MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 67255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51501	NC_015948	CTCG	2	8	2307639	2307646	0 %	25 %	25 %	50 %	344212646
51502	NC_015948	CCT	2	6	2307689	2307694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212646
51503	NC_015948	CGCC	2	8	2307726	2307733	0 %	0 %	25 %	75 %	344212646
51504	NC_015948	CTC	2	6	2307736	2307741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212646
51505	NC_015948	CGC	4	12	2307792	2307803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212646
51506	NC_015948	GCC	2	6	2307814	2307819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212646
51507	NC_015948	CTG	2	6	2307820	2307825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212646
51508	NC_015948	GAC	2	6	2307837	2307842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212646
51509	NC_015948	CTG	2	6	2307907	2307912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212646
51510	NC_015948	GAC	2	6	2308399	2308404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212647
51511	NC_015948	AC	3	6	2308403	2308408	50 %	0 %	0 %	50 %	344212647
51512	NC_015948	CGA	2	6	2308447	2308452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212647
51513	NC_015948	TGG	2	6	2308464	2308469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344212647
51514	NC_015948	GAT	2	6	2308489	2308494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212647
51515	NC_015948	GAC	2	6	2308505	2308510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212647
51516	NC_015948	GCG	2	6	2308541	2308546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212647
51517	NC_015948	ACG	2	6	2308587	2308592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212647
51518	NC_015948	CGG	2	6	2308636	2308641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212647
51519	NC_015948	GACGC	2	10	2308664	2308673	20 %	0 %	40 %	40 %	344212647
51520	NC_015948	GGA	2	6	2308681	2308686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212647
51521	NC_015948	AACC	2	8	2308720	2308727	50 %	0 %	0 %	50 %	344212647
51522	NC_015948	GACC	2	8	2308732	2308739	25 %	0 %	25 %	50 %	344212647
51523	NC_015948	GC	4	8	2308747	2308754	0 %	0 %	50 %	50 %	344212647
51524	NC_015948	GCG	2	6	2308788	2308793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212647
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51526	NC_015948	GCC	3	9	2308881	2308889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212647
51527	NC_015948	GGA	2	6	2308933	2308938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212647
51528	NC_015948	CGA	2	6	2308993	2308998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212647
51529	NC_015948	CGGGAC	2	12	2309098	2309109	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	344212647
51530	NC_015948	GAC	3	9	2309107	2309115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212647
51531	NC_015948	CCGG	2	8	2309133	2309140	0 %	0 %	50 %	50 %	344212647
51532	NC_015948	TCGG	2	8	2309144	2309151	0 %	25 %	50 %	25 %	344212647
51533	NC_015948	CTG	2	6	2309171	2309176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212647
51534	NC_015948	GCC	2	6	2309201	2309206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212647
51535	NC_015948	ACC	2	6	2309247	2309252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344212647
51536	NC_015948	GTGG	2	8	2309257	2309264	0 %	25 %	75 %	0 %	344212647
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51541	NC_015948	GCCG	2	8	2309512	2309519	0 %	0 %	50 %	50 %	344212648
51542	NC_015948	GGAT	2	8	2309550	2309557	25 %	25 %	50 %	0 %	344212648
51543	NC_015948	CGA	2	6	2309563	2309568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212648
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51547	NC_015948	ACG	2	6	2309697	2309702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212648
51548	NC_015948	GCCG	2	8	2309759	2309766	0 %	0 %	50 %	50 %	344212648
51549	NC_015948	GTC	3	9	2309801	2309809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212648
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51553	NC_015948	TGAC	2	8	2310234	2310241	25 %	25 %	25 %	25 %	344212649
51554	NC_015948	GTG	2	6	2310269	2310274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344212649
51555	NC_015948	GGGGAC	2	12	2310321	2310332	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	344212649
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51598	NC_015948	TAG	3	9	2312641	2312649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212651
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51601	NC_015948	TCGAT	2	10	2312764	2312773	20 %	40 %	20 %	20 %	344212651
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51608	NC_015948	CG	4	8	2313198	2313205	0 %	0 %	50 %	50 %	344212652
51609	NC_015948	GC	3	6	2313220	2313225	0 %	0 %	50 %	50 %	344212652
51610	NC_015948	GTCG	2	8	2313270	2313277	0 %	25 %	50 %	25 %	344212652
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51614	NC_015948	CCT	2	6	2313351	2313356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212652
51615	NC_015948	CGG	2	6	2313357	2313362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212652
51616	NC_015948	ACG	2	6	2313374	2313379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212652
51617	NC_015948	CGG	2	6	2313399	2313404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212652
51618	NC_015948	CGA	2	6	2313411	2313416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212652
51619	NC_015948	GTA	2	6	2313511	2313516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212652
51620	NC_015948	AC	3	6	2313523	2313528	50 %	0 %	0 %	50 %	344212652
51621	NC_015948	ACGTCG	2	12	2313536	2313547	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344212652
51622	NC_015948	CGA	2	6	2313555	2313560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212652
51623	NC_015948	GAA	2	6	2313565	2313570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344212652
51624	NC_015948	AGCG	2	8	2313596	2313603	25 %	0 %	50 %	25 %	344212652
51625	NC_015948	CGC	2	6	2313681	2313686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212652
51626	NC_015948	GCCG	2	8	2313733	2313740	0 %	0 %	50 %	50 %	344212652
51627	NC_015948	TCG	2	6	2313764	2313769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212652
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51630	NC_015948	TCG	2	6	2313934	2313939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212653
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51632	NC_015948	CGT	3	9	2314034	2314042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212653
51633	NC_015948	TCG	2	6	2314069	2314074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212653
51634	NC_015948	GC	3	6	2314176	2314181	0 %	0 %	50 %	50 %	344212653
51635	NC_015948	GAA	2	6	2314187	2314192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344212653
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51640	NC_015948	TCG	3	9	2314309	2314317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212653
51641	NC_015948	TCG	2	6	2314351	2314356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212653
51642	NC_015948	CGC	2	6	2314391	2314396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212653
51643	NC_015948	TCT	2	6	2314433	2314438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344212653
51644	NC_015948	CCT	2	6	2314457	2314462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212653
51645	NC_015948	CGA	2	6	2314514	2314519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212653
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51648	NC_015948	GC	3	6	2314668	2314673	0 %	0 %	50 %	50 %	344212653
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51651	NC_015948	GGCC	2	8	2314751	2314758	0 %	0 %	50 %	50 %	344212653
51652	NC_015948	GAT	2	6	2314770	2314775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212653
51653	NC_015948	CAG	2	6	2314800	2314805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212653
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51710	NC_015948	CCGGC	2	10	2317454	2317463	0 %	0 %	40 %	60 %	344212656
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51722	NC_015948	GAC	2	6	2317958	2317963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212657
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51724	NC_015948	CGGT	2	8	2318005	2318012	0 %	25 %	50 %	25 %	344212657
51725	NC_015948	CGC	2	6	2318047	2318052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212657
51726	NC_015948	GT	3	6	2318074	2318079	0 %	50 %	50 %	0 %	344212657
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