MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hyphomicrobium sp. MC1

Total Repeats: 93807

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015717	GCAG	2	8	8	15	25 %	0 %	50 %	25 %	338736864
2	NC_015717	TGC	2	6	247	252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736864
3	NC_015717	GCT	2	6	253	258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736864
4	NC_015717	CG	3	6	259	264	0 %	0 %	50 %	50 %	338736864
5	NC_015717	GGC	2	6	301	306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338736864
6	NC_015717	CGG	2	6	331	336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338736864
7	NC_015717	CGC	2	6	353	358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338736864
8	NC_015717	CGC	2	6	403	408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338736864
9	NC_015717	GCA	2	6	414	419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338736864
10	NC_015717	GCGG	2	8	459	466	0 %	0 %	75 %	25 %	338736864
11	NC_015717	CGC	2	6	478	483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338736864
12	NC_015717	TCG	3	9	511	519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736864
13	NC_015717	CGG	2	6	613	618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338736864
14	NC_015717	CTT	2	6	639	644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338736864
15	NC_015717	GAA	2	6	665	670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338736864
16	NC_015717	TCG	2	6	727	732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736864
17	NC_015717	GTC	2	6	743	748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736864
18	NC_015717	CAACAT	2	12	779	790	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	338736864
19	NC_015717	CGA	2	6	800	805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338736864
20	NC_015717	CAT	2	6	851	856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338736864
21	NC_015717	CGG	2	6	872	877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338736864
22	NC_015717	GTC	2	6	885	890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736864
23	NC_015717	GAA	2	6	1031	1036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338736864
24	NC_015717	GGC	2	6	1037	1042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338736864
25	NC_015717	CG	3	6	1063	1068	0 %	0 %	50 %	50 %	338736864
26	NC_015717	GTC	2	6	1071	1076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736864
27	NC_015717	ATT	2	6	1257	1262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338736864
28	NC_015717	CTG	2	6	1293	1298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736864
29	NC_015717	CGT	2	6	1319	1324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736864
30	NC_015717	CGG	2	6	1392	1397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338736864
31	NC_015717	CGG	2	6	1400	1405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338736864
32	NC_015717	ACCAC	2	10	1411	1420	40 %	0 %	0 %	60 %	338736864
33	NC_015717	GAG	2	6	1488	1493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338736864
34	NC_015717	CGT	2	6	1860	1865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736865
35	NC_015717	CGG	2	6	1870	1875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338736865
36	NC_015717	ACG	2	6	1876	1881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338736865
37	NC_015717	CAT	2	6	1899	1904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338736865
38	NC_015717	TGC	2	6	2021	2026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736865
39	NC_015717	CGAGAT	2	12	2058	2069	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338736865
40	NC_015717	CGA	2	6	2145	2150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338736865
41	NC_015717	GAA	2	6	2251	2256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338736865
42	NC_015717	CTA	2	6	2262	2267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338736865
43	NC_015717	ATCT	2	8	2278	2285	25 %	50 %	0 %	25 %	338736865
44	NC_015717	GACG	2	8	2298	2305	25 %	0 %	50 %	25 %	338736865
45	NC_015717	CGAC	2	8	2330	2337	25 %	0 %	25 %	50 %	338736865
46	NC_015717	CTGCCG	2	12	2362	2373	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	338736865
47	NC_015717	TCA	2	6	2399	2404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338736865
48	NC_015717	GCT	2	6	2436	2441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736865
49	NC_015717	CAA	2	6	2571	2576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338736865
50	NC_015717	CGT	2	6	2603	2608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736865
51	NC_015717	CGA	2	6	2633	2638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338736865
52	NC_015717	AGCG	2	8	2644	2651	25 %	0 %	50 %	25 %	338736865
53	NC_015717	GGC	2	6	2716	2721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338736865
54	NC_015717	GAA	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338736865
55	NC_015717	CGCT	2	8	2781	2788	0 %	25 %	25 %	50 %	338736865
56	NC_015717	CGA	2	6	2858	2863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338736865
57	NC_015717	CAG	2	6	2874	2879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338736865
58	NC_015717	GC	3	6	2888	2893	0 %	0 %	50 %	50 %	338736865
59	NC_015717	GAC	2	6	3465	3470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338736866
60	NC_015717	TCT	2	6	3522	3527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338736866
61	NC_015717	TGT	2	6	3542	3547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338736866
62	NC_015717	TCG	2	6	3578	3583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736866
63	NC_015717	GCG	2	6	3622	3627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338736866
64	NC_015717	GCG	3	9	3825	3833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338736866
65	NC_015717	GC	3	6	3897	3902	0 %	0 %	50 %	50 %	338736866
66	NC_015717	GCT	2	6	3921	3926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736866
67	NC_015717	GCG	2	6	4003	4008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338736866
68	NC_015717	TCG	2	6	4040	4045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736866
69	NC_015717	GCG	2	6	4050	4055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338736866
70	NC_015717	GAC	2	6	4117	4122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338736866
71	NC_015717	CGG	2	6	4136	4141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338736866
72	NC_015717	CG	3	6	4181	4186	0 %	0 %	50 %	50 %	338736866
73	NC_015717	TCG	2	6	4241	4246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736866
74	NC_015717	GCT	3	9	4302	4310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736866
75	NC_015717	CTG	2	6	4372	4377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736866
76	NC_015717	GC	3	6	4448	4453	0 %	0 %	50 %	50 %	338736866
77	NC_015717	A	6	6	4697	4702	100 %	0 %	0 %	0 %	338736867
78	NC_015717	GAC	2	6	4738	4743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338736867
79	NC_015717	CGA	2	6	4875	4880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338736867
80	NC_015717	CGA	2	6	4947	4952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338736867
81	NC_015717	CGA	3	9	4983	4991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338736867
82	NC_015717	GCGG	2	8	5041	5048	0 %	0 %	75 %	25 %	338736867
83	NC_015717	GGT	2	6	5080	5085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338736867
84	NC_015717	CGGCGT	2	12	5091	5102	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	338736867
85	NC_015717	GTCG	2	8	5103	5110	0 %	25 %	50 %	25 %	338736867
86	NC_015717	GTC	2	6	5209	5214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736867
87	NC_015717	GAG	2	6	5227	5232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338736867
88	NC_015717	CG	3	6	5367	5372	0 %	0 %	50 %	50 %	338736867
89	NC_015717	ACG	2	6	5405	5410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338736867
90	NC_015717	GGC	2	6	5511	5516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338736867
91	NC_015717	TGG	2	6	5521	5526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338736867
92	NC_015717	AAC	2	6	5563	5568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338736867
93	NC_015717	CGG	2	6	5583	5588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338736867
94	NC_015717	GC	3	6	5612	5617	0 %	0 %	50 %	50 %	338736867
95	NC_015717	CAA	2	6	5631	5636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338736867
96	NC_015717	GAA	2	6	5661	5666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338736867
97	NC_015717	CGA	2	6	5688	5693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338736867
98	NC_015717	CGTG	2	8	5711	5718	0 %	25 %	50 %	25 %	338736867
99	NC_015717	TTC	2	6	5748	5753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338736867
100	NC_015717	GGC	2	6	5802	5807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338736867
101	NC_015717	AAG	2	6	5849	5854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338736867
102	NC_015717	TCG	2	6	5864	5869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736867
103	NC_015717	TCG	2	6	5876	5881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736867
104	NC_015717	AGC	2	6	5883	5888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338736867
105	NC_015717	GC	3	6	5893	5898	0 %	0 %	50 %	50 %	338736867
106	NC_015717	GGC	2	6	5901	5906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338736867
107	NC_015717	GC	3	6	5905	5910	0 %	0 %	50 %	50 %	338736867
108	NC_015717	CGC	2	6	5929	5934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338736867
109	NC_015717	GC	3	6	5939	5944	0 %	0 %	50 %	50 %	338736867
110	NC_015717	TCG	2	6	6017	6022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736867
111	NC_015717	TGC	2	6	6080	6085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736867
112	NC_015717	GC	5	10	6114	6123	0 %	0 %	50 %	50 %	338736867
113	NC_015717	GTC	2	6	6138	6143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736867
114	NC_015717	CAT	2	6	6159	6164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338736867
115	NC_015717	GC	3	6	6167	6172	0 %	0 %	50 %	50 %	338736867
116	NC_015717	CGA	2	6	6192	6197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338736867
117	NC_015717	TCA	3	9	6230	6238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338736867
118	NC_015717	CCGACG	2	12	6242	6253	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	338736867
119	NC_015717	GC	3	6	6260	6265	0 %	0 %	50 %	50 %	338736867
120	NC_015717	GCT	2	6	6276	6281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736867
121	NC_015717	TTC	2	6	6289	6294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338736867
122	NC_015717	GCC	2	6	6345	6350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338736867
123	NC_015717	CG	3	6	6400	6405	0 %	0 %	50 %	50 %	338736867
124	NC_015717	GATC	2	8	6420	6427	25 %	25 %	25 %	25 %	338736867
125	NC_015717	GC	3	6	6471	6476	0 %	0 %	50 %	50 %	338736867
126	NC_015717	TCG	2	6	6497	6502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736867
127	NC_015717	GCGG	2	8	6520	6527	0 %	0 %	75 %	25 %	338736867
128	NC_015717	CAT	2	6	6541	6546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338736867
129	NC_015717	CGG	2	6	6582	6587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338736867
130	NC_015717	ACG	2	6	6716	6721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338736867
131	NC_015717	GCG	2	6	6746	6751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338736867
132	NC_015717	GCTCG	2	10	6783	6792	0 %	20 %	40 %	40 %	338736867
133	NC_015717	GCG	2	6	6801	6806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338736867
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