MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 67255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52002	NC_015948	CGA	2	6	2329843	2329848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212667
52003	NC_015948	TCG	2	6	2329860	2329865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212667
52004	NC_015948	GTC	2	6	2329952	2329957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212667
52005	NC_015948	GAC	2	6	2329963	2329968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212667
52006	NC_015948	CCT	2	6	2329981	2329986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212667
52007	NC_015948	CCG	2	6	2330005	2330010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212667
52008	NC_015948	CGA	2	6	2330029	2330034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212667
52009	NC_015948	CGT	2	6	2330083	2330088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212667
52010	NC_015948	CGA	2	6	2330101	2330106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212667
52011	NC_015948	TCGACG	2	12	2330109	2330120	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344212667
52012	NC_015948	AAGCG	2	10	2330141	2330150	40 %	0 %	40 %	20 %	344212667
52013	NC_015948	ACG	2	6	2330160	2330165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212667
52014	NC_015948	CGG	2	6	2330170	2330175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212667
52015	NC_015948	CAGT	2	8	2330190	2330197	25 %	25 %	25 %	25 %	344212667
52016	NC_015948	CGG	2	6	2330242	2330247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212667
52017	NC_015948	CG	3	6	2330270	2330275	0 %	0 %	50 %	50 %	344212667
52018	NC_015948	CCG	2	6	2330292	2330297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212667
52019	NC_015948	ACG	2	6	2330370	2330375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212667
52020	NC_015948	CGA	2	6	2330377	2330382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212667
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52025	NC_015948	GCTG	2	8	2330693	2330700	0 %	25 %	50 %	25 %	344212668
52026	NC_015948	GCC	2	6	2330723	2330728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212668
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52050	NC_015948	TAG	2	6	2331522	2331527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212668
52051	NC_015948	CGT	2	6	2331556	2331561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212668
52052	NC_015948	CGG	2	6	2331587	2331592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212668
52053	NC_015948	GTC	2	6	2331678	2331683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212668
52054	NC_015948	GACC	2	8	2331822	2331829	25 %	0 %	25 %	50 %	344212669
52055	NC_015948	CGA	2	6	2331830	2331835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212669
52056	NC_015948	CGA	2	6	2331851	2331856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212669
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52058	NC_015948	TCGC	2	8	2331901	2331908	0 %	25 %	25 %	50 %	344212669
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52060	NC_015948	CGA	3	9	2331971	2331979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212669
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52063	NC_015948	CGC	2	6	2332019	2332024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212669
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52105	NC_015948	ACC	2	6	2333795	2333800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344212670
52106	NC_015948	CGT	2	6	2333809	2333814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212670
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52110	NC_015948	GAC	2	6	2333909	2333914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212670
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52112	NC_015948	CGA	2	6	2334052	2334057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212670
52113	NC_015948	CTA	2	6	2334064	2334069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344212670
52114	NC_015948	CGA	2	6	2334091	2334096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212670
52115	NC_015948	GAC	2	6	2334110	2334115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212670
52116	NC_015948	CAC	2	6	2334116	2334121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344212670
52117	NC_015948	CGT	3	9	2334124	2334132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212670
52118	NC_015948	ACG	2	6	2334159	2334164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212670
52119	NC_015948	GAC	2	6	2334203	2334208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212670
52120	NC_015948	GTC	2	6	2334248	2334253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212670
52121	NC_015948	GAG	2	6	2334254	2334259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212670
52122	NC_015948	CTA	2	6	2334385	2334390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344212670
52123	NC_015948	TCA	2	6	2334435	2334440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344212670
52124	NC_015948	GCG	2	6	2334441	2334446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212670
52125	NC_015948	AC	3	6	2334448	2334453	50 %	0 %	0 %	50 %	344212670
52126	NC_015948	ATC	2	6	2334464	2334469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344212670
52127	NC_015948	CGG	2	6	2334513	2334518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212670
52128	NC_015948	ATC	2	6	2334678	2334683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344212671
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52130	NC_015948	GTC	3	9	2334762	2334770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212671
52131	NC_015948	GGC	2	6	2334782	2334787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212671
52132	NC_015948	TCG	2	6	2334808	2334813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212671
52133	NC_015948	CGA	3	9	2334905	2334913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212671
52134	NC_015948	ACC	2	6	2334930	2334935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344212671
52135	NC_015948	TCA	2	6	2334958	2334963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344212671
52136	NC_015948	GGCG	2	8	2334974	2334981	0 %	0 %	75 %	25 %	344212671
52137	NC_015948	TCG	2	6	2334994	2334999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212671
52138	NC_015948	CGG	2	6	2335016	2335021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212671
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52140	NC_015948	TCG	3	9	2335078	2335086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212671
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52143	NC_015948	GTC	2	6	2335308	2335313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212672
52144	NC_015948	CCT	2	6	2335316	2335321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212672
52145	NC_015948	CGT	2	6	2335343	2335348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212672
52146	NC_015948	CGT	2	6	2335355	2335360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212672
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52149	NC_015948	TCG	2	6	2335501	2335506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212672
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52166	NC_015948	CGA	2	6	2336332	2336337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212674
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52172	NC_015948	CGA	2	6	2336595	2336600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212674
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52182	NC_015948	CGA	2	6	2337034	2337039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212674
52183	NC_015948	CGA	2	6	2337070	2337075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212674
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52186	NC_015948	GCC	2	6	2337355	2337360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212675
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52209	NC_015948	CAGCGC	2	12	2338246	2338257	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	344212675
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52214	NC_015948	CCGA	2	8	2338499	2338506	25 %	0 %	25 %	50 %	344212675
52215	NC_015948	GTA	2	6	2338525	2338530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212675
52216	NC_015948	GTC	2	6	2338779	2338784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212676
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52219	NC_015948	CGG	2	6	2338933	2338938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212676
52220	NC_015948	GT	3	6	2338953	2338958	0 %	50 %	50 %	0 %	344212676
52221	NC_015948	AC	3	6	2338970	2338975	50 %	0 %	0 %	50 %	344212676
52222	NC_015948	CGC	2	6	2338976	2338981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212676
52223	NC_015948	CCGC	2	8	2338984	2338991	0 %	0 %	25 %	75 %	344212676
52224	NC_015948	CAG	2	6	2338995	2339000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212676
52225	NC_015948	CGG	2	6	2339009	2339014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212676
52226	NC_015948	AGC	2	6	2339041	2339046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212676
52227	NC_015948	TCG	2	6	2339086	2339091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212676
52228	NC_015948	CGC	2	6	2339102	2339107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212676
52229	NC_015948	CTC	2	6	2339112	2339117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212676
52230	NC_015948	GAT	2	6	2339139	2339144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212676
52231	NC_015948	GAG	2	6	2339176	2339181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212676
52232	NC_015948	GTCGGC	2	12	2339205	2339216	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344212676
52233	NC_015948	GC	3	6	2339219	2339224	0 %	0 %	50 %	50 %	344212676
52234	NC_015948	GCC	2	6	2339244	2339249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212676
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52236	NC_015948	TCG	2	6	2339293	2339298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212676
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52303	NC_015948	GTTCG	2	10	2342466	2342475	0 %	40 %	40 %	20 %	344212677
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52339	NC_015948	TCGC	2	8	2343825	2343832	0 %	25 %	25 %	50 %	344212679
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52342	NC_015948	TCG	2	6	2343865	2343870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212679
52343	NC_015948	ACA	2	6	2344158	2344163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344212680
52344	NC_015948	GGA	2	6	2344213	2344218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212680
52345	NC_015948	CGA	2	6	2344252	2344257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212680
52346	NC_015948	CGA	2	6	2344279	2344284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212680
52347	NC_015948	GAG	2	6	2344301	2344306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212680
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52350	NC_015948	CGG	2	6	2344405	2344410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212680
52351	NC_015948	CCG	2	6	2344428	2344433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212680
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52458	NC_015948	GGA	2	6	2349170	2349175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212684
52459	NC_015948	TTC	2	6	2349181	2349186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344212684
52460	NC_015948	CGC	3	9	2349191	2349199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212684
52461	NC_015948	CGA	2	6	2349200	2349205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212684
52462	NC_015948	CGT	2	6	2349356	2349361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212684
52463	NC_015948	GCC	3	9	2349370	2349378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212684
52464	NC_015948	TCC	2	6	2349442	2349447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212684
52465	NC_015948	GGT	2	6	2349509	2349514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344212684
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52482	NC_015948	CGC	2	6	2350688	2350693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212685
52483	NC_015948	GTC	2	6	2350695	2350700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212685
52484	NC_015948	CCGTCG	2	12	2350708	2350719	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344212685
52485	NC_015948	TCG	2	6	2350753	2350758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212685
52486	NC_015948	GGGA	2	8	2350805	2350812	25 %	0 %	75 %	0 %	344212685
52487	NC_015948	GTC	2	6	2350852	2350857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212686
52488	NC_015948	TCGG	2	8	2350910	2350917	0 %	25 %	50 %	25 %	344212686
52489	NC_015948	CCG	2	6	2350930	2350935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212686
52490	NC_015948	GTC	2	6	2350936	2350941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212686
52491	NC_015948	CGC	2	6	2350965	2350970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212686
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52493	NC_015948	TCGT	2	8	2350996	2351003	0 %	50 %	25 %	25 %	344212686
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52499	NC_015948	GCG	2	6	2351224	2351229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212687
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