MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 67255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_015948	CCGA	2	8	283934	283941	25 %	0 %	25 %	50 %	344210593
6502	NC_015948	ACC	2	6	284018	284023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210593
6503	NC_015948	TCG	2	6	284025	284030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210593
6504	NC_015948	ACG	2	6	284061	284066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210593
6505	NC_015948	CGA	2	6	284106	284111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210593
6506	NC_015948	AGCG	2	8	284162	284169	25 %	0 %	50 %	25 %	344210593
6507	NC_015948	CGG	2	6	284232	284237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210593
6508	NC_015948	ACG	2	6	284280	284285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210593
6509	NC_015948	TGA	2	6	284298	284303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210593
6510	NC_015948	GAG	2	6	284336	284341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210593
6511	NC_015948	TCG	2	6	284382	284387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210593
6512	NC_015948	CGG	2	6	284404	284409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210593
6513	NC_015948	GCC	2	6	284479	284484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210593
6514	NC_015948	CGT	2	6	284547	284552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210593
6515	NC_015948	CGG	2	6	284557	284562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210593
6516	NC_015948	ACT	2	6	284580	284585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210593
6517	NC_015948	TGA	2	6	284665	284670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210593
6518	NC_015948	ACG	2	6	284676	284681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210593
6519	NC_015948	CG	3	6	284718	284723	0 %	0 %	50 %	50 %	344210593
6520	NC_015948	GC	3	6	284729	284734	0 %	0 %	50 %	50 %	344210593
6521	NC_015948	GAG	2	6	284756	284761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210593
6522	NC_015948	GAA	2	6	284840	284845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210593
6523	NC_015948	GAG	2	6	284885	284890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210593
6524	NC_015948	AC	3	6	284917	284922	50 %	0 %	0 %	50 %	344210593
6525	NC_015948	ACT	2	6	285089	285094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210594
6526	NC_015948	TAGA	2	8	285101	285108	50 %	25 %	25 %	0 %	344210594
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6528	NC_015948	CCGG	2	8	285244	285251	0 %	0 %	50 %	50 %	344210595
6529	NC_015948	ACTC	2	8	285304	285311	25 %	25 %	0 %	50 %	344210595
6530	NC_015948	CTC	2	6	285317	285322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210595
6531	NC_015948	CGTA	2	8	285615	285622	25 %	25 %	25 %	25 %	344210596
6532	NC_015948	GCGA	2	8	285639	285646	25 %	0 %	50 %	25 %	344210596
6533	NC_015948	CGA	2	6	285667	285672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210596
6534	NC_015948	CGG	2	6	285836	285841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210596
6535	NC_015948	CGC	2	6	285864	285869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210596
6536	NC_015948	CG	3	6	285916	285921	0 %	0 %	50 %	50 %	344210596
6537	NC_015948	CT	3	6	285966	285971	0 %	50 %	0 %	50 %	344210596
6538	NC_015948	CGA	2	6	285984	285989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210596
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6540	NC_015948	CAAG	2	8	286023	286030	50 %	0 %	25 %	25 %	344210596
6541	NC_015948	GGC	2	6	286038	286043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210596
6542	NC_015948	AGG	2	6	286049	286054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210596
6543	NC_015948	GAG	2	6	286057	286062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210596
6544	NC_015948	GAG	2	6	286195	286200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210596
6545	NC_015948	GTC	2	6	286225	286230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210596
6546	NC_015948	AAGC	2	8	286262	286269	50 %	0 %	25 %	25 %	344210596
6547	NC_015948	ACGA	2	8	286393	286400	50 %	0 %	25 %	25 %	344210596
6548	NC_015948	GAA	2	6	286417	286422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210596
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6550	NC_015948	CGA	2	6	286551	286556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210596
6551	NC_015948	TGAC	2	8	286562	286569	25 %	25 %	25 %	25 %	344210596
6552	NC_015948	GAC	2	6	286585	286590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210596
6553	NC_015948	GAT	2	6	286615	286620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210596
6554	NC_015948	CGG	2	6	286683	286688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210596
6555	NC_015948	GTC	2	6	286702	286707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210596
6556	NC_015948	GGA	2	6	286731	286736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210596
6557	NC_015948	GGC	2	6	286743	286748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210596
6558	NC_015948	CGA	2	6	286752	286757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210596
6559	NC_015948	CGA	2	6	286794	286799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210596
6560	NC_015948	CGA	2	6	286806	286811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210596
6561	NC_015948	AG	3	6	286825	286830	50 %	0 %	50 %	0 %	344210596
6562	NC_015948	TGAC	2	8	286886	286893	25 %	25 %	25 %	25 %	344210596
6563	NC_015948	CGA	2	6	286899	286904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210596
6564	NC_015948	CGAC	2	8	286937	286944	25 %	0 %	25 %	50 %	344210596
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6566	NC_015948	ATCG	2	8	287119	287126	25 %	25 %	25 %	25 %	344210596
6567	NC_015948	ACGG	2	8	287167	287174	25 %	0 %	50 %	25 %	344210596
6568	NC_015948	ACCG	2	8	287181	287188	25 %	0 %	25 %	50 %	344210596
6569	NC_015948	ACA	2	6	287193	287198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210596
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6575	NC_015948	CGT	2	6	287304	287309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210597
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6589	NC_015948	TCG	2	6	287580	287585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210597
6590	NC_015948	CGT	2	6	287648	287653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210597
6591	NC_015948	CGA	2	6	287668	287673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210597
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6593	NC_015948	GTT	2	6	287710	287715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210597
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6599	NC_015948	CGA	2	6	288089	288094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210598
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6602	NC_015948	GCG	2	6	288343	288348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210598
6603	NC_015948	CGA	2	6	288371	288376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210598
6604	NC_015948	CT	3	6	288441	288446	0 %	50 %	0 %	50 %	344210598
6605	NC_015948	GC	3	6	288479	288484	0 %	0 %	50 %	50 %	344210598
6606	NC_015948	CGGCGA	2	12	288494	288505	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	344210598
6607	NC_015948	GCG	2	6	288655	288660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210598
6608	NC_015948	CGC	3	9	288686	288694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210598
6609	NC_015948	CGG	2	6	288718	288723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210598
6610	NC_015948	TTC	3	9	288750	288758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210598
6611	NC_015948	GTC	2	6	288852	288857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210598
6612	NC_015948	GAC	2	6	288858	288863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210598
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6614	NC_015948	GACC	2	8	288887	288894	25 %	0 %	25 %	50 %	344210598
6615	NC_015948	AGC	2	6	288895	288900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210598
6616	NC_015948	CGA	2	6	288908	288913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210598
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6620	NC_015948	CG	3	6	288988	288993	0 %	0 %	50 %	50 %	344210598
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6978	NC_015948	CGA	2	6	304354	304359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210612
6979	NC_015948	CCG	2	6	304475	304480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210612
6980	NC_015948	CGC	2	6	304498	304503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210612
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6982	NC_015948	GAA	2	6	304610	304615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210612
6983	NC_015948	ACG	2	6	304728	304733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210612
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6986	NC_015948	CAG	2	6	304913	304918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210612
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6996	NC_015948	GGC	2	6	305521	305526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210613
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6999	NC_015948	TCG	2	6	305579	305584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210613
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