MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 91388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_015666	CGG	2	6	554908	554913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252638
13502	NC_015666	TCG	2	6	554918	554923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252638
13503	NC_015666	TCG	2	6	554930	554935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252638
13504	NC_015666	GC	3	6	554943	554948	0 %	0 %	50 %	50 %	336252638
13505	NC_015666	TCACCG	2	12	554991	555002	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	336252638
13506	NC_015666	CGCC	2	8	555010	555017	0 %	0 %	25 %	75 %	336252638
13507	NC_015666	GAT	2	6	555031	555036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252638
13508	NC_015666	TCG	2	6	555042	555047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252638
13509	NC_015666	GAT	2	6	555049	555054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252638
13510	NC_015666	CGC	2	6	555127	555132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252638
13511	NC_015666	CG	3	6	555182	555187	0 %	0 %	50 %	50 %	336252638
13512	NC_015666	CGC	2	6	555252	555257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252638
13513	NC_015666	GCG	2	6	555267	555272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252638
13514	NC_015666	CGC	2	6	555345	555350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252638
13515	NC_015666	CCG	2	6	555451	555456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252638
13516	NC_015666	GCG	2	6	555464	555469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252638
13517	NC_015666	ACCG	2	8	555477	555484	25 %	0 %	25 %	50 %	336252638
13518	NC_015666	CCA	2	6	555526	555531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252638
13519	NC_015666	CGG	2	6	555570	555575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252638
13520	NC_015666	TCGACG	2	12	555612	555623	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	336252638
13521	NC_015666	GAA	2	6	555634	555639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252638
13522	NC_015666	CGA	2	6	555741	555746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252638
13523	NC_015666	CGA	2	6	555771	555776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252638
13524	NC_015666	AGA	3	9	555777	555785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252638
13525	NC_015666	TCA	2	6	555789	555794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252638
13526	NC_015666	CGG	3	9	555801	555809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252638
13527	NC_015666	CGGC	2	8	555834	555841	0 %	0 %	50 %	50 %	336252638
13528	NC_015666	CGT	2	6	555856	555861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252638
13529	NC_015666	TGT	2	6	555873	555878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336252638
13530	NC_015666	CGA	2	6	555906	555911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252638
13531	NC_015666	GCA	2	6	555912	555917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252638
13532	NC_015666	GCCG	2	8	556151	556158	0 %	0 %	50 %	50 %	336252639
13533	NC_015666	CGT	2	6	556159	556164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252639
13534	NC_015666	GAG	2	6	556193	556198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252639
13535	NC_015666	GCC	2	6	556222	556227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252639
13536	NC_015666	TCG	2	6	556239	556244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252639
13537	NC_015666	CTT	2	6	556303	556308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252639
13538	NC_015666	GC	3	6	556352	556357	0 %	0 %	50 %	50 %	336252639
13539	NC_015666	ACGAG	2	10	556384	556393	40 %	0 %	40 %	20 %	336252639
13540	NC_015666	CGACCC	2	12	556411	556422	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	336252639
13541	NC_015666	GAT	2	6	556484	556489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252639
13542	NC_015666	GCC	2	6	556731	556736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252640
13543	NC_015666	GGC	2	6	556794	556799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252640
13544	NC_015666	CGAACG	2	12	556817	556828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252640
13545	NC_015666	CGC	3	9	556845	556853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252640
13546	NC_015666	GCC	2	6	556855	556860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252640
13547	NC_015666	CAG	2	6	556872	556877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252640
13548	NC_015666	GAC	2	6	556878	556883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252640
13549	NC_015666	GTT	2	6	556890	556895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336252640
13550	NC_015666	TGA	2	6	556898	556903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252640
13551	NC_015666	CAG	2	6	556911	556916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252640
13552	NC_015666	TCG	2	6	556952	556957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252640
13553	NC_015666	GCA	2	6	556958	556963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252640
13554	NC_015666	CGA	2	6	556976	556981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252640
13555	NC_015666	AGC	2	6	556993	556998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252640
13556	NC_015666	GCC	2	6	556999	557004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252640
13557	NC_015666	CCG	2	6	557005	557010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252640
13558	NC_015666	CTC	2	6	557013	557018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252640
13559	NC_015666	CGCC	2	8	557042	557049	0 %	0 %	25 %	75 %	336252640
13560	NC_015666	GAT	2	6	557058	557063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252640
13561	NC_015666	CGT	2	6	557078	557083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252640
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13563	NC_015666	GAC	2	6	557112	557117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252640
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13565	NC_015666	CGA	2	6	557180	557185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252640
13566	NC_015666	CGACGG	2	12	557201	557212	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	336252640
13567	NC_015666	CGA	2	6	557255	557260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252640
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13569	NC_015666	CGCGA	2	10	557270	557279	20 %	0 %	40 %	40 %	336252640
13570	NC_015666	GCC	2	6	557302	557307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252640
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13583	NC_015666	CGAT	2	8	557702	557709	25 %	25 %	25 %	25 %	336252640
13584	NC_015666	CGA	2	6	557714	557719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252640
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13588	NC_015666	CCGC	2	8	557786	557793	0 %	0 %	25 %	75 %	336252640
13589	NC_015666	GAG	2	6	557811	557816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252640
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13591	NC_015666	GCCG	2	8	557927	557934	0 %	0 %	50 %	50 %	336252640
13592	NC_015666	TCG	2	6	557957	557962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252640
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13597	NC_015666	CGA	2	6	558083	558088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252640
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13599	NC_015666	CTGT	2	8	558147	558154	0 %	50 %	25 %	25 %	336252640
13600	NC_015666	CCG	2	6	558183	558188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252640
13601	NC_015666	C	6	6	558222	558227	0 %	0 %	0 %	100 %	336252640
13602	NC_015666	TCG	2	6	558257	558262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252640
13603	NC_015666	GAC	2	6	558321	558326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252640
13604	NC_015666	GAC	2	6	558402	558407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252640
13605	NC_015666	ACG	2	6	558415	558420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252640
13606	NC_015666	GTCG	2	8	558426	558433	0 %	25 %	50 %	25 %	336252640
13607	NC_015666	GCC	2	6	558448	558453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252640
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13612	NC_015666	GC	3	6	558852	558857	0 %	0 %	50 %	50 %	336252641
13613	NC_015666	GCG	2	6	558914	558919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252641
13614	NC_015666	CGC	2	6	558939	558944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252641
13615	NC_015666	CGG	2	6	558989	558994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252641
13616	NC_015666	GAG	2	6	559027	559032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252641
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13618	NC_015666	GTC	3	9	559078	559086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252641
13619	NC_015666	GCC	2	6	559126	559131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252641
13620	NC_015666	TGC	2	6	559152	559157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252641
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13723	NC_015666	TCG	3	9	562929	562937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252645
13724	NC_015666	CGA	2	6	562972	562977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252645
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13727	NC_015666	TTCG	2	8	563045	563052	0 %	50 %	25 %	25 %	336252645
13728	NC_015666	GTCC	2	8	563059	563066	0 %	25 %	25 %	50 %	336252645
13729	NC_015666	CGA	2	6	563155	563160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252645
13730	NC_015666	GCT	2	6	563213	563218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252645
13731	NC_015666	GTC	2	6	563234	563239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252645
13732	NC_015666	CGTC	2	8	563242	563249	0 %	25 %	25 %	50 %	336252645
13733	NC_015666	GCG	2	6	563250	563255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252645
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13735	NC_015666	CGC	2	6	563413	563418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252645
13736	NC_015666	CGT	2	6	563443	563448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252645
13737	NC_015666	TCG	3	9	563502	563510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252645
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13852	NC_015666	CCT	2	6	567517	567522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252649
13853	NC_015666	CGT	2	6	567526	567531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252649
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13967	NC_015666	TCG	2	6	572190	572195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252654
13968	NC_015666	GAC	2	6	572242	572247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252654
13969	NC_015666	GGTC	2	8	572302	572309	0 %	25 %	50 %	25 %	336252654
13970	NC_015666	GAC	2	6	572312	572317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252654
13971	NC_015666	CGA	2	6	572335	572340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252654
13972	NC_015666	GGCG	2	8	572347	572354	0 %	0 %	75 %	25 %	336252654
13973	NC_015666	CGA	2	6	572380	572385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252654
13974	NC_015666	TCG	2	6	572391	572396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252654
13975	NC_015666	GAG	2	6	572414	572419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252654
13976	NC_015666	TTC	2	6	572433	572438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252654
13977	NC_015666	TCGAGT	2	12	572502	572513	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	336252654
13978	NC_015666	CTG	2	6	572552	572557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252654
13979	NC_015666	AAC	2	6	572877	572882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336252655
13980	NC_015666	AAT	2	6	572883	572888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336252655
13981	NC_015666	CGG	2	6	572897	572902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252655
13982	NC_015666	CGA	2	6	572921	572926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252655
13983	NC_015666	GAAC	2	8	572984	572991	50 %	0 %	25 %	25 %	336252655
13984	NC_015666	ACG	2	6	573049	573054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252655
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13987	NC_015666	GAC	2	6	573125	573130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252655
13988	NC_015666	TCG	2	6	573135	573140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252655
13989	NC_015666	TCG	2	6	573148	573153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252655
13990	NC_015666	TCCCG	2	10	573179	573188	0 %	20 %	20 %	60 %	336252655
13991	NC_015666	CGA	2	6	573206	573211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252655
13992	NC_015666	GCG	2	6	573216	573221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252655
13993	NC_015666	GCT	2	6	573491	573496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252656
13994	NC_015666	GAC	3	9	573535	573543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252656
13995	NC_015666	TTC	2	6	573580	573585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252656
13996	NC_015666	GCC	2	6	573598	573603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252656
13997	NC_015666	CGG	2	6	573663	573668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252656
13998	NC_015666	TCG	2	6	573782	573787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252656
13999	NC_015666	GCT	2	6	573798	573803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252656
14000	NC_015666	TCG	2	6	573812	573817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252656

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