MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 67255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015948	CGG	2	6	260092	260097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210575
6002	NC_015948	CGG	2	6	260149	260154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210575
6003	NC_015948	GAT	2	6	260189	260194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210575
6004	NC_015948	TCG	2	6	260238	260243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210575
6005	NC_015948	CCG	2	6	260247	260252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210575
6006	NC_015948	TCG	2	6	260316	260321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210575
6007	NC_015948	CGG	2	6	260329	260334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210575
6008	NC_015948	TG	3	6	260350	260355	0 %	50 %	50 %	0 %	344210575
6009	NC_015948	GGT	2	6	260404	260409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210575
6010	NC_015948	GCC	2	6	260418	260423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210575
6011	NC_015948	GAC	2	6	260435	260440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210575
6012	NC_015948	TCG	2	6	260442	260447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210575
6013	NC_015948	TC	3	6	261007	261012	0 %	50 %	0 %	50 %	344210576
6014	NC_015948	TCG	2	6	261021	261026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210576
6015	NC_015948	CGA	2	6	261027	261032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210576
6016	NC_015948	CGT	2	6	261052	261057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210576
6017	NC_015948	TCG	2	6	261129	261134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210576
6018	NC_015948	CTG	2	6	261173	261178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210576
6019	NC_015948	GAC	2	6	261195	261200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210576
6020	NC_015948	CGTGAT	2	12	261358	261369	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	344210577
6021	NC_015948	GGC	2	6	261379	261384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210577
6022	NC_015948	GAG	2	6	261410	261415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210577
6023	NC_015948	CGA	2	6	261439	261444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210577
6024	NC_015948	C	6	6	261529	261534	0 %	0 %	0 %	100 %	344210577
6025	NC_015948	GTC	2	6	261536	261541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210577
6026	NC_015948	GAC	3	9	261563	261571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210577
6027	NC_015948	GCCG	2	8	261581	261588	0 %	0 %	50 %	50 %	344210577
6028	NC_015948	CG	3	6	261601	261606	0 %	0 %	50 %	50 %	344210577
6029	NC_015948	ACGT	2	8	261618	261625	25 %	25 %	25 %	25 %	344210577
6030	NC_015948	GCGA	2	8	261651	261658	25 %	0 %	50 %	25 %	344210577
6031	NC_015948	CGA	2	6	261667	261672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210577
6032	NC_015948	TCG	3	9	261732	261740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210577
6033	NC_015948	TG	3	6	261797	261802	0 %	50 %	50 %	0 %	344210577
6034	NC_015948	TCG	2	6	261819	261824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210577
6035	NC_015948	GCC	2	6	261866	261871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210577
6036	NC_015948	GTC	2	6	261881	261886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210577
6037	NC_015948	GCT	2	6	261914	261919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210577
6038	NC_015948	CGC	2	6	261935	261940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210577
6039	NC_015948	GCTG	2	8	261982	261989	0 %	25 %	50 %	25 %	344210577
6040	NC_015948	TCC	2	6	262009	262014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210578
6041	NC_015948	AGC	2	6	262026	262031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210578
6042	NC_015948	GAC	2	6	262058	262063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210578
6043	NC_015948	CGG	2	6	262087	262092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210578
6044	NC_015948	GCT	2	6	262125	262130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210578
6045	NC_015948	CCG	2	6	262156	262161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210578
6046	NC_015948	GCC	2	6	262181	262186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210578
6047	NC_015948	CTG	2	6	262220	262225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210578
6048	NC_015948	GTCG	2	8	262226	262233	0 %	25 %	50 %	25 %	344210578
6049	NC_015948	TCG	2	6	262272	262277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210578
6050	NC_015948	ACG	2	6	262278	262283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210578
6051	NC_015948	TCGT	2	8	262335	262342	0 %	50 %	25 %	25 %	344210578
6052	NC_015948	CGT	2	6	262367	262372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210578
6053	NC_015948	TCG	2	6	262404	262409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210578
6054	NC_015948	GAC	2	6	262440	262445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210578
6055	NC_015948	CGG	2	6	262447	262452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210578
6056	NC_015948	GTC	2	6	262481	262486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210578
6057	NC_015948	CGG	2	6	262501	262506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210578
6058	NC_015948	CGTA	2	8	262519	262526	25 %	25 %	25 %	25 %	344210578
6059	NC_015948	GCGG	2	8	262592	262599	0 %	0 %	75 %	25 %	344210578
6060	NC_015948	GTC	2	6	262634	262639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210578
6061	NC_015948	CTC	2	6	262766	262771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210578
6062	NC_015948	CGTTG	2	10	262835	262844	0 %	40 %	40 %	20 %	344210578
6063	NC_015948	CTC	2	6	262859	262864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210578
6064	NC_015948	GGT	2	6	262946	262951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210578
6065	NC_015948	ATG	2	6	262974	262979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210578
6066	NC_015948	GCC	2	6	263015	263020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210578
6067	NC_015948	CGCC	2	8	263056	263063	0 %	0 %	25 %	75 %	344210578
6068	NC_015948	CGA	2	6	263077	263082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210578
6069	NC_015948	GCT	2	6	263117	263122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210578
6070	NC_015948	CTC	2	6	263171	263176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210578
6071	NC_015948	TTC	2	6	263226	263231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210578
6072	NC_015948	GCCG	2	8	263312	263319	0 %	0 %	50 %	50 %	344210578
6073	NC_015948	CGT	2	6	263321	263326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210578
6074	NC_015948	GCC	2	6	263354	263359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210578
6075	NC_015948	CGG	2	6	263383	263388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210578
6076	NC_015948	TCG	2	6	263403	263408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210578
6077	NC_015948	CGG	2	6	263461	263466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210578
6078	NC_015948	CGC	3	9	263476	263484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210578
6079	NC_015948	TGACGG	2	12	263485	263496	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	344210578
6080	NC_015948	TGC	2	6	263510	263515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210578
6081	NC_015948	CGG	2	6	263551	263556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210578
6082	NC_015948	GAGTTC	2	12	263558	263569	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	344210578
6083	NC_015948	CCGAC	2	10	263584	263593	20 %	0 %	20 %	60 %	344210578
6084	NC_015948	CG	3	6	263606	263611	0 %	0 %	50 %	50 %	344210578
6085	NC_015948	CTG	3	9	263702	263710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210578
6086	NC_015948	GTA	2	6	263714	263719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210578
6087	NC_015948	ATCC	2	8	263740	263747	25 %	25 %	0 %	50 %	344210578
6088	NC_015948	CGA	2	6	263752	263757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210578
6089	NC_015948	AG	3	6	263758	263763	50 %	0 %	50 %	0 %	344210578
6090	NC_015948	GT	3	6	263920	263925	0 %	50 %	50 %	0 %	344210578
6091	NC_015948	CACT	2	8	263929	263936	25 %	25 %	0 %	50 %	344210578
6092	NC_015948	GGC	2	6	263937	263942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210578
6093	NC_015948	TGC	2	6	264005	264010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210578
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6099	NC_015948	GTT	2	6	264239	264244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210578
6100	NC_015948	GGTC	2	8	264271	264278	0 %	25 %	50 %	25 %	344210578
6101	NC_015948	CGT	2	6	264298	264303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210578
6102	NC_015948	GCG	3	9	264354	264362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210578
6103	NC_015948	CGC	2	6	264406	264411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210578
6104	NC_015948	CGA	2	6	264467	264472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210578
6105	NC_015948	GCCA	2	8	264474	264481	25 %	0 %	25 %	50 %	344210578
6106	NC_015948	CTG	2	6	264518	264523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210578
6107	NC_015948	TCG	2	6	264540	264545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210578
6108	NC_015948	CGT	2	6	264554	264559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210578
6109	NC_015948	CGA	2	6	264583	264588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210578
6110	NC_015948	CGA	2	6	264628	264633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210578
6111	NC_015948	CGC	2	6	264640	264645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210578
6112	NC_015948	CAG	2	6	264704	264709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210578
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6114	NC_015948	GTT	2	6	264779	264784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210578
6115	NC_015948	GGC	2	6	264796	264801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210578
6116	NC_015948	TTG	2	6	264846	264851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210578
6117	NC_015948	GTG	2	6	264952	264957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210578
6118	NC_015948	CGA	3	9	264970	264978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210578
6119	NC_015948	GCC	2	6	264986	264991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210578
6120	NC_015948	TCG	2	6	265005	265010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210578
6121	NC_015948	ATG	2	6	265056	265061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210578
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6237	NC_015948	CGT	2	6	270583	270588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210582
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6243	NC_015948	CGT	3	9	270904	270912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210582
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6352	NC_015948	CTCC	2	8	276217	276224	0 %	25 %	0 %	75 %	344210586
6353	NC_015948	CGATGT	2	12	276232	276243	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	344210586
6354	NC_015948	CGA	2	6	276337	276342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210586
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6357	NC_015948	CGA	2	6	276436	276441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210586
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6480	NC_015948	GTC	2	6	282577	282582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210591
6481	NC_015948	CCG	2	6	282656	282661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210591
6482	NC_015948	CGG	2	6	282711	282716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210591
6483	NC_015948	CGA	2	6	282732	282737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210591
6484	NC_015948	CGC	2	6	282774	282779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210591
6485	NC_015948	TGG	2	6	282780	282785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210591
6486	NC_015948	ACG	2	6	282878	282883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210591
6487	NC_015948	CGT	2	6	282927	282932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210591
6488	NC_015948	AGG	2	6	282935	282940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210591
6489	NC_015948	CCGGAA	2	12	283141	283152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210592
6490	NC_015948	CGG	2	6	283169	283174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210592
6491	NC_015948	GCG	2	6	283200	283205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210592
6492	NC_015948	TCG	2	6	283270	283275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210592
6493	NC_015948	TCG	2	6	283348	283353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210592
6494	NC_015948	CGG	2	6	283412	283417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210592
6495	NC_015948	GCACTC	2	12	283422	283433	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	344210592
6496	NC_015948	CTG	2	6	283443	283448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210592
6497	NC_015948	AGCGG	2	10	283482	283491	20 %	0 %	60 %	20 %	344210592
6498	NC_015948	CCG	2	6	283556	283561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210592
6499	NC_015948	TCG	3	9	283565	283573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210592
6500	NC_015948	GAC	2	6	283898	283903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210593

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