MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 67255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_015948	CGG	2	6	2462867	2462872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212791
55002	NC_015948	ACG	2	6	2462923	2462928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212791
55003	NC_015948	CTG	2	6	2462984	2462989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212792
55004	NC_015948	CGT	2	6	2463031	2463036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212792
55005	NC_015948	CCG	2	6	2463039	2463044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212792
55006	NC_015948	CGA	2	6	2463046	2463051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212792
55007	NC_015948	CGT	2	6	2463088	2463093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212792
55008	NC_015948	GCG	2	6	2463102	2463107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212792
55009	NC_015948	GAT	2	6	2463253	2463258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212792
55010	NC_015948	CAC	2	6	2463329	2463334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344212792
55011	NC_015948	GCT	2	6	2463376	2463381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212792
55012	NC_015948	CGA	2	6	2463382	2463387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212792
55013	NC_015948	ACG	2	6	2463417	2463422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212792
55014	NC_015948	CGG	2	6	2463442	2463447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212792
55015	NC_015948	CAT	2	6	2463463	2463468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344212792
55016	NC_015948	CTC	2	6	2463497	2463502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212792
55017	NC_015948	CGA	2	6	2463508	2463513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212792
55018	NC_015948	CGA	2	6	2463516	2463521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212792
55019	NC_015948	CGA	2	6	2463577	2463582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212792
55020	NC_015948	TCA	2	6	2463603	2463608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344212792
55021	NC_015948	GTGATG	2	12	2463647	2463658	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	344212792
55022	NC_015948	GCCG	2	8	2463662	2463669	0 %	0 %	50 %	50 %	344212792
55023	NC_015948	GAG	2	6	2463692	2463697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212792
55024	NC_015948	TAC	2	6	2463701	2463706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344212792
55025	NC_015948	TGA	2	6	2463735	2463740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212792
55026	NC_015948	GCC	2	6	2463880	2463885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212792
55027	NC_015948	TCG	2	6	2463888	2463893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212792
55028	NC_015948	CGG	2	6	2463933	2463938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212792
55029	NC_015948	CGAAGT	2	12	2463982	2463993	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	344212792
55030	NC_015948	CGG	2	6	2464042	2464047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212792
55031	NC_015948	CACGGA	2	12	2464051	2464062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212792
55032	NC_015948	CGGT	2	8	2464086	2464093	0 %	25 %	50 %	25 %	344212792
55033	NC_015948	GAC	2	6	2464127	2464132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212792
55034	NC_015948	TAC	2	6	2464200	2464205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344212793
55035	NC_015948	CTG	2	6	2464233	2464238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212793
55036	NC_015948	AGG	2	6	2464249	2464254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212793
55037	NC_015948	TCG	2	6	2464309	2464314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212793
55038	NC_015948	GAC	2	6	2464334	2464339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212793
55039	NC_015948	GCT	2	6	2464352	2464357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212793
55040	NC_015948	CGGC	2	8	2464375	2464382	0 %	0 %	50 %	50 %	344212793
55041	NC_015948	GAC	2	6	2464422	2464427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212793
55042	NC_015948	TCG	2	6	2464513	2464518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212793
55043	NC_015948	GAG	2	6	2464554	2464559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212793
55044	NC_015948	CA	4	8	2464611	2464618	50 %	0 %	0 %	50 %	344212793
55045	NC_015948	CAGCGC	2	12	2464647	2464658	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	344212793
55046	NC_015948	CG	3	6	2464671	2464676	0 %	0 %	50 %	50 %	344212793
55047	NC_015948	CTG	2	6	2464758	2464763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212793
55048	NC_015948	CT	3	6	2464815	2464820	0 %	50 %	0 %	50 %	344212793
55049	NC_015948	GTC	2	6	2464821	2464826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212793
55050	NC_015948	CCGA	2	8	2464884	2464891	25 %	0 %	25 %	50 %	344212793
55051	NC_015948	GCC	2	6	2464904	2464909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212793
55052	NC_015948	GCT	2	6	2464931	2464936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212793
55053	NC_015948	CGC	2	6	2465005	2465010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212793
55054	NC_015948	C	6	6	2465015	2465020	0 %	0 %	0 %	100 %	344212793
55055	NC_015948	CCG	2	6	2465155	2465160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212793
55056	NC_015948	CGG	2	6	2465284	2465289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212793
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55058	NC_015948	ACG	2	6	2465305	2465310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212793
55059	NC_015948	GGC	2	6	2465330	2465335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212793
55060	NC_015948	ACG	2	6	2465341	2465346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212793
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55062	NC_015948	GAC	2	6	2465397	2465402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212793
55063	NC_015948	GCCT	2	8	2465412	2465419	0 %	25 %	25 %	50 %	344212793
55064	NC_015948	ACG	3	9	2465425	2465433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212793
55065	NC_015948	CGA	3	9	2465543	2465551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212794
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55098	NC_015948	TCGA	2	8	2466985	2466992	25 %	25 %	25 %	25 %	344212795
55099	NC_015948	CGG	2	6	2467002	2467007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212795
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55101	NC_015948	GCC	2	6	2467047	2467052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212795
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55103	NC_015948	CGTTG	2	10	2467126	2467135	0 %	40 %	40 %	20 %	344212796
55104	NC_015948	CGG	2	6	2467143	2467148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212796
55105	NC_015948	GTA	2	6	2467165	2467170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212796
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55109	NC_015948	CCG	2	6	2467289	2467294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212796
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55227	NC_015948	GCC	2	6	2473220	2473225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212802
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55332	NC_015948	CTTC	2	8	2478332	2478339	0 %	50 %	0 %	50 %	344212811
55333	NC_015948	TCG	2	6	2478373	2478378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212811
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55339	NC_015948	GCC	2	6	2478714	2478719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212811
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55341	NC_015948	GTC	2	6	2478735	2478740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212811
55342	NC_015948	TGA	2	6	2478746	2478751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212811
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55458	NC_015948	CGG	2	6	2484331	2484336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212818
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