074	0 %	0 %	75 %	25 %	344210330
551	NC_015948	CGA	2	6	24085	24090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210330
552	NC_015948	GC	3	6	24112	24117	0 %	0 %	50 %	50 %	344210330
553	NC_015948	GTCAG	2	10	24144	24153	20 %	20 %	40 %	20 %	344210330
554	NC_015948	GTC	2	6	24279	24284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210330
555	NC_015948	ACGG	2	8	24338	24345	25 %	0 %	50 %	25 %	344210330
556	NC_015948	CCCG	2	8	24395	24402	0 %	0 %	25 %	75 %	344210330
557	NC_015948	GTTC	2	8	24409	24416	0 %	50 %	25 %	25 %	344210330
558	NC_015948	CGA	2	6	24421	24426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210330
559	NC_015948	CGG	2	6	24454	24459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210330
560	NC_015948	CGG	2	6	24496	24501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210330
561	NC_015948	GCC	2	6	24525	24530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210330
562	NC_015948	GGC	2	6	24596	24601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210330
563	NC_015948	GC	3	6	24672	24677	0 %	0 %	50 %	50 %	344210330
564	NC_015948	CAG	2	6	24716	24721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210330
565	NC_015948	CGG	2	6	24739	24744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210330
566	NC_015948	CGT	2	6	24758	24763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210330
567	NC_015948	CGC	2	6	24811	24816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210330
568	NC_015948	GGA	2	6	24859	24864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210330
569	NC_015948	GTC	2	6	24867	24872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210330
570	NC_015948	CCG	2	6	24874	24879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210330
571	NC_015948	TCG	2	6	24922	24927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210330
572	NC_015948	CT	3	6	24959	24964	0 %	50 %	0 %	50 %	344210330
573	NC_015948	TCGCTG	2	12	24996	25007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210330
574	NC_015948	GACTC	2	10	25027	25036	20 %	20 %	20 %	40 %	344210330
575	NC_015948	GAC	2	6	25275	25280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210331
576	NC_015948	CGAA	2	8	25295	25302	50 %	0 %	25 %	25 %	344210331
577	NC_015948	GGC	2	6	25338	25343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210331
578	NC_015948	GTG	2	6	25349	25354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210331
579	NC_015948	AGCC	2	8	25389	25396	25 %	0 %	25 %	50 %	344210331
580	NC_015948	CGTCGA	2	12	25421	25432	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344210331
581	NC_015948	GTCG	2	8	25458	25465	0 %	25 %	50 %	25 %	344210331
582	NC_015948	TCA	3	9	25480	25488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210331
583	NC_015948	TGG	2	6	25489	25494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210331
584	NC_015948	CCG	2	6	25506	25511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210331
585	NC_015948	CGCT	2	8	25515	25522	0 %	25 %	25 %	50 %	344210331
586	NC_015948	GAG	2	6	25563	25568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210331
587	NC_015948	TCCGAA	2	12	25599	25610	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	344210331
588	NC_015948	CGA	2	6	25634	25639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210331
589	NC_015948	GACG	2	8	25640	25647	25 %	0 %	50 %	25 %	344210331
590	NC_015948	CGA	3	9	25655	25663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210331
591	NC_015948	CGGC	2	8	25664	25671	0 %	0 %	50 %	50 %	344210331
592	NC_015948	CCG	2	6	25818	25823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210332
593	NC_015948	CGA	2	6	25824	25829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210332
594	NC_015948	CGC	2	6	25861	25866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210332
595	NC_015948	CGA	2	6	25912	25917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210332
596	NC_015948	AATC	2	8	25935	25942	50 %	25 %	0 %	25 %	344210332
597	NC_015948	GGCGAC	2	12	25943	25954	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	344210332
598	NC_015948	TCG	2	6	26004	26009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210332
599	NC_015948	CGG	2	6	26029	26034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210332
600	NC_015948	CGT	2	6	26044	26049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210332
601	NC_015948	CGG	2	6	26059	26064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210332
602	NC_015948	GAC	2	6	26089	26094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210332
603	NC_015948	CTG	2	6	26123	26128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210332
604	NC_015948	TGA	2	6	26130	26135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210332
605	NC_015948	ACC	2	6	26147	26152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210332
606	NC_015948	CGA	2	6	26182	26187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210332
607	NC_015948	CGA	2	6	26233	26238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210332
608	NC_015948	CCG	2	6	26260	26265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210332
609	NC_015948	TGA	2	6	26280	26285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210332
610	NC_015948	TCC	2	6	26331	26336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210332
611	NC_015948	TCG	2	6	26370	26375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210332
612	NC_015948	GGC	2	6	26377	26382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210332
613	NC_015948	GCG	2	6	26391	26396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210332
614	NC_015948	CGC	2	6	26439	26444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210332
615	NC_015948	GTG	2	6	26480	26485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210332
616	NC_015948	TCG	2	6	26495	26500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210332
617	NC_015948	CTC	2	6	26506	26511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210332
618	NC_015948	CGG	2	6	26542	26547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210332
619	NC_015948	GAC	2	6	26651	26656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210333
620	NC_015948	CCA	2	6	26680	26685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210333
621	NC_015948	TCGC	2	8	26721	26728	0 %	25 %	25 %	50 %	344210333
622	NC_015948	TTGT	2	8	26786	26793	0 %	75 %	25 %	0 %	344210333
623	NC_015948	GTC	2	6	26828	26833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210333
624	NC_015948	GCC	2	6	26844	26849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210333
625	NC_015948	GAC	2	6	26852	26857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210333
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629	NC_015948	ACG	2	6	26974	26979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210333
630	NC_015948	CGG	2	6	26983	26988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210333
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646	NC_015948	CG	3	6	27768	27773	0 %	0 %	50 %	50 %	344210334
647	NC_015948	GGC	2	6	27785	27790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210334
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746	NC_015948	CAC	2	6	32259	32264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210340
747	NC_015948	CGGTT	2	10	32272	32281	0 %	40 %	40 %	20 %	344210340
748	NC_015948	CGC	2	6	32285	32290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210340
749	NC_015948	CA	3	6	32317	32322	50 %	0 %	0 %	50 %	344210340
750	NC_015948	CGT	2	6	32333	32338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210340
751	NC_015948	GGC	2	6	32442	32447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210340
752	NC_015948	CGA	2	6	32517	32522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210341
753	NC_015948	GGC	2	6	32598	32603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210341
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759	NC_015948	CG	3	6	32973	32978	0 %	0 %	50 %	50 %	344210342
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867	NC_015948	CGA	2	6	37687	37692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210346
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871	NC_015948	ACG	2	6	37833	37838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210346
872	NC_015948	CGC	2	6	37855	37860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210346
873	NC_015948	GAC	2	6	37867	37872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210346
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875	NC_015948	CTC	2	6	37916	37921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210346
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1000	NC_015948	CCT	2	6	43163	43168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210349

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