MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 67255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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53002	NC_015948	CGA	2	6	2372463	2372468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212713
53003	NC_015948	TCCG	2	8	2372502	2372509	0 %	25 %	25 %	50 %	344212714
53004	NC_015948	CGG	2	6	2372538	2372543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212714
53005	NC_015948	ACG	2	6	2372559	2372564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212714
53006	NC_015948	CGCCGT	2	12	2372572	2372583	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344212714
53007	NC_015948	ACGG	2	8	2372635	2372642	25 %	0 %	50 %	25 %	344212714
53008	NC_015948	CGTCTC	2	12	2372645	2372656	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	344212714
53009	NC_015948	CGTTCG	2	12	2372688	2372699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212714
53010	NC_015948	CGC	2	6	2372731	2372736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212714
53011	NC_015948	GCC	2	6	2372753	2372758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212714
53012	NC_015948	CGA	2	6	2372782	2372787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212714
53013	NC_015948	CCG	2	6	2372791	2372796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212714
53014	NC_015948	GTC	2	6	2372798	2372803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212714
53015	NC_015948	CGG	2	6	2372819	2372824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212714
53016	NC_015948	GAC	2	6	2372861	2372866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212714
53017	NC_015948	GCC	2	6	2372986	2372991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212714
53018	NC_015948	TGG	2	6	2373018	2373023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344212714
53019	NC_015948	CCGG	2	8	2373037	2373044	0 %	0 %	50 %	50 %	344212714
53020	NC_015948	CGT	2	6	2373047	2373052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212714
53021	NC_015948	CGA	2	6	2373103	2373108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212714
53022	NC_015948	CGA	2	6	2373115	2373120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212714
53023	NC_015948	CGA	2	6	2373142	2373147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212714
53024	NC_015948	CAG	2	6	2373158	2373163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212714
53025	NC_015948	CGA	2	6	2373175	2373180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212714
53026	NC_015948	AATCA	2	10	2373206	2373215	60 %	20 %	0 %	20 %	344212714
53027	NC_015948	ACG	2	6	2373233	2373238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212715
53028	NC_015948	CGA	2	6	2373243	2373248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212715
53029	NC_015948	GAG	2	6	2373260	2373265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212715
53030	NC_015948	CGC	2	6	2373285	2373290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212715
53031	NC_015948	TCG	2	6	2373327	2373332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212715
53032	NC_015948	GAC	2	6	2373340	2373345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212715
53033	NC_015948	GGTCG	2	10	2373382	2373391	0 %	20 %	60 %	20 %	344212715
53034	NC_015948	AGC	2	6	2373482	2373487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212715
53035	NC_015948	CGT	2	6	2373490	2373495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212715
53036	NC_015948	GATT	2	8	2373532	2373539	25 %	50 %	25 %	0 %	344212715
53037	NC_015948	TCC	2	6	2373590	2373595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212715
53038	NC_015948	CGA	2	6	2373621	2373626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212715
53039	NC_015948	CGA	2	6	2373669	2373674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212715
53040	NC_015948	CGG	2	6	2373695	2373700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212715
53041	NC_015948	CGT	2	6	2373786	2373791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212715
53042	NC_015948	GGC	2	6	2373822	2373827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212715
53043	NC_015948	CGT	2	6	2373885	2373890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212715
53044	NC_015948	CGG	2	6	2373902	2373907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212715
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53047	NC_015948	CCGG	2	8	2373966	2373973	0 %	0 %	50 %	50 %	344212715
53048	NC_015948	CGA	2	6	2373999	2374004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212715
53049	NC_015948	GCG	2	6	2374014	2374019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212715
53050	NC_015948	GC	3	6	2374032	2374037	0 %	0 %	50 %	50 %	344212715
53051	NC_015948	CGA	2	6	2374131	2374136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212715
53052	NC_015948	CAG	2	6	2374147	2374152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212715
53053	NC_015948	CAG	2	6	2374155	2374160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212715
53054	NC_015948	CGC	2	6	2374171	2374176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212715
53055	NC_015948	GAC	2	6	2374186	2374191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212715
53056	NC_015948	GTC	2	6	2374205	2374210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212715
53057	NC_015948	GCG	2	6	2374218	2374223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212715
53058	NC_015948	AG	3	6	2374237	2374242	50 %	0 %	50 %	0 %	344212715
53059	NC_015948	CAC	2	6	2374279	2374284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344212715
53060	NC_015948	ACG	2	6	2374307	2374312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212715
53061	NC_015948	TGC	2	6	2374355	2374360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212715
53062	NC_015948	ATCTT	2	10	2374641	2374650	20 %	60 %	0 %	20 %	344212716
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53064	NC_015948	TA	4	8	2374694	2374701	50 %	50 %	0 %	0 %	344212716
53065	NC_015948	CT	3	6	2374824	2374829	0 %	50 %	0 %	50 %	344212716
53066	NC_015948	ATC	2	6	2374928	2374933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344212716
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53084	NC_015948	CT	3	6	2375732	2375737	0 %	50 %	0 %	50 %	344212716
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53088	NC_015948	TCT	2	6	2375874	2375879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344212716
53089	NC_015948	CAG	2	6	2375884	2375889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212716
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53101	NC_015948	GTT	2	6	2376444	2376449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344212716
53102	NC_015948	T	7	7	2376456	2376462	0 %	100 %	0 %	0 %	344212716
53103	NC_015948	TC	3	6	2376515	2376520	0 %	50 %	0 %	50 %	344212716
53104	NC_015948	ACA	2	6	2376564	2376569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344212716
53105	NC_015948	ATTT	2	8	2376583	2376590	25 %	75 %	0 %	0 %	344212716
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53108	NC_015948	CGAT	2	8	2376729	2376736	25 %	25 %	25 %	25 %	344212716
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53110	NC_015948	CTT	2	6	2376871	2376876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344212716
53111	NC_015948	AT	3	6	2376927	2376932	50 %	50 %	0 %	0 %	344212716
53112	NC_015948	AAGA	2	8	2376982	2376989	75 %	0 %	25 %	0 %	344212716
53113	NC_015948	TGCTAA	2	12	2376992	2377003	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	344212716
53114	NC_015948	T	6	6	2377007	2377012	0 %	100 %	0 %	0 %	344212716
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53116	NC_015948	T	6	6	2377122	2377127	0 %	100 %	0 %	0 %	344212716
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53232	NC_015948	GACGAG	2	12	2383195	2383206	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	344212721
53233	NC_015948	CGG	2	6	2383209	2383214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212721
53234	NC_015948	CTT	2	6	2383233	2383238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344212721
53235	NC_015948	CGA	2	6	2383254	2383259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212721
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53243	NC_015948	GCC	2	6	2383630	2383635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212722
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53250	NC_015948	CG	3	6	2383888	2383893	0 %	0 %	50 %	50 %	344212722
53251	NC_015948	GCGG	2	8	2383899	2383906	0 %	0 %	75 %	25 %	344212722
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53332	NC_015948	CG	3	6	2386913	2386918	0 %	0 %	50 %	50 %	344212724
53333	NC_015948	TCG	2	6	2386919	2386924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212724
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53342	NC_015948	CGG	2	6	2387189	2387194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212725
53343	NC_015948	CGT	2	6	2387217	2387222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212725
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53459	NC_015948	TCGAC	2	10	2391490	2391499	20 %	20 %	20 %	40 %	344212727
53460	NC_015948	GGT	2	6	2391553	2391558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344212727
53461	NC_015948	GCC	2	6	2391645	2391650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212727
53462	NC_015948	GTG	2	6	2391723	2391728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344212727
53463	NC_015948	CCGA	2	8	2391741	2391748	25 %	0 %	25 %	50 %	344212727
53464	NC_015948	TCC	2	6	2391750	2391755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212727
53465	NC_015948	GT	3	6	2391875	2391880	0 %	50 %	50 %	0 %	344212727
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53470	NC_015948	CGT	2	6	2392135	2392140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212727
53471	NC_015948	CGTAGC	2	12	2392153	2392164	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344212727
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53481	NC_015948	CGT	2	6	2392424	2392429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212727
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53487	NC_015948	GTC	2	6	2392655	2392660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212727
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53489	NC_015948	GCT	2	6	2392703	2392708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212727
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53492	NC_015948	TGG	2	6	2392812	2392817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344212727
53493	NC_015948	CGT	2	6	2392834	2392839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212727
53494	NC_015948	CGA	2	6	2392849	2392854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212727
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53499	NC_015948	CTG	2	6	2393305	2393310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212728
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