MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 91388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_015666	CGT	2	6	441693	441698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252533
10502	NC_015666	TCC	2	6	441761	441766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252533
10503	NC_015666	CG	3	6	441778	441783	0 %	0 %	50 %	50 %	336252533
10504	NC_015666	ACG	3	9	441797	441805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252533
10505	NC_015666	GTC	2	6	441820	441825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252533
10506	NC_015666	CCG	2	6	441833	441838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252533
10507	NC_015666	CTG	2	6	441859	441864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252533
10508	NC_015666	CGA	2	6	441954	441959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252533
10509	NC_015666	GAC	2	6	441978	441983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252533
10510	NC_015666	CTA	2	6	441987	441992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252533
10511	NC_015666	GAG	2	6	442015	442020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252533
10512	NC_015666	TGG	2	6	442070	442075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252533
10513	NC_015666	TCG	2	6	442085	442090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252533
10514	NC_015666	CT	3	6	442105	442110	0 %	50 %	0 %	50 %	336252533
10515	NC_015666	TAC	2	6	442147	442152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252533
10516	NC_015666	GAG	2	6	442201	442206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252533
10517	NC_015666	CCG	2	6	442250	442255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252533
10518	NC_015666	ACGCG	2	10	442290	442299	20 %	0 %	40 %	40 %	336252533
10519	NC_015666	GGCC	2	8	442341	442348	0 %	0 %	50 %	50 %	336252533
10520	NC_015666	TCC	2	6	442367	442372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252533
10521	NC_015666	GAC	2	6	442389	442394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252533
10522	NC_015666	ACGCG	2	10	442436	442445	20 %	0 %	40 %	40 %	336252533
10523	NC_015666	TCG	2	6	442481	442486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252533
10524	NC_015666	TCGC	2	8	442505	442512	0 %	25 %	25 %	50 %	336252533
10525	NC_015666	CGG	2	6	442544	442549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252533
10526	NC_015666	CG	3	6	442591	442596	0 %	0 %	50 %	50 %	336252533
10527	NC_015666	AGG	2	6	442610	442615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252533
10528	NC_015666	TCGA	2	8	442726	442733	25 %	25 %	25 %	25 %	336252533
10529	NC_015666	G	6	6	442742	442747	0 %	0 %	100 %	0 %	336252533
10530	NC_015666	CG	3	6	442818	442823	0 %	0 %	50 %	50 %	336252533
10531	NC_015666	ACCT	2	8	442873	442880	25 %	25 %	0 %	50 %	336252533
10532	NC_015666	GACG	2	8	442923	442930	25 %	0 %	50 %	25 %	336252533
10533	NC_015666	GAG	2	6	442963	442968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252533
10534	NC_015666	GAG	2	6	442984	442989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252533
10535	NC_015666	CGGC	2	8	443104	443111	0 %	0 %	50 %	50 %	336252534
10536	NC_015666	CGA	2	6	443116	443121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252534
10537	NC_015666	TCG	2	6	443124	443129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252534
10538	NC_015666	GAGGTC	2	12	443138	443149	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	336252534
10539	NC_015666	CGA	2	6	443173	443178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252534
10540	NC_015666	CACCG	2	10	443180	443189	20 %	0 %	20 %	60 %	336252534
10541	NC_015666	CGA	3	9	443227	443235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252534
10542	NC_015666	CTCG	2	8	443261	443268	0 %	25 %	25 %	50 %	336252534
10543	NC_015666	TCGGGC	2	12	443286	443297	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	336252534
10544	NC_015666	CGC	2	6	443303	443308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252534
10545	NC_015666	GAC	2	6	443327	443332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252534
10546	NC_015666	GAG	2	6	443389	443394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252534
10547	NC_015666	GACGA	2	10	443397	443406	40 %	0 %	40 %	20 %	336252534
10548	NC_015666	CGC	2	6	443419	443424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252534
10549	NC_015666	CG	3	6	443525	443530	0 %	0 %	50 %	50 %	336252534
10550	NC_015666	CGACGT	2	12	443602	443613	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	336252534
10551	NC_015666	CGG	3	9	443626	443634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252534
10552	NC_015666	GGA	2	6	443635	443640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252534
10553	NC_015666	TCG	2	6	443643	443648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252534
10554	NC_015666	AGT	2	6	443665	443670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252534
10555	NC_015666	CTGC	2	8	443710	443717	0 %	25 %	25 %	50 %	336252534
10556	NC_015666	TCG	2	6	443837	443842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252535
10557	NC_015666	CGTCG	2	10	443849	443858	0 %	20 %	40 %	40 %	336252535
10558	NC_015666	CGGT	2	8	443874	443881	0 %	25 %	50 %	25 %	336252535
10559	NC_015666	GTA	2	6	443903	443908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252535
10560	NC_015666	TCG	2	6	443919	443924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252535
10561	NC_015666	GTTCG	2	10	443970	443979	0 %	40 %	40 %	20 %	336252535
10562	NC_015666	CGA	2	6	443996	444001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252535
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10564	NC_015666	CCG	2	6	444046	444051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252535
10565	NC_015666	TCG	2	6	444084	444089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252535
10566	NC_015666	CGC	2	6	444098	444103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252535
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10568	NC_015666	CGT	2	6	444208	444213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252535
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10570	NC_015666	CGCT	2	8	444396	444403	0 %	25 %	25 %	50 %	336252535
10571	NC_015666	TCG	2	6	444408	444413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252535
10572	NC_015666	GTA	2	6	444419	444424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252535
10573	NC_015666	GTA	2	6	444428	444433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252535
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10577	NC_015666	CGA	3	9	444834	444842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252536
10578	NC_015666	TTC	2	6	444847	444852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252536
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10581	NC_015666	CG	3	6	444934	444939	0 %	0 %	50 %	50 %	336252536
10582	NC_015666	CGT	2	6	444945	444950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252536
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10584	NC_015666	CGA	2	6	445172	445177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252537
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10587	NC_015666	CGT	2	6	445232	445237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252537
10588	NC_015666	CGA	2	6	445238	445243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252537
10589	NC_015666	TCG	2	6	445249	445254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252537
10590	NC_015666	CGC	2	6	445263	445268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252537
10591	NC_015666	GTG	2	6	445303	445308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252537
10592	NC_015666	GGCC	2	8	445312	445319	0 %	0 %	50 %	50 %	336252537
10593	NC_015666	AGT	2	6	445324	445329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252537
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10598	NC_015666	GCC	3	9	445464	445472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252537
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10600	NC_015666	CGTCC	2	10	445503	445512	0 %	20 %	20 %	60 %	336252537
10601	NC_015666	GGTC	2	8	445547	445554	0 %	25 %	50 %	25 %	336252537
10602	NC_015666	GCG	2	6	445600	445605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252537
10603	NC_015666	TCG	2	6	445642	445647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252537
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10605	NC_015666	CGC	3	9	446057	446065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252538
10606	NC_015666	CGA	2	6	446096	446101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252538
10607	NC_015666	ACGCGA	2	12	446107	446118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252538
10608	NC_015666	ACGGAA	2	12	446134	446145	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	336252538
10609	NC_015666	CGC	2	6	446174	446179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252538
10610	NC_015666	GCGAAC	2	12	446187	446198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252538
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10613	NC_015666	GCG	2	6	446305	446310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252538
10614	NC_015666	CGA	2	6	446357	446362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252538
10615	NC_015666	GAC	2	6	446379	446384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252538
10616	NC_015666	CGA	2	6	446387	446392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252538
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10618	NC_015666	CGA	3	9	446468	446476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252538
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