MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 91388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_015666	GAC	2	6	262817	262822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252355
6502	NC_015666	ACG	2	6	262893	262898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252355
6503	NC_015666	TCGT	2	8	262899	262906	0 %	50 %	25 %	25 %	336252355
6504	NC_015666	TCG	2	6	262920	262925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252355
6505	NC_015666	CGC	2	6	262942	262947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252355
6506	NC_015666	CA	3	6	263018	263023	50 %	0 %	0 %	50 %	336252355
6507	NC_015666	CGA	3	9	263031	263039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252355
6508	NC_015666	GAC	2	6	263066	263071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252355
6509	NC_015666	GAG	2	6	263216	263221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252355
6510	NC_015666	CCT	2	6	263257	263262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252355
6511	NC_015666	TACGG	2	10	263268	263277	20 %	20 %	40 %	20 %	336252355
6512	NC_015666	TCC	2	6	263307	263312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252355
6513	NC_015666	CCA	2	6	263359	263364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252355
6514	NC_015666	GAG	2	6	263375	263380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252355
6515	NC_015666	GGC	2	6	263400	263405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252355
6516	NC_015666	TCG	2	6	263424	263429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252355
6517	NC_015666	TTCC	2	8	263465	263472	0 %	50 %	0 %	50 %	336252355
6518	NC_015666	TTG	2	6	263574	263579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336252355
6519	NC_015666	CGA	2	6	263647	263652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252355
6520	NC_015666	GAG	2	6	263660	263665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252355
6521	NC_015666	TCC	2	6	263667	263672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252355
6522	NC_015666	GAA	2	6	263719	263724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252355
6523	NC_015666	GGC	2	6	263764	263769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252355
6524	NC_015666	GGA	2	6	263848	263853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252355
6525	NC_015666	GAT	3	9	263905	263913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336252355
6526	NC_015666	TCA	2	6	263970	263975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252355
6527	NC_015666	GACG	2	8	264043	264050	25 %	0 %	50 %	25 %	336252355
6528	NC_015666	AAC	2	6	264083	264088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336252355
6529	NC_015666	GTC	2	6	264113	264118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252355
6530	NC_015666	AAT	2	6	264122	264127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336252355
6531	NC_015666	ATCA	2	8	264191	264198	50 %	25 %	0 %	25 %	336252355
6532	NC_015666	TTC	2	6	264264	264269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252355
6533	NC_015666	TGG	2	6	264342	264347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252355
6534	NC_015666	CG	3	6	264369	264374	0 %	0 %	50 %	50 %	336252355
6535	NC_015666	GAA	2	6	264443	264448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252355
6536	NC_015666	ACG	2	6	264479	264484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252355
6537	NC_015666	CACG	2	8	264507	264514	25 %	0 %	25 %	50 %	336252355
6538	NC_015666	CGAC	2	8	264540	264547	25 %	0 %	25 %	50 %	336252355
6539	NC_015666	CA	3	6	264551	264556	50 %	0 %	0 %	50 %	336252355
6540	NC_015666	CGC	2	6	264646	264651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252355
6541	NC_015666	GTG	2	6	264841	264846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252356
6542	NC_015666	TGAC	2	8	264847	264854	25 %	25 %	25 %	25 %	336252356
6543	NC_015666	GCA	2	6	264905	264910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252356
6544	NC_015666	GCC	2	6	264912	264917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252356
6545	NC_015666	CGCT	2	8	264936	264943	0 %	25 %	25 %	50 %	336252356
6546	NC_015666	TGG	2	6	264998	265003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252356
6547	NC_015666	GTCGAC	2	12	265008	265019	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	336252356
6548	NC_015666	CGA	2	6	265055	265060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252356
6549	NC_015666	CGA	2	6	265085	265090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252356
6550	NC_015666	GAG	2	6	265113	265118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252356
6551	NC_015666	GAG	2	6	265179	265184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252356
6552	NC_015666	GCC	2	6	265208	265213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252356
6553	NC_015666	GGA	2	6	265226	265231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252356
6554	NC_015666	GGA	2	6	265238	265243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252356
6555	NC_015666	CGCC	2	8	265277	265284	0 %	0 %	25 %	75 %	336252356
6556	NC_015666	GAC	2	6	265344	265349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252356
6557	NC_015666	CG	3	6	265373	265378	0 %	0 %	50 %	50 %	336252356
6558	NC_015666	GCC	2	6	265453	265458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252357
6559	NC_015666	GAG	2	6	265483	265488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252357
6560	NC_015666	GCG	2	6	265577	265582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252357
6561	NC_015666	GAG	2	6	265606	265611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252357
6562	NC_015666	GAG	2	6	265630	265635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252357
6563	NC_015666	CGA	2	6	265653	265658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252357
6564	NC_015666	GCG	2	6	265676	265681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252357
6565	NC_015666	G	6	6	265705	265710	0 %	0 %	100 %	0 %	336252357
6566	NC_015666	GTT	2	6	265759	265764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336252357
6567	NC_015666	GAC	3	9	265765	265773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252357
6568	NC_015666	CGA	2	6	265775	265780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252357
6569	NC_015666	GGA	2	6	265875	265880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252357
6570	NC_015666	GAC	2	6	265900	265905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252357
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6572	NC_015666	GCT	2	6	266094	266099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252357
6573	NC_015666	TGT	2	6	266162	266167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336252357
6574	NC_015666	CGCGG	2	10	266223	266232	0 %	0 %	60 %	40 %	336252357
6575	NC_015666	GAA	2	6	266274	266279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252357
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6577	NC_015666	GAC	2	6	266394	266399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252357
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6579	NC_015666	CG	3	6	266437	266442	0 %	0 %	50 %	50 %	336252357
6580	NC_015666	GAC	2	6	266549	266554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252358
6581	NC_015666	CGA	2	6	266581	266586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252358
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6583	NC_015666	CGA	2	6	266617	266622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252358
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6587	NC_015666	GGA	2	6	266755	266760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252358
6588	NC_015666	CGA	2	6	266800	266805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252358
6589	NC_015666	CGC	2	6	266826	266831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336252358
6590	NC_015666	CTC	2	6	266833	266838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336252358
6591	NC_015666	TCG	2	6	266901	266906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252358
6592	NC_015666	AGA	2	6	266958	266963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252358
6593	NC_015666	GAGT	2	8	266980	266987	25 %	25 %	50 %	0 %	336252358
6594	NC_015666	GGCG	2	8	266994	267001	0 %	0 %	75 %	25 %	336252359
6595	NC_015666	GGA	2	6	267027	267032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336252359
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6601	NC_015666	TCG	2	6	267371	267376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252360
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6604	NC_015666	TCG	2	6	267440	267445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252360
6605	NC_015666	GA	3	6	267447	267452	50 %	0 %	50 %	0 %	336252360
6606	NC_015666	TCT	2	6	267461	267466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252360
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6610	NC_015666	CG	5	10	267741	267750	0 %	0 %	50 %	50 %	336252361
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6615	NC_015666	CGG	2	6	267858	267863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252361
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6621	NC_015666	GCG	2	6	268030	268035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252362
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6979	NC_015666	GCG	2	6	284313	284318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336252378
6980	NC_015666	TCT	2	6	284444	284449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252379
6981	NC_015666	GA	3	6	284462	284467	50 %	0 %	50 %	0 %	336252379
6982	NC_015666	AGA	2	6	284483	284488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252379
6983	NC_015666	TGG	2	6	284676	284681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252379
6984	NC_015666	TG	3	6	284762	284767	0 %	50 %	50 %	0 %	336252379
6985	NC_015666	TATT	2	8	284771	284778	25 %	75 %	0 %	0 %	336252379
6986	NC_015666	CTT	2	6	284992	284997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336252379
6987	NC_015666	TC	3	6	285128	285133	0 %	50 %	0 %	50 %	336252379
6988	NC_015666	TCG	2	6	285157	285162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336252379
6989	NC_015666	AGA	2	6	285174	285179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336252379
6990	NC_015666	GA	3	6	285250	285255	50 %	0 %	50 %	0 %	336252379
6991	NC_015666	CAG	2	6	285259	285264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336252379
6992	NC_015666	GGT	2	6	285267	285272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336252379
6993	NC_015666	AAT	2	6	285363	285368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336252379
6994	NC_015666	CCA	2	6	285445	285450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336252379
6995	NC_015666	GT	3	6	285476	285481	0 %	50 %	50 %	0 %	336252379
6996	NC_015666	CT	3	6	285551	285556	0 %	50 %	0 %	50 %	336252379
6997	NC_015666	GGTT	2	8	285856	285863	0 %	50 %	50 %	0 %	336252380
6998	NC_015666	AGCAGA	2	12	285883	285894	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	336252380
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7000	NC_015666	TAC	2	6	286002	286007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336252380

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