MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 67255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
52501	NC_015948	GGTC	2	8	2351343	2351350	0 %	25 %	50 %	25 %	344212687
52502	NC_015948	GCGG	2	8	2351466	2351473	0 %	0 %	75 %	25 %	344212687
52503	NC_015948	CGT	2	6	2351523	2351528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212687
52504	NC_015948	GCG	2	6	2351549	2351554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212687
52505	NC_015948	CGA	2	6	2351589	2351594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212687
52506	NC_015948	CGAAC	2	10	2351598	2351607	40 %	0 %	20 %	40 %	344212687
52507	NC_015948	CGG	2	6	2351624	2351629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212687
52508	NC_015948	CGAA	2	8	2351688	2351695	50 %	0 %	25 %	25 %	344212687
52509	NC_015948	GTC	2	6	2351742	2351747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212688
52510	NC_015948	CGA	2	6	2351764	2351769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212688
52511	NC_015948	CG	3	6	2351842	2351847	0 %	0 %	50 %	50 %	344212688
52512	NC_015948	CTG	2	6	2351861	2351866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212688
52513	NC_015948	TGA	2	6	2351881	2351886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212688
52514	NC_015948	CGTC	2	8	2351896	2351903	0 %	25 %	25 %	50 %	344212688
52515	NC_015948	CGC	2	6	2351929	2351934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212688
52516	NC_015948	GGAG	2	8	2352061	2352068	25 %	0 %	75 %	0 %	344212688
52517	NC_015948	CGC	2	6	2352088	2352093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212688
52518	NC_015948	CAG	2	6	2352128	2352133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212688
52519	NC_015948	CGG	2	6	2352145	2352150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212688
52520	NC_015948	CGG	2	6	2352231	2352236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212688
52521	NC_015948	GTG	2	6	2352281	2352286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344212688
52522	NC_015948	CGG	2	6	2352313	2352318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212688
52523	NC_015948	GGCT	2	8	2352372	2352379	0 %	25 %	50 %	25 %	344212688
52524	NC_015948	GTC	2	6	2352446	2352451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212688
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52526	NC_015948	GGA	2	6	2352691	2352696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212689
52527	NC_015948	TTG	2	6	2352708	2352713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344212689
52528	NC_015948	GTC	2	6	2352749	2352754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212689
52529	NC_015948	CGC	2	6	2352794	2352799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212689
52530	NC_015948	TCGG	2	8	2352813	2352820	0 %	25 %	50 %	25 %	344212689
52531	NC_015948	CCG	2	6	2352823	2352828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212689
52532	NC_015948	GTCC	2	8	2352832	2352839	0 %	25 %	25 %	50 %	344212689
52533	NC_015948	GTG	2	6	2352840	2352845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344212689
52534	NC_015948	GCC	2	6	2352852	2352857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212689
52535	NC_015948	TCG	2	6	2352862	2352867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212689
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52539	NC_015948	CGT	2	6	2352940	2352945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212689
52540	NC_015948	CAG	2	6	2352950	2352955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212689
52541	NC_015948	CGGC	2	8	2352967	2352974	0 %	0 %	50 %	50 %	344212689
52542	NC_015948	GGT	2	6	2352989	2352994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344212689
52543	NC_015948	CGT	2	6	2353013	2353018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212689
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52545	NC_015948	CGG	2	6	2353040	2353045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212689
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52547	NC_015948	CGA	2	6	2353120	2353125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212689
52548	NC_015948	TC	3	6	2353138	2353143	0 %	50 %	0 %	50 %	344212689
52549	NC_015948	GC	3	6	2353237	2353242	0 %	0 %	50 %	50 %	344212689
52550	NC_015948	ACG	2	6	2353258	2353263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212689
52551	NC_015948	GAA	2	6	2353419	2353424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344212690
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52553	NC_015948	TCT	2	6	2353514	2353519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344212690
52554	NC_015948	CGAC	2	8	2353531	2353538	25 %	0 %	25 %	50 %	344212690
52555	NC_015948	TCC	2	6	2353558	2353563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212690
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52557	NC_015948	CCGG	3	12	2353679	2353690	0 %	0 %	50 %	50 %	344212690
52558	NC_015948	CGG	2	6	2353703	2353708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212690
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52565	NC_015948	GC	3	6	2353889	2353894	0 %	0 %	50 %	50 %	344212690
52566	NC_015948	GCC	2	6	2353953	2353958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212690
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52575	NC_015948	GTC	2	6	2354549	2354554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212691
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52587	NC_015948	ACG	3	9	2354964	2354972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212691
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52598	NC_015948	TCG	3	9	2355786	2355794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212692
52599	NC_015948	CGGG	2	8	2355823	2355830	0 %	0 %	75 %	25 %	344212692
52600	NC_015948	ACG	2	6	2355831	2355836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212692
52601	NC_015948	GTTC	2	8	2355847	2355854	0 %	50 %	25 %	25 %	344212692
52602	NC_015948	GTGC	2	8	2355882	2355889	0 %	25 %	50 %	25 %	344212692
52603	NC_015948	GTG	2	6	2355926	2355931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344212692
52604	NC_015948	TCG	2	6	2355954	2355959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212692
52605	NC_015948	CAGA	2	8	2355995	2356002	50 %	0 %	25 %	25 %	344212692
52606	NC_015948	GCAC	2	8	2356023	2356030	25 %	0 %	25 %	50 %	344212692
52607	NC_015948	GT	3	6	2356047	2356052	0 %	50 %	50 %	0 %	344212692
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52610	NC_015948	GA	3	6	2356098	2356103	50 %	0 %	50 %	0 %	344212692
52611	NC_015948	GGA	2	6	2356111	2356116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212692
52612	NC_015948	CAGT	2	8	2356176	2356183	25 %	25 %	25 %	25 %	344212692
52613	NC_015948	CGGTG	2	10	2356195	2356204	0 %	20 %	60 %	20 %	344212692
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52615	NC_015948	CTG	2	6	2356220	2356225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212692
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52846	NC_015948	TCG	2	6	2365031	2365036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212703
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52946	NC_015948	CA	3	6	2370089	2370094	50 %	0 %	0 %	50 %	344212709
52947	NC_015948	TACCG	2	10	2370114	2370123	20 %	20 %	20 %	40 %	344212709
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52954	NC_015948	GACC	2	8	2370429	2370436	25 %	0 %	25 %	50 %	344212710
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52957	NC_015948	GTC	4	12	2370480	2370491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212710
52958	NC_015948	CGTG	2	8	2370514	2370521	0 %	25 %	50 %	25 %	344212710
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52961	NC_015948	CGGA	2	8	2370589	2370596	25 %	0 %	50 %	25 %	344212710
52962	NC_015948	GTCG	2	8	2370682	2370689	0 %	25 %	50 %	25 %	344212710
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52989	NC_015948	CGA	2	6	2371858	2371863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212712
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52991	NC_015948	TCG	2	6	2371896	2371901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212712
52992	NC_015948	GAC	2	6	2371958	2371963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212712
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