MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 91388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_015666	CGC	2	6	854399	854404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252952
21002	NC_015666	CGT	2	6	854423	854428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252952
21003	NC_015666	CTCG	2	8	854462	854469	0 %	25 %	25 %	50 %	336252952
21004	NC_015666	CGCT	2	8	854478	854485	0 %	25 %	25 %	50 %	336252952
21005	NC_015666	CG	3	6	854492	854497	0 %	0 %	50 %	50 %	336252952
21006	NC_015666	CGG	2	6	854534	854539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252952
21007	NC_015666	TCG	2	6	854545	854550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252952
21008	NC_015666	CGA	2	6	854576	854581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252952
21009	NC_015666	GAG	3	9	854598	854606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252952
21010	NC_015666	CG	3	6	854619	854624	0 %	0 %	50 %	50 %	336252952
21011	NC_015666	CGA	2	6	854645	854650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252952
21012	NC_015666	CCGG	2	8	854699	854706	0 %	0 %	50 %	50 %	336252952
21013	NC_015666	CGA	2	6	854708	854713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252952
21014	NC_015666	GGA	2	6	854798	854803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252952
21015	NC_015666	CGA	2	6	854828	854833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252952
21016	NC_015666	GATC	2	8	854864	854871	25 %	25 %	25 %	25 %	336252952
21017	NC_015666	CGT	2	6	855026	855031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252953
21018	NC_015666	CCT	2	6	855032	855037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252953
21019	NC_015666	TCG	2	6	855055	855060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252953
21020	NC_015666	CGT	2	6	855131	855136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252953
21021	NC_015666	GTC	2	6	855147	855152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252953
21022	NC_015666	TCG	2	6	855157	855162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252953
21023	NC_015666	CGGC	2	8	855333	855340	0 %	0 %	50 %	50 %	336252954
21024	NC_015666	GC	3	6	855339	855344	0 %	0 %	50 %	50 %	336252954
21025	NC_015666	CGC	3	9	855342	855350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252954
21026	NC_015666	CCG	3	9	855353	855361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252954
21027	NC_015666	CCGC	2	8	855371	855378	0 %	0 %	25 %	75 %	336252954
21028	NC_015666	AGGT	2	8	855410	855417	25 %	25 %	50 %	0 %	336252954
21029	NC_015666	CAG	3	9	855436	855444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252954
21030	NC_015666	CGA	2	6	855495	855500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252954
21031	NC_015666	CGGC	2	8	855501	855508	0 %	0 %	50 %	50 %	336252954
21032	NC_015666	GCC	2	6	855544	855549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252954
21033	NC_015666	GAC	3	9	855571	855579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252954
21034	NC_015666	CGT	2	6	855604	855609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252954
21035	NC_015666	CGGC	2	8	855696	855703	0 %	0 %	50 %	50 %	336252954
21036	NC_015666	GGC	2	6	855811	855816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252954
21037	NC_015666	CGA	2	6	855915	855920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252954
21038	NC_015666	TCG	2	6	855948	855953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252954
21039	NC_015666	GTC	2	6	855959	855964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252954
21040	NC_015666	CGA	2	6	856032	856037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252954
21041	NC_015666	GAT	2	6	856048	856053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252954
21042	NC_015666	GCC	2	6	856087	856092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252954
21043	NC_015666	CGA	2	6	856113	856118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252954
21044	NC_015666	CGA	2	6	856146	856151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252954
21045	NC_015666	GCC	2	6	856174	856179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252954
21046	NC_015666	CGT	2	6	856182	856187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252954
21047	NC_015666	GGT	2	6	856192	856197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252954
21048	NC_015666	CGA	2	6	856242	856247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252954
21049	NC_015666	CTT	2	6	856257	856262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252954
21050	NC_015666	GCT	2	6	856273	856278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252954
21051	NC_015666	CGG	2	6	856281	856286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252954
21052	NC_015666	CGCCGT	2	12	856308	856319	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	336252954
21053	NC_015666	CGT	4	12	856335	856346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252954
21054	NC_015666	TGCCTG	2	12	856348	856359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252954
21055	NC_015666	GTC	2	6	856405	856410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252954
21056	NC_015666	TCC	4	12	856442	856453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252954
21057	NC_015666	GTC	2	6	856528	856533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252954
21058	NC_015666	GCA	2	6	856575	856580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252954
21059	NC_015666	CGA	2	6	856605	856610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252954
21060	NC_015666	CGA	2	6	856614	856619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252954
21061	NC_015666	GGC	2	6	856642	856647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252954
21062	NC_015666	GCC	2	6	856687	856692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252954
21063	NC_015666	GCA	2	6	856725	856730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252954
21064	NC_015666	AGC	2	6	856736	856741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252954
21065	NC_015666	CTT	2	6	856743	856748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252954
21066	NC_015666	CGGTC	2	10	856749	856758	0 %	20 %	40 %	40 %	336252954
21067	NC_015666	TGAT	2	8	856769	856776	25 %	50 %	25 %	0 %	336252954
21068	NC_015666	GAC	2	6	856777	856782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252954
21069	NC_015666	CGACGG	2	12	856791	856802	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	336252954
21070	NC_015666	GC	3	6	856809	856814	0 %	0 %	50 %	50 %	336252954
21071	NC_015666	CGA	2	6	856815	856820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252954
21072	NC_015666	GCCGC	2	10	856868	856877	0 %	0 %	40 %	60 %	336252954
21073	NC_015666	GAC	2	6	856894	856899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252954
21074	NC_015666	CGG	2	6	856972	856977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252954
21075	NC_015666	GAT	2	6	857008	857013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252954
21076	NC_015666	CGAA	2	8	857106	857113	50 %	0 %	25 %	25 %	336252954
21077	NC_015666	TCG	2	6	857187	857192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252954
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21080	NC_015666	GCCGAC	2	12	857236	857247	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	336252954
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21082	NC_015666	GAC	2	6	857305	857310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252954
21083	NC_015666	GA	3	6	857343	857348	50 %	0 %	50 %	0 %	336252954
21084	NC_015666	CAG	2	6	857353	857358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252954
21085	NC_015666	AGG	2	6	857408	857413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252954
21086	NC_015666	TGA	2	6	857436	857441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252954
21087	NC_015666	GTCG	2	8	857443	857450	0 %	25 %	50 %	25 %	336252954
21088	NC_015666	CCCG	2	8	857613	857620	0 %	0 %	25 %	75 %	336252954
21089	NC_015666	TCG	2	6	857645	857650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252954
21090	NC_015666	CGA	2	6	857914	857919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252955
21091	NC_015666	CGG	2	6	857935	857940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252955
21092	NC_015666	TTCGGA	2	12	857983	857994	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	336252955
21093	NC_015666	GACTCG	2	12	858023	858034	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	336252955
21094	NC_015666	ACG	4	12	858057	858068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252955
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21097	NC_015666	GCCGGC	2	12	858128	858139	0 %	0 %	50 %	50 %	336252955
21098	NC_015666	ACCCCG	2	12	858147	858158	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	336252955
21099	NC_015666	CGA	3	9	858172	858180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252955
21100	NC_015666	CGC	2	6	858201	858206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252955
21101	NC_015666	GAC	2	6	858209	858214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252955
21102	NC_015666	GAG	2	6	858215	858220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252955
21103	NC_015666	GAG	2	6	858242	858247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252955
21104	NC_015666	TCC	2	6	858252	858257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252955
21105	NC_015666	GTC	2	6	858266	858271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252955
21106	NC_015666	CTG	2	6	858272	858277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252955
21107	NC_015666	CGC	2	6	858355	858360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252955
21108	NC_015666	GAG	2	6	858365	858370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252955
21109	NC_015666	GCC	3	9	858373	858381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252955
21110	NC_015666	TAC	2	6	858521	858526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252955
21111	NC_015666	CGG	2	6	858531	858536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252955
21112	NC_015666	CGA	2	6	858540	858545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252955
21113	NC_015666	CGT	2	6	858547	858552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252955
21114	NC_015666	TAC	2	6	858620	858625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252955
21115	NC_015666	TCA	2	6	858726	858731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252955
21116	NC_015666	ATG	2	6	858743	858748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252955
21117	NC_015666	TCG	2	6	858858	858863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252955
21118	NC_015666	GCT	2	6	858895	858900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252955
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21236	NC_015666	TCG	2	6	862767	862772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252957
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21347	NC_015666	TCGT	2	8	868329	868336	0 %	50 %	25 %	25 %	336252962
21348	NC_015666	GCC	2	6	868415	868420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252962
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21471	NC_015666	CGA	2	6	873080	873085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252969
21472	NC_015666	GGCGA	2	10	873165	873174	20 %	0 %	60 %	20 %	336252969
21473	NC_015666	CGCT	2	8	873205	873212	0 %	25 %	25 %	50 %	336252969
21474	NC_015666	ACT	2	6	873223	873228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252969
21475	NC_015666	CGG	2	6	873254	873259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252969
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21479	NC_015666	GCG	2	6	873354	873359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252969
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21499	NC_015666	GGT	2	6	874046	874051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252969
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