MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 67255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_015948	CGA	2	6	305619	305624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210613
7002	NC_015948	CTCG	2	8	305664	305671	0 %	25 %	25 %	50 %	344210613
7003	NC_015948	CCG	2	6	305677	305682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210613
7004	NC_015948	TCG	2	6	305729	305734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210613
7005	NC_015948	ACA	2	6	305735	305740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210613
7006	NC_015948	CCT	2	6	305787	305792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210613
7007	NC_015948	CGA	3	9	305801	305809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210613
7008	NC_015948	CGG	2	6	305838	305843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210613
7009	NC_015948	TCG	2	6	305849	305854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210613
7010	NC_015948	CGG	2	6	305856	305861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210613
7011	NC_015948	GCG	2	6	305906	305911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210613
7012	NC_015948	CGC	2	6	305970	305975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210613
7013	NC_015948	GC	3	6	305982	305987	0 %	0 %	50 %	50 %	344210613
7014	NC_015948	CGA	2	6	306111	306116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210613
7015	NC_015948	CAG	2	6	306181	306186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210613
7016	NC_015948	CGG	2	6	306195	306200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210613
7017	NC_015948	CGG	2	6	306204	306209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210613
7018	NC_015948	GGC	2	6	306232	306237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210613
7019	NC_015948	GCCG	2	8	306244	306251	0 %	0 %	50 %	50 %	344210613
7020	NC_015948	GAG	2	6	306262	306267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210613
7021	NC_015948	ACC	2	6	306334	306339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210613
7022	NC_015948	GCG	2	6	306374	306379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210613
7023	NC_015948	CCT	2	6	306390	306395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210613
7024	NC_015948	CAT	2	6	306429	306434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210613
7025	NC_015948	CGA	2	6	306444	306449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210613
7026	NC_015948	AACAC	2	10	306478	306487	60 %	0 %	0 %	40 %	344210614
7027	NC_015948	CGAGTT	2	12	306500	306511	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	344210614
7028	NC_015948	GCG	2	6	306517	306522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210614
7029	NC_015948	GCCG	2	8	306624	306631	0 %	0 %	50 %	50 %	344210614
7030	NC_015948	TGG	2	6	306666	306671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210614
7031	NC_015948	GAC	2	6	306672	306677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210614
7032	NC_015948	TCG	2	6	306679	306684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210614
7033	NC_015948	TAC	2	6	306714	306719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210614
7034	NC_015948	GTC	2	6	306720	306725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210614
7035	NC_015948	CCG	2	6	306813	306818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210614
7036	NC_015948	GGACT	2	10	306830	306839	20 %	20 %	40 %	20 %	344210614
7037	NC_015948	GC	4	8	306848	306855	0 %	0 %	50 %	50 %	344210614
7038	NC_015948	CGA	2	6	306860	306865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210614
7039	NC_015948	GTC	2	6	306891	306896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210614
7040	NC_015948	GGC	2	6	306897	306902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210614
7041	NC_015948	CGG	2	6	306908	306913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210614
7042	NC_015948	CGC	2	6	306974	306979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210614
7043	NC_015948	CG	3	6	306983	306988	0 %	0 %	50 %	50 %	344210614
7044	NC_015948	AC	3	6	306994	306999	50 %	0 %	0 %	50 %	344210614
7045	NC_015948	CTCG	2	8	307007	307014	0 %	25 %	25 %	50 %	344210614
7046	NC_015948	CGAC	2	8	307039	307046	25 %	0 %	25 %	50 %	344210614
7047	NC_015948	ACT	2	6	307066	307071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210614
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7049	NC_015948	GCTGGC	2	12	307103	307114	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344210614
7050	NC_015948	GCC	2	6	307171	307176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210614
7051	NC_015948	GCC	2	6	307179	307184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210614
7052	NC_015948	CGC	2	6	307217	307222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210614
7053	NC_015948	TTC	2	6	307230	307235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210614
7054	NC_015948	CTACCT	2	12	307307	307318	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	344210614
7055	NC_015948	CGC	2	6	307346	307351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210614
7056	NC_015948	GACGCG	2	12	307365	307376	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	344210614
7057	NC_015948	GGC	2	6	307379	307384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210614
7058	NC_015948	CCG	2	6	307417	307422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210614
7059	NC_015948	CAC	2	6	307433	307438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210614
7060	NC_015948	CAG	2	6	307440	307445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210614
7061	NC_015948	GGC	2	6	307472	307477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210614
7062	NC_015948	CAC	2	6	307494	307499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210614
7063	NC_015948	ACG	2	6	307522	307527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210614
7064	NC_015948	TCG	2	6	307534	307539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210614
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7067	NC_015948	GAG	2	6	307823	307828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210615
7068	NC_015948	TTCG	2	8	307831	307838	0 %	50 %	25 %	25 %	344210615
7069	NC_015948	ACG	2	6	307851	307856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210615
7070	NC_015948	CGA	2	6	307891	307896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210615
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7072	NC_015948	GCT	2	6	307992	307997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210615
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7082	NC_015948	G	6	6	308403	308408	0 %	0 %	100 %	0 %	344210616
7083	NC_015948	GCCG	2	8	308415	308422	0 %	0 %	50 %	50 %	344210616
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7102	NC_015948	GC	3	6	309127	309132	0 %	0 %	50 %	50 %	344210617
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7120	NC_015948	CTTC	2	8	309867	309874	0 %	50 %	0 %	50 %	344210618
7121	NC_015948	CGT	2	6	309915	309920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210618
7122	NC_015948	CGTG	2	8	309939	309946	0 %	25 %	50 %	25 %	344210618
7123	NC_015948	TCG	2	6	309977	309982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210618
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7125	NC_015948	CGG	2	6	310029	310034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210618
7126	NC_015948	CGG	2	6	310044	310049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210618
7127	NC_015948	GCAA	2	8	310106	310113	50 %	0 %	25 %	25 %	344210618
7128	NC_015948	GC	3	6	310118	310123	0 %	0 %	50 %	50 %	344210618
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7137	NC_015948	ACG	2	6	310655	310660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210618
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7139	NC_015948	ACC	2	6	310780	310785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210618
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7152	NC_015948	ACG	2	6	311297	311302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210619
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7174	NC_015948	GAC	2	6	312260	312265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210620
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7238	NC_015948	CGT	2	6	315952	315957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210625
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7241	NC_015948	GTCGA	2	10	316049	316058	20 %	20 %	40 %	20 %	344210625
7242	NC_015948	CGG	2	6	316071	316076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210625
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7359	NC_015948	GGCC	2	8	321202	321209	0 %	0 %	50 %	50 %	344210634
7360	NC_015948	CCGGG	2	10	321214	321223	0 %	0 %	60 %	40 %	344210634
7361	NC_015948	CAGGG	2	10	321279	321288	20 %	0 %	60 %	20 %	344210634
7362	NC_015948	CCG	2	6	321303	321308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210634
7363	NC_015948	GAC	2	6	321347	321352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210634
7364	NC_015948	GAC	2	6	321370	321375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210634
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7370	NC_015948	GAC	2	6	321587	321592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210634
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7374	NC_015948	CTG	2	6	321727	321732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210635
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7477	NC_015948	GCGA	2	8	326020	326027	25 %	0 %	50 %	25 %	344210640
7478	NC_015948	ACGA	2	8	326060	326067	50 %	0 %	25 %	25 %	344210640
7479	NC_015948	GTCT	2	8	326086	326093	0 %	50 %	25 %	25 %	344210640
7480	NC_015948	CTG	2	6	326131	326136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210640
7481	NC_015948	ACC	2	6	326141	326146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210640
7482	NC_015948	GCG	2	6	326186	326191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210640
7483	NC_015948	TCG	2	6	326249	326254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210640
7484	NC_015948	TCG	2	6	326258	326263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210640
7485	NC_015948	ATC	2	6	326308	326313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210640
7486	NC_015948	CGA	2	6	326328	326333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210640
7487	NC_015948	GACGA	2	10	326335	326344	40 %	0 %	40 %	20 %	344210640
7488	NC_015948	CGC	2	6	326412	326417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210640
7489	NC_015948	GGC	2	6	326437	326442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210640
7490	NC_015948	GGC	2	6	326502	326507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210640
7491	NC_015948	CGA	2	6	326508	326513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210640
7492	NC_015948	TCG	4	12	326665	326676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210641
7493	NC_015948	GAC	2	6	326723	326728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210641
7494	NC_015948	TCG	2	6	326809	326814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210641
7495	NC_015948	ACGC	2	8	326845	326852	25 %	0 %	25 %	50 %	344210641
7496	NC_015948	ACT	2	6	327034	327039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210642
7497	NC_015948	ACG	2	6	327085	327090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210642
7498	NC_015948	CAG	2	6	327123	327128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210642
7499	NC_015948	CCGA	2	8	327192	327199	25 %	0 %	25 %	50 %	344210642
7500	NC_015948	ATC	2	6	327213	327218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210642

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