MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 91388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_015666	CGT	2	6	657168	657173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252747
16002	NC_015666	TCG	2	6	657186	657191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252747
16003	NC_015666	GTC	2	6	657202	657207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252747
16004	NC_015666	CTC	2	6	657247	657252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252747
16005	NC_015666	GTC	2	6	657373	657378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252747
16006	NC_015666	ATCGG	2	10	657386	657395	20 %	20 %	40 %	20 %	336252747
16007	NC_015666	CGG	2	6	657725	657730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252748
16008	NC_015666	ATG	2	6	657792	657797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252748
16009	NC_015666	TCC	3	9	657865	657873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252748
16010	NC_015666	TCG	2	6	657898	657903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252748
16011	NC_015666	ACG	2	6	657924	657929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252748
16012	NC_015666	TCG	2	6	657937	657942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252748
16013	NC_015666	TCG	2	6	657997	658002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252748
16014	NC_015666	TTC	2	6	658026	658031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252748
16015	NC_015666	CGA	2	6	658036	658041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252748
16016	NC_015666	ATGTTC	2	12	658044	658055	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	336252748
16017	NC_015666	TCA	2	6	658087	658092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252748
16018	NC_015666	TCGCCG	2	12	658123	658134	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	336252748
16019	NC_015666	GCCG	2	8	658143	658150	0 %	0 %	50 %	50 %	336252748
16020	NC_015666	GCT	2	6	658202	658207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252748
16021	NC_015666	GAC	2	6	658312	658317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252749
16022	NC_015666	CGTTC	2	10	658342	658351	0 %	40 %	20 %	40 %	336252749
16023	NC_015666	TC	3	6	658376	658381	0 %	50 %	0 %	50 %	336252749
16024	NC_015666	CGA	2	6	658386	658391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252749
16025	NC_015666	CGTTCC	2	12	658417	658428	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	336252749
16026	NC_015666	TCG	2	6	658474	658479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252749
16027	NC_015666	GGT	2	6	658523	658528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252749
16028	NC_015666	CCGG	2	8	658535	658542	0 %	0 %	50 %	50 %	336252749
16029	NC_015666	CGA	3	9	658556	658564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252749
16030	NC_015666	CTT	2	6	658590	658595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252749
16031	NC_015666	CGT	2	6	658599	658604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252749
16032	NC_015666	TCG	2	6	658624	658629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252749
16033	NC_015666	CTC	2	6	658653	658658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252749
16034	NC_015666	CAA	2	6	658678	658683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336252749
16035	NC_015666	CGT	3	9	658685	658693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252749
16036	NC_015666	GAT	2	6	658704	658709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252749
16037	NC_015666	GGTCGG	2	12	658712	658723	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	336252749
16038	NC_015666	CGAC	2	8	658733	658740	25 %	0 %	25 %	50 %	336252749
16039	NC_015666	CGT	2	6	658859	658864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252750
16040	NC_015666	GAC	2	6	658929	658934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252750
16041	NC_015666	CCG	2	6	658950	658955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252750
16042	NC_015666	CG	3	6	658954	658959	0 %	0 %	50 %	50 %	336252750
16043	NC_015666	AGC	2	6	659011	659016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252750
16044	NC_015666	CGG	2	6	659044	659049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252750
16045	NC_015666	TCG	3	9	659053	659061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252750
16046	NC_015666	CG	3	6	659126	659131	0 %	0 %	50 %	50 %	336252750
16047	NC_015666	CGA	2	6	659135	659140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252750
16048	NC_015666	GGC	2	6	659160	659165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252750
16049	NC_015666	CGA	2	6	659183	659188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252750
16050	NC_015666	CTC	2	6	659196	659201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252750
16051	NC_015666	GTCG	2	8	659226	659233	0 %	25 %	50 %	25 %	336252750
16052	NC_015666	GTC	2	6	659257	659262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252750
16053	NC_015666	AGC	2	6	659299	659304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252750
16054	NC_015666	CGT	3	9	659309	659317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252750
16055	NC_015666	CG	3	6	659347	659352	0 %	0 %	50 %	50 %	336252750
16056	NC_015666	GTC	2	6	659370	659375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252750
16057	NC_015666	CGA	2	6	659381	659386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252750
16058	NC_015666	GTC	2	6	659391	659396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252750
16059	NC_015666	TCG	2	6	659473	659478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252750
16060	NC_015666	CGT	2	6	659528	659533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252750
16061	NC_015666	CGA	2	6	659555	659560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252750
16062	NC_015666	CGA	3	9	659618	659626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252750
16063	NC_015666	GCC	2	6	659652	659657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252750
16064	NC_015666	GAG	2	6	659970	659975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252751
16065	NC_015666	CGA	2	6	659981	659986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252751
16066	NC_015666	GAC	2	6	659994	659999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252751
16067	NC_015666	GTCGAC	2	12	660024	660035	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	336252751
16068	NC_015666	ACG	2	6	660046	660051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252751
16069	NC_015666	AGG	2	6	660130	660135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252751
16070	NC_015666	GAC	2	6	660174	660179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252751
16071	NC_015666	CGT	2	6	660182	660187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252751
16072	NC_015666	CGC	2	6	660215	660220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252751
16073	NC_015666	TAC	2	6	660243	660248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252751
16074	NC_015666	ACG	3	9	660253	660261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252751
16075	NC_015666	CTC	2	6	660267	660272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252751
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16077	NC_015666	GAG	2	6	660321	660326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252751
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16082	NC_015666	TCGC	2	8	660437	660444	0 %	25 %	25 %	50 %	336252751
16083	NC_015666	GAG	2	6	660447	660452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252751
16084	NC_015666	GCG	2	6	660457	660462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252751
16085	NC_015666	CCG	2	6	660474	660479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252751
16086	NC_015666	GCG	2	6	660502	660507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252751
16087	NC_015666	GAA	2	6	660524	660529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252751
16088	NC_015666	GGC	2	6	660539	660544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252751
16089	NC_015666	ACG	3	9	660553	660561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252751
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16091	NC_015666	GAC	2	6	660626	660631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252751
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16096	NC_015666	CGG	2	6	661025	661030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252752
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16100	NC_015666	CAC	2	6	661083	661088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252752
16101	NC_015666	TTCCGC	2	12	661092	661103	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	336252752
16102	NC_015666	TCG	2	6	661166	661171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252752
16103	NC_015666	GAC	2	6	661264	661269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252752
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16105	NC_015666	CGAG	2	8	661277	661284	25 %	0 %	50 %	25 %	336252752
16106	NC_015666	CTG	2	6	661306	661311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252752
16107	NC_015666	ACG	2	6	661340	661345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252752
16108	NC_015666	TCCGGA	2	12	661347	661358	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	336252752
16109	NC_015666	CGA	2	6	661371	661376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252752
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16111	NC_015666	CCG	2	6	661443	661448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252752
16112	NC_015666	TGC	2	6	661460	661465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252752
16113	NC_015666	GCGG	2	8	661479	661486	0 %	0 %	75 %	25 %	336252752
16114	NC_015666	CG	3	6	661579	661584	0 %	0 %	50 %	50 %	336252753
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16116	NC_015666	TCG	2	6	661605	661610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252753
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16222	NC_015666	GACG	2	8	666268	666275	25 %	0 %	50 %	25 %	336252761
16223	NC_015666	CTCG	2	8	666277	666284	0 %	25 %	25 %	50 %	336252761
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16472	NC_015666	GAC	2	6	675646	675651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252772
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