MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 plasmid pHALXA02

Total Repeats: 3316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015667	GCAT	2	8	133	140	25 %	25 %	25 %	25 %	336251561
2	NC_015667	CT	3	6	215	220	0 %	50 %	0 %	50 %	336251561
3	NC_015667	CGC	2	6	223	228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251561
4	NC_015667	CGA	2	6	348	353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251561
5	NC_015667	CAG	2	6	376	381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251561
6	NC_015667	TCT	2	6	515	520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251562
7	NC_015667	TTC	2	6	604	609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251562
8	NC_015667	CAC	2	6	615	620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336251562
9	NC_015667	GGCA	2	8	653	660	25 %	0 %	50 %	25 %	336251562
10	NC_015667	AGA	2	6	698	703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251562
11	NC_015667	GTC	2	6	745	750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251562
12	NC_015667	TCG	2	6	752	757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251562
13	NC_015667	GAT	2	6	789	794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251562
14	NC_015667	ACC	2	6	869	874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336251563
15	NC_015667	TCG	2	6	929	934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251563
16	NC_015667	CGC	2	6	944	949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251563
17	NC_015667	GGA	2	6	960	965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251563
18	NC_015667	AGG	2	6	1031	1036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251563
19	NC_015667	CCG	2	6	1067	1072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251563
20	NC_015667	CCA	2	6	1074	1079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336251563
21	NC_015667	CCG	2	6	1114	1119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251563
22	NC_015667	CGG	2	6	1167	1172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251563
23	NC_015667	GAT	2	6	1228	1233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251563
24	NC_015667	CCACG	2	10	1236	1245	20 %	0 %	20 %	60 %	336251563
25	NC_015667	GAA	2	6	1431	1436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251563
26	NC_015667	TC	3	6	1518	1523	0 %	50 %	0 %	50 %	336251563
27	NC_015667	CGTC	2	8	1542	1549	0 %	25 %	25 %	50 %	336251563
28	NC_015667	GAA	2	6	1551	1556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251563
29	NC_015667	CGGA	2	8	1582	1589	25 %	0 %	50 %	25 %	336251563
30	NC_015667	CGGA	2	8	1606	1613	25 %	0 %	50 %	25 %	336251563
31	NC_015667	TAC	2	6	1672	1677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251563
32	NC_015667	CG	3	6	1907	1912	0 %	0 %	50 %	50 %	336251563
33	NC_015667	ACATCG	2	12	2000	2011	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	336251563
34	NC_015667	CCAA	2	8	2012	2019	50 %	0 %	0 %	50 %	336251563
35	NC_015667	ACG	3	9	2026	2034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251563
36	NC_015667	CGA	2	6	2253	2258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251563
37	NC_015667	CGAT	2	8	2357	2364	25 %	25 %	25 %	25 %	336251563
38	NC_015667	TGGC	2	8	2502	2509	0 %	25 %	50 %	25 %	336251563
39	NC_015667	AGA	2	6	2571	2576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251563
40	NC_015667	CAA	2	6	2584	2589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251563
41	NC_015667	CAG	2	6	2618	2623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251564
42	NC_015667	GCTG	2	8	2670	2677	0 %	25 %	50 %	25 %	336251564
43	NC_015667	GTT	2	6	2757	2762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336251564
44	NC_015667	AAC	2	6	2768	2773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251564
45	NC_015667	GTC	2	6	2778	2783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251564
46	NC_015667	CAA	2	6	2874	2879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251564
47	NC_015667	CT	3	6	2963	2968	0 %	50 %	0 %	50 %	336251564
48	NC_015667	GAA	2	6	3011	3016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251564
49	NC_015667	AGG	2	6	3061	3066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251564
50	NC_015667	CTC	2	6	3117	3122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251564
51	NC_015667	CAA	2	6	3173	3178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251564
52	NC_015667	TA	3	6	3194	3199	50 %	50 %	0 %	0 %	336251564
53	NC_015667	GGT	2	6	3230	3235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336251564
54	NC_015667	AGC	2	6	3250	3255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251564
55	NC_015667	TTCG	2	8	3288	3295	0 %	50 %	25 %	25 %	336251564
56	NC_015667	CCT	2	6	3307	3312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251564
57	NC_015667	GAA	2	6	3321	3326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251564
58	NC_015667	ACT	2	6	3400	3405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251564
59	NC_015667	AGA	2	6	3413	3418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251564
60	NC_015667	AGTG	2	8	3444	3451	25 %	25 %	50 %	0 %	336251564
61	NC_015667	GTT	2	6	3476	3481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336251565
62	NC_015667	AAC	2	6	3539	3544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251565
63	NC_015667	GGA	2	6	3562	3567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251565
64	NC_015667	ACT	2	6	3685	3690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251565
65	NC_015667	AC	3	6	3718	3723	50 %	0 %	0 %	50 %	336251565
66	NC_015667	ACGA	2	8	3763	3770	50 %	0 %	25 %	25 %	336251565
67	NC_015667	TCA	3	9	3798	3806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251565
68	NC_015667	TC	3	6	3964	3969	0 %	50 %	0 %	50 %	336251565
69	NC_015667	GA	3	6	4002	4007	50 %	0 %	50 %	0 %	336251565
70	NC_015667	TTC	2	6	4125	4130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251565
71	NC_015667	CAG	3	9	4137	4145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251565
72	NC_015667	CTT	2	6	4166	4171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251565
73	NC_015667	GC	3	6	4182	4187	0 %	0 %	50 %	50 %	336251565
74	NC_015667	GCT	2	6	4223	4228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251565
75	NC_015667	TC	3	6	4229	4234	0 %	50 %	0 %	50 %	336251565
76	NC_015667	CT	3	6	4245	4250	0 %	50 %	0 %	50 %	336251565
77	NC_015667	GCC	2	6	4406	4411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251565
78	NC_015667	GGC	2	6	4435	4440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251565
79	NC_015667	CGA	2	6	4459	4464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251565
80	NC_015667	CGG	2	6	4487	4492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251565
81	NC_015667	CTA	2	6	4513	4518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251565
82	NC_015667	CAT	2	6	4558	4563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251566
83	NC_015667	TCGC	2	8	4682	4689	0 %	25 %	25 %	50 %	336251566
84	NC_015667	CGTT	2	8	4695	4702	0 %	50 %	25 %	25 %	336251566
85	NC_015667	CGG	2	6	4705	4710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251566
86	NC_015667	TTCGGC	2	12	4712	4723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251566
87	NC_015667	TC	3	6	4740	4745	0 %	50 %	0 %	50 %	336251566
88	NC_015667	ATC	2	6	4749	4754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251566
89	NC_015667	AT	3	6	4789	4794	50 %	50 %	0 %	0 %	336251566
90	NC_015667	AGA	2	6	4825	4830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251566
91	NC_015667	AGT	2	6	4838	4843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251566
92	NC_015667	GGC	2	6	4868	4873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251566
93	NC_015667	CGA	2	6	5029	5034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251566
94	NC_015667	CAA	2	6	5071	5076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251566
95	NC_015667	ACTCG	2	10	5080	5089	20 %	20 %	20 %	40 %	336251566
96	NC_015667	ACG	2	6	5163	5168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251566
97	NC_015667	CTC	2	6	5201	5206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251566
98	NC_015667	GAG	2	6	5207	5212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251566
99	NC_015667	CAG	2	6	5255	5260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251566
100	NC_015667	CGC	2	6	5289	5294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251566
101	NC_015667	CGA	2	6	5317	5322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251566
102	NC_015667	CGTT	2	8	5379	5386	0 %	50 %	25 %	25 %	336251566
103	NC_015667	TCG	2	6	5389	5394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251566
104	NC_015667	ACG	2	6	5457	5462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251566
105	NC_015667	ATTC	2	8	5473	5480	25 %	50 %	0 %	25 %	336251566
106	NC_015667	GGT	2	6	5493	5498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336251566
107	NC_015667	TGA	2	6	5532	5537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251566
108	NC_015667	TCGT	2	8	5589	5596	0 %	50 %	25 %	25 %	336251566
109	NC_015667	AAC	2	6	5598	5603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251566
110	NC_015667	GGA	2	6	5626	5631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251566
111	NC_015667	TCC	2	6	5653	5658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251567
112	NC_015667	AGC	2	6	5664	5669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251567
113	NC_015667	GGA	2	6	5846	5851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251567
114	NC_015667	CGA	2	6	5876	5881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251567
115	NC_015667	ACG	2	6	5967	5972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251567
116	NC_015667	GAA	2	6	6074	6079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251567
117	NC_015667	CGA	2	6	6116	6121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251567
118	NC_015667	TCA	2	6	6247	6252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251567
119	NC_015667	CGA	2	6	6317	6322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251567
120	NC_015667	CCG	2	6	6379	6384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251567
121	NC_015667	CGG	2	6	6428	6433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251567
122	NC_015667	CGC	2	6	6457	6462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336251567
123	NC_015667	CGA	2	6	6469	6474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251567
124	NC_015667	GAG	2	6	6480	6485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251567
125	NC_015667	GGC	2	6	6486	6491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251567
126	NC_015667	GGT	2	6	6527	6532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336251567
127	NC_015667	CG	3	6	6545	6550	0 %	0 %	50 %	50 %	336251567
128	NC_015667	GAGCA	2	10	6636	6645	40 %	0 %	40 %	20 %	336251567
129	NC_015667	CAT	2	6	6659	6664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251567
130	NC_015667	AAC	2	6	6678	6683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336251567
131	NC_015667	CGG	2	6	6728	6733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251567
132	NC_015667	CGA	2	6	6827	6832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251567
133	NC_015667	CTT	2	6	6854	6859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251567
134	NC_015667	GAC	2	6	6893	6898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251567
135	NC_015667	GAT	2	6	6945	6950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336251567
136	NC_015667	CGA	2	6	6976	6981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251567
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139	NC_015667	AAG	2	6	7068	7073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251567
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248	NC_015667	GAG	2	6	11682	11687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251569
249	NC_015667	TAC	2	6	11697	11702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251569
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255	NC_015667	AG	3	6	11865	11870	50 %	0 %	50 %	0 %	336251569
256	NC_015667	CAG	2	6	11878	11883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251569
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260	NC_015667	GAGC	2	8	12087	12094	25 %	0 %	50 %	25 %	336251569
261	NC_015667	CAG	2	6	12175	12180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251569
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383	NC_015667	ACC	2	6	20454	20459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336251580
384	NC_015667	GCG	2	6	20491	20496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251580
385	NC_015667	CGA	2	6	20592	20597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251581
386	NC_015667	CTC	2	6	20650	20655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251581
387	NC_015667	ACG	2	6	20672	20677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251581
388	NC_015667	TCT	2	6	20679	20684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251581
389	NC_015667	CGA	2	6	20691	20696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251581
390	NC_015667	ACC	2	6	20744	20749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336251581
391	NC_015667	TGC	2	6	21229	21234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251582
392	NC_015667	CTC	2	6	21346	21351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336251582
393	NC_015667	ACGA	2	8	21355	21362	50 %	0 %	25 %	25 %	336251582
394	NC_015667	TCG	2	6	21420	21425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251582
395	NC_015667	GGC	2	6	22088	22093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251583
396	NC_015667	AGG	2	6	22102	22107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336251583
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399	NC_015667	CCTGA	2	10	22208	22217	20 %	20 %	20 %	40 %	336251583
400	NC_015667	TCA	2	6	22248	22253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251583
401	NC_015667	ACT	2	6	22279	22284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251583
402	NC_015667	ACC	2	6	22324	22329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336251583
403	NC_015667	CAT	2	6	22374	22379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251583
404	NC_015667	TCA	2	6	22406	22411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251583
405	NC_015667	TCA	2	6	22454	22459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251583
406	NC_015667	CAT	2	6	22464	22469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251583
407	NC_015667	GAC	2	6	22508	22513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251583
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409	NC_015667	GAGT	2	8	22531	22538	25 %	25 %	50 %	0 %	336251583
410	NC_015667	GAC	2	6	22544	22549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251583
411	NC_015667	TTC	2	6	22561	22566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336251583
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415	NC_015667	AGA	2	6	22810	22815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251583
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418	NC_015667	CGT	2	6	22923	22928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336251583
419	NC_015667	CCA	2	6	22996	23001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336251583
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427	NC_015667	CTGG	2	8	23208	23215	0 %	25 %	50 %	25 %	336251583
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489	NC_015667	CGG	2	6	27249	27254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336251586
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493	NC_015667	GAA	2	6	27465	27470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336251586
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497	NC_015667	CCGT	2	8	28652	28659	0 %	25 %	25 %	50 %	336251587
498	NC_015667	TCGG	2	8	28686	28693	0 %	25 %	50 %	25 %	336251587
499	NC_015667	CGA	2	6	28731	28736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336251587
500	NC_015667	CAT	2	6	28756	28761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336251587

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