MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hyphomicrobium sp. MC1

Total Repeats: 93807

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015717	CGGTGC	2	12	48907	48918	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	338736913
1002	NC_015717	GCC	2	6	48962	48967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338736913
1003	NC_015717	GAT	2	6	48971	48976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338736913
1004	NC_015717	GGC	2	6	48977	48982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338736913
1005	NC_015717	CGA	2	6	48985	48990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338736913
1006	NC_015717	TCA	2	6	49062	49067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338736913
1007	NC_015717	CGT	2	6	49120	49125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736913
1008	NC_015717	GCC	2	6	49130	49135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338736913
1009	NC_015717	CAT	2	6	49202	49207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338736913
1010	NC_015717	CTCA	2	8	49352	49359	25 %	25 %	0 %	50 %	338736913
1011	NC_015717	GGA	2	6	49407	49412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338736913
1012	NC_015717	CGGT	2	8	49501	49508	0 %	25 %	50 %	25 %	338736914
1013	NC_015717	CG	3	6	49571	49576	0 %	0 %	50 %	50 %	338736914
1014	NC_015717	CGGA	2	8	49586	49593	25 %	0 %	50 %	25 %	338736914
1015	NC_015717	GC	3	6	49628	49633	0 %	0 %	50 %	50 %	338736914
1016	NC_015717	CGGG	2	8	49697	49704	0 %	0 %	75 %	25 %	338736914
1017	NC_015717	CGG	2	6	49719	49724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338736914
1018	NC_015717	TCG	2	6	49750	49755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736914
1019	NC_015717	GCGGG	2	10	49778	49787	0 %	0 %	80 %	20 %	338736914
1020	NC_015717	TCG	2	6	49799	49804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736914
1021	NC_015717	CG	3	6	49803	49808	0 %	0 %	50 %	50 %	338736914
1022	NC_015717	AAC	2	6	49873	49878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338736914
1023	NC_015717	CGGCG	2	10	49881	49890	0 %	0 %	60 %	40 %	338736914
1024	NC_015717	CGA	2	6	49901	49906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338736914
1025	NC_015717	GCC	2	6	49931	49936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338736914
1026	NC_015717	CGT	2	6	49964	49969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736914
1027	NC_015717	GCG	2	6	50051	50056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338736914
1028	NC_015717	GGC	2	6	50085	50090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338736914
1029	NC_015717	GCG	2	6	50093	50098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338736914
1030	NC_015717	CGCT	2	8	50158	50165	0 %	25 %	25 %	50 %	338736914
1031	NC_015717	ATG	2	6	50182	50187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338736914
1032	NC_015717	CCG	2	6	50194	50199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338736914
1033	NC_015717	CG	4	8	50198	50205	0 %	0 %	50 %	50 %	338736914
1034	NC_015717	GCC	2	6	50250	50255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338736914
1035	NC_015717	CGA	2	6	50327	50332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338736914
1036	NC_015717	CG	4	8	50348	50355	0 %	0 %	50 %	50 %	338736914
1037	NC_015717	CCGTG	2	10	50411	50420	0 %	20 %	40 %	40 %	338736914
1038	NC_015717	TCG	2	6	50428	50433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736914
1039	NC_015717	TTC	2	6	50437	50442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338736914
1040	NC_015717	GCCT	2	8	50502	50509	0 %	25 %	25 %	50 %	338736914
1041	NC_015717	CGG	2	6	50561	50566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338736914
1042	NC_015717	AAT	2	6	50603	50608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338736914
1043	NC_015717	TGG	2	6	50644	50649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338736914
1044	NC_015717	CGA	2	6	50654	50659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338736914
1045	NC_015717	GTT	2	6	50711	50716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338736914
1046	NC_015717	TGA	2	6	50753	50758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338736914
1047	NC_015717	TCGG	2	8	50764	50771	0 %	25 %	50 %	25 %	338736914
1048	NC_015717	GCG	2	6	50776	50781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338736914
1049	NC_015717	GCG	2	6	50801	50806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338736914
1050	NC_015717	GC	3	6	50854	50859	0 %	0 %	50 %	50 %	338736914
1051	NC_015717	TGA	2	6	50876	50881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338736914
1052	NC_015717	GGC	2	6	50886	50891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338736914
1053	NC_015717	TGCG	2	8	50915	50922	0 %	25 %	50 %	25 %	338736914
1054	NC_015717	CGG	2	6	50953	50958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338736914
1055	NC_015717	CGA	2	6	50981	50986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338736914
1056	NC_015717	AGCG	2	8	51036	51043	25 %	0 %	50 %	25 %	338736914
1057	NC_015717	GCC	2	6	51069	51074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338736914
1058	NC_015717	GTTCGA	2	12	51128	51139	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338736914
1059	NC_015717	GGC	2	6	51185	51190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338736914
1060	NC_015717	GC	3	6	51201	51206	0 %	0 %	50 %	50 %	338736914
1061	NC_015717	GCC	2	6	51228	51233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338736914
1062	NC_015717	GCA	2	6	51254	51259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338736914
1063	NC_015717	GAC	2	6	51276	51281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338736914
1064	NC_015717	GTG	2	6	51300	51305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338736914
1065	NC_015717	GTC	2	6	51400	51405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736914
1066	NC_015717	GCA	2	6	51416	51421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338736914
1067	NC_015717	GTC	2	6	51426	51431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736914
1068	NC_015717	CGA	2	6	51437	51442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338736914
1069	NC_015717	GGT	2	6	51444	51449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338736914
1070	NC_015717	GC	4	8	51457	51464	0 %	0 %	50 %	50 %	338736914
1071	NC_015717	GGT	2	6	51513	51518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338736914
1072	NC_015717	CTGC	2	8	51617	51624	0 %	25 %	25 %	50 %	338736914
1073	NC_015717	GAGGGG	2	12	51625	51636	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	338736914
1074	NC_015717	TGC	2	6	51652	51657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736914
1075	NC_015717	GGGGT	2	10	51686	51695	0 %	20 %	80 %	0 %	338736914
1076	NC_015717	GGA	2	6	51722	51727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338736914
1077	NC_015717	GCT	2	6	51805	51810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736914
1078	NC_015717	GAA	2	6	51833	51838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338736914
1079	NC_015717	GAGC	2	8	51879	51886	25 %	0 %	50 %	25 %	338736915
1080	NC_015717	GCC	2	6	51937	51942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338736915
1081	NC_015717	CGA	2	6	52077	52082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338736915
1082	NC_015717	CAA	2	6	52112	52117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338736915
1083	NC_015717	TCG	2	6	52123	52128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736915
1084	NC_015717	CGC	2	6	52187	52192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338736915
1085	NC_015717	CGA	2	6	52196	52201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338736915
1086	NC_015717	CGA	2	6	52241	52246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338736915
1087	NC_015717	CGGC	2	8	52255	52262	0 %	0 %	50 %	50 %	338736915
1088	NC_015717	ATC	2	6	52266	52271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338736915
1089	NC_015717	GCC	2	6	52326	52331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338736915
1090	NC_015717	GATC	2	8	52346	52353	25 %	25 %	25 %	25 %	338736915
1091	NC_015717	CGG	2	6	52407	52412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338736915
1092	NC_015717	TGC	2	6	52425	52430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736915
1093	NC_015717	CGG	2	6	52457	52462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338736915
1094	NC_015717	GTT	2	6	52470	52475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338736915
1095	NC_015717	GC	3	6	52487	52492	0 %	0 %	50 %	50 %	338736915
1096	NC_015717	TTC	2	6	52495	52500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338736915
1097	NC_015717	CGG	2	6	52505	52510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338736915
1098	NC_015717	CAG	2	6	52524	52529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338736915
1099	NC_015717	CGT	2	6	52563	52568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736915
1100	NC_015717	AGC	2	6	52603	52608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338736915
1101	NC_015717	GCT	2	6	52682	52687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736915
1102	NC_015717	CG	3	6	52693	52698	0 %	0 %	50 %	50 %	338736915
1103	NC_015717	CGG	2	6	52709	52714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338736915
1104	NC_015717	GCG	2	6	52795	52800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338736915
1105	NC_015717	CG	3	6	52815	52820	0 %	0 %	50 %	50 %	338736915
1106	NC_015717	CAT	2	6	52842	52847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338736915
1107	NC_015717	GCG	2	6	52880	52885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338736915
1108	NC_015717	GTA	2	6	52914	52919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338736915
1109	NC_015717	GC	3	6	52937	52942	0 %	0 %	50 %	50 %	338736915
1110	NC_015717	CGC	2	6	52985	52990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338736915
1111	NC_015717	CG	3	6	53057	53062	0 %	0 %	50 %	50 %	338736915
1112	NC_015717	CGT	2	6	53066	53071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736915
1113	NC_015717	CTTC	2	8	53078	53085	0 %	50 %	0 %	50 %	338736915
1114	NC_015717	CGA	3	9	53264	53272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338736915
1115	NC_015717	CG	3	6	53356	53361	0 %	0 %	50 %	50 %	338736915
1116	NC_015717	CCGA	2	8	53368	53375	25 %	0 %	25 %	50 %	338736915
1117	NC_015717	GACGA	2	10	53422	53431	40 %	0 %	40 %	20 %	338736915
1118	NC_015717	GCC	2	6	53439	53444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338736915
1119	NC_015717	CGA	2	6	53454	53459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338736915
1120	NC_015717	TCG	2	6	53462	53467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736915
1121	NC_015717	GCGG	2	8	53485	53492	0 %	0 %	75 %	25 %	338736915
1122	NC_015717	GAC	2	6	53544	53549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338736915
1123	NC_015717	ATG	2	6	53602	53607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338736915
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1125	NC_015717	GTC	2	6	53667	53672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736915
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1371	NC_015717	C	6	6	65862	65867	0 %	0 %	0 %	100 %	338736919
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1499	NC_015717	CGA	2	6	72154	72159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338736925
1500	NC_015717	TCG	2	6	72163	72168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338736925

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