MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haloarcula hispanica ATCC 33960 chromosome II

Total Repeats: 8342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015943	AGG	3	9	66711	66719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209559
1002	NC_015943	TACGAC	2	12	66722	66733	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	344209559
1003	NC_015943	CAG	2	6	66788	66793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209559
1004	NC_015943	GAA	2	6	66794	66799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209559
1005	NC_015943	TGGA	2	8	66950	66957	25 %	25 %	50 %	0 %	344209559
1006	NC_015943	CAG	2	6	66983	66988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209559
1007	NC_015943	GCA	2	6	67028	67033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209559
1008	NC_015943	GCC	2	6	67035	67040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209559
1009	NC_015943	CGA	2	6	67150	67155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209559
1010	NC_015943	CAT	2	6	67204	67209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209559
1011	NC_015943	GAG	2	6	67211	67216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209559
1012	NC_015943	GAC	2	6	67256	67261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209559
1013	NC_015943	CGG	2	6	67306	67311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209559
1014	NC_015943	CGA	2	6	67369	67374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209559
1015	NC_015943	CAT	2	6	67423	67428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209559
1016	NC_015943	GCG	2	6	67434	67439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209559
1017	NC_015943	GTTCG	2	10	67474	67483	0 %	40 %	40 %	20 %	344209559
1018	NC_015943	CGG	2	6	67500	67505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209559
1019	NC_015943	CGT	2	6	67506	67511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209559
1020	NC_015943	CG	3	6	67562	67567	0 %	0 %	50 %	50 %	344209559
1021	NC_015943	GCC	2	6	67640	67645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209559
1022	NC_015943	CTCG	2	8	68373	68380	0 %	25 %	25 %	50 %	344209560
1023	NC_015943	CGT	2	6	68474	68479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209560
1024	NC_015943	CTCA	2	8	68484	68491	25 %	25 %	0 %	50 %	344209560
1025	NC_015943	CGA	2	6	68492	68497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209560
1026	NC_015943	GAC	2	6	68540	68545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209560
1027	NC_015943	CGGT	2	8	68593	68600	0 %	25 %	50 %	25 %	344209560
1028	NC_015943	AAC	2	6	68702	68707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209560
1029	NC_015943	CGC	2	6	68740	68745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209560
1030	NC_015943	GAT	2	6	68756	68761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209560
1031	NC_015943	CGT	2	6	68780	68785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209560
1032	NC_015943	CGA	2	6	68840	68845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209560
1033	NC_015943	TGA	2	6	68858	68863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209560
1034	NC_015943	AGC	2	6	68870	68875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209560
1035	NC_015943	TCG	2	6	68883	68888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209561
1036	NC_015943	TCG	2	6	68901	68906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209561
1037	NC_015943	CCGT	2	8	68940	68947	0 %	25 %	25 %	50 %	344209561
1038	NC_015943	GAG	2	6	68999	69004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209561
1039	NC_015943	CGA	2	6	69013	69018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209561
1040	NC_015943	TGC	2	6	69046	69051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209561
1041	NC_015943	GAG	2	6	69059	69064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209561
1042	NC_015943	GATG	2	8	69118	69125	25 %	25 %	50 %	0 %	344209561
1043	NC_015943	GACC	2	8	69155	69162	25 %	0 %	25 %	50 %	344209561
1044	NC_015943	CGAG	2	8	69175	69182	25 %	0 %	50 %	25 %	344209561
1045	NC_015943	CGC	2	6	69187	69192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209561
1046	NC_015943	GCT	2	6	69206	69211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209561
1047	NC_015943	GCC	2	6	69266	69271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209561
1048	NC_015943	T	7	7	69851	69857	0 %	100 %	0 %	0 %	344209562
1049	NC_015943	GTG	2	6	69952	69957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209562
1050	NC_015943	TC	3	6	70337	70342	0 %	50 %	0 %	50 %	344209563
1051	NC_015943	GAG	2	6	70368	70373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209563
1052	NC_015943	GTC	2	6	70476	70481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209563
1053	NC_015943	TGCA	2	8	72514	72521	25 %	25 %	25 %	25 %	344209564
1054	NC_015943	GAC	2	6	72556	72561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209564
1055	NC_015943	TAC	2	6	72580	72585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209564
1056	NC_015943	CGA	2	6	72681	72686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209564
1057	NC_015943	ACA	2	6	72756	72761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344209564
1058	NC_015943	TGA	3	9	72798	72806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209564
1059	NC_015943	GCCCG	2	10	72933	72942	0 %	0 %	40 %	60 %	344209564
1060	NC_015943	TCAA	2	8	73289	73296	50 %	25 %	0 %	25 %	344209565
1061	NC_015943	AAAC	2	8	73304	73311	75 %	0 %	0 %	25 %	344209565
1062	NC_015943	CA	3	6	73356	73361	50 %	0 %	0 %	50 %	344209565
1063	NC_015943	GAATC	2	10	73370	73379	40 %	20 %	20 %	20 %	344209565
1064	NC_015943	AC	3	6	73400	73405	50 %	0 %	0 %	50 %	344209565
1065	NC_015943	GAAC	2	8	73472	73479	50 %	0 %	25 %	25 %	344209565
1066	NC_015943	CAC	2	6	73485	73490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209565
1067	NC_015943	AC	3	6	73547	73552	50 %	0 %	0 %	50 %	344209565
1068	NC_015943	GCCG	2	8	73671	73678	0 %	0 %	50 %	50 %	344209565
1069	NC_015943	TAG	2	6	73695	73700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209565
1070	NC_015943	AGT	2	6	73740	73745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209565
1071	NC_015943	AGC	2	6	73795	73800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209565
1072	NC_015943	CCCG	2	8	73849	73856	0 %	0 %	25 %	75 %	344209565
1073	NC_015943	CGA	2	6	73878	73883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209565
1074	NC_015943	GAC	2	6	73912	73917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209565
1075	NC_015943	GCA	2	6	73919	73924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209565
1076	NC_015943	ACG	2	6	74015	74020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209565
1077	NC_015943	GGAT	2	8	74097	74104	25 %	25 %	50 %	0 %	344209566
1078	NC_015943	ACG	2	6	74222	74227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209566
1079	NC_015943	GAA	2	6	74254	74259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344209566
1080	NC_015943	CAC	2	6	74286	74291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209566
1081	NC_015943	TCG	2	6	74345	74350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209566
1082	NC_015943	TGA	2	6	74406	74411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209566
1083	NC_015943	T	6	6	75034	75039	0 %	100 %	0 %	0 %	344209567
1084	NC_015943	AGG	2	6	75078	75083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209567
1085	NC_015943	TCA	2	6	75093	75098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209567
1086	NC_015943	TCC	2	6	75234	75239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344209567
1087	NC_015943	CGG	2	6	75279	75284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209567
1088	NC_015943	TCG	2	6	75300	75305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209567
1089	NC_015943	CTTCT	2	10	76511	76520	0 %	60 %	0 %	40 %	344209568
1090	NC_015943	TCA	2	6	76539	76544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209568
1091	NC_015943	TCA	2	6	76605	76610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344209568
1092	NC_015943	GTG	2	6	76611	76616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209568
1093	NC_015943	TGT	2	6	76651	76656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209568
1094	NC_015943	CTG	2	6	76664	76669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209568
1095	NC_015943	TTC	2	6	76697	76702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344209568
1096	NC_015943	CGG	2	6	76741	76746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209568
1097	NC_015943	TGT	2	6	76754	76759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344209568
1098	NC_015943	GTCG	2	8	76772	76779	0 %	25 %	50 %	25 %	344209568
1099	NC_015943	TCG	3	9	76782	76790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209568
1100	NC_015943	CT	4	8	76848	76855	0 %	50 %	0 %	50 %	344209568
1101	NC_015943	CGT	3	9	76864	76872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209568
1102	NC_015943	TCG	2	6	76899	76904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209568
1103	NC_015943	CT	3	6	76938	76943	0 %	50 %	0 %	50 %	344209568
1104	NC_015943	CGT	2	6	77023	77028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209568
1105	NC_015943	GA	3	6	77065	77070	50 %	0 %	50 %	0 %	344209568
1106	NC_015943	CGC	2	6	77173	77178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344209568
1107	NC_015943	TGG	2	6	77184	77189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344209568
1108	NC_015943	TGTAC	2	10	77321	77330	20 %	40 %	20 %	20 %	344209568
1109	NC_015943	TGAG	2	8	77415	77422	25 %	25 %	50 %	0 %	344209568
1110	NC_015943	TCG	2	6	77442	77447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209568
1111	NC_015943	AGC	2	6	77505	77510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209568
1112	NC_015943	ATG	2	6	77556	77561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344209568
1113	NC_015943	GTCG	2	8	77716	77723	0 %	25 %	50 %	25 %	344209568
1114	NC_015943	GAG	2	6	77765	77770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209568
1115	NC_015943	GGC	2	6	77800	77805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209568
1116	NC_015943	CGA	2	6	78424	78429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209569
1117	NC_015943	GCTG	2	8	78523	78530	0 %	25 %	50 %	25 %	344209569
1118	NC_015943	GAG	2	6	78554	78559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344209569
1119	NC_015943	TGGC	2	8	78560	78567	0 %	25 %	50 %	25 %	344209569
1120	NC_015943	CAGG	2	8	78583	78590	25 %	0 %	50 %	25 %	344209569
1121	NC_015943	GAC	2	6	78619	78624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209569
1122	NC_015943	ACC	2	6	78662	78667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344209569
1123	NC_015943	C	6	6	78666	78671	0 %	0 %	0 %	100 %	344209569
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1125	NC_015943	GCTC	2	8	79094	79101	0 %	25 %	25 %	50 %	344209570
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1493	NC_015943	CGTC	2	8	106498	106505	0 %	25 %	25 %	50 %	344209606
1494	NC_015943	GAC	2	6	106526	106531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209606
1495	NC_015943	GTC	2	6	106547	106552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209606
1496	NC_015943	CGG	2	6	106568	106573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344209606
1497	NC_015943	GTC	2	6	106610	106615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209606
1498	NC_015943	GTC	2	6	106667	106672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209606
1499	NC_015943	ACG	2	6	106686	106691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344209606
1500	NC_015943	GTC	2	6	106793	106798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344209606

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