MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 67255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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58002	NC_015948	CGG	2	6	2590831	2590836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212933
58003	NC_015948	TCG	2	6	2590868	2590873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212933
58004	NC_015948	GAC	2	6	2590879	2590884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212933
58005	NC_015948	CGG	2	6	2590924	2590929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212933
58006	NC_015948	TGG	2	6	2590938	2590943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344212933
58007	NC_015948	TCA	2	6	2590989	2590994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344212933
58008	NC_015948	CCGG	2	8	2591019	2591026	0 %	0 %	50 %	50 %	344212933
58009	NC_015948	GC	3	6	2591084	2591089	0 %	0 %	50 %	50 %	344212933
58010	NC_015948	CGG	3	9	2591092	2591100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212933
58011	NC_015948	TCG	2	6	2591109	2591114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212933
58012	NC_015948	CCGG	2	8	2591203	2591210	0 %	0 %	50 %	50 %	344212933
58013	NC_015948	CGA	2	6	2591248	2591253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212933
58014	NC_015948	TCG	2	6	2591259	2591264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212933
58015	NC_015948	CGG	2	6	2591309	2591314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212933
58016	NC_015948	CAAG	2	8	2591317	2591324	50 %	0 %	25 %	25 %	344212933
58017	NC_015948	GC	3	6	2591383	2591388	0 %	0 %	50 %	50 %	344212933
58018	NC_015948	TG	3	6	2591402	2591407	0 %	50 %	50 %	0 %	344212933
58019	NC_015948	CGA	2	6	2591425	2591430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212933
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58025	NC_015948	CGA	2	6	2591688	2591693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212934
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58027	NC_015948	CGA	2	6	2591814	2591819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212934
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58031	NC_015948	CGAG	2	8	2591973	2591980	25 %	0 %	50 %	25 %	344212934
58032	NC_015948	CGA	2	6	2592222	2592227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212934
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58034	NC_015948	CGA	2	6	2592321	2592326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212934
58035	NC_015948	CGA	2	6	2592360	2592365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212934
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58041	NC_015948	GTC	2	6	2592532	2592537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212934
58042	NC_015948	CG	4	8	2592567	2592574	0 %	0 %	50 %	50 %	344212934
58043	NC_015948	TCC	2	6	2592668	2592673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212934
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58047	NC_015948	TCGAAG	2	12	2592785	2592796	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	344212934
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58050	NC_015948	CGA	2	6	2592933	2592938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212934
58051	NC_015948	TGAC	2	8	2592941	2592948	25 %	25 %	25 %	25 %	344212934
58052	NC_015948	GCG	2	6	2592959	2592964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212934
58053	NC_015948	CGT	2	6	2592975	2592980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212934
58054	NC_015948	GGTC	2	8	2593007	2593014	0 %	25 %	50 %	25 %	344212934
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58057	NC_015948	GAG	2	6	2593111	2593116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212934
58058	NC_015948	CGA	2	6	2593140	2593145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212934
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58070	NC_015948	CGA	2	6	2593625	2593630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212935
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58099	NC_015948	AG	3	6	2595128	2595133	50 %	0 %	50 %	0 %	344212936
58100	NC_015948	GCG	2	6	2595149	2595154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212936
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58102	NC_015948	CGA	3	9	2595236	2595244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212936
58103	NC_015948	CGC	2	6	2595263	2595268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212936
58104	NC_015948	CGA	3	9	2595290	2595298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212936
58105	NC_015948	GCG	2	6	2595311	2595316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212936
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58107	NC_015948	GAC	2	6	2595336	2595341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212936
58108	NC_015948	GGCCA	2	10	2595363	2595372	20 %	0 %	40 %	40 %	344212936
58109	NC_015948	CGG	2	6	2595392	2595397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212936
58110	NC_015948	ACG	2	6	2595445	2595450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212936
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58112	NC_015948	GTC	2	6	2595614	2595619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212937
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58114	NC_015948	CAAC	2	8	2595696	2595703	50 %	0 %	0 %	50 %	344212937
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58225	NC_015948	TCG	2	6	2600305	2600310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212944
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58228	NC_015948	GTC	2	6	2600421	2600426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212944
58229	NC_015948	CGG	2	6	2600456	2600461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212944
58230	NC_015948	TCG	2	6	2600479	2600484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212944
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58233	NC_015948	CGG	2	6	2600576	2600581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212944
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58340	NC_015948	TCG	2	6	2605044	2605049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212952
58341	NC_015948	CGG	2	6	2605069	2605074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212952
58342	NC_015948	GC	3	6	2605089	2605094	0 %	0 %	50 %	50 %	344212952
58343	NC_015948	ACGG	2	8	2605138	2605145	25 %	0 %	50 %	25 %	344212952
58344	NC_015948	CGACAG	2	12	2605147	2605158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212952
58345	NC_015948	TCA	2	6	2605164	2605169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344212952
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58350	NC_015948	GAT	2	6	2605384	2605389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212952
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58354	NC_015948	CGA	2	6	2605618	2605623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212952
58355	NC_015948	CGG	2	6	2605642	2605647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212952
58356	NC_015948	CATCGC	2	12	2605666	2605677	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	344212952
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58366	NC_015948	GAG	2	6	2605892	2605897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212952
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58368	NC_015948	CTG	2	6	2605934	2605939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212952
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58374	NC_015948	A	6	6	2606231	2606236	100 %	0 %	0 %	0 %	344212952
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58380	NC_015948	GC	3	6	2606733	2606738	0 %	0 %	50 %	50 %	344212952
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58442	NC_015948	GGC	2	6	2609761	2609766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212954
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58445	NC_015948	GCT	2	6	2609890	2609895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212954
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58451	NC_015948	GAT	2	6	2610127	2610132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212954
58452	NC_015948	CTC	2	6	2610136	2610141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212954
58453	NC_015948	CG	3	6	2610178	2610183	0 %	0 %	50 %	50 %	344212954
58454	NC_015948	TGA	2	6	2610213	2610218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212954
58455	NC_015948	GTC	2	6	2610248	2610253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212954
58456	NC_015948	GCT	2	6	2610280	2610285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212954
58457	NC_015948	CTG	2	6	2610404	2610409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212954
58458	NC_015948	TCG	2	6	2610429	2610434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212954
58459	NC_015948	CAA	2	6	2610467	2610472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344212954
58460	NC_015948	CTG	2	6	2610538	2610543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212955
58461	NC_015948	CGT	2	6	2610558	2610563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212955
58462	NC_015948	ATC	2	6	2610574	2610579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344212955
58463	NC_015948	GC	3	6	2610629	2610634	0 %	0 %	50 %	50 %	344212955
58464	NC_015948	GGCT	2	8	2610682	2610689	0 %	25 %	50 %	25 %	344212955
58465	NC_015948	CCCGCG	2	12	2610694	2610705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212955
58466	NC_015948	CAA	2	6	2610709	2610714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344212955
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58469	NC_015948	TGGC	2	8	2610772	2610779	0 %	25 %	50 %	25 %	344212955
58470	NC_015948	TAT	2	6	2610837	2610842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344212955
58471	NC_015948	GCG	2	6	2610844	2610849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212955
58472	NC_015948	TAC	2	6	2610850	2610855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344212955
58473	NC_015948	TCA	2	6	2610875	2610880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344212955
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58477	NC_015948	GTC	2	6	2611018	2611023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212955
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58481	NC_015948	GTG	2	6	2611284	2611289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344212955
58482	NC_015948	CTT	2	6	2611296	2611301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344212955
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58488	NC_015948	CTG	2	6	2611593	2611598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212956
58489	NC_015948	GCCG	2	8	2611620	2611627	0 %	0 %	50 %	50 %	344212956
58490	NC_015948	CGG	2	6	2611689	2611694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212956
58491	NC_015948	TGGCGG	2	12	2611712	2611723	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	344212956
58492	NC_015948	AAT	2	6	2611727	2611732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344212956
58493	NC_015948	GTC	2	6	2611746	2611751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212956
58494	NC_015948	GCG	2	6	2611752	2611757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212956
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58496	NC_015948	CCGCG	2	10	2611778	2611787	0 %	0 %	40 %	60 %	344212957
58497	NC_015948	GCG	2	6	2611826	2611831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212957
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58499	NC_015948	GAC	2	6	2611866	2611871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212957
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