MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 67255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
61001	NC_015948	CGA	2	6	2724651	2724656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213081
61002	NC_015948	ACGGC	2	10	2724823	2724832	20 %	0 %	40 %	40 %	344213081
61003	NC_015948	GGAA	2	8	2725025	2725032	50 %	0 %	50 %	0 %	344213081
61004	NC_015948	CGA	2	6	2725086	2725091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213081
61005	NC_015948	CGGA	2	8	2725103	2725110	25 %	0 %	50 %	25 %	344213081
61006	NC_015948	TCG	2	6	2725113	2725118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213081
61007	NC_015948	TGGC	2	8	2725122	2725129	0 %	25 %	50 %	25 %	344213081
61008	NC_015948	CGA	2	6	2725215	2725220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213081
61009	NC_015948	CGG	2	6	2725236	2725241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213081
61010	NC_015948	GGC	2	6	2725309	2725314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213081
61011	NC_015948	TCA	3	9	2725319	2725327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344213081
61012	NC_015948	ACG	2	6	2725334	2725339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213081
61013	NC_015948	AAGG	2	8	2725387	2725394	50 %	0 %	50 %	0 %	344213081
61014	NC_015948	AAG	2	6	2725400	2725405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344213081
61015	NC_015948	TCT	2	6	2725451	2725456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344213081
61016	NC_015948	ACG	2	6	2725490	2725495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213081
61017	NC_015948	CGA	2	6	2725505	2725510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213081
61018	NC_015948	CGTGGT	2	12	2725511	2725522	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	344213081
61019	NC_015948	GCG	2	6	2725526	2725531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213081
61020	NC_015948	CT	3	6	2725564	2725569	0 %	50 %	0 %	50 %	344213081
61021	NC_015948	TCA	2	6	2725592	2725597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344213081
61022	NC_015948	GAC	2	6	2725696	2725701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213081
61023	NC_015948	TGGT	2	8	2725718	2725725	0 %	50 %	50 %	0 %	344213081
61024	NC_015948	TTC	2	6	2727173	2727178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344213083
61025	NC_015948	AGT	2	6	2727212	2727217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344213083
61026	NC_015948	TCT	2	6	2727230	2727235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344213083
61027	NC_015948	CGG	2	6	2727246	2727251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213083
61028	NC_015948	TC	3	6	2727275	2727280	0 %	50 %	0 %	50 %	344213083
61029	NC_015948	TC	3	6	2727290	2727295	0 %	50 %	0 %	50 %	344213083
61030	NC_015948	CTCA	2	8	2727301	2727308	25 %	25 %	0 %	50 %	344213083
61031	NC_015948	CGC	2	6	2728151	2728156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213084
61032	NC_015948	TCG	2	6	2728191	2728196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213084
61033	NC_015948	CGG	2	6	2728198	2728203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213084
61034	NC_015948	TC	3	6	2728276	2728281	0 %	50 %	0 %	50 %	344213084
61035	NC_015948	TCG	2	6	2728320	2728325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213084
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61037	NC_015948	CCG	2	6	2728350	2728355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213084
61038	NC_015948	GA	3	6	2728407	2728412	50 %	0 %	50 %	0 %	344213084
61039	NC_015948	ACG	2	6	2728419	2728424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213084
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61042	NC_015948	CAG	2	6	2728643	2728648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213084
61043	NC_015948	GTC	2	6	2728694	2728699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213084
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61047	NC_015948	GTA	2	6	2728805	2728810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344213084
61048	NC_015948	CCGC	2	8	2728823	2728830	0 %	0 %	25 %	75 %	344213084
61049	NC_015948	TCG	2	6	2728833	2728838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213084
61050	NC_015948	CGG	2	6	2728869	2728874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213084
61051	NC_015948	CGC	2	6	2728898	2728903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213084
61052	NC_015948	ACCG	2	8	2729008	2729015	25 %	0 %	25 %	50 %	344213084
61053	NC_015948	CGT	2	6	2729146	2729151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213084
61054	NC_015948	CTG	2	6	2729204	2729209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213084
61055	NC_015948	CCGA	2	8	2729211	2729218	25 %	0 %	25 %	50 %	344213084
61056	NC_015948	TCC	2	6	2729220	2729225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344213084
61057	NC_015948	CGC	2	6	2729374	2729379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213084
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61059	NC_015948	GTCA	2	8	2729781	2729788	25 %	25 %	25 %	25 %	344213085
61060	NC_015948	TCT	2	6	2729898	2729903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344213086
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61065	NC_015948	TGG	2	6	2730681	2730686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344213087
61066	NC_015948	ACCGG	2	10	2730695	2730704	20 %	0 %	40 %	40 %	344213087
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61071	NC_015948	GGA	2	6	2730901	2730906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344213088
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61081	NC_015948	GTC	2	6	2731189	2731194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213088
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61102	NC_015948	GCCCTT	2	12	2731927	2731938	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	344213088
61103	NC_015948	CTC	2	6	2731939	2731944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344213088
61104	NC_015948	CTT	2	6	2731947	2731952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344213088
61105	NC_015948	CGA	2	6	2732010	2732015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213088
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61110	NC_015948	CGA	2	6	2732536	2732541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213089
61111	NC_015948	CGA	2	6	2732674	2732679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213089
61112	NC_015948	CGTCGA	2	12	2732707	2732718	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344213089
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61114	NC_015948	GTC	2	6	2732867	2732872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213089
61115	NC_015948	CGC	2	6	2732896	2732901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344213089
61116	NC_015948	GC	3	6	2732947	2732952	0 %	0 %	50 %	50 %	344213089
61117	NC_015948	CGT	2	6	2733062	2733067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213089
61118	NC_015948	CGA	2	6	2733079	2733084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213089
61119	NC_015948	CGT	2	6	2733088	2733093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213089
61120	NC_015948	ACT	2	6	2733200	2733205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344213089
61121	NC_015948	TCGC	2	8	2733240	2733247	0 %	25 %	25 %	50 %	344213089
61122	NC_015948	CGA	2	6	2733253	2733258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213089
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61126	NC_015948	GC	4	8	2733415	2733422	0 %	0 %	50 %	50 %	344213090
61127	NC_015948	CGT	2	6	2733429	2733434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213090
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61130	NC_015948	GAT	2	6	2733544	2733549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344213090
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61197	NC_015948	GTC	2	6	2736507	2736512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213093
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61209	NC_015948	GTC	2	6	2737152	2737157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213093
61210	NC_015948	TCCT	2	8	2737236	2737243	0 %	50 %	0 %	50 %	344213093
61211	NC_015948	TTG	2	6	2737270	2737275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344213093
61212	NC_015948	CGA	2	6	2737358	2737363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213093
61213	NC_015948	CCA	2	6	2737364	2737369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344213093
61214	NC_015948	GC	3	6	2737370	2737375	0 %	0 %	50 %	50 %	344213093
61215	NC_015948	TGA	2	6	2737445	2737450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344213093
61216	NC_015948	GGT	2	6	2737451	2737456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344213093
61217	NC_015948	CGG	2	6	2737556	2737561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344213093
61218	NC_015948	GTC	2	6	2737563	2737568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213093
61219	NC_015948	CAG	2	6	2737590	2737595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213093
61220	NC_015948	TGTC	2	8	2737598	2737605	0 %	50 %	25 %	25 %	344213093
61221	NC_015948	GTC	2	6	2737609	2737614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213093
61222	NC_015948	AGC	2	6	2737632	2737637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213093
61223	NC_015948	CAG	3	9	2738047	2738055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344213094
61224	NC_015948	TCG	2	6	2738082	2738087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344213094
61225	NC_015948	CT	4	8	2738118	2738125	0 %	50 %	0 %	50 %	344213094
61226	NC_015948	GGA	2	6	2738126	2738131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344213094
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61228	NC_015948	GAGC	2	8	2738226	2738233	25 %	0 %	50 %	25 %	344213094
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