MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 91388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_015666	CGG	2	6	612386	612391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252695
15002	NC_015666	GCTC	2	8	612401	612408	0 %	25 %	25 %	50 %	336252695
15003	NC_015666	GTC	2	6	612411	612416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252695
15004	NC_015666	CTC	2	6	612459	612464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252695
15005	NC_015666	CCT	2	6	612500	612505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252695
15006	NC_015666	GTC	2	6	612516	612521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252695
15007	NC_015666	AGC	2	6	612604	612609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252695
15008	NC_015666	TCG	2	6	612625	612630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252695
15009	NC_015666	GAC	2	6	612663	612668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252695
15010	NC_015666	CGG	2	6	612714	612719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252695
15011	NC_015666	TCG	2	6	612733	612738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252695
15012	NC_015666	GTC	2	6	612744	612749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252695
15013	NC_015666	TCG	3	9	612781	612789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252695
15014	NC_015666	GTCA	2	8	612798	612805	25 %	25 %	25 %	25 %	336252695
15015	NC_015666	CGA	2	6	612989	612994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252696
15016	NC_015666	CGG	2	6	613040	613045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252696
15017	NC_015666	GAG	2	6	613104	613109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252696
15018	NC_015666	GCC	2	6	613143	613148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252696
15019	NC_015666	CGG	2	6	613187	613192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252696
15020	NC_015666	CGT	2	6	613226	613231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252696
15021	NC_015666	GCG	2	6	613252	613257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252696
15022	NC_015666	CG	3	6	613265	613270	0 %	0 %	50 %	50 %	336252696
15023	NC_015666	GGA	2	6	613319	613324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252696
15024	NC_015666	CG	3	6	613352	613357	0 %	0 %	50 %	50 %	336252696
15025	NC_015666	CGC	2	6	613367	613372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252696
15026	NC_015666	GGAA	2	8	613375	613382	50 %	0 %	50 %	0 %	336252696
15027	NC_015666	CGACC	2	10	613409	613418	20 %	0 %	20 %	60 %	336252696
15028	NC_015666	CGA	2	6	613436	613441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252696
15029	NC_015666	CGA	2	6	613469	613474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252696
15030	NC_015666	GTCGC	2	10	613578	613587	0 %	20 %	40 %	40 %	336252697
15031	NC_015666	GAG	2	6	613592	613597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252697
15032	NC_015666	AGC	2	6	613617	613622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252697
15033	NC_015666	GAA	2	6	613628	613633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252697
15034	NC_015666	GAC	3	9	613634	613642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252697
15035	NC_015666	GGGT	2	8	613659	613666	0 %	25 %	75 %	0 %	336252697
15036	NC_015666	GAC	2	6	613697	613702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252697
15037	NC_015666	GAT	3	9	613769	613777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252697
15038	NC_015666	GAG	2	6	614026	614031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252698
15039	NC_015666	GTC	2	6	614079	614084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252698
15040	NC_015666	TCGG	2	8	614106	614113	0 %	25 %	50 %	25 %	336252698
15041	NC_015666	GCCGC	2	10	614136	614145	0 %	0 %	40 %	60 %	336252698
15042	NC_015666	GAC	2	6	614147	614152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252698
15043	NC_015666	CG	3	6	614173	614178	0 %	0 %	50 %	50 %	336252698
15044	NC_015666	CCCGT	2	10	614202	614211	0 %	20 %	20 %	60 %	336252698
15045	NC_015666	CGG	2	6	614395	614400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252698
15046	NC_015666	TCG	2	6	614419	614424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252698
15047	NC_015666	CGG	2	6	614472	614477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252698
15048	NC_015666	GAC	2	6	614495	614500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252698
15049	NC_015666	CGG	2	6	614546	614551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252698
15050	NC_015666	CGA	2	6	614600	614605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252698
15051	NC_015666	CCG	2	6	614608	614613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252698
15052	NC_015666	CCG	2	6	614617	614622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252698
15053	NC_015666	GC	3	6	614653	614658	0 %	0 %	50 %	50 %	336252698
15054	NC_015666	CGT	2	6	614663	614668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252698
15055	NC_015666	CGC	2	6	614762	614767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252698
15056	NC_015666	CGA	2	6	614825	614830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252698
15057	NC_015666	GCC	2	6	614833	614838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252698
15058	NC_015666	CGCT	2	8	614906	614913	0 %	25 %	25 %	50 %	336252698
15059	NC_015666	GCCG	2	8	614916	614923	0 %	0 %	50 %	50 %	336252698
15060	NC_015666	ACG	2	6	614938	614943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252698
15061	NC_015666	ACG	2	6	614956	614961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252698
15062	NC_015666	CCGA	2	8	615000	615007	25 %	0 %	25 %	50 %	336252698
15063	NC_015666	GGC	2	6	615020	615025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252698
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15065	NC_015666	CGT	2	6	615343	615348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252700
15066	NC_015666	AAG	2	6	615371	615376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252700
15067	NC_015666	CGA	2	6	615448	615453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252700
15068	NC_015666	CGC	2	6	615516	615521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252700
15069	NC_015666	TCCGCG	2	12	615528	615539	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	336252700
15070	NC_015666	GAG	2	6	615551	615556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252700
15071	NC_015666	CGT	2	6	615568	615573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252700
15072	NC_015666	CG	3	6	615646	615651	0 %	0 %	50 %	50 %	336252701
15073	NC_015666	CGTG	2	8	615659	615666	0 %	25 %	50 %	25 %	336252701
15074	NC_015666	CGA	3	9	615684	615692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252701
15075	NC_015666	CGT	2	6	615693	615698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252701
15076	NC_015666	CGA	2	6	615711	615716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252701
15077	NC_015666	GAC	2	6	615738	615743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252701
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15079	NC_015666	TTC	2	6	615753	615758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252701
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15082	NC_015666	CGGC	2	8	615890	615897	0 %	0 %	50 %	50 %	336252701
15083	NC_015666	CGT	2	6	615900	615905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252701
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15085	NC_015666	CCG	2	6	616031	616036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252701
15086	NC_015666	CGAC	2	8	616076	616083	25 %	0 %	25 %	50 %	336252701
15087	NC_015666	GAG	2	6	616102	616107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252701
15088	NC_015666	GC	3	6	616148	616153	0 %	0 %	50 %	50 %	336252701
15089	NC_015666	CGT	2	6	616194	616199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252701
15090	NC_015666	GACT	2	8	616258	616265	25 %	25 %	25 %	25 %	336252701
15091	NC_015666	CTGCG	2	10	616419	616428	0 %	20 %	40 %	40 %	336252702
15092	NC_015666	ACG	2	6	616436	616441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252702
15093	NC_015666	GCG	2	6	616472	616477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252702
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15095	NC_015666	TCG	2	6	616539	616544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252702
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15098	NC_015666	GCG	2	6	616592	616597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252702
15099	NC_015666	CAC	2	6	616618	616623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252702
15100	NC_015666	ACGA	2	8	616646	616653	50 %	0 %	25 %	25 %	336252702
15101	NC_015666	GCG	2	6	616667	616672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252702
15102	NC_015666	GTC	3	9	616768	616776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252703
15103	NC_015666	TCG	2	6	616787	616792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252703
15104	NC_015666	TCG	2	6	616810	616815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252703
15105	NC_015666	GTC	2	6	616828	616833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252703
15106	NC_015666	TCG	2	6	616856	616861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252703
15107	NC_015666	GCGT	2	8	616875	616882	0 %	25 %	50 %	25 %	336252703
15108	NC_015666	CGT	2	6	616891	616896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252703
15109	NC_015666	TCG	3	9	616910	616918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252703
15110	NC_015666	TCG	2	6	616937	616942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252703
15111	NC_015666	TGG	2	6	616949	616954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252703
15112	NC_015666	GTC	2	6	617020	617025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252703
15113	NC_015666	TC	3	6	617034	617039	0 %	50 %	0 %	50 %	336252703
15114	NC_015666	CCGG	2	8	617266	617273	0 %	0 %	50 %	50 %	336252704
15115	NC_015666	TCGC	2	8	617335	617342	0 %	25 %	25 %	50 %	336252704
15116	NC_015666	CGT	2	6	617408	617413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252704
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15231	NC_015666	CCGACG	2	12	621530	621541	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	336252707
15232	NC_015666	ACG	2	6	621582	621587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252708
15233	NC_015666	CGA	3	9	621652	621660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252708
15234	NC_015666	CGC	2	6	621688	621693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252708
15235	NC_015666	GACGG	2	10	621707	621716	20 %	0 %	60 %	20 %	336252708
15236	NC_015666	GACG	2	8	621742	621749	25 %	0 %	50 %	25 %	336252708
15237	NC_015666	GTT	2	6	621783	621788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336252708
15238	NC_015666	CCG	2	6	621819	621824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252708
15239	NC_015666	CGAC	2	8	621849	621856	25 %	0 %	25 %	50 %	336252708
15240	NC_015666	GGGC	2	8	621876	621883	0 %	0 %	75 %	25 %	336252708
15241	NC_015666	CGA	2	6	621895	621900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252708
15242	NC_015666	CCG	2	6	621936	621941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252708
15243	NC_015666	ACG	3	9	621963	621971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252708
15244	NC_015666	CG	3	6	621981	621986	0 %	0 %	50 %	50 %	336252708
15245	NC_015666	TCGG	2	8	622033	622040	0 %	25 %	50 %	25 %	336252708
15246	NC_015666	CGA	2	6	622105	622110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252708
15247	NC_015666	TCGGCG	2	12	622164	622175	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	336252708
15248	NC_015666	GAC	2	6	622178	622183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252708
15249	NC_015666	CTG	2	6	622222	622227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252708
15250	NC_015666	CGG	2	6	622243	622248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252708
15251	NC_015666	CGG	2	6	622279	622284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252708
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15253	NC_015666	CGG	2	6	622369	622374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252708
15254	NC_015666	CGT	2	6	622375	622380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252708
15255	NC_015666	GCT	2	6	622399	622404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252708
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15258	NC_015666	AGG	2	6	622491	622496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252708
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15261	NC_015666	CG	3	6	622697	622702	0 %	0 %	50 %	50 %	336252708
15262	NC_015666	GAA	2	6	622732	622737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252708
15263	NC_015666	ACT	2	6	622743	622748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252708
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15268	NC_015666	GAT	2	6	622858	622863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252708
15269	NC_015666	GGA	3	9	622867	622875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252708
15270	NC_015666	ACG	2	6	622890	622895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252708
15271	NC_015666	CGA	2	6	622912	622917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252708
15272	NC_015666	CGA	2	6	622975	622980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252708
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15282	NC_015666	GAG	2	6	623553	623558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252709
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15304	NC_015666	GC	3	6	624253	624258	0 %	0 %	50 %	50 %	336252709
15305	NC_015666	CA	3	6	624300	624305	50 %	0 %	0 %	50 %	336252709
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15316	NC_015666	CCG	2	6	624745	624750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252710
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15321	NC_015666	CCT	2	6	624874	624879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252710
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15324	NC_015666	CGA	2	6	625169	625174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252711
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15328	NC_015666	CGG	2	6	625249	625254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252711
15329	NC_015666	ATCGA	2	10	625272	625281	40 %	20 %	20 %	20 %	336252711
15330	NC_015666	GAG	2	6	625287	625292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252711
15331	NC_015666	CTACGC	2	12	625334	625345	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	336252711
15332	NC_015666	GCGCC	2	10	625361	625370	0 %	0 %	40 %	60 %	336252711
15333	NC_015666	GTC	2	6	625380	625385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252711
15334	NC_015666	GAC	2	6	625499	625504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252711
15335	NC_015666	GGA	2	6	625586	625591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252711
15336	NC_015666	TGG	2	6	625611	625616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252711
15337	NC_015666	CGC	2	6	625617	625622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252711
15338	NC_015666	CGC	2	6	625667	625672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252711
15339	NC_015666	ACG	2	6	625687	625692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252711
15340	NC_015666	TCG	2	6	625708	625713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252711
15341	NC_015666	CGA	2	6	625787	625792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252712
15342	NC_015666	GGT	2	6	625842	625847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252712
15343	NC_015666	CCG	2	6	625877	625882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252712
15344	NC_015666	CTC	2	6	625896	625901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252712
15345	NC_015666	GTC	2	6	625977	625982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252712
15346	NC_015666	GATC	2	8	625985	625992	25 %	25 %	25 %	25 %	336252712
15347	NC_015666	GCC	2	6	626007	626012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252712
15348	NC_015666	CGA	2	6	626021	626026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252712
15349	NC_015666	GCC	2	6	626028	626033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252712
15350	NC_015666	GC	3	6	626049	626054	0 %	0 %	50 %	50 %	336252712
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15352	NC_015666	AGGC	2	8	626071	626078	25 %	0 %	50 %	25 %	336252712
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15470	NC_015666	GAC	2	6	631892	631897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252718
15471	NC_015666	CGA	2	6	631917	631922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252718
15472	NC_015666	GCG	2	6	631954	631959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252718
15473	NC_015666	CAG	2	6	632049	632054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252718
15474	NC_015666	CTG	2	6	632095	632100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252718
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15476	NC_015666	GTC	2	6	632141	632146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252718
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15481	NC_015666	CGCT	2	8	632444	632451	0 %	25 %	25 %	50 %	336252718
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15500	NC_015666	CTC	2	6	633825	633830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252720

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