MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 plasmid pHH400

Total Repeats: 7750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015944	TCGTC	2	10	84408	84417	0 %	40 %	20 %	40 %	344210018
1502	NC_015944	GAC	2	6	84433	84438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210018
1503	NC_015944	TCG	2	6	84455	84460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210018
1504	NC_015944	TTG	2	6	84515	84520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210018
1505	NC_015944	AGT	2	6	84606	84611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210018
1506	NC_015944	CGC	2	6	84634	84639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210018
1507	NC_015944	CGC	3	9	84648	84656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210018
1508	NC_015944	GGT	2	6	84684	84689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210018
1509	NC_015944	CTG	2	6	84709	84714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210018
1510	NC_015944	GAC	2	6	84793	84798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210018
1511	NC_015944	CAG	2	6	84907	84912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210018
1512	NC_015944	GCC	2	6	84937	84942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210018
1513	NC_015944	TG	3	6	84968	84973	0 %	50 %	50 %	0 %	344210018
1514	NC_015944	TC	3	6	85019	85024	0 %	50 %	0 %	50 %	344210019
1515	NC_015944	TCG	3	9	85036	85044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210019
1516	NC_015944	CCGAC	2	10	85046	85055	20 %	0 %	20 %	60 %	344210019
1517	NC_015944	ATC	2	6	85135	85140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210019
1518	NC_015944	AGC	2	6	85174	85179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210019
1519	NC_015944	CGAC	2	8	85205	85212	25 %	0 %	25 %	50 %	344210019
1520	NC_015944	CGC	2	6	85283	85288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210019
1521	NC_015944	GCC	2	6	85298	85303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210019
1522	NC_015944	GTC	2	6	85463	85468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210020
1523	NC_015944	TGT	2	6	85480	85485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344210020
1524	NC_015944	GTC	2	6	85493	85498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210020
1525	NC_015944	GAGTC	2	10	85539	85548	20 %	20 %	40 %	20 %	344210020
1526	NC_015944	TCG	2	6	85554	85559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210020
1527	NC_015944	CGG	2	6	85573	85578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210020
1528	NC_015944	CCG	2	6	85579	85584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210020
1529	NC_015944	ACGA	2	8	85590	85597	50 %	0 %	25 %	25 %	344210020
1530	NC_015944	TCA	2	6	85666	85671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210020
1531	NC_015944	GCC	2	6	85712	85717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210020
1532	NC_015944	GAA	2	6	85745	85750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210020
1533	NC_015944	GGT	2	6	85870	85875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210020
1534	NC_015944	TCA	2	6	85996	86001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210020
1535	NC_015944	CGG	2	6	86035	86040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210020
1536	NC_015944	TCC	2	6	86082	86087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210020
1537	NC_015944	TGA	2	6	86106	86111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210020
1538	NC_015944	TCG	2	6	86173	86178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210020
1539	NC_015944	ACG	2	6	86179	86184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210020
1540	NC_015944	ATG	2	6	86214	86219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344210020
1541	NC_015944	GCC	3	9	86231	86239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210020
1542	NC_015944	CGA	2	6	86299	86304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210020
1543	NC_015944	AGCC	2	8	86305	86312	25 %	0 %	25 %	50 %	344210020
1544	NC_015944	AC	3	6	86336	86341	50 %	0 %	0 %	50 %	344210020
1545	NC_015944	CGTCCT	2	12	86347	86358	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	344210020
1546	NC_015944	CGG	2	6	86515	86520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210020
1547	NC_015944	GGTCGT	2	12	86552	86563	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	344210020
1548	NC_015944	CGC	3	9	86569	86577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210020
1549	NC_015944	GTGGAT	2	12	86648	86659	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	344210020
1550	NC_015944	CCA	2	6	86667	86672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210020
1551	NC_015944	CGG	2	6	86692	86697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210020
1552	NC_015944	CGTC	2	8	86704	86711	0 %	25 %	25 %	50 %	344210020
1553	NC_015944	CGA	2	6	86719	86724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210020
1554	NC_015944	CGG	2	6	86803	86808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210020
1555	NC_015944	CGA	2	6	86809	86814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210020
1556	NC_015944	TCG	2	6	86836	86841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210020
1557	NC_015944	GC	3	6	86863	86868	0 %	0 %	50 %	50 %	344210020
1558	NC_015944	TG	3	6	86877	86882	0 %	50 %	50 %	0 %	344210020
1559	NC_015944	CGC	2	6	86923	86928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210020
1560	NC_015944	TCG	2	6	86940	86945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210020
1561	NC_015944	GTC	2	6	86960	86965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210020
1562	NC_015944	CGT	2	6	87014	87019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210020
1563	NC_015944	CTCC	2	8	87072	87079	0 %	25 %	0 %	75 %	344210021
1564	NC_015944	TCG	2	6	87080	87085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210021
1565	NC_015944	GCC	2	6	87113	87118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210021
1566	NC_015944	CCG	2	6	87200	87205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210021
1567	NC_015944	CGA	2	6	87210	87215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210021
1568	NC_015944	TCG	2	6	87230	87235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210021
1569	NC_015944	CGG	2	6	87261	87266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210021
1570	NC_015944	GCC	2	6	87290	87295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210021
1571	NC_015944	GAA	2	6	87328	87333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210021
1572	NC_015944	CGT	2	6	87391	87396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210021
1573	NC_015944	GTC	2	6	88106	88111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210022
1574	NC_015944	AGC	2	6	88216	88221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210022
1575	NC_015944	CGG	2	6	88332	88337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210022
1576	NC_015944	GAG	2	6	88426	88431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210022
1577	NC_015944	CTC	2	6	88458	88463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210022
1578	NC_015944	ACC	2	6	88522	88527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210022
1579	NC_015944	GCG	2	6	88538	88543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210022
1580	NC_015944	CGA	2	6	88548	88553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210022
1581	NC_015944	CG	3	6	88578	88583	0 %	0 %	50 %	50 %	344210022
1582	NC_015944	TCC	2	6	88601	88606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210022
1583	NC_015944	GAG	2	6	88618	88623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210022
1584	NC_015944	ACG	2	6	88709	88714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210022
1585	NC_015944	GAG	2	6	88729	88734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210022
1586	NC_015944	TCC	2	6	88753	88758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210022
1587	NC_015944	AGG	2	6	88784	88789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210022
1588	NC_015944	CGT	2	6	88835	88840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210022
1589	NC_015944	CGGC	2	8	88859	88866	0 %	0 %	50 %	50 %	344210022
1590	NC_015944	GGA	2	6	88971	88976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210022
1591	NC_015944	ACCG	2	8	88980	88987	25 %	0 %	25 %	50 %	344210022
1592	NC_015944	CGG	2	6	89004	89009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210022
1593	NC_015944	TCG	2	6	89012	89017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210022
1594	NC_015944	GAG	2	6	89059	89064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210022
1595	NC_015944	ACT	2	6	89075	89080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210022
1596	NC_015944	AAG	2	6	89098	89103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210022
1597	NC_015944	CAC	2	6	89121	89126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210022
1598	NC_015944	CAC	2	6	89233	89238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210022
1599	NC_015944	ACC	2	6	89243	89248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344210022
1600	NC_015944	GC	3	6	89262	89267	0 %	0 %	50 %	50 %	344210022
1601	NC_015944	CGGC	2	8	89333	89340	0 %	0 %	50 %	50 %	344210022
1602	NC_015944	ACT	2	6	89387	89392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210022
1603	NC_015944	GAG	2	6	89395	89400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344210022
1604	NC_015944	CGC	2	6	89471	89476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210023
1605	NC_015944	CAT	2	6	89489	89494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210023
1606	NC_015944	TCA	2	6	89512	89517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210023
1607	NC_015944	TCG	2	6	89593	89598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210023
1608	NC_015944	CGG	2	6	89612	89617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210023
1609	NC_015944	TCA	2	6	89656	89661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210023
1610	NC_015944	CAGC	2	8	89687	89694	25 %	0 %	25 %	50 %	344210023
1611	NC_015944	CAT	2	6	89711	89716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210023
1612	NC_015944	GCT	2	6	89906	89911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210023
1613	NC_015944	CTA	2	6	89921	89926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210023
1614	NC_015944	GC	3	6	89954	89959	0 %	0 %	50 %	50 %	344210023
1615	NC_015944	CGA	2	6	89965	89970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210023
1616	NC_015944	GC	3	6	90067	90072	0 %	0 %	50 %	50 %	344210023
1617	NC_015944	GTC	2	6	90084	90089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210023
1618	NC_015944	TCG	2	6	90121	90126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210023
1619	NC_015944	TCGT	2	8	90129	90136	0 %	50 %	25 %	25 %	344210023
1620	NC_015944	CGT	2	6	90140	90145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210023
1621	NC_015944	CGT	2	6	90161	90166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210023
1622	NC_015944	G	6	6	90185	90190	0 %	0 %	100 %	0 %	344210023
1623	NC_015944	TCG	2	6	90271	90276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210023
1624	NC_015944	TCC	2	6	90286	90291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210023
1625	NC_015944	AAC	2	6	90316	90321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344210023
1626	NC_015944	GACA	2	8	90356	90363	50 %	0 %	25 %	25 %	344210024
1627	NC_015944	GGCGA	2	10	90372	90381	20 %	0 %	60 %	20 %	344210024
1628	NC_015944	TCG	2	6	90466	90471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210024
1629	NC_015944	CTG	2	6	90543	90548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210024
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1631	NC_015944	GTC	2	6	90603	90608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210024
1632	NC_015944	TTC	2	6	90609	90614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344210024
1633	NC_015944	CGT	2	6	90638	90643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210024
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1643	NC_015944	TCGGCG	2	12	90901	90912	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	344210024
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1649	NC_015944	CGC	2	6	91187	91192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210024
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1651	NC_015944	GCT	2	6	91226	91231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210024
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1654	NC_015944	CTG	2	6	91356	91361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210024
1655	NC_015944	CGG	2	6	91397	91402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210024
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1660	NC_015944	CCG	2	6	91563	91568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210025
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1662	NC_015944	CGG	2	6	91633	91638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210025
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1744	NC_015944	AGC	2	6	95646	95651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210029
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1869	NC_015944	TTCC	2	8	103302	103309	0 %	50 %	0 %	50 %	344210039
1870	NC_015944	GAC	2	6	103327	103332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210039
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1872	NC_015944	GTC	2	6	103414	103419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210039
1873	NC_015944	GAC	2	6	103420	103425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210039
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1875	NC_015944	TG	3	6	103471	103476	0 %	50 %	50 %	0 %	344210039
1876	NC_015944	TCGT	2	8	103536	103543	0 %	50 %	25 %	25 %	344210039
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1975	NC_015944	CAGGA	2	10	108359	108368	40 %	0 %	40 %	20 %	344210044
1976	NC_015944	CGAA	2	8	108369	108376	50 %	0 %	25 %	25 %	344210044
1977	NC_015944	CGA	2	6	108436	108441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210044
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1983	NC_015944	CGA	2	6	108661	108666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210044
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1985	NC_015944	ACG	2	6	108725	108730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210044
1986	NC_015944	TCG	2	6	108774	108779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210044
1987	NC_015944	GAA	2	6	108833	108838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210044
1988	NC_015944	CTC	2	6	108848	108853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344210044
1989	NC_015944	GTG	2	6	108881	108886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344210044
1990	NC_015944	CCGCC	2	10	108952	108961	0 %	0 %	20 %	80 %	344210044
1991	NC_015944	CGC	2	6	109176	109181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210045
1992	NC_015944	TCG	2	6	109196	109201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210045
1993	NC_015944	CGG	2	6	109285	109290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344210045
1994	NC_015944	CCG	2	6	109310	109315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344210045
1995	NC_015944	GTC	2	6	109420	109425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210046
1996	NC_015944	GGCG	2	8	109426	109433	0 %	0 %	75 %	25 %	344210046
1997	NC_015944	CGT	2	6	109954	109959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344210047
1998	NC_015944	GAA	2	6	109982	109987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344210047
1999	NC_015944	CGA	2	6	109996	110001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344210047
2000	NC_015944	TCA	3	9	110028	110036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344210047

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