MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 91388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_015666	ACG	2	6	310867	310872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252400
7502	NC_015666	ACG	2	6	310897	310902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252400
7503	NC_015666	CGA	2	6	310913	310918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252400
7504	NC_015666	GAT	2	6	310973	310978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252400
7505	NC_015666	GAC	2	6	310995	311000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252400
7506	NC_015666	TGCG	2	8	311027	311034	0 %	25 %	50 %	25 %	336252400
7507	NC_015666	GAG	2	6	311068	311073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252400
7508	NC_015666	AGA	2	6	311081	311086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252400
7509	NC_015666	GCC	2	6	311104	311109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252400
7510	NC_015666	GAC	2	6	311169	311174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252400
7511	NC_015666	ACT	2	6	311191	311196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252400
7512	NC_015666	GGT	2	6	311206	311211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252400
7513	NC_015666	GAC	2	6	311214	311219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252400
7514	NC_015666	GAG	2	6	311244	311249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252400
7515	NC_015666	CGTTGA	2	12	311267	311278	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	336252400
7516	NC_015666	GGAGCA	2	12	311309	311320	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	336252400
7517	NC_015666	AAT	2	6	311324	311329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336252400
7518	NC_015666	GAG	2	6	311343	311348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252400
7519	NC_015666	GAC	2	6	311355	311360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252400
7520	NC_015666	CGC	2	6	311364	311369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252400
7521	NC_015666	AGGA	2	8	311440	311447	50 %	0 %	50 %	0 %	336252400
7522	NC_015666	CGA	2	6	311459	311464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252400
7523	NC_015666	GAT	2	6	311472	311477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252400
7524	NC_015666	GAG	2	6	311487	311492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252400
7525	NC_015666	TCT	2	6	311870	311875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252401
7526	NC_015666	CAA	2	6	311906	311911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336252401
7527	NC_015666	CGC	2	6	311912	311917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252401
7528	NC_015666	C	6	6	311926	311931	0 %	0 %	0 %	100 %	336252401
7529	NC_015666	TCCA	2	8	311935	311942	25 %	25 %	0 %	50 %	336252401
7530	NC_015666	CCT	2	6	312011	312016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252401
7531	NC_015666	TCT	2	6	312023	312028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252401
7532	NC_015666	TCT	2	6	312032	312037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252401
7533	NC_015666	CTC	2	6	312045	312050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252401
7534	NC_015666	TCT	2	6	312172	312177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252401
7535	NC_015666	GATT	2	8	312198	312205	25 %	50 %	25 %	0 %	336252401
7536	NC_015666	TCG	2	6	312235	312240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252401
7537	NC_015666	TCAT	2	8	312268	312275	25 %	50 %	0 %	25 %	336252401
7538	NC_015666	TGT	2	6	312360	312365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336252401
7539	NC_015666	TGCG	2	8	312393	312400	0 %	25 %	50 %	25 %	336252401
7540	NC_015666	TCG	2	6	312445	312450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252401
7541	NC_015666	TGA	2	6	312461	312466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252401
7542	NC_015666	CCG	2	6	312478	312483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252401
7543	NC_015666	TGC	2	6	312506	312511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252401
7544	NC_015666	TCT	2	6	312542	312547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252401
7545	NC_015666	GAG	2	6	312552	312557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252401
7546	NC_015666	GT	3	6	313272	313277	0 %	50 %	50 %	0 %	336252402
7547	NC_015666	CT	3	6	313305	313310	0 %	50 %	0 %	50 %	336252402
7548	NC_015666	GAC	2	6	313342	313347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252402
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7550	NC_015666	CGA	2	6	313483	313488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252402
7551	NC_015666	CGC	2	6	313510	313515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252402
7552	NC_015666	GTT	2	6	313539	313544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336252402
7553	NC_015666	GGA	2	6	313546	313551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252402
7554	NC_015666	TGCG	2	8	313563	313570	0 %	25 %	50 %	25 %	336252402
7555	NC_015666	GAG	2	6	313598	313603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252402
7556	NC_015666	CCG	2	6	313632	313637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252402
7557	NC_015666	GTCG	2	8	313684	313691	0 %	25 %	50 %	25 %	336252402
7558	NC_015666	ACG	2	6	313749	313754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252402
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7560	NC_015666	TCG	2	6	313824	313829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252402
7561	NC_015666	CGT	2	6	313834	313839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252402
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7563	NC_015666	ACG	2	6	313866	313871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252402
7564	NC_015666	GCG	2	6	313890	313895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252402
7565	NC_015666	TCG	2	6	313911	313916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252402
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7568	NC_015666	CGA	3	9	313969	313977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252402
7569	NC_015666	TGC	2	6	314001	314006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252402
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7571	NC_015666	CGT	2	6	314083	314088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252402
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7574	NC_015666	CGA	2	6	314161	314166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252402
7575	NC_015666	GAT	2	6	314261	314266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252402
7576	NC_015666	TCGA	2	8	314282	314289	25 %	25 %	25 %	25 %	336252402
7577	NC_015666	CGA	2	6	314335	314340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252402
7578	NC_015666	CTG	2	6	314351	314356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252402
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7580	NC_015666	TGGAC	2	10	314418	314427	20 %	20 %	40 %	20 %	336252402
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7587	NC_015666	ACT	3	9	314757	314765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252402
7588	NC_015666	TCG	2	6	314775	314780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252402
7589	NC_015666	TCG	2	6	314988	314993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252402
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7591	NC_015666	ACCG	2	8	315008	315015	25 %	0 %	25 %	50 %	336252402
7592	NC_015666	ACGA	2	8	315030	315037	50 %	0 %	25 %	25 %	336252402
7593	NC_015666	AGG	2	6	315039	315044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252402
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7601	NC_015666	TCT	2	6	315318	315323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252402
7602	NC_015666	GTTG	2	8	315337	315344	0 %	50 %	50 %	0 %	336252402
7603	NC_015666	ACG	2	6	315345	315350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252402
7604	NC_015666	ACC	2	6	315399	315404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252402
7605	NC_015666	CGG	2	6	315482	315487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252402
7606	NC_015666	ACG	2	6	315510	315515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252402
7607	NC_015666	TTC	2	6	315527	315532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252402
7608	NC_015666	GAC	2	6	315557	315562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252402
7609	NC_015666	CGA	2	6	315565	315570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252402
7610	NC_015666	GCT	2	6	315571	315576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252402
7611	NC_015666	CTACGT	2	12	315631	315642	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	336252402
7612	NC_015666	GACGG	2	10	315647	315656	20 %	0 %	60 %	20 %	336252402
7613	NC_015666	GC	3	6	315660	315665	0 %	0 %	50 %	50 %	336252402
7614	NC_015666	AAG	2	6	315668	315673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252402
7615	NC_015666	CACC	2	8	315811	315818	25 %	0 %	0 %	75 %	336252402
7616	NC_015666	CGA	2	6	315883	315888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252403
7617	NC_015666	CGT	2	6	315899	315904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252403
7618	NC_015666	CGCCGG	2	12	315908	315919	0 %	0 %	50 %	50 %	336252403
7619	NC_015666	CGC	2	6	315945	315950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252403
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7979	NC_015666	TTG	2	6	333171	333176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336252419
7980	NC_015666	GC	3	6	333211	333216	0 %	0 %	50 %	50 %	336252419
7981	NC_015666	TCACC	2	10	333277	333286	20 %	20 %	0 %	60 %	336252419
7982	NC_015666	TCGG	2	8	333340	333347	0 %	25 %	50 %	25 %	336252420
7983	NC_015666	GGC	2	6	333508	333513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252420
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7985	NC_015666	CGT	2	6	333571	333576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252420
7986	NC_015666	TCC	2	6	333611	333616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252420
7987	NC_015666	GTC	2	6	333697	333702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252420
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