MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 67255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015948	ACA	2	6	241945	241950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210558
5502	NC_015948	GCGA	2	8	241989	241996	25 %	0 %	50 %	25 %	344210558
5503	NC_015948	GCGA	2	8	242019	242026	25 %	0 %	50 %	25 %	344210558
5504	NC_015948	ACC	2	6	242040	242045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210558
5505	NC_015948	TCG	2	6	242070	242075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210558
5506	NC_015948	CGA	2	6	242099	242104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210558
5507	NC_015948	TCG	2	6	242130	242135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210558
5508	NC_015948	TCG	2	6	242142	242147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210558
5509	NC_015948	CAG	2	6	242156	242161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210558
5510	NC_015948	TCG	2	6	242181	242186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210558
5511	NC_015948	GAG	3	9	242202	242210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210558
5512	NC_015948	GAC	2	6	242226	242231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210558
5513	NC_015948	TCGGCC	2	12	242263	242274	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344210558
5514	NC_015948	CCGC	2	8	242296	242303	0 %	0 %	25 %	75 %	344210558
5515	NC_015948	TCG	2	6	242335	242340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210558
5516	NC_015948	CTG	2	6	242361	242366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210558
5517	NC_015948	CGA	2	6	242369	242374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210558
5518	NC_015948	CGA	2	6	242390	242395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210558
5519	NC_015948	ACA	2	6	242401	242406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210558
5520	NC_015948	TG	3	6	242413	242418	0 %	50 %	50 %	0 %	344210558
5521	NC_015948	GGA	2	6	242435	242440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210558
5522	NC_015948	CG	3	6	242451	242456	0 %	0 %	50 %	50 %	344210558
5523	NC_015948	ACG	2	6	242467	242472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210558
5524	NC_015948	CAT	2	6	242477	242482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210558
5525	NC_015948	GCG	2	6	242488	242493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210558
5526	NC_015948	GGCC	2	8	242513	242520	0 %	0 %	50 %	50 %	344210558
5527	NC_015948	ATC	2	6	242532	242537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210558
5528	NC_015948	GCGACG	2	12	242550	242561	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	344210558
5529	NC_015948	GCC	2	6	242610	242615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210558
5530	NC_015948	GC	3	6	242623	242628	0 %	0 %	50 %	50 %	344210558
5531	NC_015948	ACC	2	6	242665	242670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210558
5532	NC_015948	CGC	3	9	242705	242713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210558
5533	NC_015948	AGG	2	6	242716	242721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210558
5534	NC_015948	ACCATC	2	12	242727	242738	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	344210558
5535	NC_015948	CGT	2	6	242828	242833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210558
5536	NC_015948	CGC	2	6	242837	242842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210558
5537	NC_015948	TCG	2	6	242869	242874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210558
5538	NC_015948	ACC	3	9	242922	242930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210558
5539	NC_015948	CTC	2	6	242931	242936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210558
5540	NC_015948	GAC	2	6	242964	242969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210558
5541	NC_015948	ACT	2	6	243007	243012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210558
5542	NC_015948	CGA	2	6	243073	243078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210559
5543	NC_015948	TCG	2	6	243084	243089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210559
5544	NC_015948	GGC	2	6	243106	243111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210559
5545	NC_015948	GACG	2	8	243118	243125	25 %	0 %	50 %	25 %	344210559
5546	NC_015948	CGA	3	9	243151	243159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210559
5547	NC_015948	CGG	2	6	243161	243166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210559
5548	NC_015948	GAG	2	6	243227	243232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210559
5549	NC_015948	GCC	2	6	243242	243247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210559
5550	NC_015948	GAG	2	6	243272	243277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210559
5551	NC_015948	CGGCGA	2	12	243363	243374	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	344210560
5552	NC_015948	ACGA	2	8	243403	243410	50 %	0 %	25 %	25 %	344210560
5553	NC_015948	CGG	2	6	243424	243429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210560
5554	NC_015948	CCG	2	6	243462	243467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210560
5555	NC_015948	TCG	2	6	243470	243475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210560
5556	NC_015948	AGG	3	9	243512	243520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210560
5557	NC_015948	GTC	2	6	243535	243540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210560
5558	NC_015948	GGC	2	6	243598	243603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210560
5559	NC_015948	CTC	2	6	243640	243645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210560
5560	NC_015948	GT	3	6	243673	243678	0 %	50 %	50 %	0 %	344210560
5561	NC_015948	CGA	3	9	243687	243695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210560
5562	NC_015948	CGGT	2	8	243698	243705	0 %	25 %	50 %	25 %	344210560
5563	NC_015948	ACGA	2	8	243725	243732	50 %	0 %	25 %	25 %	344210560
5564	NC_015948	CTC	2	6	243733	243738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210560
5565	NC_015948	GCT	2	6	243753	243758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210560
5566	NC_015948	ACG	2	6	243785	243790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210560
5567	NC_015948	TCG	2	6	243805	243810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210560
5568	NC_015948	CGA	2	6	243831	243836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210560
5569	NC_015948	GCC	2	6	243902	243907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210560
5570	NC_015948	GAC	2	6	243975	243980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210561
5571	NC_015948	TGC	2	6	243988	243993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210561
5572	NC_015948	CGAA	2	8	244024	244031	50 %	0 %	25 %	25 %	344210561
5573	NC_015948	CGA	2	6	244118	244123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210561
5574	NC_015948	GGT	2	6	244163	244168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210561
5575	NC_015948	GCC	2	6	244185	244190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210561
5576	NC_015948	ACG	2	6	244204	244209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210561
5577	NC_015948	GCTG	2	8	244214	244221	0 %	25 %	50 %	25 %	344210561
5578	NC_015948	CAA	2	6	244259	244264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210561
5579	NC_015948	GC	3	6	244267	244272	0 %	0 %	50 %	50 %	344210561
5580	NC_015948	GCT	2	6	244292	244297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210561
5581	NC_015948	CTG	2	6	244302	244307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210561
5582	NC_015948	GAC	2	6	244308	244313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210561
5583	NC_015948	CG	3	6	244314	244319	0 %	0 %	50 %	50 %	344210561
5584	NC_015948	GCC	2	6	244368	244373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210561
5585	NC_015948	GTC	2	6	244374	244379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210561
5586	NC_015948	GCTC	2	8	244427	244434	0 %	25 %	25 %	50 %	344210561
5587	NC_015948	CTG	2	6	244437	244442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210561
5588	NC_015948	CGT	2	6	244474	244479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210561
5589	NC_015948	CGT	3	9	244547	244555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210561
5590	NC_015948	CGA	2	6	244619	244624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210561
5591	NC_015948	CGC	2	6	244643	244648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210561
5592	NC_015948	CTG	2	6	244680	244685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210561
5593	NC_015948	GAG	2	6	244779	244784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210561
5594	NC_015948	GCG	2	6	244792	244797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210561
5595	NC_015948	CG	3	6	244800	244805	0 %	0 %	50 %	50 %	344210561
5596	NC_015948	CGA	3	9	244856	244864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210561
5597	NC_015948	ACG	2	6	244876	244881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210561
5598	NC_015948	GC	3	6	244921	244926	0 %	0 %	50 %	50 %	344210561
5599	NC_015948	GC	3	6	244933	244938	0 %	0 %	50 %	50 %	344210561
5600	NC_015948	GCC	2	6	244965	244970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210561
5601	NC_015948	GTC	2	6	245006	245011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210561
5602	NC_015948	GCG	2	6	245026	245031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210561
5603	NC_015948	CGG	2	6	245072	245077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210561
5604	NC_015948	CGAGGA	2	12	245081	245092	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	344210561
5605	NC_015948	CGC	2	6	245093	245098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210561
5606	NC_015948	GACCGC	2	12	245121	245132	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	344210561
5607	NC_015948	TCG	2	6	245146	245151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210561
5608	NC_015948	GCT	2	6	245196	245201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210562
5609	NC_015948	GAC	2	6	245252	245257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210562
5610	NC_015948	CGCC	2	8	245260	245267	0 %	0 %	25 %	75 %	344210562
5611	NC_015948	GCC	2	6	245339	245344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210562
5612	NC_015948	CGC	2	6	245362	245367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210562
5613	NC_015948	CGC	2	6	245392	245397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210562
5614	NC_015948	GAC	2	6	245408	245413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210562
5615	NC_015948	GCGG	2	8	245464	245471	0 %	0 %	75 %	25 %	344210562
5616	NC_015948	ACG	2	6	245526	245531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210562
5617	NC_015948	TCC	2	6	245532	245537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210562
5618	NC_015948	GC	3	6	245567	245572	0 %	0 %	50 %	50 %	344210563
5619	NC_015948	GCC	2	6	245623	245628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210563
5620	NC_015948	CGG	2	6	245632	245637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210563
5621	NC_015948	GTC	2	6	245661	245666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210563
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5739	NC_015948	TCG	2	6	250112	250117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210567
5740	NC_015948	GAT	2	6	250141	250146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210567
5741	NC_015948	GCGG	2	8	250215	250222	0 %	0 %	75 %	25 %	344210567
5742	NC_015948	CTC	2	6	250231	250236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210567
5743	NC_015948	CGA	2	6	250251	250256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210567
5744	NC_015948	CGG	2	6	250266	250271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210567
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5754	NC_015948	CCGC	2	8	250536	250543	0 %	0 %	25 %	75 %	344210567
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5773	NC_015948	TGCG	2	8	251208	251215	0 %	25 %	50 %	25 %	344210568
5774	NC_015948	TGG	2	6	251221	251226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210568
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5778	NC_015948	CGAC	2	8	251476	251483	25 %	0 %	25 %	50 %	344210568
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5847	NC_015948	CGA	2	6	254030	254035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210568
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5852	NC_015948	CGACG	2	10	254159	254168	20 %	0 %	40 %	40 %	344210568
5853	NC_015948	CCG	2	6	254185	254190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210568
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5855	NC_015948	CGG	2	6	254231	254236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210568
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5859	NC_015948	CTCGA	2	10	254382	254391	20 %	20 %	20 %	40 %	344210568
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5980	NC_015948	GTC	2	6	259329	259334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210574
5981	NC_015948	TGA	2	6	259382	259387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210574
5982	NC_015948	ACG	3	9	259506	259514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210575
5983	NC_015948	TC	3	6	259603	259608	0 %	50 %	0 %	50 %	344210575
5984	NC_015948	CCAGA	2	10	259613	259622	40 %	0 %	20 %	40 %	344210575
5985	NC_015948	TCG	2	6	259632	259637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210575
5986	NC_015948	TCG	2	6	259657	259662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210575
5987	NC_015948	AGA	2	6	259687	259692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210575
5988	NC_015948	GCC	2	6	259718	259723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210575
5989	NC_015948	GGT	2	6	259724	259729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210575
5990	NC_015948	CGC	2	6	259732	259737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210575
5991	NC_015948	GAC	2	6	259742	259747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210575
5992	NC_015948	GCC	2	6	259751	259756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210575
5993	NC_015948	CGC	2	6	259822	259827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210575
5994	NC_015948	TCGC	2	8	259851	259858	0 %	25 %	25 %	50 %	344210575
5995	NC_015948	CCT	2	6	259867	259872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210575
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5997	NC_015948	GCT	2	6	259928	259933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210575
5998	NC_015948	CCG	2	6	259995	260000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210575
5999	NC_015948	CGAGAA	2	12	260008	260019	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	344210575
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