MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 91388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_015666	TCG	2	6	414607	414612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252511
10002	NC_015666	CGC	2	6	414614	414619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252511
10003	NC_015666	CGA	2	6	414638	414643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252511
10004	NC_015666	GCC	2	6	414663	414668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252511
10005	NC_015666	ACG	2	6	414768	414773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252511
10006	NC_015666	CGA	2	6	414778	414783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252511
10007	NC_015666	CGT	2	6	414803	414808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252511
10008	NC_015666	ACG	2	6	414850	414855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252511
10009	NC_015666	CGAC	2	8	414869	414876	25 %	0 %	25 %	50 %	336252511
10010	NC_015666	TAC	2	6	414882	414887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252511
10011	NC_015666	GTC	2	6	414894	414899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252511
10012	NC_015666	GC	3	6	414938	414943	0 %	0 %	50 %	50 %	336252511
10013	NC_015666	CGGC	2	8	415012	415019	0 %	0 %	50 %	50 %	336252512
10014	NC_015666	GC	3	6	415033	415038	0 %	0 %	50 %	50 %	336252512
10015	NC_015666	CGA	2	6	415049	415054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252512
10016	NC_015666	TCG	2	6	415056	415061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252512
10017	NC_015666	GCG	2	6	415066	415071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252512
10018	NC_015666	GTT	2	6	415073	415078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336252512
10019	NC_015666	CGT	2	6	415133	415138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252512
10020	NC_015666	TCG	2	6	415155	415160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252512
10021	NC_015666	GTC	2	6	415179	415184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252512
10022	NC_015666	ACG	2	6	415185	415190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252512
10023	NC_015666	GAC	2	6	415226	415231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252512
10024	NC_015666	CGA	2	6	415246	415251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252512
10025	NC_015666	ATC	2	6	415263	415268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252512
10026	NC_015666	GGA	2	6	415282	415287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252512
10027	NC_015666	CAG	2	6	415322	415327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252512
10028	NC_015666	AACG	2	8	415328	415335	50 %	0 %	25 %	25 %	336252512
10029	NC_015666	CCG	2	6	415350	415355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252512
10030	NC_015666	CGA	2	6	415450	415455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252512
10031	NC_015666	GAT	2	6	415466	415471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252512
10032	NC_015666	CTG	2	6	415538	415543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252512
10033	NC_015666	ATC	2	6	415560	415565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252512
10034	NC_015666	TTG	2	6	415587	415592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336252512
10035	NC_015666	TCACT	2	10	415615	415624	20 %	40 %	0 %	40 %	336252512
10036	NC_015666	GAC	2	6	415625	415630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252512
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10038	NC_015666	CGA	2	6	415714	415719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252512
10039	NC_015666	TG	3	6	415720	415725	0 %	50 %	50 %	0 %	336252512
10040	NC_015666	GCC	2	6	415847	415852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252512
10041	NC_015666	CGA	2	6	415885	415890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252512
10042	NC_015666	ACG	2	6	415923	415928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252512
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10046	NC_015666	CGAC	2	8	416349	416356	25 %	0 %	25 %	50 %	336252513
10047	NC_015666	GAACA	2	10	416360	416369	60 %	0 %	20 %	20 %	336252513
10048	NC_015666	AAG	2	6	416444	416449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252513
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10050	NC_015666	GGCC	2	8	416782	416789	0 %	0 %	50 %	50 %	336252514
10051	NC_015666	AGG	2	6	416871	416876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252514
10052	NC_015666	CAG	2	6	416882	416887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252514
10053	NC_015666	ACG	2	6	416892	416897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252514
10054	NC_015666	CGC	2	6	417343	417348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252515
10055	NC_015666	ACAG	2	8	417384	417391	50 %	0 %	25 %	25 %	336252515
10056	NC_015666	GCC	2	6	417392	417397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252515
10057	NC_015666	GAC	2	6	417464	417469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252515
10058	NC_015666	ACG	2	6	417477	417482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252515
10059	NC_015666	TCT	2	6	417492	417497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252515
10060	NC_015666	GCC	2	6	417532	417537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252515
10061	NC_015666	CGT	2	6	417556	417561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252515
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10063	NC_015666	CTC	2	6	417571	417576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252515
10064	NC_015666	GAC	3	9	417590	417598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252515
10065	NC_015666	CGA	2	6	417658	417663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252515
10066	NC_015666	CGA	2	6	417705	417710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252515
10067	NC_015666	ACG	2	6	417801	417806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252515
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10070	NC_015666	CCT	2	6	417945	417950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252515
10071	NC_015666	GAG	2	6	418004	418009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252515
10072	NC_015666	CTCG	2	8	418054	418061	0 %	25 %	25 %	50 %	336252515
10073	NC_015666	CTC	2	6	418069	418074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252515
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10082	NC_015666	ACC	2	6	418643	418648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252516
10083	NC_015666	GAC	2	6	418666	418671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252516
10084	NC_015666	GC	3	6	418684	418689	0 %	0 %	50 %	50 %	336252516
10085	NC_015666	AGC	2	6	418693	418698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252516
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10100	NC_015666	GAC	4	12	419245	419256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252517
10101	NC_015666	TCG	2	6	419262	419267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252517
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10107	NC_015666	GTA	2	6	419622	419627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252518
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10109	NC_015666	GCG	2	6	419651	419656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252518
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10112	NC_015666	CGA	2	6	419780	419785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252518
10113	NC_015666	GATC	2	8	419822	419829	25 %	25 %	25 %	25 %	336252518
10114	NC_015666	GTCC	2	8	419898	419905	0 %	25 %	25 %	50 %	336252518
10115	NC_015666	CGT	2	6	419915	419920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252518
10116	NC_015666	CGT	2	6	419948	419953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252518
10117	NC_015666	CGA	2	6	420053	420058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252518
10118	NC_015666	CGG	2	6	420109	420114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252518
10119	NC_015666	CCG	2	6	420141	420146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252518
10120	NC_015666	GGA	2	6	420155	420160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252518
10121	NC_015666	CGTCAC	2	12	420213	420224	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	336252518
10122	NC_015666	CTC	2	6	420231	420236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252518
10123	NC_015666	GAG	2	6	420309	420314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252518
10124	NC_015666	CTC	2	6	420369	420374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252518
10125	NC_015666	CGC	2	6	420426	420431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252518
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10128	NC_015666	TCG	2	6	420712	420717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252519
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10135	NC_015666	TCC	2	6	420910	420915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252519
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10139	NC_015666	GACC	2	8	421103	421110	25 %	0 %	25 %	50 %	336252519
10140	NC_015666	GACC	2	8	421132	421139	25 %	0 %	25 %	50 %	336252519
10141	NC_015666	CGT	2	6	421184	421189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252519
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10148	NC_015666	CGA	2	6	421571	421576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252519
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10155	NC_015666	GC	3	6	421826	421831	0 %	0 %	50 %	50 %	336252519
10156	NC_015666	CGA	2	6	421838	421843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252519
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10203	NC_015666	CGA	2	6	430378	430383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252523
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10219	NC_015666	GC	3	6	431004	431009	0 %	0 %	50 %	50 %	336252524
10220	NC_015666	CTT	2	6	431058	431063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252524
10221	NC_015666	GAC	2	6	431113	431118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252524
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10223	NC_015666	CGC	2	6	431143	431148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252524
10224	NC_015666	CGG	2	6	431169	431174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252524
10225	NC_015666	GTC	2	6	431293	431298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252524
10226	NC_015666	CGA	2	6	431358	431363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252524
10227	NC_015666	CGTC	2	8	431415	431422	0 %	25 %	25 %	50 %	336252524
10228	NC_015666	GCC	2	6	431437	431442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252524
10229	NC_015666	CGG	3	9	431445	431453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252524
10230	NC_015666	CGA	2	6	431472	431477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252524
10231	NC_015666	GCCGTC	2	12	431485	431496	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	336252524
10232	NC_015666	CGAACT	2	12	431529	431540	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	336252524
10233	NC_015666	GTC	3	9	431584	431592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252524
10234	NC_015666	TCGAG	2	10	431607	431616	20 %	20 %	40 %	20 %	336252524
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10253	NC_015666	GGT	2	6	432408	432413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252525
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10350	NC_015666	GTC	2	6	435852	435857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252527
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10466	NC_015666	CGCCC	2	10	440462	440471	0 %	0 %	20 %	80 %	336252532
10467	NC_015666	GC	3	6	440486	440491	0 %	0 %	50 %	50 %	336252532
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10469	NC_015666	GAG	2	6	440707	440712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252533
10470	NC_015666	CGG	2	6	440841	440846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252533
10471	NC_015666	CGC	2	6	440864	440869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252533
10472	NC_015666	AGG	2	6	440891	440896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252533
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10474	NC_015666	CGT	2	6	440937	440942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252533
10475	NC_015666	GC	5	10	440970	440979	0 %	0 %	50 %	50 %	336252533
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