MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 91388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_015666	ACG	2	6	286138	286143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252380
7002	NC_015666	GAG	2	6	286149	286154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252380
7003	NC_015666	CTC	2	6	286230	286235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252380
7004	NC_015666	GAA	2	6	286281	286286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252380
7005	NC_015666	TAC	2	6	286359	286364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252380
7006	NC_015666	GTCG	2	8	286376	286383	0 %	25 %	50 %	25 %	336252380
7007	NC_015666	GCC	2	6	286506	286511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252380
7008	NC_015666	CGA	2	6	286526	286531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252380
7009	NC_015666	GA	3	6	286570	286575	50 %	0 %	50 %	0 %	336252380
7010	NC_015666	GTCG	2	8	286576	286583	0 %	25 %	50 %	25 %	336252380
7011	NC_015666	CGA	2	6	286622	286627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252380
7012	NC_015666	GGCA	2	8	286694	286701	25 %	0 %	50 %	25 %	336252381
7013	NC_015666	CGA	2	6	286804	286809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252381
7014	NC_015666	CGT	2	6	286852	286857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252381
7015	NC_015666	GAG	2	6	286871	286876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252381
7016	NC_015666	ACG	3	9	286911	286919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252381
7017	NC_015666	CAAC	2	8	286939	286946	50 %	0 %	0 %	50 %	336252381
7018	NC_015666	AGTC	2	8	287061	287068	25 %	25 %	25 %	25 %	336252381
7019	NC_015666	GAC	2	6	287081	287086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252381
7020	NC_015666	CAG	2	6	287153	287158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252381
7021	NC_015666	CA	3	6	287188	287193	50 %	0 %	0 %	50 %	336252381
7022	NC_015666	ACT	2	6	287206	287211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252381
7023	NC_015666	AGC	2	6	287223	287228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252381
7024	NC_015666	ACA	2	6	287229	287234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336252381
7025	NC_015666	TC	3	6	287322	287327	0 %	50 %	0 %	50 %	336252381
7026	NC_015666	GAC	3	9	287417	287425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252381
7027	NC_015666	TTCGTC	2	12	287546	287557	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	336252382
7028	NC_015666	CAC	2	6	287566	287571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252382
7029	NC_015666	TCG	2	6	287583	287588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252382
7030	NC_015666	CAT	2	6	287692	287697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252382
7031	NC_015666	CTT	2	6	287701	287706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252382
7032	NC_015666	TCG	2	6	287727	287732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252382
7033	NC_015666	CT	3	6	287752	287757	0 %	50 %	0 %	50 %	336252382
7034	NC_015666	CGT	2	6	287830	287835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252382
7035	NC_015666	GAG	2	6	287937	287942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252382
7036	NC_015666	TCA	2	6	287943	287948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252382
7037	NC_015666	CTT	2	6	288082	288087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252382
7038	NC_015666	TTC	2	6	288200	288205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252382
7039	NC_015666	TCG	2	6	288231	288236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252382
7040	NC_015666	GCT	2	6	288264	288269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252382
7041	NC_015666	TAA	2	6	288301	288306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336252382
7042	NC_015666	AGA	2	6	288536	288541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252383
7043	NC_015666	GGA	2	6	288574	288579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252383
7044	NC_015666	CGA	2	6	288594	288599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252383
7045	NC_015666	ATGA	2	8	288608	288615	50 %	25 %	25 %	0 %	336252383
7046	NC_015666	G	6	6	288656	288661	0 %	0 %	100 %	0 %	336252383
7047	NC_015666	GAT	2	6	288722	288727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252383
7048	NC_015666	CGA	2	6	288774	288779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252383
7049	NC_015666	GATG	2	8	288787	288794	25 %	25 %	50 %	0 %	336252383
7050	NC_015666	CCT	2	6	288911	288916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252383
7051	NC_015666	TG	3	6	288930	288935	0 %	50 %	50 %	0 %	336252383
7052	NC_015666	TCA	2	6	288964	288969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252383
7053	NC_015666	CGG	2	6	289036	289041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252383
7054	NC_015666	GGT	2	6	289065	289070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252383
7055	NC_015666	GAG	2	6	289118	289123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252383
7056	NC_015666	CAT	2	6	289354	289359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252384
7057	NC_015666	TC	3	6	289404	289409	0 %	50 %	0 %	50 %	336252384
7058	NC_015666	GAA	2	6	289415	289420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252384
7059	NC_015666	ATC	2	6	289451	289456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252384
7060	NC_015666	GGA	2	6	289480	289485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252384
7061	NC_015666	TCGG	2	8	289497	289504	0 %	25 %	50 %	25 %	336252384
7062	NC_015666	CGT	2	6	289567	289572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252384
7063	NC_015666	GC	3	6	289593	289598	0 %	0 %	50 %	50 %	336252384
7064	NC_015666	CGC	2	6	289633	289638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252384
7065	NC_015666	ACG	2	6	289697	289702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252384
7066	NC_015666	CGA	2	6	289750	289755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252384
7067	NC_015666	TCG	2	6	289803	289808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252384
7068	NC_015666	GATC	2	8	289860	289867	25 %	25 %	25 %	25 %	336252384
7069	NC_015666	CTC	2	6	289892	289897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252384
7070	NC_015666	GCAGA	2	10	289925	289934	40 %	0 %	40 %	20 %	336252384
7071	NC_015666	GACG	2	8	289960	289967	25 %	0 %	50 %	25 %	336252384
7072	NC_015666	AGG	2	6	289998	290003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252384
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7074	NC_015666	ACG	2	6	290202	290207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252384
7075	NC_015666	TGC	2	6	290227	290232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252384
7076	NC_015666	CGGAG	2	10	290303	290312	20 %	0 %	60 %	20 %	336252384
7077	NC_015666	ACT	2	6	290390	290395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252384
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7079	NC_015666	TCG	2	6	290468	290473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252385
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7081	NC_015666	CA	3	6	290495	290500	50 %	0 %	0 %	50 %	336252385
7082	NC_015666	TC	3	6	290529	290534	0 %	50 %	0 %	50 %	336252385
7083	NC_015666	CGC	2	6	290587	290592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252385
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7085	NC_015666	CGC	2	6	290619	290624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252385
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7088	NC_015666	TTC	2	6	290716	290721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252385
7089	NC_015666	TCT	2	6	290778	290783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252385
7090	NC_015666	CAT	2	6	290809	290814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252385
7091	NC_015666	GTA	2	6	290821	290826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252385
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7093	NC_015666	CAG	2	6	291055	291060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252385
7094	NC_015666	TCGCGA	2	12	291122	291133	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	336252385
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7102	NC_015666	CCGA	2	8	291707	291714	25 %	0 %	25 %	50 %	336252386
7103	NC_015666	ATC	2	6	291769	291774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252386
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7108	NC_015666	GAA	2	6	292181	292186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252387
7109	NC_015666	CGT	2	6	292204	292209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252387
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7114	NC_015666	GAC	2	6	292367	292372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252387
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7118	NC_015666	GAG	2	6	292523	292528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252387
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7120	NC_015666	CGA	2	6	292576	292581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252387
7121	NC_015666	GAG	2	6	292589	292594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252387
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7481	NC_015666	AGA	2	6	309836	309841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252397
7482	NC_015666	AGC	2	6	309851	309856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252397
7483	NC_015666	AGG	2	6	309893	309898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252397
7484	NC_015666	GTC	2	6	309915	309920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252398
7485	NC_015666	CGG	2	6	309947	309952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252398
7486	NC_015666	TC	3	6	310113	310118	0 %	50 %	0 %	50 %	336252399
7487	NC_015666	CCAT	2	8	310188	310195	25 %	25 %	0 %	50 %	336252399
7488	NC_015666	TCC	2	6	310203	310208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252399
7489	NC_015666	TTC	2	6	310268	310273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252399
7490	NC_015666	TCC	2	6	310275	310280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252399
7491	NC_015666	GGC	2	6	310541	310546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252400
7492	NC_015666	CGA	2	6	310565	310570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252400
7493	NC_015666	TCC	2	6	310571	310576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252400
7494	NC_015666	CGA	2	6	310604	310609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252400
7495	NC_015666	AC	3	6	310645	310650	50 %	0 %	0 %	50 %	336252400
7496	NC_015666	CGA	2	6	310682	310687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252400
7497	NC_015666	GCTC	2	8	310710	310717	0 %	25 %	25 %	50 %	336252400
7498	NC_015666	CGTT	2	8	310750	310757	0 %	50 %	25 %	25 %	336252400
7499	NC_015666	CGA	2	6	310763	310768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252400
7500	NC_015666	CTG	2	6	310775	310780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252400

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