MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 91388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_015666	CCG	2	6	535970	535975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252620
13003	NC_015666	ACG	2	6	536000	536005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252620
13004	NC_015666	GCG	2	6	536006	536011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252620
13005	NC_015666	CGA	2	6	536016	536021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252620
13006	NC_015666	TCG	2	6	536108	536113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252620
13007	NC_015666	ACC	2	6	536140	536145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252620
13008	NC_015666	GGCG	2	8	536157	536164	0 %	0 %	75 %	25 %	336252620
13009	NC_015666	CAC	2	6	536169	536174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252620
13010	NC_015666	CCGA	2	8	536191	536198	25 %	0 %	25 %	50 %	336252620
13011	NC_015666	CGG	2	6	536258	536263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252620
13012	NC_015666	TCG	2	6	536291	536296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252620
13013	NC_015666	GC	3	6	536315	536320	0 %	0 %	50 %	50 %	336252620
13014	NC_015666	CTG	2	6	536326	536331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252620
13015	NC_015666	CGG	2	6	536343	536348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252620
13016	NC_015666	GCG	2	6	536354	536359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252620
13017	NC_015666	CCGGCG	2	12	536396	536407	0 %	0 %	50 %	50 %	336252620
13018	NC_015666	GTC	2	6	536530	536535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252621
13019	NC_015666	CGC	2	6	536554	536559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252621
13020	NC_015666	GCCGAT	2	12	536615	536626	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	336252621
13021	NC_015666	CG	3	6	536639	536644	0 %	0 %	50 %	50 %	336252621
13022	NC_015666	TCG	2	6	536649	536654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252621
13023	NC_015666	CGC	2	6	536704	536709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252621
13024	NC_015666	GTC	2	6	536732	536737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252621
13025	NC_015666	GCC	2	6	536763	536768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252621
13026	NC_015666	CG	3	6	536815	536820	0 %	0 %	50 %	50 %	336252621
13027	NC_015666	GGC	2	6	536869	536874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252621
13028	NC_015666	ACCG	2	8	536893	536900	25 %	0 %	25 %	50 %	336252621
13029	NC_015666	CCG	2	6	536904	536909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252621
13030	NC_015666	CGC	2	6	536914	536919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252621
13031	NC_015666	CGGC	2	8	536920	536927	0 %	0 %	50 %	50 %	336252621
13032	NC_015666	ACT	2	6	537039	537044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252621
13033	NC_015666	CGACGT	2	12	537091	537102	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	336252621
13034	NC_015666	GCGG	2	8	537105	537112	0 %	0 %	75 %	25 %	336252621
13035	NC_015666	CGT	3	9	537115	537123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252621
13036	NC_015666	CGA	2	6	537127	537132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252621
13037	NC_015666	CAT	2	6	537133	537138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252621
13038	NC_015666	CGA	2	6	537150	537155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252621
13039	NC_015666	GCG	2	6	537300	537305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252621
13040	NC_015666	ACGT	2	8	537593	537600	25 %	25 %	25 %	25 %	336252622
13041	NC_015666	TCGA	2	8	537603	537610	25 %	25 %	25 %	25 %	336252622
13042	NC_015666	CGA	2	6	537613	537618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252622
13043	NC_015666	CGT	2	6	537634	537639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252622
13044	NC_015666	CG	3	6	537644	537649	0 %	0 %	50 %	50 %	336252622
13045	NC_015666	ACG	2	6	537687	537692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252622
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13048	NC_015666	TCCC	2	8	537899	537906	0 %	25 %	0 %	75 %	336252622
13049	NC_015666	GAC	2	6	537967	537972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252622
13050	NC_015666	GCT	2	6	538006	538011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252622
13051	NC_015666	GAC	2	6	538076	538081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252622
13052	NC_015666	CGAGGA	2	12	538111	538122	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	336252622
13053	NC_015666	AGCG	2	8	538175	538182	25 %	0 %	50 %	25 %	336252623
13054	NC_015666	CGC	2	6	538222	538227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252623
13055	NC_015666	CGGC	2	8	538260	538267	0 %	0 %	50 %	50 %	336252623
13056	NC_015666	GAC	2	6	538291	538296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252623
13057	NC_015666	CTG	2	6	538303	538308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252623
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13059	NC_015666	GAG	2	6	538429	538434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252623
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13068	NC_015666	TCG	2	6	538740	538745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252623
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13083	NC_015666	GC	3	6	539365	539370	0 %	0 %	50 %	50 %	336252623
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13086	NC_015666	TCGG	2	8	539495	539502	0 %	25 %	50 %	25 %	336252623
13087	NC_015666	CGA	2	6	539508	539513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252623
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13102	NC_015666	CCGA	2	8	539920	539927	25 %	0 %	25 %	50 %	336252623
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13119	NC_015666	TCG	2	6	540642	540647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252624
13120	NC_015666	GTC	2	6	540665	540670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252624
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13219	NC_015666	TCCG	2	8	544290	544297	0 %	25 %	25 %	50 %	336252626
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13223	NC_015666	GC	4	8	544430	544437	0 %	0 %	50 %	50 %	336252626
13224	NC_015666	TCG	3	9	544505	544513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252626
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13227	NC_015666	ACG	2	6	544637	544642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252626
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13230	NC_015666	GAG	2	6	544723	544728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252626
13231	NC_015666	CTG	2	6	544750	544755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252626
13232	NC_015666	GTC	2	6	544783	544788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252626
13233	NC_015666	CGA	2	6	544808	544813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252626
13234	NC_015666	GGC	2	6	544824	544829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252626
13235	NC_015666	GAAGG	2	10	544831	544840	40 %	0 %	60 %	0 %	336252626
13236	NC_015666	CGGC	2	8	544944	544951	0 %	0 %	50 %	50 %	336252626
13237	NC_015666	CGA	2	6	544965	544970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252626
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13346	NC_015666	CTC	3	9	549840	549848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252633
13347	NC_015666	CCGA	2	8	549862	549869	25 %	0 %	25 %	50 %	336252633
13348	NC_015666	CGC	2	6	549884	549889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252633
13349	NC_015666	GGCG	2	8	549890	549897	0 %	0 %	75 %	25 %	336252633
13350	NC_015666	CGT	3	9	549906	549914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252633
13351	NC_015666	GAT	2	6	549942	549947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252633
13352	NC_015666	TCG	2	6	549953	549958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252633
13353	NC_015666	GAC	2	6	549963	549968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252633
13354	NC_015666	GAG	2	6	549991	549996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252633
13355	NC_015666	TCG	2	6	550010	550015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252633
13356	NC_015666	TGA	2	6	550019	550024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252633
13357	NC_015666	CGA	3	9	550028	550036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252633
13358	NC_015666	CGC	2	6	550038	550043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252633
13359	NC_015666	GCGA	2	8	550092	550099	25 %	0 %	50 %	25 %	336252633
13360	NC_015666	GATCAG	2	12	550134	550145	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	336252633
13361	NC_015666	CGA	2	6	550212	550217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252633
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13363	NC_015666	ATC	2	6	550330	550335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252633
13364	NC_015666	CGA	2	6	550400	550405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252633
13365	NC_015666	GAT	2	6	550425	550430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252633
13366	NC_015666	CGA	2	6	550436	550441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252633
13367	NC_015666	CCA	2	6	550443	550448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252633
13368	NC_015666	GAC	2	6	550449	550454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252633
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13370	NC_015666	CGG	2	6	550520	550525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252633
13371	NC_015666	CGA	2	6	550562	550567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252633
13372	NC_015666	GC	3	6	550571	550576	0 %	0 %	50 %	50 %	336252633
13373	NC_015666	GTCG	2	8	550623	550630	0 %	25 %	50 %	25 %	336252633
13374	NC_015666	CGA	2	6	550658	550663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252633
13375	NC_015666	CGA	2	6	550688	550693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252633
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13378	NC_015666	TGA	2	6	550733	550738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252633
13379	NC_015666	GTC	2	6	550774	550779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252633
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13382	NC_015666	CGA	2	6	550799	550804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252633
13383	NC_015666	AGT	2	6	550831	550836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252633
13384	NC_015666	ACG	2	6	551021	551026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252634
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13390	NC_015666	TGA	2	6	551145	551150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252634
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13392	NC_015666	GTC	2	6	551275	551280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252634
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13403	NC_015666	GAT	2	6	551725	551730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252635
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13406	NC_015666	CCGCGG	2	12	551781	551792	0 %	0 %	50 %	50 %	336252635
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13411	NC_015666	TCG	2	6	551976	551981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252635
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13424	NC_015666	GTC	3	9	552371	552379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252635
13425	NC_015666	TCG	2	6	552405	552410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252635
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13441	NC_015666	CACG	2	8	553221	553228	25 %	0 %	25 %	50 %	336252636
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13456	NC_015666	CCCT	2	8	553597	553604	0 %	25 %	0 %	75 %	336252636
13457	NC_015666	CTG	2	6	553612	553617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252636
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13460	NC_015666	GTCG	2	8	553650	553657	0 %	25 %	50 %	25 %	336252636
13461	NC_015666	TGG	2	6	553667	553672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252636
13462	NC_015666	GAC	2	6	553684	553689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252636
13463	NC_015666	TCG	2	6	553690	553695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252636
13464	NC_015666	ATCAGG	2	12	553707	553718	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	336252636
13465	NC_015666	GTCAGA	2	12	553719	553730	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	336252636
13466	NC_015666	GCC	2	6	553786	553791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252637
13467	NC_015666	TCG	2	6	553792	553797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252637
13468	NC_015666	TCC	2	6	553798	553803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252637
13469	NC_015666	GAC	2	6	553821	553826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252637
13470	NC_015666	TTCGC	2	10	553844	553853	0 %	40 %	20 %	40 %	336252637
13471	NC_015666	GCG	2	6	553884	553889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252637
13472	NC_015666	GGC	2	6	553898	553903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252637
13473	NC_015666	CGA	2	6	553913	553918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252637
13474	NC_015666	CGT	2	6	553922	553927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252637
13475	NC_015666	CGG	2	6	553934	553939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252637
13476	NC_015666	TCGG	2	8	553954	553961	0 %	25 %	50 %	25 %	336252637
13477	NC_015666	GTC	2	6	553965	553970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252637
13478	NC_015666	GAC	3	9	553971	553979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252637
13479	NC_015666	TCG	2	6	554033	554038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252637
13480	NC_015666	CGA	2	6	554078	554083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252637
13481	NC_015666	AGCGT	2	10	554092	554101	20 %	20 %	40 %	20 %	336252637
13482	NC_015666	CGA	2	6	554129	554134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252637
13483	NC_015666	CGA	2	6	554174	554179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252637
13484	NC_015666	CGG	2	6	554306	554311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252637
13485	NC_015666	AGC	2	6	554324	554329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252637
13486	NC_015666	CTC	2	6	554331	554336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252637
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13488	NC_015666	CGC	2	6	554353	554358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252637
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13490	NC_015666	CGG	2	6	554382	554387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252637
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13494	NC_015666	GCG	2	6	554515	554520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252637
13495	NC_015666	TCG	2	6	554799	554804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252638
13496	NC_015666	ACG	2	6	554816	554821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252638
13497	NC_015666	ACG	2	6	554834	554839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252638
13498	NC_015666	CGT	2	6	554845	554850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252638
13499	NC_015666	CCG	2	6	554868	554873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252638
13500	NC_015666	TTC	2	6	554893	554898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252638

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