MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 67255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
64501	NC_015948	GGAC	2	8	2878063	2878070	25 %	0 %	50 %	25 %	344213234
64502	NC_015948	GTC	2	6	2878079	2878084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213234
64503	NC_015948	TGG	2	6	2878110	2878115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344213234
64504	NC_015948	GCG	3	9	2878179	2878187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213234
64505	NC_015948	CCA	2	6	2878195	2878200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344213234
64506	NC_015948	GGT	2	6	2878222	2878227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344213234
64507	NC_015948	GCC	2	6	2878241	2878246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213234
64508	NC_015948	CTC	2	6	2878250	2878255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344213234
64509	NC_015948	GCC	2	6	2878256	2878261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213234
64510	NC_015948	CGT	2	6	2878270	2878275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213234
64511	NC_015948	GGAC	2	8	2878324	2878331	25 %	0 %	50 %	25 %	344213234
64512	NC_015948	CGA	2	6	2878357	2878362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213234
64513	NC_015948	GAC	2	6	2878472	2878477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213234
64514	NC_015948	CGT	2	6	2878498	2878503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213234
64515	NC_015948	TGA	2	6	2878504	2878509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344213234
64516	NC_015948	CAGCG	2	10	2878514	2878523	20 %	0 %	40 %	40 %	344213234
64517	NC_015948	CCA	2	6	2878543	2878548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344213234
64518	NC_015948	CCG	2	6	2878564	2878569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213234
64519	NC_015948	CGC	2	6	2878585	2878590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213234
64520	NC_015948	GAG	2	6	2878646	2878651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344213234
64521	NC_015948	CGC	2	6	2878663	2878668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213234
64522	NC_015948	CGT	2	6	2878687	2878692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213234
64523	NC_015948	CGA	2	6	2878723	2878728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213234
64524	NC_015948	TCC	3	9	2878764	2878772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344213234
64525	NC_015948	TCGC	2	8	2878775	2878782	0 %	25 %	25 %	50 %	344213234
64526	NC_015948	GGC	2	6	2878832	2878837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213234
64527	NC_015948	TGGC	2	8	2878908	2878915	0 %	25 %	50 %	25 %	344213234
64528	NC_015948	TCGGCG	2	12	2878969	2878980	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344213234
64529	NC_015948	CG	3	6	2879015	2879020	0 %	0 %	50 %	50 %	344213234
64530	NC_015948	CGT	2	6	2879068	2879073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213234
64531	NC_015948	GTG	2	6	2879115	2879120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344213234
64532	NC_015948	CCA	2	6	2879134	2879139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344213234
64533	NC_015948	CGCC	2	8	2879174	2879181	0 %	0 %	25 %	75 %	344213234
64534	NC_015948	CCGT	2	8	2879184	2879191	0 %	25 %	25 %	50 %	344213234
64535	NC_015948	CGT	2	6	2879224	2879229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213234
64536	NC_015948	CGA	2	6	2879410	2879415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213235
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64538	NC_015948	CG	3	6	2879524	2879529	0 %	0 %	50 %	50 %	344213235
64539	NC_015948	CGT	2	6	2879551	2879556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213235
64540	NC_015948	GGA	2	6	2879620	2879625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344213235
64541	NC_015948	TGG	2	6	2879670	2879675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344213236
64542	NC_015948	GC	3	6	2879700	2879705	0 %	0 %	50 %	50 %	344213236
64543	NC_015948	TC	3	6	2879706	2879711	0 %	50 %	0 %	50 %	344213236
64544	NC_015948	TCG	2	6	2879952	2879957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213237
64545	NC_015948	GGCC	2	8	2879974	2879981	0 %	0 %	50 %	50 %	344213237
64546	NC_015948	CGG	2	6	2879989	2879994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213237
64547	NC_015948	ACG	2	6	2880015	2880020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213237
64548	NC_015948	GCC	2	6	2880057	2880062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213237
64549	NC_015948	CCG	2	6	2880072	2880077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213237
64550	NC_015948	GC	3	6	2880148	2880153	0 %	0 %	50 %	50 %	344213237
64551	NC_015948	CGC	2	6	2880164	2880169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213237
64552	NC_015948	CGT	2	6	2880241	2880246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213237
64553	NC_015948	CCGG	2	8	2880297	2880304	0 %	0 %	50 %	50 %	344213237
64554	NC_015948	GGCG	2	8	2880368	2880375	0 %	0 %	75 %	25 %	344213237
64555	NC_015948	TCG	2	6	2880376	2880381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213237
64556	NC_015948	CCA	2	6	2880382	2880387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344213237
64557	NC_015948	GTC	2	6	2880401	2880406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213237
64558	NC_015948	GTC	2	6	2880456	2880461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213237
64559	NC_015948	GCCC	2	8	2880492	2880499	0 %	0 %	25 %	75 %	344213237
64560	NC_015948	CGT	2	6	2880500	2880505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213237
64561	NC_015948	CCG	2	6	2880538	2880543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213237
64562	NC_015948	TCC	2	6	2880588	2880593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344213237
64563	NC_015948	GCG	2	6	2880597	2880602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213237
64564	NC_015948	ACCG	2	8	2880607	2880614	25 %	0 %	25 %	50 %	344213237
64565	NC_015948	GCC	2	6	2880642	2880647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213237
64566	NC_015948	CGC	2	6	2880674	2880679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213237
64567	NC_015948	GCC	2	6	2881013	2881018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213238
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64569	NC_015948	CGA	2	6	2881072	2881077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213238
64570	NC_015948	GCT	2	6	2881090	2881095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213238
64571	NC_015948	GCCGA	2	10	2881110	2881119	20 %	0 %	40 %	40 %	344213238
64572	NC_015948	CG	3	6	2881146	2881151	0 %	0 %	50 %	50 %	344213238
64573	NC_015948	AGT	2	6	2881240	2881245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344213239
64574	NC_015948	TCG	2	6	2881259	2881264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213239
64575	NC_015948	CGA	2	6	2881272	2881277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213239
64576	NC_015948	CGA	2	6	2881290	2881295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213239
64577	NC_015948	GCG	2	6	2881307	2881312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213239
64578	NC_015948	GCG	2	6	2881328	2881333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213239
64579	NC_015948	GTC	2	6	2881336	2881341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213239
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64581	NC_015948	ATC	2	6	2881441	2881446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344213239
64582	NC_015948	ACCGGC	2	12	2881490	2881501	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	344213239
64583	NC_015948	GGTCG	2	10	2881525	2881534	0 %	20 %	60 %	20 %	344213239
64584	NC_015948	CGA	3	9	2881536	2881544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213239
64585	NC_015948	CGA	2	6	2881566	2881571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213239
64586	NC_015948	TCT	2	6	2881572	2881577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344213239
64587	NC_015948	GCT	2	6	2881589	2881594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213239
64588	NC_015948	GCC	2	6	2881615	2881620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213239
64589	NC_015948	TCG	2	6	2881628	2881633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213239
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64596	NC_015948	GGGC	2	8	2882287	2882294	0 %	0 %	75 %	25 %	344213240
64597	NC_015948	GGT	2	6	2882316	2882321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344213240
64598	NC_015948	CGAG	2	8	2882338	2882345	25 %	0 %	50 %	25 %	344213240
64599	NC_015948	GGC	2	6	2882361	2882366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213240
64600	NC_015948	TGG	2	6	2882369	2882374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344213240
64601	NC_015948	GA	3	6	2882384	2882389	50 %	0 %	50 %	0 %	344213240
64602	NC_015948	GCG	2	6	2882390	2882395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213240
64603	NC_015948	CGG	2	6	2882412	2882417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213240
64604	NC_015948	GCG	2	6	2882419	2882424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213240
64605	NC_015948	TGGCA	2	10	2882447	2882456	20 %	20 %	40 %	20 %	344213240
64606	NC_015948	GACGCC	2	12	2882458	2882469	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	344213240
64607	NC_015948	CCAG	2	8	2882598	2882605	25 %	0 %	25 %	50 %	344213240
64608	NC_015948	GCG	2	6	2882621	2882626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213240
64609	NC_015948	GCCA	2	8	2882644	2882651	25 %	0 %	25 %	50 %	344213240
64610	NC_015948	CGT	3	9	2882706	2882714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213240
64611	NC_015948	GCT	2	6	2882768	2882773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213240
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64613	NC_015948	GCGG	2	8	2882922	2882929	0 %	0 %	75 %	25 %	344213240
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64615	NC_015948	ACC	2	6	2883047	2883052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344213240
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64842	NC_015948	TCACCG	2	12	2893134	2893145	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	344213250
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