MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 67255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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63002	NC_015948	CGA	2	6	2813125	2813130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213170
63003	NC_015948	TCG	2	6	2813155	2813160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213170
63004	NC_015948	TCC	2	6	2813161	2813166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344213171
63005	NC_015948	TCG	2	6	2813176	2813181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213171
63006	NC_015948	TGG	2	6	2813212	2813217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344213171
63007	NC_015948	CCG	2	6	2813219	2813224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213171
63008	NC_015948	AAC	2	6	2813233	2813238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344213171
63009	NC_015948	GTCCA	2	10	2813576	2813585	20 %	20 %	20 %	40 %	344213172
63010	NC_015948	TG	3	6	2813683	2813688	0 %	50 %	50 %	0 %	344213172
63011	NC_015948	CGA	2	6	2813710	2813715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213172
63012	NC_015948	CGA	2	6	2813725	2813730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213172
63013	NC_015948	GTC	2	6	2813738	2813743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213172
63014	NC_015948	CAG	2	6	2813810	2813815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213172
63015	NC_015948	GCCG	2	8	2813828	2813835	0 %	0 %	50 %	50 %	344213172
63016	NC_015948	GAT	2	6	2813855	2813860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344213172
63017	NC_015948	CGG	2	6	2813872	2813877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213172
63018	NC_015948	GCC	2	6	2813993	2813998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213172
63019	NC_015948	CTC	2	6	2814041	2814046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344213172
63020	NC_015948	CGA	2	6	2814115	2814120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213172
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63022	NC_015948	GTC	2	6	2814270	2814275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213173
63023	NC_015948	CTT	2	6	2814280	2814285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344213173
63024	NC_015948	TCG	2	6	2814312	2814317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213173
63025	NC_015948	CTG	2	6	2814355	2814360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213173
63026	NC_015948	GGC	2	6	2814384	2814389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213173
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63028	NC_015948	TCGG	2	8	2814405	2814412	0 %	25 %	50 %	25 %	344213173
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63030	NC_015948	GGC	2	6	2814432	2814437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213173
63031	NC_015948	TCGG	2	8	2814453	2814460	0 %	25 %	50 %	25 %	344213173
63032	NC_015948	TTC	2	6	2814461	2814466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344213173
63033	NC_015948	TGG	2	6	2814479	2814484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344213173
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63035	NC_015948	TTCG	2	8	2814494	2814501	0 %	50 %	25 %	25 %	344213173
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63039	NC_015948	TTCG	2	8	2814542	2814549	0 %	50 %	25 %	25 %	344213173
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63048	NC_015948	TTCG	2	8	2814662	2814669	0 %	50 %	25 %	25 %	344213173
63049	NC_015948	GGC	2	6	2814672	2814677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213173
63050	NC_015948	GGC	2	6	2814696	2814701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213173
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63052	NC_015948	TTC	2	6	2814749	2814754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344213173
63053	NC_015948	CGT	2	6	2814823	2814828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213173
63054	NC_015948	CG	3	6	2814829	2814834	0 %	0 %	50 %	50 %	344213173
63055	NC_015948	ACGTC	2	10	2814889	2814898	20 %	20 %	20 %	40 %	344213173
63056	NC_015948	TTCG	2	8	2814905	2814912	0 %	50 %	25 %	25 %	344213173
63057	NC_015948	TGT	2	6	2815021	2815026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344213173
63058	NC_015948	CGG	2	6	2815030	2815035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213173
63059	NC_015948	TCG	2	6	2815042	2815047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213173
63060	NC_015948	CGT	2	6	2815105	2815110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213173
63061	NC_015948	TGG	2	6	2815180	2815185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344213173
63062	NC_015948	CGA	2	6	2815219	2815224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213173
63063	NC_015948	GTT	2	6	2815274	2815279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344213173
63064	NC_015948	CAG	2	6	2815300	2815305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213173
63065	NC_015948	GCC	2	6	2815433	2815438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213173
63066	NC_015948	GAC	2	6	2815439	2815444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213173
63067	NC_015948	GTGTGC	2	12	2815468	2815479	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	344213173
63068	NC_015948	ATG	2	6	2815485	2815490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344213173
63069	NC_015948	CGA	2	6	2815899	2815904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213174
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63071	NC_015948	GCG	2	6	2815965	2815970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213174
63072	NC_015948	CA	3	6	2815975	2815980	50 %	0 %	0 %	50 %	344213174
63073	NC_015948	GAT	2	6	2815987	2815992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344213174
63074	NC_015948	ACC	2	6	2816019	2816024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344213174
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63077	NC_015948	GC	3	6	2816104	2816109	0 %	0 %	50 %	50 %	344213174
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63079	NC_015948	CG	3	6	2816136	2816141	0 %	0 %	50 %	50 %	344213174
63080	NC_015948	GAC	2	6	2816173	2816178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213174
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63082	NC_015948	CGT	2	6	2816437	2816442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213174
63083	NC_015948	CGGC	2	8	2816458	2816465	0 %	0 %	50 %	50 %	344213174
63084	NC_015948	AG	3	6	2816497	2816502	50 %	0 %	50 %	0 %	344213174
63085	NC_015948	AGCG	2	8	2816512	2816519	25 %	0 %	50 %	25 %	344213174
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63088	NC_015948	AGCG	2	8	2816571	2816578	25 %	0 %	50 %	25 %	344213174
63089	NC_015948	GCC	2	6	2816609	2816614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213174
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63095	NC_015948	G	6	6	2816863	2816868	0 %	0 %	100 %	0 %	344213175
63096	NC_015948	CCG	2	6	2816900	2816905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213175
63097	NC_015948	GTC	2	6	2816930	2816935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213175
63098	NC_015948	GAG	2	6	2816999	2817004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344213175
63099	NC_015948	CGGC	2	8	2817038	2817045	0 %	0 %	50 %	50 %	344213175
63100	NC_015948	CGC	2	6	2817066	2817071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213175
63101	NC_015948	CGT	2	6	2817088	2817093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213175
63102	NC_015948	ATC	2	6	2817122	2817127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344213175
63103	NC_015948	AC	3	6	2817147	2817152	50 %	0 %	0 %	50 %	344213175
63104	NC_015948	AAG	2	6	2817197	2817202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344213175
63105	NC_015948	GAC	2	6	2817241	2817246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213175
63106	NC_015948	CCG	2	6	2817250	2817255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213175
63107	NC_015948	GAG	2	6	2817263	2817268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344213175
63108	NC_015948	CGAG	2	8	2817316	2817323	25 %	0 %	50 %	25 %	344213175
63109	NC_015948	CCA	2	6	2817382	2817387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344213175
63110	NC_015948	GAG	2	6	2817455	2817460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344213175
63111	NC_015948	ACG	2	6	2817468	2817473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213175
63112	NC_015948	CGA	2	6	2817549	2817554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213175
63113	NC_015948	TCC	2	6	2817609	2817614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344213175
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63115	NC_015948	GAA	2	6	2817727	2817732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344213175
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63225	NC_015948	TCGTC	2	10	2822586	2822595	0 %	40 %	20 %	40 %	344213181
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63227	NC_015948	CGG	2	6	2822625	2822630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213181
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63230	NC_015948	TGA	2	6	2822745	2822750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344213181
63231	NC_015948	GGT	2	6	2822770	2822775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344213181
63232	NC_015948	TGA	2	6	2822931	2822936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344213181
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63458	NC_015948	GAC	2	6	2833755	2833760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213191
63459	NC_015948	CCG	2	6	2833762	2833767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213191
63460	NC_015948	CG	3	6	2833836	2833841	0 %	0 %	50 %	50 %	344213191
63461	NC_015948	CGA	3	9	2833865	2833873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213191
63462	NC_015948	CAT	2	6	2833934	2833939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344213191
63463	NC_015948	TCGG	2	8	2833944	2833951	0 %	25 %	50 %	25 %	344213191
63464	NC_015948	TCGG	2	8	2833967	2833974	0 %	25 %	50 %	25 %	344213191
63465	NC_015948	CGT	2	6	2833979	2833984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213191
63466	NC_015948	CGA	2	6	2833985	2833990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213191
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63469	NC_015948	CGA	2	6	2834205	2834210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213192
63470	NC_015948	GTC	2	6	2834212	2834217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213192
63471	NC_015948	TCG	2	6	2834249	2834254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213192
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63481	NC_015948	CCT	2	6	2834726	2834731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344213193
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63487	NC_015948	GAC	2	6	2835248	2835253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213194
63488	NC_015948	GAC	2	6	2835286	2835291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213194
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63490	NC_015948	CGT	2	6	2835361	2835366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213194
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63492	NC_015948	GAC	2	6	2835530	2835535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213194
63493	NC_015948	CGC	3	9	2835593	2835601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213194
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