MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome I

Total Repeats: 67255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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51002	NC_015948	GTC	2	6	2286178	2286183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212626
51003	NC_015948	GAC	2	6	2286184	2286189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212626
51004	NC_015948	CGGA	2	8	2286199	2286206	25 %	0 %	50 %	25 %	344212626
51005	NC_015948	CCGA	2	8	2286221	2286228	25 %	0 %	25 %	50 %	344212626
51006	NC_015948	ACCGTC	2	12	2286295	2286306	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	344212626
51007	NC_015948	CGC	2	6	2286432	2286437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212626
51008	NC_015948	AGGC	2	8	2286481	2286488	25 %	0 %	50 %	25 %	344212626
51009	NC_015948	CG	3	6	2286590	2286595	0 %	0 %	50 %	50 %	344212626
51010	NC_015948	CCCGGT	2	12	2286609	2286620	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344212626
51011	NC_015948	CCGG	2	8	2286625	2286632	0 %	0 %	50 %	50 %	344212626
51012	NC_015948	CG	3	6	2286703	2286708	0 %	0 %	50 %	50 %	344212626
51013	NC_015948	TGG	2	6	2286731	2286736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344212626
51014	NC_015948	CGC	2	6	2286774	2286779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212626
51015	NC_015948	CGT	2	6	2286786	2286791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212626
51016	NC_015948	CGAA	2	8	2286857	2286864	50 %	0 %	25 %	25 %	344212626
51017	NC_015948	CGCT	2	8	2286890	2286897	0 %	25 %	25 %	50 %	344212626
51018	NC_015948	GAG	2	6	2286940	2286945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212626
51019	NC_015948	GAC	3	9	2286948	2286956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212626
51020	NC_015948	CTGG	2	8	2286960	2286967	0 %	25 %	50 %	25 %	344212626
51021	NC_015948	AC	3	6	2287040	2287045	50 %	0 %	0 %	50 %	344212626
51022	NC_015948	CGG	2	6	2287046	2287051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212626
51023	NC_015948	GCGCTG	2	12	2287057	2287068	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344212626
51024	NC_015948	CGG	2	6	2287220	2287225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212626
51025	NC_015948	CAG	2	6	2287288	2287293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212626
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51031	NC_015948	GAC	3	9	2287507	2287515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212626
51032	NC_015948	CCG	2	6	2287538	2287543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212626
51033	NC_015948	GTC	2	6	2287576	2287581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212626
51034	NC_015948	CG	3	6	2287598	2287603	0 %	0 %	50 %	50 %	344212626
51035	NC_015948	CCG	2	6	2287625	2287630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212626
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51038	NC_015948	GAG	2	6	2287761	2287766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212627
51039	NC_015948	GGC	2	6	2287772	2287777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212627
51040	NC_015948	TCG	2	6	2287828	2287833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212627
51041	NC_015948	ACCC	2	8	2287926	2287933	25 %	0 %	0 %	75 %	344212627
51042	NC_015948	CCGG	2	8	2287937	2287944	0 %	0 %	50 %	50 %	344212627
51043	NC_015948	TCC	2	6	2287978	2287983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344212627
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51045	NC_015948	CGA	3	9	2288036	2288044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212627
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51049	NC_015948	CGA	2	6	2288242	2288247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212628
51050	NC_015948	GACC	2	8	2288299	2288306	25 %	0 %	25 %	50 %	344212628
51051	NC_015948	CGG	2	6	2288319	2288324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212628
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51059	NC_015948	TCGC	2	8	2288619	2288626	0 %	25 %	25 %	50 %	344212628
51060	NC_015948	CGGC	2	8	2288688	2288695	0 %	0 %	50 %	50 %	344212628
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51066	NC_015948	CTGG	2	8	2288821	2288828	0 %	25 %	50 %	25 %	344212628
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51082	NC_015948	CGA	2	6	2289455	2289460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212629
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51084	NC_015948	TCG	2	6	2289484	2289489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212629
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51087	NC_015948	AC	3	6	2289664	2289669	50 %	0 %	0 %	50 %	344212629
51088	NC_015948	TATCGA	2	12	2289683	2289694	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	344212629
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51098	NC_015948	GCG	2	6	2290159	2290164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212629
51099	NC_015948	GGCC	2	8	2290187	2290194	0 %	0 %	50 %	50 %	344212629
51100	NC_015948	CGATG	2	10	2290244	2290253	20 %	20 %	40 %	20 %	344212629
51101	NC_015948	GCG	2	6	2290255	2290260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212629
51102	NC_015948	GAC	2	6	2290374	2290379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212630
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51104	NC_015948	CG	3	6	2290391	2290396	0 %	0 %	50 %	50 %	344212630
51105	NC_015948	CGG	2	6	2290407	2290412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212630
51106	NC_015948	CGT	2	6	2290424	2290429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212630
51107	NC_015948	GCATCG	2	12	2290435	2290446	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344212630
51108	NC_015948	CGACC	2	10	2290460	2290469	20 %	0 %	20 %	60 %	344212630
51109	NC_015948	ACG	2	6	2290492	2290497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212630
51110	NC_015948	CGT	2	6	2290529	2290534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212630
51111	NC_015948	GTC	2	6	2290575	2290580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212630
51112	NC_015948	CGA	2	6	2290630	2290635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212630
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51114	NC_015948	CGG	2	6	2290669	2290674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212630
51115	NC_015948	CGA	2	6	2290727	2290732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212630
51116	NC_015948	TCG	2	6	2290735	2290740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212630
51117	NC_015948	GAC	2	6	2290773	2290778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212630
51118	NC_015948	CGCT	2	8	2290788	2290795	0 %	25 %	25 %	50 %	344212630
51119	NC_015948	CTA	2	6	2290826	2290831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344212630
51120	NC_015948	GGA	2	6	2290913	2290918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212630
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51122	NC_015948	TC	3	6	2291000	2291005	0 %	50 %	0 %	50 %	344212630
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51216	NC_015948	CGA	2	6	2294490	2294495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212635
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51219	NC_015948	CGGC	2	8	2294612	2294619	0 %	0 %	50 %	50 %	344212635
51220	NC_015948	CGGTC	2	10	2294712	2294721	0 %	20 %	40 %	40 %	344212635
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51222	NC_015948	CGT	2	6	2294934	2294939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212636
51223	NC_015948	CGG	3	9	2294940	2294948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212636
51224	NC_015948	GCCGC	2	10	2295041	2295050	0 %	0 %	40 %	60 %	344212636
51225	NC_015948	ACG	2	6	2295062	2295067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212636
51226	NC_015948	CGA	2	6	2295075	2295080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212636
51227	NC_015948	CGC	2	6	2295096	2295101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212636
51228	NC_015948	GACCTG	2	12	2295124	2295135	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344212636
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51230	NC_015948	CGC	2	6	2295180	2295185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212636
51231	NC_015948	CGG	2	6	2295248	2295253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212636
51232	NC_015948	GGCC	2	8	2295300	2295307	0 %	0 %	50 %	50 %	344212636
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51325	NC_015948	CAGCGG	2	12	2299302	2299313	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	344212640
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51330	NC_015948	ACCGC	2	10	2299435	2299444	20 %	0 %	20 %	60 %	344212640
51331	NC_015948	GAC	2	6	2299503	2299508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212640
51332	NC_015948	TCG	2	6	2299516	2299521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212640
51333	NC_015948	CGA	2	6	2299589	2299594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212640
51334	NC_015948	TCAC	2	8	2299898	2299905	25 %	25 %	0 %	50 %	344212641
51335	NC_015948	GAC	2	6	2300102	2300107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212641
51336	NC_015948	CTG	2	6	2300132	2300137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212641
51337	NC_015948	TAC	2	6	2300225	2300230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344212641
51338	NC_015948	GCT	2	6	2300275	2300280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212641
51339	NC_015948	GTC	2	6	2300288	2300293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212641
51340	NC_015948	GAC	2	6	2300317	2300322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212641
51341	NC_015948	CATCGG	2	12	2300347	2300358	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344212641
51342	NC_015948	C	6	6	2300433	2300438	0 %	0 %	0 %	100 %	344212641
51343	NC_015948	ACG	2	6	2300447	2300452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212641
51344	NC_015948	GCC	2	6	2300462	2300467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212641
51345	NC_015948	CGCTG	2	10	2300551	2300560	0 %	20 %	40 %	40 %	344212641
51346	NC_015948	TCG	2	6	2300661	2300666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212641
51347	NC_015948	GCC	2	6	2300774	2300779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212641
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51351	NC_015948	CTG	2	6	2300961	2300966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212641
51352	NC_015948	GTC	2	6	2300987	2300992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212641
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51440	NC_015948	CGG	2	6	2304879	2304884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212644
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51442	NC_015948	GCCGTG	2	12	2304910	2304921	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344212644
51443	NC_015948	GCG	2	6	2304926	2304931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212644
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51450	NC_015948	CTT	2	6	2305221	2305226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344212644
51451	NC_015948	CGG	2	6	2305272	2305277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212644
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51455	NC_015948	CGT	2	6	2305383	2305388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212644
51456	NC_015948	CAT	2	6	2305392	2305397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344212644
51457	NC_015948	CGG	2	6	2305398	2305403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212644
51458	NC_015948	GAC	2	6	2305437	2305442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212644
51459	NC_015948	GAG	2	6	2305450	2305455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344212644
51460	NC_015948	CCG	2	6	2305463	2305468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212644
51461	NC_015948	AAAC	2	8	2305484	2305491	75 %	0 %	0 %	25 %	344212644
51462	NC_015948	AGC	2	6	2305889	2305894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212645
51463	NC_015948	GGC	2	6	2305920	2305925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212645
51464	NC_015948	CGG	2	6	2305931	2305936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344212645
51465	NC_015948	TGA	2	6	2305937	2305942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212645
51466	NC_015948	GAC	2	6	2306001	2306006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212645
51467	NC_015948	CTGAA	2	10	2306008	2306017	40 %	20 %	20 %	20 %	344212645
51468	NC_015948	ACAGAG	2	12	2306028	2306039	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	344212645
51469	NC_015948	CGA	2	6	2306078	2306083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212645
51470	NC_015948	GA	3	6	2306122	2306127	50 %	0 %	50 %	0 %	344212645
51471	NC_015948	CGC	2	6	2306141	2306146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212645
51472	NC_015948	TCGCCA	2	12	2306251	2306262	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	344212645
51473	NC_015948	AGTCG	2	10	2306408	2306417	20 %	20 %	40 %	20 %	344212645
51474	NC_015948	CGT	2	6	2306450	2306455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212645
51475	NC_015948	CGA	2	6	2306462	2306467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212645
51476	NC_015948	CCA	2	6	2306494	2306499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344212645
51477	NC_015948	GAC	3	9	2306523	2306531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212645
51478	NC_015948	TGC	2	6	2306555	2306560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212645
51479	NC_015948	CGGT	2	8	2306575	2306582	0 %	25 %	50 %	25 %	344212645
51480	NC_015948	TAC	2	6	2306667	2306672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344212645
51481	NC_015948	AG	3	6	2306719	2306724	50 %	0 %	50 %	0 %	344212645
51482	NC_015948	AC	4	8	2306985	2306992	50 %	0 %	0 %	50 %	344212646
51483	NC_015948	GAC	2	6	2307018	2307023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212646
51484	NC_015948	GCTC	2	8	2307068	2307075	0 %	25 %	25 %	50 %	344212646
51485	NC_015948	CGA	3	9	2307081	2307089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212646
51486	NC_015948	TCG	3	9	2307122	2307130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212646
51487	NC_015948	CGA	2	6	2307135	2307140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212646
51488	NC_015948	GC	3	6	2307162	2307167	0 %	0 %	50 %	50 %	344212646
51489	NC_015948	CGA	3	9	2307212	2307220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212646
51490	NC_015948	ATG	2	6	2307223	2307228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344212646
51491	NC_015948	CGA	2	6	2307245	2307250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212646
51492	NC_015948	CT	3	6	2307289	2307294	0 %	50 %	0 %	50 %	344212646
51493	NC_015948	AAC	2	6	2307299	2307304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344212646
51494	NC_015948	AGA	2	6	2307308	2307313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344212646
51495	NC_015948	CCG	2	6	2307459	2307464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212646
51496	NC_015948	CG	3	6	2307463	2307468	0 %	0 %	50 %	50 %	344212646
51497	NC_015948	CGC	3	9	2307528	2307536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344212646
51498	NC_015948	CGCT	2	8	2307556	2307563	0 %	25 %	25 %	50 %	344212646
51499	NC_015948	CGA	2	6	2307564	2307569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344212646
51500	NC_015948	CGT	2	6	2307624	2307629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344212646

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