MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 91388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_015666	TGGACG	2	12	516608	516619	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	336252601
12502	NC_015666	CGGACG	2	12	516620	516631	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	336252601
12503	NC_015666	GAC	2	6	516646	516651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252601
12504	NC_015666	GCGAC	3	15	516663	516677	20 %	0 %	40 %	40 %	336252601
12505	NC_015666	CTT	2	6	516723	516728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252601
12506	NC_015666	TCA	2	6	516734	516739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252601
12507	NC_015666	ATC	2	6	516742	516747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252601
12508	NC_015666	TCT	2	6	516749	516754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252601
12509	NC_015666	GGC	2	6	516755	516760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252601
12510	NC_015666	CGG	2	6	516783	516788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252601
12511	NC_015666	CGT	3	9	516795	516803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252601
12512	NC_015666	CGC	2	6	516843	516848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252601
12513	NC_015666	CGA	2	6	516852	516857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252601
12514	NC_015666	CCG	2	6	516860	516865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252601
12515	NC_015666	GCGG	2	8	516915	516922	0 %	0 %	75 %	25 %	336252601
12516	NC_015666	CGC	2	6	516927	516932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252601
12517	NC_015666	ATC	2	6	516958	516963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252601
12518	NC_015666	AAC	2	6	517000	517005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336252601
12519	NC_015666	GGC	2	6	517044	517049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252601
12520	NC_015666	CGCTCG	2	12	517061	517072	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	336252601
12521	NC_015666	TCG	2	6	517087	517092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252601
12522	NC_015666	GTCG	2	8	517101	517108	0 %	25 %	50 %	25 %	336252601
12523	NC_015666	CGA	2	6	517122	517127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252601
12524	NC_015666	CTCTAC	2	12	517135	517146	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	336252601
12525	NC_015666	TCGG	2	8	517198	517205	0 %	25 %	50 %	25 %	336252601
12526	NC_015666	CGT	3	9	517212	517220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252601
12527	NC_015666	TC	3	6	517222	517227	0 %	50 %	0 %	50 %	336252601
12528	NC_015666	CGG	2	6	517242	517247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252601
12529	NC_015666	GTC	2	6	517273	517278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252601
12530	NC_015666	GCC	2	6	517281	517286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252601
12531	NC_015666	CGC	2	6	517293	517298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252601
12532	NC_015666	GCC	2	6	517332	517337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252601
12533	NC_015666	GAC	2	6	517346	517351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252601
12534	NC_015666	CGT	2	6	517438	517443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252602
12535	NC_015666	CCT	2	6	517486	517491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252602
12536	NC_015666	CAT	2	6	517526	517531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252602
12537	NC_015666	CGT	2	6	517573	517578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252602
12538	NC_015666	CTC	2	6	517595	517600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252602
12539	NC_015666	CG	3	6	517613	517618	0 %	0 %	50 %	50 %	336252602
12540	NC_015666	CTC	2	6	517649	517654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252602
12541	NC_015666	CGC	2	6	517708	517713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252602
12542	NC_015666	TCG	2	6	517731	517736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252602
12543	NC_015666	CGC	2	6	517759	517764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252602
12544	NC_015666	GAT	2	6	517781	517786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252602
12545	NC_015666	CTC	2	6	517787	517792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252602
12546	NC_015666	TCC	2	6	517800	517805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252602
12547	NC_015666	GGT	2	6	517823	517828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252602
12548	NC_015666	TCG	2	6	517836	517841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252602
12549	NC_015666	TCG	2	6	517890	517895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252602
12550	NC_015666	TTC	2	6	517899	517904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252602
12551	NC_015666	GAC	2	6	518006	518011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252602
12552	NC_015666	TCG	2	6	518088	518093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252602
12553	NC_015666	CCT	2	6	518143	518148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252602
12554	NC_015666	GTT	2	6	518159	518164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336252602
12555	NC_015666	TCC	2	6	518199	518204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252602
12556	NC_015666	ATC	2	6	518235	518240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252602
12557	NC_015666	TCG	2	6	518250	518255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252602
12558	NC_015666	CGC	2	6	518281	518286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252602
12559	NC_015666	CAG	2	6	518444	518449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252602
12560	NC_015666	GAG	2	6	518477	518482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252602
12561	NC_015666	GAG	2	6	518516	518521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252602
12562	NC_015666	CGA	2	6	518534	518539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252602
12563	NC_015666	GTT	2	6	518558	518563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336252602
12564	NC_015666	CAG	2	6	518582	518587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252602
12565	NC_015666	CGA	2	6	518614	518619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252602
12566	NC_015666	CTC	2	6	518639	518644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252602
12567	NC_015666	GAG	3	9	518694	518702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252602
12568	NC_015666	TGA	2	6	518737	518742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252602
12569	NC_015666	AGC	2	6	518820	518825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252602
12570	NC_015666	CGA	2	6	519011	519016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252603
12571	NC_015666	CCG	2	6	519018	519023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252603
12572	NC_015666	CGCC	2	8	519068	519075	0 %	0 %	25 %	75 %	336252603
12573	NC_015666	TCG	2	6	519112	519117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252603
12574	NC_015666	CGT	2	6	519140	519145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252603
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12576	NC_015666	TCG	2	6	519226	519231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252603
12577	NC_015666	GTC	2	6	519281	519286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252604
12578	NC_015666	GAG	2	6	519320	519325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252604
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12581	NC_015666	TCG	2	6	519414	519419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252604
12582	NC_015666	GTTC	2	8	519438	519445	0 %	50 %	25 %	25 %	336252604
12583	NC_015666	CGA	2	6	519472	519477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252604
12584	NC_015666	ACG	2	6	519489	519494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252604
12585	NC_015666	GTC	2	6	519509	519514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252604
12586	NC_015666	GAG	2	6	519557	519562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252604
12587	NC_015666	ACG	2	6	519570	519575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252604
12588	NC_015666	CGA	2	6	519685	519690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252604
12589	NC_015666	ACG	2	6	519747	519752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252604
12590	NC_015666	GC	3	6	519961	519966	0 %	0 %	50 %	50 %	336252605
12591	NC_015666	GGC	2	6	519986	519991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252605
12592	NC_015666	CCGA	2	8	520004	520011	25 %	0 %	25 %	50 %	336252605
12593	NC_015666	CGC	2	6	520027	520032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252605
12594	NC_015666	GGGAC	2	10	520078	520087	20 %	0 %	60 %	20 %	336252605
12595	NC_015666	CGAGCG	2	12	520159	520170	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	336252605
12596	NC_015666	CG	3	6	520169	520174	0 %	0 %	50 %	50 %	336252605
12597	NC_015666	GAG	2	6	520181	520186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252605
12598	NC_015666	GTC	2	6	520229	520234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252605
12599	NC_015666	GCG	2	6	520254	520259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252605
12600	NC_015666	GCC	2	6	520313	520318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252605
12601	NC_015666	GCG	2	6	520353	520358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252605
12602	NC_015666	CGT	2	6	520411	520416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252605
12603	NC_015666	CGG	2	6	520423	520428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252605
12604	NC_015666	CGT	2	6	520453	520458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252605
12605	NC_015666	CCG	2	6	520483	520488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252605
12606	NC_015666	GC	3	6	520491	520496	0 %	0 %	50 %	50 %	336252605
12607	NC_015666	CGA	2	6	520501	520506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252605
12608	NC_015666	GAG	2	6	520523	520528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252605
12609	NC_015666	CGG	2	6	520530	520535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252605
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12611	NC_015666	CGG	2	6	520709	520714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252606
12612	NC_015666	CGG	2	6	520735	520740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252606
12613	NC_015666	GA	3	6	520753	520758	50 %	0 %	50 %	0 %	336252606
12614	NC_015666	TGG	2	6	520792	520797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252606
12615	NC_015666	CGG	3	9	520856	520864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252606
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12617	NC_015666	CGC	2	6	520893	520898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252606
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12735	NC_015666	CGC	2	6	525687	525692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252610
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12840	NC_015666	CGAAG	2	10	529978	529987	40 %	0 %	40 %	20 %	336252613
12841	NC_015666	CG	3	6	529996	530001	0 %	0 %	50 %	50 %	336252613
12842	NC_015666	CG	3	6	530043	530048	0 %	0 %	50 %	50 %	336252613
12843	NC_015666	CG	3	6	530140	530145	0 %	0 %	50 %	50 %	336252613
12844	NC_015666	GCC	2	6	530154	530159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252613
12845	NC_015666	GATCTC	2	12	530168	530179	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	336252613
12846	NC_015666	CGT	2	6	530182	530187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252613
12847	NC_015666	TCG	2	6	530218	530223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252613
12848	NC_015666	GCG	2	6	530319	530324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252613
12849	NC_015666	ATC	2	6	530370	530375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252613
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12969	NC_015666	GCT	2	6	534604	534609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252618
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